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1、Sample & Assay TechnologiesQIAGEN新一代测序解决方案2 QIAGEN新一代测序解决方案 01/2013目录QIAGEN 提供完整的NGS 工作流程 .3动植物基因组NGS前样本制备产品 .4微生物基因组NGS前样本制备产品 .6RNA NGS前样本制备产品 .7宏基因组NGS前样本制备产品 .8外显子测序/目标区域深度测序前样本制备产品 .9QIAxcel用于NGS建库快速检测应用 .10NGS结果后续验证平台.10QIAGEN新一代测序解决方案 01/2013 Sample & Assay Technologies 32012年QIAGEN里程碑事件 正式进
2、军NGS市场高通量测序技术堪称测序技术发展历程的一个里程碑,该技术可以对数百万个DNA分子进行同时测序。这使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全面的分析成为可能,因此也称其为深度测序或下一代测序(NGS)技术。为了更好的给NGS领域客户提供完善的样本制备产品,QIA GEN在2012年正式进军NGS,推出了一系列的NGS前样本制备新品,并将于2013年推出自己的NGS测序平台。 上述举措必将进一步促进NGS市场的繁荣。QIAGEN提供完整的NGS工作流程MagAttractHMW DNA Kit & MagAttract Magnetic RackREPLI-gSingle Cell Kit
3、 GeneRead DNA ChIP KitGeneRead rRNA Depletion KitGeneRead Bacteria DNA KitGeneRead DNAseq NGS Panel SystemGeneRead DNA Library Prep I/L/QGeneRead Library Quantification KitsGeneRead Size Selection KitPlatformReagentsBiological contentData analysisRT2PCR Arrays (RNA, SNP, mutations, CNV)Type-itCNV qP
4、CR Kits PyroMarkQuantiTect& QuantiFastKits & Rotor-GeneQSAMPLE TechnologiesNGS前样本处理 NEW ASSAY TechnologiesNGS平台 NEW NGS后续验证 4 QIAGEN新一代测序解决方案 01/2013动植物基因组NGS前样本制备产品动植物基因组NGS测序主要包括基因组重测序和de novo测序。重测序主要是指在已知物种基因组的情况下,对物种内的不同个体或某个个体的不同组织进行基因组重测序,可以在全基因组水平上发现不同个体或组织细胞之间的差异。通过这种方法,可以寻找出SNP,插入缺失位点,结构变异
5、位点SV,拷贝数变异CNV等变异信息,从而获得生物群体的遗传特征。基因组de novo测序也叫做基因组从头测序,是指不依赖于任何已知基因组序列信息对某个物种的基因组进行测序,然后应用生物信息学手段对测序序列进行拼接和组装,最终获得该物种基因组序列图谱。从基因组水平上对物种的生长、发育、进化、起源等重大问题进行研究,将加深我们对物种的认识,在新基因的发现、物种改良等方面发挥巨大作用。QIAampDNA系列,DNeasy系列特点:核酸纯化全球第一品牌;硅胶膜技术确保高质量gDNA;方便快捷的实验流程;支持低通量或96孔板高通量;针对不同样品类型的优化设计。MagAttract HMW DNA Ki
6、tNEW特点:快速纯化大分子量DNA(长至150Kb),直接用于NGS研究,适合多种样本。REPLI-g Single Cell KitNEW特点:尤其适合从单细胞/极低样本量中获得足量DNA;可靠的等温多重置换扩增MDA技术,扩增无偏差;Phi29酶保真度是普通Taq酶的1000倍;产物平均长度大于10 kb,产量大于40 g;独特的UV去污染过程,确保无任何残留DNA污染。新品即将推出动植物基因组NGS分析建库流程QIAGEN解决方案基因组DNA纯化(样本量太少/单细胞研究)全基因组扩增DNA片段化QIAGEN新一代测序解决方案 01/2013 Sample & Assay Technol
