《整合分析甘蓝型油菜中控制种子含油量变异的数量性状位点(1)(1)》由会员分享,可在线阅读,更多相关《整合分析甘蓝型油菜中控制种子含油量变异的数量性状位点(1)(1)(146页珍藏版)》请在金锄头文库上搜索。
1、O i lC o n t e n tV a r i a t i o ni nS e e d so f B r a s s i c an a p u s 博士研究生: 指导教师: 指导小组: 专业:发育生物学 获得学位名称:理学博士 蒋枞璁 孟金陵教授 孟金陵教授 徐芳森教授 赵建伟副教授 张椿雨副教授 研究方向:油菜数量遗传学 获得学位时间: 华中农业大学植物科学技术学院 二。一O 年十二月 华中农业大学学位论文独创性声明及使用授权书 l I I IIIII I I II I I I I I I IIIl Y 2 0 0 4 6 4 5 学位论文 如需保密,解密时间 年月日 楚否保密卺 独创性
2、声明 本人声明所里交的论文是我个人在导师指导下避行的研究工作及取得的研究成 果。尽我所知,除了文中特别加l ;之标注和致谢的地方外,论文中不包含其他入已经发 表或撰写过的研究成果,也不包含为获得华中农韭大学或其他教育机构的学位或证书 面使用过的材料,指导教师对此进行了审定与我一圃工作的同志对本研究所做的任 何贡献均已在论文中做了明确的说明,并表示了谢意 研究生签名:蔫私姆憩 峙阀:劬膨年胆月 日 学位论文使用授权书 本人完全了解华中农业大学关于保存使用学位论文的规定,印学生必须按照学 校要求提交学位论文的印刷本和电子版本:学校有权保存提交论文的印刷版和电子版, 并提供目录检索和阕览服务,可以采
3、用影印。缩印或扫描等复制手段保存,汇编学位 论文本人网意华中农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全 注:保密学位论文( 印涉及技术秘密、商业秘密或申请专利等潜在需要提交保密的论 黼鲐蔫檩名:淄 签名日期:鼬,o 年,2 月日签名日期:2 o t o 年亿月日 注:请将本表点接装订在学位论文的扉页和目彖之问 整合分析甘蓝型油菜中控制种子含油量变异的数量性状位点 目录 摘| 要I A b s t r a c t I I I 缩略词表 l 前言1 1 1 植物数量性状位点( Q T L ) 的遗传定位:1 1 1 1 植物数量性状的研究历史1 1 1 2 植物Q T L 在基因组上
4、的遗传定位2 1 1 3 植物O T L 研究的新动向4 1 2 油料作物种子含油量的变异6 1 2 1 一些重要油料作物种子油份的含量与特征6 1 2 2 种子油脂的合成与积累6 1 2 3 种子油脂与其它贮存物的相互关系8 1 3 甘蓝型油菜种子含油量相关遗传位点的研究情况一9 1 3 1 对个别位点的遗传改良操作9 1 3 2 全基因组水平分析种子含油量相关基因的定位或表达l O 1 4 本研究的目的和意义1 1 1 4 1 研究目的1 1 1 4 2 研究意义1 2 2 材料与方法1 3 2 1 甘蓝型油菜T N 遗传群体的种植与考察1 3 2 1 1T N 遗传群体的构成1 3 2
5、1 2 田间试验与含油量考察1 3 2 1 3T N 遗传群体在各个独立试验中种子发育期的记录和相应气象条件的获得1 5 2 2 甘蓝型油菜S G 遗传群体的种植与考察1 6 2 2 1S G 遗传群体的来源:1 6 2 2 2 田间试验与含油量考察1 6 2 3 田间试验的数据统计分析1 7 2 3 1 各独立试验基本的描述性统计分析1 7 2 3 2 “主花序沿成熟过程自下而上分节段收获”试验中基因型差异与表型变异类型的 相关性分析l 7 2 4 分子标记定位,加密基于T ND H 群体的遗传图谱1 8 2 4 1 在T N 遗传图谱上定位芸苔属公共资源中的S S R 标记1 8 2 4
6、2 在T N 遗传图谱上定位种子油脂代谢相关基因的S T S 标记1 8 2 4 3 新标记在T N 遗传图谱上的定位与新遗传图谱的绘制1 9 2 4 4T N 遗传图谱与拟南芥基因组的同源比对1 9 2 5 检测各个独立试验中与种子含油量变异相关的遗传位点2 l 2 5 1 各个独立试验中种子含油量变异相关的Q T L 定位2 l 2 5 2 各个独立试验中种子含油量变异相关的上位性互作位点分析2 l 2 6 整合T N 遗传群体在不同试验中检测到的重叠的Q T L 区间2 2 2 7 将其它遗传群体中定位的种子含油量相关的Q T L 映射至T N 遗传图谱上2 3 2 8 在甘蓝型油菜栽培
