LOINC与SNOMEDCT简介教材课程

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1、LOINC与SNOMED CT简介,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心 河北石家庄 2009年,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,讲义提纲,前言 LOINC 概述 IHTSDO 及其 SNOMED CT 概述 LOINC 与 SNOMED 的联合运用 致谢,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,前言,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,互操作性之层次,基础层次 使消息在计算机系统之间得以交换 字处理文档, 电子表格 功能层次 描述的是消息的标准语法(格式) 文档模板、表单、数据结构 消息标准 语义层次 需要在消息之中采用标准词表,张林 白求恩国际

2、和平医院 核医学科/PET中心,可比性,当在不同的参与方之间共享之时,数据的含义协调一致 需要共同的术语集 公共术语集应当在幕后发挥作用 不仅仅是字词,还包括: 代码 对术语加以唯一的标识 分类 对相关的术语加以分组 词表 精确的专业化术语,旨在消除歧义,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,卫生数据的潜在用途受到数据质量因素的制约,数据质量问题 对于客户通讯与分析来说,有所不同 常常受到外力的制约 例如,诊断标准往往有别于报告标准 数据合并的单向作用 详细 概括 概括 详细,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,问题之所在,“在试图获知真相的过程中, 我为信息资料而到处求

3、索,但却很少能够获得适合于任何比较用途的医院记录 。 假如能够获得这些记录,那将使我们能够解决许多其他的问题 它们将会向订购者表明他们的钱究竟是如何花掉的以及究竟这些钱实际上带来了多大的好处 ”,南丁格尔,弗洛伦斯- 关于某家医院的笔记, 1873年,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,为何要采用 LOINC和SNOMED CT?,“在实验室内部,也许可以用本地行话,同事们通常都心知肚明;但是,对于和外部的沟通交流而言,这些行话就不是那么广为人知了。” Source: U. Forsum et al., Pure Appl. Chem 72:555-745, 2000 Proper

4、ties and Units in the Clinical Laboratory Sciences Part VII. Properties and Units in Clinical Microbiology,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,检验项目比较,实验室 A 试验名称:莱姆病血清学检查 受检成分: B. burgdorferi Ab IgG 试验方法: ELISA 检测精度: 定量 例如: 滴度 1:40,实验室 B 试验名称:莱姆病抗体 受检成分: B. burgdorferi Ab IgM 试验方法: 免疫印记 检测精度: 定性 例如: 阳性,LOINC 代码

5、= 5062-5,LOINC 代码 = 6321-4,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,映射的代价:N*(N-1)/2 vs N,节点映射(无共同标准) 21 33 46 510 615 721 828 936 1045 1155 1266 1378 1491 15105 16120 17136 18153 19171 20190,缺乏统一标准,采用统一标准,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,巴别通天塔,英文:The Tower of Babel 又称为巴别塔、巴贝尔塔、巴比伦塔 据圣经创世记第11章记载,是当时人类联合起来兴建,希望能通往天堂的高塔。 为了阻止人类

6、的计划,上帝让人类说不同的语言,使人类相互之间不能沟通,计划因此失败,人类自此各奔东西。,The Tower of Babel by Pieter Brueghel the Elder (1563).,http:/en.wikipedia.org/wiki/Tower_of_Babel http:/zh.wikipedia.org/wiki/巴别塔,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,LOINC 概述,Logical Observation Identifiers Names and Codes 观测指标标识符逻辑命名与编码系统,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,什么

7、是LOINC,LOINC是个首字母缩略语 Logical Observation Identifiers Names and Codes 观测指标标识符逻辑命名与编码系统 LOINC是一套通用的代码和名称,用于标识医学检验项目及其他的临床观测指标 LOINC旨在促进临床结果的交换与汇集,使其更好地服务于临床医疗护理、患者结局管理以及科学研究工作,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,LOINC的过去和现在,LOINC最初是由Regenstrief研究院的研究人员们所发起的(1994年) 如今,他们依然还在与LOINC委员会协作,继续担负着LOINC数据库及其支持文档和RELMA映射程

8、序的开发、编制与维护工作,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,5193-8:Hepatitis B virus surface Ab:ACnc:Pt:Ser:Qn:EIA,5193-8,LOINC 代码,Hepatitis B virus surface Ab,ACnc,Pt,Ser,Qn,EIA,成分 Component,受检属性 Property Measured,时间特征 Timing,体系 System,标尺精度 Scale,方法 Method,LOINC 术语剖析,其中,包括六个主要的 LOINC 轴,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,并非 LOINC 名称

9、组成部分的内容?,检测当中所使用的设备 关于标本的具体细节 优先级别(如急诊) 检测地点 完成检测的人员(检验者) 试验项目解释 并非结果名称之固有组成部分的任何信息 下列结构之中所携带的其他信息: OBX 区段 第3版 HL7 观察指标对象,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,所测量、评价或观测(观察)的物质或实体,成分/分析物,-钠 -葡萄糖 微生物:布鲁氏菌属 甲型流感病毒抗原 巨细胞病毒抗体 脂类.总计,5193-8:Hepatitis B virus surface Ab:ACnc:Pt:Ser:Qn:EIA,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,成分/分析物结

