动物生物化学课件4 核酸的化学

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1、,第4章,核酸的化学,本章主要内容:,核酸的化学组成,核酸的结构,核酸的理化性质,著名的肺炎链球菌转化实验,更有说服力的噬菌体实验,脱氧核糖核酸,DNA (Deoxyribonucleic Acid),在原核细 胞是核质的成分,在真核细胞DNA与蛋白质结合形成染色 体,少量存在于线粒体。一个生命有机体的每个体细胞(除 生殖细胞外)都含有相同质和量的DNA,包含了它的全部遗 传信息。,核糖核酸,RNA (Ribonucleic Acid)主要存在于胞液内, 真核细胞的核仁和线粒体也含有少量RNA。RNA的量是变动 的。主要有mRNA,tRNA和rRNA。 病毒或者是DNA病毒或者是RNA病毒。,

2、1.核酸的化学组成,核酸,DNA或RNA,经核酸酶水解生成单核 苷酸。,单核苷酸是组成核酸的基本单位。,核苷酸进一步分解生成碱基、核糖(或脱氧 核糖)和磷酸。,核酸的水解,核酸 核苷酸 nucleic acid nucleotide,磷酸,phosphate,核苷 nucleoside,碱基 戊糖,base pentose,2 3 4,N 1,9,1.核酸的化学组成 1.1 碱基,胞嘧啶(Cytosine,C),C,2,1 6 CH N H,C HN 3 4 5 CH,O,O,HN 3,C,2,1 6 CH N H,C 4 5 C,O,O,CH 3,N 3,C,2,CH,1 6 N H,C 4

3、 5 CH,NH 2,O,HC,C C,5,C 6 N,CH,N 7 8 9 N H,尿嘧啶(Uracil,U) NH2,HN 1 2,5 4,6 3 N,CH,N 7 8 N H,O,H2N,鸟嘌呤(Guanine, G),胸腺嘧啶(Thymine,T) 核酸中的嘧啶碱基,腺嘌呤(Adenine, A) 核酸中的嘌呤碱基,1.核酸的化学组成 1.2 核糖,4,2 H,3 OH,H,5 CH2OH O H,H,OH H 1,4,2 H OH,5 CH2OH O H,H 3 OH,OH H 1,核糖(D-ribose),脱氧核糖(2-deoxy-D-ribose),DNA: 脱氧核糖,RNA:

4、核,糖,1.核酸的化学组成,1.3 核苷,A、 概念:,碱基和戊糖通过糖苷键连接而成的化合物,B、分类:,嘌呤核苷(腺苷、鸟苷),嘧啶核苷(胞苷、尿苷、胸苷),核糖核苷构成RNA,脱氧核糖核苷 构成DNA,N,N,N 9 N,O,H,OH,H 1,H,H,HO CH 2 H,N,HN H 2N,N 9 N,O,H,OH,H 1,H,H,HO CH 2 H,O,H,OH,H,H,HO CH 2 H,H 1,1 N,N,O,O,H,OH,H,H,HO CH2 H,H 1,1 N,HN O,腺嘌呤脱氧核苷,鸟嘌呤脱氧核苷,胞嘧啶脱氧核苷,胸腺嘧啶脱氧核苷,N,N,9 N,N,NH 2,OH,H 1,

5、H OH,H,HO CH 2 O H,HN,N,N,O,H 2N,9 N,O,OH,H 1,H OH,H,HO CH 2 H,O,OH,H OH,H,HO CH 2 H,H 1,1 N,N,NH 2,O,OH,H OH,H,HO CH2 O H,H 1,1 N,HN,O,O,腺嘌呤核苷 NH 2,鸟嘌呤核苷 O,胞嘧啶核苷 NH 2,尿嘧啶核苷 O,CH 3,核苷(上)与脱氧核苷(下),1.核酸的化学组成,1.4 核苷酸,核苷酸(nucleotide)的概念:,核苷(脱氧核苷)与磷酸通过酯键结合,而成的化合物。,N,N,N 9 N,NH2,1,H H OH,N,O,HN H2N,N 9 N,H