7、品种和育种中间材料中进行种子含油量相关遗传位点的关联分析 一2 5 2 8 1 关联分析中考察的品系材料2 5 2 8 2 田间试验,调查品系材料的种子含油量变异2 5 华中农业大学2 0 1 0 届博士研究生学位论文 2 8 3 表型变异与标记基因型的关联分析2 5 3 结果与分析2 7 3 1 甘蓝型油菜T N 遗传群体内种子含油量的变异2 7 3 1 1T N 遗传群体的两个亲本株系在不同环境下的种子含油量2 7 3 1 2 各独立试验中T N 遗传群体内的种子含油量变异2 8 3 1 3 对T N 遗传群体种子含油量变异的方差分析。2 9 3 2 甘蓝型油菜S G 遗传群体内种子含油量
8、的变异2 9 3 2 1S G 遗传群体两亲本株系的种子含油量2 9 3 2 2 各独立试验中S G 遗传群体内的种子含油量变异。3 0 3 2 3 对S G 遗传群体种子含油量变异的方差分析3 0 3 3 “主花序沿成熟过程自下而上分节段收获”试验中种子含油量的变异。3 1 3 3 1 在主花序各节段上,T N 遗传群体内种子含油量变异的分布3 1 3 3 2 在相邻节段间,T N 遗传群体各株系的种子含油量的变异形式3 2 3 4 增加分子标记后的新版本T N 遗传图谱3 3 3 5T N 遗传群体在各个独立试验中与种子含油量相关的遗传位点3 4 3 5 1 各独立试验中检测到的种子含油量
9、相关Q T L 3 4 3 5 2 各独立试验中检测到的种子含油量相关互作位点3 7 3 5 3 “主花序沿成熟过程自下而上分节段收获”试验中与相邻节段间表型变异类型相 关的遗传位点4 0 3 6 T N 遗传群体在不同试验中重叠的Q T L 区间的整合4 1 3 7T N 遗传群体元Q T L ( M e t a - Q T L ) 的环境特异性4 5 3 7 1T N 遗传群体在各独立试验中的种子发育期与经历的环境条件4 5 3 7 2T N 遗传群体中元Q T L 的环境特异性4 7 3 8 不同遗传群体间Q T L 定位结果的比较。4 9 3 8 1 已发表的其它三个遗传群体中种子含油
10、量相关Q T L 的基本情况4 9 3 8 2 其它遗传群体的Q T L 映射到T N 遗传图谱上的位置5 0 3 8 3T N 遗传群体与其它遗传群体O T L 定位结果的比较6 9 3 9 通过关联分析定位的种子含油量相关遗传位点及其与遗传群体中Q T L 定位结果的比 较7 0 3 9 1 用于关联分析的品系材料中种子含油量的变异7 0 3 9 2 与品系材料中种子含油量变异相关的遗传位点7 l 3 9 3 关联位点对应在1 N 图谱上的定位以及与Q T L 定位结果的比较7 3 4 讨论7 4 4 1 以不同环境条件的多 4 2Q T L 效应大小的相对 4 3 甘蓝型油菜种子含油 4
11、 4Q T L 整合分析与数量 参考文献 附 整合分析甘蓝型油菜中控制种子含油量变异的数量性状位点 摘要 甘蓝型油菜( B r a s s i c a n a p u s L ) 是世界范围内四大油料作物之一,其菜籽产油除 了满足日常食用所需,也可以被加工成工业用油;随着不可再生的原油资源日益告急, 提高植物油的产量和品质对国计民生有着重大的战略意义。在过去的数十年间,甘蓝 型油菜的菜籽单产量得到了翻番,菜籽油的脂肪酸含量比例可以实现满足不同用途的 优化,但是菜籽的含油量提升幅度较小。由于种子含油量是一个典型的数量性状,因 此通过数量性状位点遗传定位( Q T Lm a p p i n g ) 的方法来发掘其调控位点、研究其变 异的机理、并应用于育种改良,是切实可行的策略。之前已有许多关于甘蓝型油菜种 子含油量Q T L 的定位研究,但是其中存在一些问题,以致这些研究结果对育种改良实 践的促进效果并不明显,如,单项研究中定位得到的Q T L 数目非常有限、不超过2 0 个,单个Q T L 对表型变异的贡献率大多不超过1 0 ,