PubMed检索基础

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1、PUBMED反馈与加强 主要问题 v 没有应用到PUBMED的筛选的功能 也就是特征词 v 对于副主题词的作用不了解 v 未从detail转化情况来反思检索结果 v 未能理解主题标引的概念 v 欠缺思考 太敷衍 PUBMED基础与提高 基础 提高 1 2 MESH检索 主题词与副主题词 1 2 主题词与关键词的有效运用 2 PUBMED中医药内容的检索技巧 3检索之上的分析利器GoPubMed 过滤器 限定检索 特征词 特征词 v特征词的内涵及在检索的作用 由于临床医学 医学教育与科研人员经常需要并感 兴趣而设置的具有特殊意义的词组 形成族性限定 人类和动物 年龄组 性别 时代特征词 妊娠 出

2、版类型特征词 具体动物名称特征词 PUBMED2 请查找近3年发表的有关幼儿 6 12岁 哮喘的随机对照 试验的文献 要求哮喘出现在题名中 下载两篇以文摘格式保存 v 字段限定的功能 高级检索或字段限定 TI v PUBMED过滤器的功能 年龄 6 12 出版时间 近3年 文献类型 随机对照试验 v 文摘下载方式 Mesh在检索中的重要作用 v 准确性 准确揭示文献内容的主题 更进一步选择主要主题词 MAJR 即以其为核心内容 进一步缩小检索范 围 提高查准率 v 专指性 主题词与副主题组配检索 使检索结果更专指 副主题 对主题词起限定作用 两者组配 缩小检索范围 Mesh 83个副主题词 副

3、主题词中英文对照参见FMJS 见教材附录一P212 主题词选择策略 vMesh试查 查看转化情况 v应用FMJS与万方医学网辅助翻译 v选用专业的医学词典 v甚至是查看文献中的专业术语的翻译 vMesh的树状结构如针灸的选词 PUBMED 3 请查找放射疗法对非小细胞肺癌生活质量影响的相关文献 选择2篇下载文摘 并尝试获取一篇免费综述性全文以截图的方式呈现 1 检索词的提取 2 采用主题词 副主题词组配的方式 比较 Carcinoma Non Small Cell Lung radiotherapy Mesh Carcinoma Non Small Cell Lung AND radiothe

4、rapy 2 PUBMED过滤器的功能 文献类型 综述性文献 免费全文 非小细胞肺癌 放射疗法 脑癌 放射疗法 非小细胞肺癌 化学疗法 非小细胞肺癌 遗传学 获取全文的途径 v1 全文数据库 v2 文献传递 FMJS 读秀 FULINK 万方医学网 v3 论坛 向作者索取 主题词与关键词的有效运用 v 不是每个词都有对应的主题词 v 没有主题标引的文献不可以用主题词检索 如何识别主题标引的文献 策略 根据实际需求选择 最好的是使用主题词与关键词相结合 1 已有对应主题词先进行MESH检索 确定该检索词的主题词 进而通过Entry Terms确定同义词 拓展检索词 再以主题词 结合同义词查找 2

5、 没有对应主题词时可以想到检索词相关的上位词是否有对应 的主题词或者直接用关键词 最好用专业词典进行翻译 PUBMED中医药内容的检索技巧 v 1 中医词汇首选对应的Mesh词 注重Mesh词与自由词结合 并配合自由 词的不同拼写方法 推拿 气功 v 2 中药名称首选药材拉丁名配合英文名与汉语拼音 同时需要注意中药的 上位概念如Drug Chinese Herbal Plant Roots v 3 方剂检索一般用方名的汉语拼音 但必需注意使用拉丁字母拼写的方名 日韩 其中甚至有些拉丁字母拼写的方名已为Mesh词 v 4 疾病的中医疗法 采用疾病主题词与对应的中医药疗法的主题词如 Drug Ch

6、inese Herbal Plant Roots Medicine Chinese Traditional chinese herbal 实验研究与临床研究分别应用中药与药理作用 治疗应用 结合进行检索 Pubmed5 检索PUBMED中有关四逆汤的文献 请写出你所用的检索词 v PUBMED中医药文献检索的注意事项 方剂检索一般用方名的汉语拼音 但需注意一些翻译问题及拼写不同 中医药的概念部分在增补概念 Supplementary Concept 中 也有类似主题 词的聚类功能 检索中应有效运用 v sini tang Supplementary Concept OR sini tang A

