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1、新疆罗布泊地区可培养嗜盐古菌多样性及其功能酶筛选 【关键词】 嗜盐古菌; 罗布泊; 多样性; 功能酶 ; 多相分类; 【英文关键词】 Lop Nur; Halophilic archaeon; Culture-dependent; Diversity; Functional enzymes; 【中文摘要】 本论文以新疆罗布泊地区嗜盐古菌为研究对象,拟解决适合罗布泊地区嗜盐古菌可培养多样性的科学难题。借鉴嗜盐放线菌的分离经验,筛选出适合的分离培养基,以纯培养技术为手段,结合基于 16S rRNA 基因的系统发育分析,研究罗布泊地区嗜盐古菌物种多样性;通过 3 种功能酶的筛选,初步探寻嗜盐古菌潜在
2、的应用价值。为今后进一步研究新疆罗布泊地区嗜盐古菌资源及开发利用提供技术支持和理论依据。 对采自新疆罗布泊地区的 13 个土样,选用CCMS、改良 Gause 1、ISP 5、HV 分离培养基,分离菌株经纯化去重复后共得到 56 株嗜盐古菌。通过 16S rRNA 基因的系统发育分析,发现这 56 株株嗜盐古菌分布于 5 个候选新属:Group 1、Group 2、Group 3、Group 4、Group 5 和 10 个生效发表属:盐海洋菌属(Halopelagius),钠线菌属(Natrinema) ,盐陆生菌属(Haloterrigena),盐碱团球菌属(Halalkalicoccus
3、),盐惰菌属(Halopiger),适盐菌属(Halodaptatus) ,盐红菌属(Halorubrum),盐碱球菌属(Natronococcus), 盐叠球菌属(. 【英文摘要】 To better resolve the scientific problem of cultured Halophilic archaeon in Lop nur region, this thesis took the Halophilic archaeon in Lop nur region to be the research object. The present study mainly focus
4、 on the diversity and functional enzymes screening of the Halophilic archaeon isolated using cultural dependent methods from the samples collected from Lop Nur region On the basis of the experience of isolating actinomycetes in salt environment, suitable media were selected for the related isolation
5、 exp.摘要 4-6 Abstract 6-7 第一章 绪论 10-29 1.1 嗜盐古菌定义及其分类学地位 10-12 1.2 嗜盐古菌系统发育学的研究进展 12-16 1.3 嗜盐古菌的分类方法及存在的相关问题 16-21 1.3.1 表型特征 17 1.3.2 细胞化学组分 17-18 1.3.3 基因组 DNA G+C mol%含量 18-19 1.3.4 基于 16S rRNA 基因序列的系统发育分析 19-20 1.3.5 基因组 DNA-DNA 杂交 20 1.3.6 总结 20-21 1.4 嗜盐古菌应用价值 21-24 1.4.1 细菌视紫红质 21 1.4.2 嗜盐古菌产
6、生的多聚物 21-22 1.4.3 嗜盐古菌的耐辐射特性 22 1.4.4 嗜盐古菌产生的水解酶 22-23 1.4.5 类胡罗卜素 23 1.4.6 嗜盐菌素（Halocin） 23-24 1.4.7 总结 24 1.5 新疆盐湖环境及嗜盐古菌多样性研究概述 24-26 1.5.1 新疆盐湖环境介绍 24-25 1.5.2 新疆盐环境嗜盐古菌多样性研究现状及存在问题 25-26 1.6 本实验的基本思路、目的和意义,研究内容及拟解决的关键问题 26-29 1.6.1 本实验的基本思路、目的和意义 26-27 1.6.2 研究的内容 27 1.6.3 拟解决的关键问题 27-29 第二章 新疆
7、罗布泊地区可培养嗜盐古菌的多样性研究 29-39 2.1 材料和方法 29-31 2.1.1 材料 29-30 2.1.2 方法 30-31 2.2 结果与分析 31-36 2.2.1 基于系统发育 N-J 树的可培养嗜盐古菌多样性分析 31 2.2.2 香农指数分析 31-33 2.2.3 不同土样嗜盐古菌多样性分析 33-35 2.2.4 不同培养基对嗜盐古菌分离效果的影响 35-36 2.3 讨论 36-39 第三章 嗜盐古菌功能酶筛选 39-45 3.1 材料和方法 39-40 3.1.1 材料 39 3.1.2 NaCl 盐浓度耐受 39-40 3.1.3 酶活检测的方法 40 3.
8、2 结果与分析 40-43 3.2.1 嗜盐古菌盐浓度耐受实验 40-41 3.2.2 功能酶酶活检测 41-43 3.3 讨论 43-45 第四章 两株嗜盐古菌的多相分类 45-53 4.1 方法 45-48 4.1.1 表型特征分析 45-46 4.1.2 生理生化特征 46-47 4.1.3 嗜盐古菌细胞极性脂组分分析 47 4.1.4 嗜盐古菌基因组 DNA 的提取 47 4.1.5 嗜盐古菌 16S rRNA 基因序列分析 47 4.1.6 基因组 DNA G+C mol%含量分析 47-48 4.1.7 DNA-DNA 同源性分析 48 4.2 多相分类结果 48-51 4.2.1 候选新种的系统发育关系 48-49 4.2.2 部分多相分类结果 49-51 4.3 讨论 51-53 第五章 总结与展望 53-54 参考文献
