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2、活 时尚 心理 美食 医 护 电脑网络 百宝箱 网盘 零点花园零点花园 生命科学生命科学 生物信息学常用数据库(已分类) 下 上 返回列表 回 复 发 帖 交流交流 生科综合生科综合 生物信息学常用数据库生物信息学常用数据库(已分类已分类) 花园学徒 skochilly Rank: 1 帖子 441 积分 20 金币 339 贡献值 3 点 最后登录 10-5-10 发表于 10-3-13 22:54:19 | 只看该作 者 1 楼楼 交流 生科综合 生物信息学常用数据库生物信息学常用数据库(已分类已分类) 交流交流 原创与否是 主要序列数据库 名称 地址 说明 DDBJ序列数据库 http:
3、/www.ddbj.nig.ac.jp 所有已知的核酸和蛋白质序列数据库，国际核酸序列数据库合作项目 EMBL序列数据库 http:/www.ebi.ac.uk/embl.html 所有已知的核酸和蛋白质序列数据库，国际核酸序列数据库合作项目 GenBank序列数据库 http:/www.ncbi.nlm.nih.gov 所有已知的核酸和蛋白质序列数据库，国际核酸序列数据库合作项目 STACK http:/www.sanbi.ac.za/Dbases.html 非冗余的基因簇 零点花园 注册 登录 会员之家会员之家会员服务插件红包搜索帮助 www zhhema comGoogle 提供的广告
4、TIGR基因索引 http:/www.tigr.org/tdb/index.shtml 非冗余的基因簇 UniGene http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/UniGene/ 非冗余的基因簇 比较基因组学 名称 地址 说明 COG数据库 http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/ 基于43个已完成基因组测序的微生物的蛋白质的进化分析的同源基因蔟 XREFdb http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/XREFdb/ 模式生物遗传学和哺乳类表型之间的交叉索引 ASDB http:/Cbcg.nersc.gov/asdb 具有不同剪接形式基因的蛋白质
5、产物和表达模式 基因表达 名称 地址 说明 Axeldb http:/www.dkfz-heidelberg.de/abt0135/axeldb.htm 爪蟾的基因表达 BodyMap http:/Bodymap.ims.u-tokyo.ac.jp 人和小鼠基因表达数据 EpoDB http:/www.cbil.upenn.edu/EpoDB/ 脊椎动物红细胞基因表达 FlyView http:/Pbio07.uni-muenster.de 果蝇的发育和遗传 GXD基因表达数据库 http:/www.informatics.jax.org/mgihome/GXD/aboutGXD.shtml
6、小鼠的基因表达和遗传 肾脏发育数据库(KDD) http:/golgi.ana.ed.ac.uk/kidhome.html 肾脏发育和基因表达 MAGEST http:/www.genome.ad.jp/magest/welcome.html 海鞘基因表达模式 MethDB http:/www.methdb.de DNA甲基化数据、模式和轮廓 小鼠基因表达数据库(MAGED) http:/Genex.hgu.mrc.ac.uk 与组织相关的基因表达数据 PEDB http:/www.pedb.org/ 正常和异常的前列腺基因表达 RECODE http:/Recode.genetics.uta
7、h.edu 表达过程中采用程序化翻译编码的基因 斯坦福微阵列数据库(SMD) http:/Genome-www.Stanford.edu/microarray 来自微阵列实验的原始和均一化了的数据 TRIPLES http:/Ygac.med.yale.edu/triples/triples.htm 酵母中转座子插入表型、定位和表达 牙齿发育数据库(TDD) http:/Bite-it.Helsinki.fi 牙组织发育中的基因表达 基因特征和结构 名称 地 址 说 明 AllGenes http:/www.allgenes.org 人和小鼠基因索引、整合基因、转录和蛋白注释 Ares Lab
8、 Intron Site http:/www.cse.ucsc.edu/research/compbio/yeast_introns.html 酵母剪接体和内含子 COMPEL http:/compel.bionet.nsc.ru/ 复合调控元件（Composite regulatory elements） CUTG http:/www.kazusa.or.jp/codon/ 遗传密码使用表 DBTBS http:/dbtbs.hgc.jp/ 枯草杆菌反式作用因子和启动子 EID http:/mcb.harvard.edu/gilbert/EID/ 内含子、外显子数据库 EPD http:/w
