《SNP关联分析SPSS流程》由会员分享，可在线阅读，更多相关《SNP关联分析SPSS流程（1页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、1. 数据格式：将个体的生长性状（体重，体长等）与个体基因型数据导入Excel，建立文档。如图：2. 导入SPSS软件：打开SPSS软件后点击File-OPEN-DATA，选定数据文档3. 分析数据：点击Analyze-General linear model-univariate(当分析多个性状时选择Multivariate)-将体重设为Dependent(可同时分析多个性状)-将基因型设为Fixed factors(可以多选)点击右边的Model，选择Custom，将Build term 选择为Main effects, 然后将基因型数据点击进入右边窗口，完成后点击Continue返回上个
2、窗口 点击Plots,选择基因型数据进入Horizontal Axis，用于后续数据结果显示时出现图表（只有当基因型为3个及以上时才有必要）点击Post Hoc，在新跳出的窗口中将基因型数据选入右边小窗口，然后在下面选择你需要的统计方法，一般选择LSD, Turkeys-b, Turkey, Duncan，任何一种方法在后面的数据中显示出显著性都可以使用该数据发表文章，不过需说明所用方法。选择完成后点击Continue返回上一窗口点击Options, 将基因型数据导入右边窗口，选择Compare main effects, 然后在下面选择一些显示形，一般选择Descriptive statistics, Estimates of effect size, General estimable function等，可根据需要尝试。点击Continue返回上一页面点击OK，出现数据分析结果窗口。说明：数据格式当中，我只有一个位点的基因型，所以直接用基因型命名，如果是多个位点的话可以分别命名为G432A形式，便于后续分析和查看结果。但是最好一次分析一个位点，不然不同位点间可能会存在相互作用，数据不好解释。
