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1、步骤一：打开sopc builder。步骤二：建立新NIOS II系统。步骤三：给NIOS II系统添加IP核（可以自定义IP核）。步骤四：设置IP核属性（处理器cpu属性需要选择复位存储器和异常存储器如图Reset vector Memory和Exception Vector Memory，通常复位存储器选择ROM，异常存储器选择RAM。因为RAM的读取速度比ROM快，系统处理异常情况如中断等就比较快）。步骤五：正确连接NIOS II系统AVALON总线(cpu模块的instruction_master是用于传输指令的AVALON总线，data_master是用于传输数据的AVALON总线。
2、存储器模块与cpu之间存在指令的传输和数据的传输，其他模块与cpu之间仅仅存在数据的传输)。步骤六：给IP核分配基地址和中断号IRQ。步骤七：此时可保存NIOS II系统生成.SOPC文件。步骤八：以上步骤操作正确可点击generate生成sopc builder工程名.qip文件（此处为mynios.qpf文件，QUARTUS II工程中需包含此文件），sopc builder工程名.sopcinfo（此处为mynios.sopcinfo文件，建立ecplise工程时需用到此文件，为与Qsys保持兼容），sopc builder工程名.ptf（此处为mynios.ptf文件，作用等同于myn
3、ios.sopcinfo文件，建立ecplise工程时需用到此文件），各个IP核的.vhd文件（sopc builder工程名.vhd文件通过元件例化语句调用这些文件），sopc builder工程名.vhd文件（此处为mynios.vhd，QUARTUS II工程顶层文件元件例化时用到），sopc builder工程名_inst.vhd（此处为mynios_inst.vhd，QUARTUS II工程顶层文件元件例化时用到）。其中sopc builder工程名.vhd（此处为mynios.vhd）文件包含各个IP核Avalon交换结构的vhdl函数等，sopc builder工程名_inst.vhd文件（此处为mynios_inst.vhd）为sopc builder工程名.vhd（此处为mynios.vhd）文件的元件例化示例。存储器名.hex文件（此处为data_ram.hex和program_rom.hex，用于初始化对应存储器）。总结：NIOS II微处理器系统是通过搭建NIOS II系统后产生.vhd文件再经过编译，引脚分配，最终下载到FPGA中形成硬件电路。其本质还是通过vhdl语言描硬件电路，只不过这些.vhd文件是通过搭建NIOS II系统后由系统自动生成的（除了用户自定义的IP核需要用户自己编写.vhd文件）。