6、 1 H OH,H 1 H OH,1 N,N,NH2,O,H 1 H OH,1 N,O,HN O,O,O P O CH2 O O H H OH,O,O P O CH2 O O H H OH,O,O P O CH2 O O H H OH,O,O P O CH2 O O H H OH,N,N,N 9 N,5腺嘌呤核苷酸 NH2,1,H H,H,N,5鸟嘌呤核苷酸 O,HN H2N,N 9 N,H 1 H H,H 1 H H,1 N,N,5胞嘧啶核苷酸 NH2,O,H 1 H H,N 1,5尿嘧啶核苷酸 O,HN O,5腺嘌呤脱氧核苷酸,5鸟嘌呤脱氧核苷酸,5胞嘧啶脱氧核苷酸,5胸腺嘧啶脱氧核苷酸,

7、O,O P O CH2 O O H H OH,O,O P O CH2 O O H H OH,O,O P O CH2 O O H H OH,O,O P O CH2 O O H H OH,CH3,核糖核苷酸(上)与脱氧核糖核苷酸(下),1.核酸的化学组成,1.5 其他核苷酸,A 、参加能量代谢的核苷酸:ATP、ADP B 、参加细胞信号传导的核苷酸: 环腺苷酸(cyclic AMP,cAMP) 环鸟苷酸(cyclic GMP,cGMP),O ,CH,N N,NH 2,H,N HC N 5 O CH 2 O H,-O,O O P O P O P O - O - O -,H H OH OH 腺嘌呤核苷

8、三磷酸(ATP),N HC,N,CH,N N,NH 2,H O,H H OH,CH 2 O,H,O,O P,O- 3,5-环状腺苷酸(cAMP),1.核酸的化学组成,DNA分子和RNA分子核苷酸组成的差别,5 H2C,5 CH2,5 H2C,3,5-磷 酸二酯键,NH2 N N N N,O,N,NH,N N,NH2 N N O,HO P O O O,3 OH,OH HO P O O O 3 O HO P O O O 3 O,G NH2,C A,3end,2. 核酸的结构 5end 2.1 核酸中核苷 酸的连结方式 3,5 phosphodiester linkage,侧链 核苷酸之 间的连接

9、方式是,主链,2.核酸的结构,2.2 DNA分子的结构,DNA分子的大小,天然存在的DNA分子最显著的特点是很长,分子质量很,大,一般在1061010 。,DNA的碱基组成有如下特点: 具有种的特异性。, 没有器官和组织的特异性。, 在同一种DNA中,A=T 、G = C+m5C,即A+G = T+C+mC。 年龄、营养状况、环境的改变不影响DNA的碱基组成。,2. 核酸的结构,2.3 核酸的一级结构,概念:,核酸一级结构指DNA或RNA中,核苷酸的排列顺序,亦可称之为碱基,排列顺序。,2.核酸的结构,2.4 DNA的二级结构,DNA双螺旋结构的研究背景 :,A、Chargaff 规则:20世

10、纪40年代末至50年代初,a、Pu=Py,且A=T、G=C,b 、不同生物种属DNA碱基组成不同,c、同一个体不同器官(组织)的DNA碱基组成,B、Rosalind Franklin 获得高质量的DNA X衍射照,片,显示DNA分子呈螺旋外形,2.核酸的结构,DNA分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链(简称DNA单链)组 成。两条链沿着同一根轴平行盘绕,形成右手双螺旋结构。 两条链方向相反。,碱基位于螺旋的内侧,磷酸和脱氧核糖基以磷酸二酯键 相连形成的骨架位于螺旋外侧。,内侧碱基呈平面状,碱基平面与中心轴相垂直,脱氧核 糖的平面与碱基平面几乎成直角。相邻碱基平面在螺旋轴 之间的距离为0.34nm,旋

11、转夹角为36。因此,每10对核 苷酸绕中心轴旋转一圈,螺距为3.4nm。,DNA双螺旋结构要点 :,2.核酸的结构,螺旋的直径约为2nm。沿螺旋的中心轴形成的大沟 和小沟交替出现。,两条链被碱基对之间形成的氢键稳定地维系在一起。 碱基的相互结合具有严格的配对规律,A与T,G与 C,A和T之间形成两个氢键,G与C之间形成三个氢键。,2.核酸的结构,Watson和Crick所提出 的模型称为B-DNA。,不同构型的 DNA,B型是最稳定的构型,2.核酸的结构,2.5 超螺旋DNA,A、原核生物:超螺旋结构,核小体的构成,核小体由DNA和组蛋白共同构成。,组蛋白H2A、H2B、H3和H4各2分子构成

