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1、山东农业大学硕士学位论文I符 号 说 明PCR:Polym eraseChainReaction聚合酶链式反应rDNA:ibosomaldeoxyribonucleicaid核糖体脱氧核糖核酸FISH:Fluorescenceinsituhybridization荧光原位杂交PLFA:Phospholipidfatyacidanalysi磷脂肪酸分析DGE:DenaturingGradientGelElectrophoresi变性梯度凝胶电泳T:Therm alradientellectrophoresi温度梯度凝胶电泳RDP:RibosomalDatbaseProject核糖数据库计划E.c
2、oli:Escherichiacoli大肠埃希氏菌DMF:N,N-Dim ethylform am ideN,-二甲基甲酰胺BSA:BovineSerumAlbumin牛血清白蛋白IPTG:Isoprophyl-D-thiogalactopyranoside异丙基 -D-硫代半乳糖苷X-al:5-bromo-4-chloro-3-indoly-D-galactose5-溴 -4-氯 -3-吲 哚 -D-半 乳 糖苷 OUT:OperationalTaxonomicUnit可操作分类单元ARDA:m plifedRibosomalDNARestrictionAnalysi扩 增 核 糖 体 DN
3、A限制性分析 T-RFLP:Term inalRestrictionFragmentLengthPolym orphism 末 端 限 制 性 片 段长度多态性 ANOVA:nalysiofvariance方差分析PC:PrincipalComponentAnalysi主成分分析WA:eightedAverage加权平均R:Recipricalverage相互平均DCA:DetrndedCorrespondenceAnalysi去趋势对应分析V:anonicalVariteAnalysi典型变量分析CoA:CanonicalCorrelationAnalysi典型相关分析RDA:Redunda
4、nceAnalysi冗余分析东平湖沉积物细菌多样性分析ICA:CanonicalCorrespondenceAnalysi典型对应分析m p:m picilin氨苄青霉素TP:otalphosphorus总磷N:Totalnitrogen总氮TOC:otalorganicarbon总有机碳NH-:Am m oniumnitrogen铵态氮O-:Nitratenitrogen硝态氮山东农业大学硕士学位论文I目 录摘要 .1ABSTRACT.31引言 .51.1沉积物微生物多样性研究概述 .51.1.1沉积物环境特征 .51.1.2沉积物中微生物群落与环境因子间的相互作用 .61.1.3沉积物微生
5、物生态学研究进展 .71.1.3.1沉积物中特定微生物群落分布的研究 .71.1.3.2沉积物环境中微生物群落结构组成 .71.1.3.3沉积物宏基因组研究 .81.2细菌群落分析方法 .81.2.1环境基因组 16SrDNA的 PCR扩增 .91.2.216SrDNA文库 .11.2.3T-RFLP.141.3生物群落多样性的测度 .161.3.1多样性的测度 .161.3.1.1物种丰富度 .171.3.1.2物种相对多度模型 .171.3.1.3物种多样性指数 .171.3.1.4物种均匀度指数 .181.3.2多样性的测度 .181.3.2.1二元属性数据测度法 .181.3.2.2数量数据测度法 .191.4生物群落梯度分析 .201.4.1直接梯度分析 .211.4.2间接梯度分析 .211.4.3约束直接梯度分析 .211.4.3.1典型变量分析 .221.4.3.2典型相关分析 .22东平湖沉积物细菌多样性分析IV1.4.3.3冗余分析 .221.4.3.4典型对应分析 .221.5本文选题依据及研究意义 .222材料与方法 .232.1生化试剂 .232.2仪器设备 .242.3样品的采集 .242.4主要溶液的配制 .252.4.1LB培养基 .252.4.2氨苄青霉素溶液 .252.4.3X-Gal贮液 .
