dna多态性分型技术2013:.ppt

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1、虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 第三节 DNA多态性分型技术 四川大学华西公共卫生学院 汪川 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 什么是DNA多态性? 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和

2、慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 多态性(polymorphism)是指在一个生物 群体中,同时和经常存在两种或多种不连续 的变异型或基因型或等位基因,亦称遗传多 态性(genetic polymorphism)或基因多态 性。 从本质上来讲,多态性的产生在于基因水平 上的变异,一般发生在基因序列中不编码蛋 白的区域和没有重要调节功能的区域。 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如

3、吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 DNA多态性对微生物有哪些实际意义? 将导致 不同的细菌亚型 耐药菌株出现 毒力变异株出现 抗原漂移与抗原变异 。 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 在疾病预防控制中的应用 同源性追踪 细菌分型 传染控制 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病

4、危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 DNA多态性分析常用的方法 限制性片段长度多态性分析 随机扩增多态性DNA分析技术 细菌基因组重复序列PCR技术 扩增片段长度多态性分析技术(自学要考 ) 脉冲场凝胶电泳 。 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 一、限制性片段长度多态性分析 restriction fragment length polymorphism, R

5、FLP 以DNA-DNA杂交为基础的第一代遗传 标记,是限制性内切酶、核酸电泳、印迹技 术、探针-杂交技术的综合应用 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 每种生物基因型具有其独特的特征,及独特的限 制酶识别序列分布,其基因组DNA在限制性内切 酶作用下,产生相当多的大小不等片段,这些片 段经电泳以后几乎是连续排列的,如用放射性同 位素标记的DNA作探针,将与被标记的DNA相 关的片段检测出来,即可构建出多态性图谱

6、。 基 本 原 理 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 因此,RFLP即是基于限制性核酸内切酶 酶切消化核酸及标记的DNA探针能与任 何序列相似的片段杂交,通过片段长度 变异性来检测生物体多态性。 基 本 原 理 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍

7、未得到有效控制。 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 基本 方法 提取基因组DNA 制性内切酶酶切 琼脂糖凝胶电泳 DNA变性、转膜、固定 核酸杂交 显影、显色、分析 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 限制性内切酶 (restri

8、ction endonuclease, RE) 一类能识别环状或线性双链DNA特定 核苷酸序列的DNA水解酶,在合适反应条 件下,使每条链的一个磷酸二酯键断开 ,产生多种可测量的寡核苷酸片段的酶 。 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 内切酶的命名规则 前三个字母代表其来源的细菌种名,用 斜体字母,第四个字母代表菌株名称, 如果同一株菌有不同限制性内切酶系统 ,则不同的内切酶系用罗马数字区分。 例:EcoRI代表

9、该酶来源于E. coli 的R菌株。 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 琼脂糖凝胶电泳槽和电泳仪 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 转移电泳槽 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸

10、系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 核酸分子杂交的概念及原理 核酸杂交: 两个不同来源的、含有互补核苷酸顺序 的单股核酸分子,通过碱基配对形成一 个新的、稳定的双股分子的过程。 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带

11、来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 核酸经加热变性后,在低于变性温度 20 30时,反应系统中加入的核酸探针 与待测核酸样品中具有互补序列的单链DNA 或RNA形成双链结构,通过检测标记信号即 可检测特定的核苷酸片段。 核酸分子杂交技术原理 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 根据探针上的标记,可用放射自显影 或加入酶底物显色的方式

12、观察结果。 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 优点 1可靠性较高 2来源于自然变异 3标记覆盖面广 优 缺 点 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 缺点: 检测步骤多,周期长; 对DNA需求量大,一般需要5l0g ,纯度要求较高;

13、 技术复杂,操作繁琐,工作量大; 具有放射性的危害; 检测成本高。 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 讨论: RFLP与脉冲场凝胶电泳都是根据 基因组上的限制性内切酶位点的 多态性来对生物进行基因分型的 ,那么它们两者的异同点有哪些 呢? 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和

14、膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 基于上述RFLP的缺点,一种更好的 分析技术聚合酶链反应-限制性 片段长度多态性分析技术 (PCR- RFLP )应运而生。 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 结合PCR技术与RFLP技术的优点,其基本原 理是对目的基因片段PCR扩增后,利用多种限 制性内切酶,对扩增产物进行酶切,不同基因 序列,不同限制性内切酶酶切扩增产物,在电 泳后可产生不同电泳图谱,通过对电泳

15、图谱的 分析,得出基因多态性结果。 思考:需要和探针做核酸杂交吗?为什么? 基本原理 根据名称: PCR-RFLP猜想本方法的原理? 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 1. 提取DNA 2. 设计特异引物进行目的基因PCR反应 3. 将DNA扩增产物选用合适限制性内切酶酶 切 4. 将酶切出来的具各种长度的DNA片段在琼 脂糖凝胶上电泳分离 5. 对显示出来的带谱进行分析。 基 本 程 序 根据基本原理思考基本

16、程序? 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 优 缺 点 优点: 敏感性高。 操作简便省时。 缺点: 影响因素较多。 不能完全区分基因非常相似,甚至只有一 个核苷酸差异的生物类型。 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健康生活方式仍未得到有效控制。 RFLP与PCR-RFLP的应用 1.结核分枝杆菌IS6110-RFLP分 析 2.厌氧菌16SrRNA基因PCR- RFLP分析 3.其他 虽然我国人民的健康水平显著提高,但依然面临着心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病和慢性呼吸系统疾病等慢性病带来的挑战。那些可防可控的慢性病危险因素,如吸烟、过量饮酒、身体活动不足和膳食不合理等不健

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