12、八聚 体,DNA双螺旋缠绕在此八聚体上,形成核心颗,粒(core particle),核心颗粒间通过连接区(组 蛋白H1和60bp DNA)连接成串珠状结构。,长约140bp的DNA分子绕核心部位1圈。,核小体的串珠状结构,2. 核酸的结构,2.6 RNA分子的结构,mRNA:占细胞中RNA总量的3%5%,分子量大小不 一,不稳定,代谢活跃,更新迅速,是合成蛋白质的模板。 rRNA:细胞中含量最多的RNA,核糖体的组成成分,蛋白 质合成的场所。,tRNA:约占细胞中RNA总量的15%。约由7590个核苷酸 组成。蛋白质合成中携带活化的氨基酸。,RNA的碱基组成: A、G、C、U,RNA分子的类

13、型:mRNA、rRNA、tRNA,2.6.1 mRNA的结构和功能,把DNA所携带的遗传信息,按碱基互,补配对原则,抄录并传送至核糖体,用以 决定其合成蛋白质的氨基酸排列顺序 。,2.6.2 转运RNA的结构与功能,tRNA一级结构特点:,A、小分子单链RNA,70-90个核苷酸组成 B、含10-20%的稀有碱基(rare bases),I、DHU、mA、mG,C、5 端通常为pG;3端通常为-CCA-OH,tRNA空间结构特点:,A、三叶草形二级结构:,AA臂:特异结合AA,反密码环(反密码子):与密码子配对 DHU环:与氨基酰-tRNA合成酶结合 TC环:与核蛋白体结合,可变环,B、倒L形

14、三级结构,* tRNA的二级结构,三叶草形,氨基酸臂, 氨基酸臂 DHU环 反密码环 额外环 可变环 TC环,* tRNA的三级结构, 倒L形,* tRNA的功能,活化、搬运氨基 酸到核糖体,参与蛋 白质的翻译。,2.6.3 核蛋白体RNA的结构与功能,rRNA结构特点,A、原核生物有:5S、16S、23S三种 真核生物有:5S、5.8S、18S、28S四种,B、核蛋白体RNA和数十种蛋白质构成核蛋白 体( ribosome ),核蛋白体包括大、小两个亚基。,C、多个茎-环(stem-loop)结构,rRNA的功能,参与构成核蛋白体,是合成蛋白质的场所。,3.核酸的性质,3.1 紫外吸收的特性

15、,嘌呤和嘧啶在 260,nm有特异的吸收峰 , 这个性质用于核酸 的分析,3.核酸的性质,3.2 溶解性,溶于偏碱的溶剂中,可以为乙醇沉淀,容,易受机械作用力而断裂。,3.3 黏性,DNA溶液有高度的黏性,3.核酸的性质,3.4 DNA分子的变性,DNA双螺旋的有序结构受各种理化因子,如热、酸碱、变性 剂、有机溶剂以及稀释的作用,转变为无规则的线团结构。,变性的特征:增色 效应,黏度下降, 沉降系数增加,生 物学活性丧失,3. 核酸的性质,增色效应:核酸分子加热变性时,其在 260nm处的紫外吸收急剧增加的现象。,Tm值 :当紫外吸收变化达到最大变化的半数,值时,此时所对应的温度称为熔解温度、

16、变,性温度或用Tm值表示。,DNA解链曲线,3.核酸的性质,影响Tm值的因素:,溶液的性质,大肠杆菌DNA在不同浓度 KCl溶液下的熔融温度曲线,DNA的性质和组成,3. 核酸的性质,3.4 复性(renaturation),复性:变性DNA分开的两条链在适当条件下重新生,成双链结构的过程。,退火(annealing):热变性的DNA经缓慢冷却后复性 的过程。,3.核酸的性质 3.5 分子杂交 当两条不同来源的 DNA(或RNA)链或DNA链与RNA链之间存在互补顺序 时,在一定条件下可以发生互补配对形成双螺旋分子,这种分子称为 杂交分,子。形成杂交分子的过程称为 分子杂交(molecule,hybridization ) 。, ,研究DNA之间的亲缘关系; 发现基因的缺失或突变; 测定某种遗传信息的量; 鉴定某种基因等,3. 核酸的性质 核酸探针(nucleic ac

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