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1、0高性能计算机集群软件安装手册Intel 软件的安装前提： 软件都是开源下载的，下载软件及 license 网址：http:/ 将软件的序列号文件（*.lic 文件）拷贝到/opt/intel/licenses 下（此目录需要手动建立）。1 Intel C+编译器的安装：1. 复制源码包：使用 cp 命令复制 Intel C+的源码包 l_cproc_p_11.0.083_intel64.tgz 到 root 目录下2. 解压缩：tar zxvf l_cproc_p_11.1.072_intel64.tgzcd l_cproc_p_11.1.072_intel643. 安装：./install
2、.sh如下图所示，需要经历 7steps 安装过程，基本都是默认选项回车进行下一步。Press Enter key to continue or q to quit: 回车Please type a selection or press Enter to accept default choice 1:回车（View the license agreement (required)）Type accept to continue or decline to back to the previous menu:accept1Please type a selection or press Ent
3、er to accept default choice 1:回车（Use existing license）Please type a selection or press Enter to accept default choice 1:回车（Typical Install (Recommended)）Please type a selection or press Enter to accept default choice 1:回车（Install）Please type a selection or press Enter to accept default choice q:回车（Q
4、uit）至此，已安装成功，默认的安装路径为/opt/intel/Compiler/版本号/ 的路径下，4. 设置环境变量：vi /root/.bashrc /编辑.bashrc 文件，在文档最后加入以下内容：source /opt/intel/Compiler/11.1/072/bin/intel64/iccvars_intel64.sh /（：wq）保存退出source /root/.bashrc /source 使其生效which icc /查看是否环境变量设置正确2 Intel Fortran 编译器的安装：1. 复制源码包：使用 cp 命令复制 Intel Fortran 的源码包 l
5、_cprof_p_11.0.083_intel64.tgz 到 root 目录下2. 解压缩：tar zxvf l_ l_cprof_p_11.1.072_intel64.tgzcd l_cprof_p_11.1.072_intel643. 安装：./install.sh如下图所示，需要经历 7steps 安装过程，基本都是默认选项回车进行下一步。2Press Enter key to continue or q to quit: 回车Please type a selection or press Enter to accept default choice 1:回车（View the li
6、cense agreement (required)）Type accept to continue or decline to back to the previous menu:acceptPlease type a selection or press Enter to accept default choice 1:回车（Use existing license）Please type a selection or press Enter to accept default choice 1:回车（Typical Install (Recommended)）Please type a
7、selection or press Enter to accept default choice 1:回车（Install）Please type a selection or press Enter to accept default choice q:回车（Quit）4. 设置环境变量：vi /root/.bashrc /编辑.bashrc 文件，在文档最后加入以下内容：source /opt/intel/Compiler/11.1/072/bin/intel64/ifortvars_intel64.sh /（：wq）保存退出source /root/.bashrc /source 使其
8、生效which ifort /查看是否环境变量设置正确3 Intel MPI 的安装：1. 复制源码包：使用 cp 命令复制 Intel MPI 的源码包 l_mpi_p_4.0.0.028.tgz 到 root 目录下2. 解压缩：tar zxvf l_mpi_p_4.0.0.028.tgzcd l_mpi_p_4.0.0.0283. 安装：./install.shPlease type a selection (1/2/x) 1:回车（Install cluster node software on an automounted shared file system）Press Enter
9、 to continue. 回车Enter accept to continue, reject to exit: (accept/reject): accept3Please specify installation prefix /opt/intel/mpi/3.0: 回车Preparing packages for installation.intel-mpi-em64t-3.0p-043Installation successful.To uninstall this package, run /opt/intel/mpi/3.0/uninstall.Completed cluster
10、 installation successfully.4. 设置环境变量：vi /root/.bashrc /编辑.bashrc 文件，在文档最后加入以下内容：source /opt/intel/impi/4.0.0.028/intel64/bin/mpivars.sh /（：wq ）保存退出source /root/.bashrc /source 使其生效which mpirun /查看是否环境变量设置正确5. MPD 环境初始化设置：在每个节点的终端下运行以下命令：touch /root/.mpd.confchmod 600 /root/.mpd.confecho MPD_SECRETWO
11、RD=mr45-j9z /root/.mpd.conftouch /etc/mpd.confchmod 600 /etc/mpd.confecho MPD_SECRETWORD=111111 /etc/mpd.conf快捷运行命令：假设所有计算节点 IP 为 192.168.100.* （*从 1 到 100）for(i=1,i= 1) 1 # of panels in recursion 2 NDIVs 1 # of recursive panel fact. 1 0 2 RFACTs (0=left, 1=Crout, 2=Right) 1 # of broadcast 0 BCASTs
12、(0=1rg,1=1rM,2=2rg,3=2rM,4=Lng,5=LnM) 1 # of lookahead depth 0 DEPTHs (=0) 2 SWAP (0=bin-exch,1=long,2=mix) 256 swapping threshold 81 L1 in (0=transposed,1=no-transposed) form 1 U in (0=transposed,1=no-transposed) form 0 Equilibration (0=no,1=yes) 8 memory alignment in double ( 0) 主要注意N，NB，P 和Q 的值 N
13、 是矩阵的大小，其公式为：N*N*8=总内存*80% ，在intel Nehalem以上的cpu, N*N*8=总内存*90% 测试的效果会更好些。 NB 是求解矩阵分块大小，一般为192,224 P和Q 要满足：P*Q=进程数；PQ 这2 个关系 4. 运行linpack mpdboot mpiexec machinefile hosts n 12 ./xhpl 5. 看输出结果，并算出效率。 一台双路服务器配置了2颗Xeon x56502.66GHz的理论峰值为2.66 （主频）*4 (每个时钟执行4 次浮点运算)*2（2 颗cpu ）*6 (每颗cpu 有6 个核)=127.68 GFl
14、ops 实测的一组输出结果： = T/V N NB P Q Time Gflops - WR00C2L2 50760 224 2 6 720.91 1.210e+02 - |Ax-b|_oo/(eps*(|A|_oo*|x|_oo+|b|_oo)*N)= 0.0024948 . PASSED = Finished 8 tests with the following results: 8 tests completed and passed residual checks, 0 tests completed and failed residual checks, 0 tests skipped because of illegal input values. - End of Tests. nt