7、ogies 5GeneRead Library Prep KitsNEW特点:文库制备产品一管试剂完成全部反应,节约50%以上时间;宽广的DNA用量范围,可低至50 ng起始DNA;扩增步骤数据无偏移;支持Illumina, Ion Torrent等平台。QIAquick/MinEluteGel Extraction kitGeneRead Size Selection KitsNEW特点:可以在QIAcube上面进行自动化,有效去除文库中的残留接头二聚体和单体;先进的硅胶膜技术;高回收效率(90%)。QIAquick/MinElute PCR Purification kitGeneRead
8、 Library Quant SystemNEW特点:DNA文库定量;精确,灵敏,高通量;基于qPCR的文库DNA定量。末端补平、加接头 PCR扩增并纯化选取合适大小片段高通量测序及生物信息学分析6 QIAGEN新一代测序解决方案 01/2013QIAamp DNA系列, DNeasy系列QIAamp RNA Blood Mini kit,RNeasy系列,miRNeasy系列特点:核酸纯化全球第一品牌,硅胶膜技术确保高质量RNA/miRNA,通量灵活,适合多种样本类型。GeneRead Bacteria DNA Kit NEW特点:简单方便纯化细菌DNA;高效去除人DNA;高效去除抑制剂;
9、高回收效率。GeneRead rRNA Depletion kit NEW特点:去除各种类型的ribosomal RNA效率高达99.5%;高效保留其他类型RNA信息;适合人,大鼠,小鼠三个物种;高度适合RNA测序。REPLI-g Single Cell Kit NEWRNeasy系列,miRNeasy系列新品即将推出微生物基因组测序建库流程RNA测序 建库流程QIAGEN解决方案QIAGEN解决方案微生物基因组NGS前样本制备产品随着基因组研究的迅速发展,全基因组测序已逐步成为微生物基础研究的重要手段之一。对细菌基因组或真菌基因组的测序不仅可以为微生物特性的分析提供重要的依据,同时也必将加速
10、其重要的药用价值和食用价值的研究。RNA NGS前样本制备产品RNA测序主要包括转录组测序,小RNA测序及基因表达谱测序:转录组测序是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序,全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。目前Small RNA(miRNA , piwiRNA等)也是一大研究热点,Small RNA能够调控基因的表达,在细胞的生长、发育、代谢等基础生物学过程中扮演着重要的角色,甚至在癌症等相关疾病形成过程中起着关键的作用。利用NGS测序技术省去了烦琐的Small RNA克隆文库构建过程,快速鉴定Small RNA微生物DNA纯化RNA纯化去除细菌DNA中的
11、人DNA目标RNA富集DNA片段化(样本量少/单细胞研究)全基因组扩增RNA片段化与纯化QIAGEN新一代测序解决方案 01/2013 Sample & Assay Technologies 7新品即将推出Omniscript/SensiscriptReverse Transcriptase kitQuantiTect Reverse Transcription kit特点:独特的gDNA去除设计;反转录酶本身具有RNase H活性,无需额外消化步骤;耗时短。GeneRead Library Prep Kits NEWGeneRead Size Selection Kits NEW QIAqu
12、ick/MinElute Gel Extraction kitQIAquick/MinElute PCR Purification kitGeneRead Library Quant System NEWDNA片段化cDNA合成选取合适大小片段末端补平、加接头以下与DNA NGS相同PCR扩增并纯化高通量测序及生物信息学分析8 QIAGEN新一代测序解决方案 01/2013QIAamp Stool系列QIAamp DNA系列, DNeasy系列QIAamp DNA系列, DNeasy系列GeneRead Bacteria DNA KitNEWREPLI-g Single Cell Kit NEWREPLI-g Single Cell Kit NEWREPLI-g Single Cell KitNEW新品即将推出Target Enrichment Panels NEW新品即将推出宏基因组测序建库流程外显子测序建库流程目标区域深度测序QIAGEN解决方案QIAGEN解决方案QIAGEN解决方案宏基因组NGS前样本制备产品与传统的微生物个体研究相比,宏基因组学(Metagenomics)的研究手段是直接从环境样品中提取基因组DNA后进行测序分析。这种新的研究技术具有许多优势: 自然界中,有许多微生物是不能在实验室条件下进行培养繁殖的,宏基因组学研究不要求对微生