7、ll Fields sini tang OR sini decoction v检索式 sini tang Supplementary Concept OR sini tang All Fields OR sini decoction All Fields OR sini tang Supplementary Concept OR sini tang All Fields v si ni tang vsinitang 日韩的汉方研究 复方常以拉丁字母拼写 并且进入PUBMED的时间都较早 研究 方法值得借鉴 实例 分析检索词与检索技巧 v1 有一位老师已查了外文数据库中有关国外研 究四逆汤的文献

8、 但由于没有日本的医学数据库 想查找一些日本国内研究四逆汤的信息做研究 内容的补充 请问应该如何检索 v2 在此基础上想要尝试能不能有一些PDF的文 献做为参考支撑 如何实现 Google与百度的搜索技巧 1 逻辑运算符 逻辑与 空格 逻辑非 用 表示 号前必须有空格 逻辑或 用大写 OR OR的前面必须有空格 Google 用 表示 百度 2 site 域名 表示搜索结果局限于某个具体网站或 一类网站 注 冒号后不能有空格 域名不能有http 用途 搜索国家 政府 组织 学校的信息 搜索死链接网站 替代站内搜索 搜索受限的网站 例 site site site jp site org sit

9、e gov 3 intile 表示把搜索范围限定在网页标题中 例 intile 肝炎 4 filetype 表示限定查找文件类型 例 filetype pdf 常用的文件类型 DOC XLS PPT PDF RTF 5 双引号 表示精确搜索 例 搜索糖尿病饮食治疗 如果不加双引号 搜索结果被拆分 效果不 是很好 但加上双引号后 糖尿病饮食治疗 获得的结果就全是符 合要求的了 部分功能可以通过搜索引擎的高级搜索来实现 v Science Links Japan 日本科技门户类网站 将 日本各类科学技术在线信息源收集后予以分类 并用英语向日本国外进行介绍的综合性网页 主 要目的是向日本国外的科研人

10、员 科技政策研究 人员等提供便利的日本科技信息 v Asia Science and Technology Portal 亚洲科学技 术门户网站 v Asia Science and Technology Portal ASTP provides you with a comprehensive single access point to information on useful science and technology related websites in ASEAN countries as well as Australia China India Japan New Zeal

11、and and the Republic of Korea 传统医疗与制药的数据库 英文版 医科大学的汉方医学中心 参考文献 1 宋一伦 杨学智 吕晓燕 等 PubMed MEDLINE数据库英 文中医药信息检索方法的探讨 J 中国中西医结合杂志 2006 26 7 651 654 2 林丹红 利用 M edline 检索中医药论文的方法与局限性分 析 术 J 医学信息学杂志 2009 30 7 3 林丹红著 中西医学文献信息获取与利用 M 北京市 中国 中医药出版社 2010 检索之上的分析利器 GoPubMed 由德国Transinsight公司和德累斯顿大学合作研 发的 基于PubMed

12、的文献资源的文本挖掘与分析 http www gopubmed org web gopubmed 数据与PubMed同步 语义检索 深度应用 无高级检索需在PubMed构建完检索策略再进行分析 GoPubMed 生物医学概念与语义关系 GO 基因本体 Mesh医学主题词表 多维度分析与挖掘 可视化 PRO蛋白质本体 PubMed 可视化 4W Bread PPT 4W what whowhere when 可视化 从出版年限 国家 城市 期刊 主题 作者 发文趋势 作者网络等方面分析检索结果的 学科领域的总体概况 初步了解学科领域研究热点 涉及的主要研究方向 主要作者 机构 合作网络 学科领域

13、主要期刊资源 GoPubMed 案例分析 分析痛风研究的研究进展 从出版年限 国家 城市 期刊 主题 作者 发文趋势 作者网 络等方面实现检索结果的可视化 高频词统计了解研究热点 找寻最新文献 了解研究进展 了解研究区域分 布 参考投稿方 向 主题与作者分析 发现热点 重 要作者 寻求合 作或锁定跟踪对 象 课题发展态势 主要研究人员研究关 系网络 线条越多 线形越多 地位越重 要 v GoPubMed 对高频的GO 和MeSH 词进行统计分析 反映出该领域的 研究热点 高频词 研究领域子类 新近展 GoPubMed FMJS vGoPubMed FMJS 更直观 更细仔的分析内容 医学统计平台 思考题 v对比GoPubMed与SCI分析功能的异同及各自的 优势

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