10、构,分析物的正式名称(如钙) 必须指明任何的“子分析物” 例如,冠状病毒抗原 可能具有某一子类 采用园点“.”隔开 例如, 钙.游离型 刺激 - 例如, 口服 100 mg 葡萄糖之后1小时 两个子部分之间采用“post”分隔 post 调整/校正 例如, 调整至 pH 7.4,分析物名称刺激调整,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,质量: 在报告观测指标结果时,计量单位的分子为质量(毫克、克等等) 物质的量:在报告观测指标结果时,计量单位的分子为摩尔或毫当量 催化活性: 报告的是酶活性的那些观测指标结果 任意类(人工类):在报告结果时,计量单位的分子为任意型单位(人工类单位) 数

11、量: 计数,属性,5193-8:Hepatitis B virus surface Ab:ACnc:Pt:Ser:Qn:EIA,所测量、评价或观测(观察)的分析物的特性、品质、特征或属性,最为困难的 LOINC 轴,主要类别,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,MCnc 质量浓度(质量/单位体积) MCnt 质量含量(质量/单位质量) NCnc 数量浓度(数量/单位体积) TmStp 时间戳:时间 CCnc 催化浓度(活性) Prid 存在与否或身份标识 Imp 印象/解释 Find 发现(所见):主观或客观观测结果 Type 类型:“是一种”,属性,5193-8:Hepatiti

12、s B virus surface Ab:ACnc:Pt:Ser:Qn:EIA,最为困难的 LOINC 轴,主要类别与子类型共同构成完整的属性,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,与 LOINC 属性有关的常见问题,分数 = 部分/整体 数量分数 (NFr): % 嗜酸性粒细胞 物质的量分数 (SFr): % 血红蛋白 A2 比率 = 源自同一体系的测量指标 质量浓度比率 - MCrto 例如,同一尿标本之中的尿素氮与肌酐之比 物质的量比率 - SCrto 采用SI国际单位 mmol/L 表示的尿素氮与肌酐之比 相对比率 = 源自同一体系的测量指标 RelRto 中位数之倍数 Rl

13、Tm 实际测量时间与正常对照时间之比,分数(比例) 与 比率(比值,比) a/a+b 与 a/b,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,Pt 时间点(point in time,时刻,随机) 12H 12小时收集物 24H 24小时收集物,时间特征*,*非时间点型的时间特征 通常与比率类属性相关联,用于完成当前观测或测量的时间间隔(时段 ),张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,体系/标本,当前观测所针对的体系(背景环境)或标本类型,超体系(超级体系),第二个子部分 ()。在不包括超体系的情况下,缺省的超体系为“病人”。 超体系用于表示血液制品单位(BPU)、骨髓捐献者或胎

14、儿。,血清 全血 尿液 动脉全血 肝脏 体液,未详细说明,胃液/胃内容物 食物或饲料 组织 XXX 将在当前消息的其他组成部分之中加以详细说明,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,标尺(精度),Qn 定量型 连续数值(实数、整数、比率) 可选运算符(、) Ord 等级型 经过分级的一套可能取值( 1+、2+、 3+ ) Nom 名义型 未经分级的一套可能取值 分类法(如细菌列表) Nar 叙述型 自由文本叙述(如就诊或访视记录),张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,标尺(特殊情况),OrdQn 等级型或定量型 主要用于抗菌类观测结果,如报告成耐药、中介或敏感,或报告成抑

15、菌圈直径毫米数的MIC 不鼓励使用 Multi 多样型:结构化文本“块” 例如,色谱输出 不鼓励使用 Doc 文档型:临床文档 Set 集合型:临床信息附件(标头),张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,观测方法,只有当影响解释时才需要方法信息 不同的正常值范围 试验的灵敏度不同 仅仅在总称层次上加以列出 凝集试验 免疫测定 采用靶向扩增的探针,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,将本地术语映射至 LOINC需要记住的事情,医嘱所下达的事情并不总是所检测的事情: 血培养 经过鉴定的一种或多种活体生物 VDRL(性病研究实验室) 苍白螺旋体抗体 尿液分析 许许多多不同的事情

16、 问题(我在检测什么?)并非其答案 (如阳性) 我们所映射的是问题,而不是答案! 我们必须晓得所检测的那种成分的具体细节(该试验实际上检测的究竟是什么?),张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,RELMA,Regenstrief LOINC Mapping Assistant Regenstrief LOINC 映射辅助程序,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,RELMA 的功能,手工和自动映射的助手 像 LOINC 一样免费使用(参见许可协议) 配备有LOINC文件和索引 采用 Visual Basic 开发(无API) RELMA可转换本地文件之中的本地词汇 用户负责创建由本地术语/名称及其代码所构成的文件 为本地检验项目/组套代码指定 LOINC 术语,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,版权窗口(RELMA 4.0版),张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,主菜单/欢迎窗口,单击 File, 设置首选语言,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中心,选择语种形式,张林 白求恩国际和平医院 核医学科/PET中

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