9、ww.epd.isb-sib.ch/ 通过实验获得的真核生物POL II启动子非冗余数据库 ExInt http:/intron.bic.nus.edu.sg/exint/exint.html 真核生物外显子和内含子结构 HUNT http:/www.hri.co.jp/HUNT 注释了的人类全长cDNA序列 IDB/IEdb http:/nutmeg.bio.indiana.edu/intron/index.html 内含子序列和进化 PLACE http:/www.dna.affrc.go.jp/htdocs/PLACE 植物顺式调控元件 遗传学和物理图谱 名称 地址 说明 DRESH h
10、ttp:/www.tigem.it/LOCAL/drosophila/dros.html 果蝇突变基因同源的人cDNA克隆 G3-RH http:/www-shgc.stanford.edu/RH/ 斯坦福G3和TNG辐射杂交图谱 GB4-RH http:/www.Sanger.ac.uk/Software/RHserver/RHserver.shtml 人辐射杂交图谱Genebridge4 (GB4) GDB http:/www.gdb.org/ 人类基因和基因组图谱 GenAtlas http:/www.dsi.univ-paris5.fr/genatlas/ 人类基因、标记和表型 Gen
11、Mapdb http:/genomics.med.upenn.edu/genmapdb 已经定位的人BAC克隆 GenMap99 http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/genemap/ 国际辐射图谱合作项目下的人类基因图谱 HugeMap http:/www.infobiogen.fr/services/Hugemap 人类基因组遗传和物理图谱数据 IXDB http:/ixdb.mpimg-berlin-dahlem.mpg.de/ 人类x染色体物理图谱 RHdb http:/www.ebi.ac.uk/RHdb 辐射杂交图谱数据 wufujun-01 金币金币 +15 感谢
12、您一直支持！ 10-3-15 17:37 评分记录 back to top 回复 引用 skochilly 发表于 10-3-13 22:54:43 | 只看该作 者 2 楼楼 基因组数据库 花园学徒 Rank: 1 帖子 441 积分 20 金币 339 贡献值 3 点 最后登录 10-5-10 名称 地址 说明 AceDB http:/www.sanger.ac.uk/Software/Acedb/ 线虫(C.elegans),酵母(S.pombe)的序列和基因组信息 AmmtDB r.it/mitochondriome/ 寄生虫(Metazoan)线粒体DNA序列 ArkDB http:
13、/www.thearkdb.org/sites.html 农业相关和其他动物的基因组数据库 综合的微生物资源(CMR) http:/www.tigr.org/tigr-scripts/CMR2/CMRHomePage.spl 已完成测序的微生物基因组 CropNet 农作物基因组图谱 CyanoBase http:/www.kazusa.or.jp/cyano/ Synechocystis sp.基因组 EMGlib http:/pbil.univ-lyon1.fr/emglib/emglib.html 已完成基因组测序的细菌、古细菌、酵母 EcoGene http:/bmb.med.miam
14、i.edu/EcoGene/EcoWeb/ 大肠杆菌(E.coli)K-12的序列 FlyBase http:/www.fruitfly.org/ 果蝇基因序列和基因组信息 Full-Malaria http:/fullmal.ims.u-tokyo.ac.jp/ 红细胞期恶性疟原虫的全长cDNA文库 GOBASE http:/megasun.bch.umontreal.ca/gobase/gobase.html 细胞器基因组数据库 GOLD 已完成和正在进行测序项目的信息 HIV序列数据库 http:/hiv-web.lanl.gov/ HIV的RNA序列 Human BAC Ends Da
15、tabase http:/www.tigr.org/tdb/humgen/bac_end_search/bac_end_intro.html 非冗余的人类BAC末端序列 ICB http:/www.mbio.co.jp/icb 采用蛋白编码进行细菌的分类和鉴定 INE http:/rgp.dna.affrc.go.jp/giot/INE.html 水稻的遗传学、物理图谱和序列数据 MITOMAP http:/www.mitomap.org/ 人类线粒体基因组 MITOP http:/mips.gsf.de/proj/medgen/mitop/ 线粒体蛋白、基因和疾病 苜蓿属基因组数据库(MGI) http:/www.noble.org/medicago/ 模式苜蓿属荚果(1egumeMedicago)的ESTs、基因表达和蛋白质组数据 Mendel数据库 利用基因家族信息注释的植物EST和STS序列数据库 MitoDat http:/www-lecb.ncifcrf.gov/mitoDat/ 线粒体蛋白(以人类为主) 小鼠基因组数据库(MGD) http:
