利用bp数据库有效挖掘生命科学信息

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1、综合性生命科学信息数据库综合性生命科学信息数据库 BIOSIS Previews BIOSIS Previews 在科学研究中的作用与价值在科学研究中的作用与价值 张张 辉辉 汤森路透科技与医疗集团汤森路透科技与医疗集团 BIOSIS Previews 生物学家不可缺少的科研工具 如何快速检索宏观课题:水产养殖、中国林业? 如何精准检索某类生物体的相关文献:蔷薇科植物杀虫剂? 如何多角度分析课题研究趋势把握全局? 如何参考本课题相关的仪器方法文献? 如何对课题进行新进展跟踪:定题跟踪服务? 问题解答 提 纲 生命科学和生物医学研究领域的综合资源,来源于期刊、会 议、专利和书籍。 覆盖来自生命科

2、学领域的近6000种期刊、1500多个国际会 议,以及与生命科学研究相关的美国专利 由原美国生物学文摘生命科学信息服务社(现隶属于 Thomson Scientific)编辑出版 Biological Abstracts与Biological Abstracts/RRM (Reports, Reviews, Meetings)整合在一起的互联网版本 内容来源于90多个国家,涵盖了自1926年以来的近1800万 条记录,数据每周更新,每周更新条目1万多条,每年增录 560,000多条记录。 BIOSIS Previews简介 BIOSIS Previews学科范围 传统生物学: 如:分子生物学、

3、植物学、生态与环境科学、微生物学 、医学、药理学、动物学 交叉学科: 如:农业、生物化学、生物医学、生物技术、实验医学 、临床医学、兽医学、遗传学、营养学、药物学、公共 卫生 相关领域: 如:仪器、实验方法等 BIOSIS Previews 传统生物学 应用动物学 生物医学 生物技术 微生物学 行为学与 生态科学 淡水/海水水产业 动物控制 野生生物管理 昆虫经济学 人类流行病 兽类流行病 传染病学 寄生虫病学 生物制药 生物化学 细胞生物学 分子遗传学 生物物理学 生物通讯 生物种群密度 环境污染与保护 园艺学 森林学 土壤科学 Proteomics、药物反应遗传学 遗传作物育种、信号传导、

4、纳米技术 Phytomedicine、Microarray Technology 生物信息学、基因治疗 神经科学 免疫学 生殖学 发育学 营养学 细菌学 病毒学 生理学 农业与植物学 分子生物学 ISI products are registered trademarks and service marks used under license BIOSIS Previews: 关联性标引 BIOSIS 在文献标引过程中采用独有的标引方法 , 称为关联性标引 (Relational Indexing) 其特色在于能够标引出每一个检索字段和控制字汇 之间的关联性。这个标引系统使研究人员能快速而

5、准确地找到数据。 关键词 同义词 描述词 上级分类 关联性标引 Coronavirus Positive Sense ssRNA Viruses pathogen; strain-TOR2 Coronaviridae 03613 关联性标引 示例:示例:CoronavirusCoronavirus 冠状病毒冠状病毒 在BIOSIS Previews全记录中有关 Coronavirus的标引 全记录页面关联性标引 检索词 turkey ? ? 根据词语在上、下文中的明确含义,将关键词提取并且 分门别类归入到如下大类: BIOSIS Previews Relational Indexing (关联

6、性索引) 生物体 疾病名称 化学物质 基因名称 序列 地理区划 地质年代 实验方法与仪器 细胞器/器官/系统 其他 例2:Sudan 苏丹红(化学物质概念) 苏丹 (非洲国家/地理概念) 例1:Turkey 火鸡(生物体概念) 土耳其(地理概念) 例3:Cancer 肿瘤(疾病概念) 甲壳类动物(生物体概念 ) 所有数据库 主题 标题 作者 出版物名称 出版年 地址 个检索字段 主题 标题 作者 出版物名称 地址 出版年 分类数据 主概念 概念代码 化学和生化名称 会议信息 识别码 语种 出版类型 文献类型 分类注释 检索时段限制 帮助文档随时随地查询字段含义 BP中的检索字段(常规检索字段)

7、 作者名: zhang jing 期刊名: Environmental Pollution 主题词:aspirin same antithrombotic 例:查找有关阿斯匹林抗血栓形成的文献 地址:266003 常规字段的检索 作者: 作者的检索方式是姓在前,名或明的缩写在后 出版物名称: 可以用出版物全名,也可以用截词符* ,还可以从出版物列表中选择。如果检索一本书, 可以通过主题和出版物两种途径检索 地址:包括作者、编者、发明者地址。由于地址的 多种写法,可以使用截词符“* ”以简化检索。常用的 地址词用截词的方式表达,通常使用“SAME”算符连 接同一地址中出现的多个地址词 BP中的检

8、索字段(专业检索字段) BIOSIS Previews 生物学家不可缺少的科研工具 如何快速检索宏观课题:中国林业、水产养殖? 如何精准检索某类生物体的相关文献:蔷薇科植物杀虫剂? 如何多角度分析课题研究趋势把握全局? 如何参考本课题相关的仪器方法文献? 如何对课题进行新进展跟踪:定题跟踪服务? 问题解答 提 纲 主要概念 同BA相同,Biosis Previews有168个主要概念词 主要概念通过主题方式来类聚文献 主要概念是涉及生命和生物科学领域的相关词汇 点击放大镜图标可以浏览主概念的列表。列表中分 为两种格式:字顺列表和按照概念的层级排列。通 过拷贝粘贴将主概念检索词添加到检索框中。检

9、索 框中不同的检索术语用逻辑算符“OR”连接。 例: 检索有关中国林业和林学方面相关文献 China 主要概念 在辅助索引中输入检索词forest* 例: 检索有关中国林业和林学方面相关文献 检索结果列表 例: 检索水产养殖方面的相关研究 输入检索词 主要概念 在辅助索引中输入检索词aquacu* 举例: 检索有关水产养殖的相关研究 BIOSIS Previews 生物学家不可缺少的科研工具 如何快速检索宏观课题:中国林业、水产养殖? 如何精准检索某类生物体的相关文献:蔷薇科植物杀虫剂? 如何多角度分析课题研究趋势把握全局? 如何参考本课题相关的仪器方法文献? 如何对课题进行新进展跟踪:定题跟

10、踪服务? 问题解答 提 纲 分类数据(上位生物分类生物系统名称) 采用自然主题分类法,按照生物界的自然分类系统 分类。全部生物体按照类、门、纲、目、科、属、 种的顺序排列。大类分为微生物、植物、古生物、 动物,每大类分为四级类目(门、纲、目、科) 使用任一生物体的科以上类目,都可以查出与该生 物相关的文献 生物系统学代码/名称是一个五位的代码,代表种级 别以上的分类组。点击list连接可以看到生物系统 学代码 概念代码 概念代码是一个五位数的编码,代表生命科学中的 广泛的学科领域,每一个编码对应着一个学科名称 。点击相应的链接可以看到概念代码和相应的名称 。 概念代码与名称用于标引自1993目

11、前年的 BIOSIS的纪录。 共计571个五位的概念代码代表了生命科学的大类 。 检索代码和名称结果相同。 一组相关的概念代码放在上一级主题下。 例如:toxicology的概念代码为22501-22508,可 通过通配符*检索225*而获得。 例: 检索有关蔷薇科植物杀虫剂的研究 输入检索词 概念代码 在辅助索引中输入检索词Insectic* 例: 检索有关蔷薇科植物杀虫剂的研究 输入检索词 分类数据 BIOSIS Previews关于蔷薇科植物杀虫剂的文献 BIOSIS Previews具有精炼和分析检索结果功能 化学和生化名称 可使用化合物基因名序列名或者化学物质登记号进行检索 利用化合

12、物基因名序列名或 者化学物质登记号进行检索 例: 检索有关苏丹红的研究文献 Sudan red OR Sudan I BIOSIS Previews 生物学家不可缺少的科研工具 如何快速检索宏观课题:中国林业? 如何精准检索某类生物体的相关文献:蔷薇科植物杀虫剂? 如何多角度分析课题研究趋势把握全局? 如何参考本课题相关的仪器方法文献? 如何对课题进行新进展跟踪:定题跟踪服务? 问题解答 提 纲 谁能读这么多? 谁需要读这么多? 发现与创新是不是一个数字的游戏? “首先必需认识到,科研工作者都十分宝贵自己的时间,除极少数和自己工作关系十 分密切的论文以外,绝大多数读者都不会阅读全文。” - 邹

13、承鲁 “我的科学之路”,2003年10月 为什么我们需要分析工具? 例: 检索转基因农作物相关文献 主要概念 转基因农作物相关文献列表 11个角度深入分析 出版年 概念代码 主要概念 Super Taxa 语种 学科类别 来源出版物 文献类型 出版物类型 作者 专利权人 文献发表按年代分布(保存文件后Excel打开作图 ) 发表文献的主要类型 文献涉及的主要学科类别 涉及的研究角度 研究主要涉及的生物体 发表文献最多的作者 发表论文的首选出版物 BIOSIS Previews 生物学家不可缺少的科研工具 如何快速检索宏观课题:水产养殖、中国林业? 如何精准检索某类生物体的相关文献:蔷薇科植物杀

14、虫剂? 如何多角度分析课题研究趋势把握全局? 如何参考本课题相关的仪器方法文献? 如何对课题进行新进展跟踪:定题跟踪服务? 问题解答 提 纲 高级检索 举例:检索有关小龙虾白斑病的文献 在任意字段进行自由检索 TA=(Crayfish or crawdads)and host) and TA=(white spot* or wssv) and pathogen) 检索结果:有关小龙虾白斑病的文献 TA=(Crayfish or crawdads)and host) and TA=(white spot* or wssv) and pathogen) and MQ=spectrophotomet

15、ry 高级检索 举例:检索有关小龙虾白斑病的研究,并且在实验 中应用了分光光度法的文献,HQ字段进行限制 BIOSIS Previews 生物学家不可缺少的科研工具 如何快速检索宏观课题:水产养殖、中国林业? 如何精准检索某类生物体的相关文献:蔷薇科植物杀虫剂? 如何多角度分析课题研究趋势把握全局? 如何参考本课题相关的仪器方法文献? 如何对课题进行新进展跟踪:定题跟踪服务? 问题解答 提 纲 免费注册,登录后可以使用个性化服务 创建定题服务,随时跟踪课题最新进展 可以保存检索历史在服务器或本地计算机上 可以订制定题服务 定期检索相关课题,并把最新结果发送到指定的邮箱中 有效期半年,到时间后可以续订 支持RSS Feed BIOSIS Previews 生物学家不可缺少的科研工具 如何快速检索宏观课题:水产养殖、中国林业? 如何精准检索某类生物体的相关文献:蔷薇科植物杀虫剂? 如何多角度分析课题研究趋势把握全局? 如何参考本课题相关的仪器方法文献? 如何对课题进行新进展跟踪:定题跟踪服务? 问题解答 提 纲 布尔逻辑算符 检检索包含所有关键键字的数据。 标题标题 : “stem cell*” AND lymphoma 检

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