《sequin软件序列提交》由会员分享，可在线阅读，更多相关《sequin软件序列提交（19页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、Genebank序列提交,leolvcxm99L,序列提交,序列提交目的是为了获得Genebank登录号，一般的文章都需要并且非常重要。序列提交首先要使用软件sequin进行编辑。其次将编辑好的序列用邮件发送至Genebank编辑邮箱，一星期左右就会得到序列登录号。,序列编辑,首先将确定分类的序列进行编辑，可以将同类（同门）菌株放入同一个文件夹。格式：建立一个*.TXT的文档，里面键入的格式如图。,B1-14 organism=Uncultured bacteriumclone=B1-14,isolation_source=glaicer foreland soilcountry=China,
2、序列另起一行顶格输入,此处如果是纯培养菌株就写strain=B1-14,此处一定要写，否则编辑会专门发邮件向你要这些信息。,Uncultured bacterium clone B1-14 ammonia monooxygenase subunit A (amoA) gene, partial cds. 此处信息根据你的基因类型可以参考BLAST里面信息写,Sequin序列编辑,选择所提交的数据库,开始提交,输入一个名字，名字可以是你未来要发表文章的名字或者也可以填写Direct submission。,输入名字，邮件电话等，此步很重要！,也可以根据自己的序列情况来选择，对于绝大多数搞环境微生
3、物的基本是用免培养法做的那么直接就选择Uncultured samples这一项也可以,选择这个项出现的就是本PPT第12页的内容.注：12页之后的内容是老版本的操作方法都可以使用,这是选择Uncultured sample项出现的内容,选择导入核酸序列，这个就是本PPT第4页说述格式。之后选择右上角的测序方法，选择相应的方法（如一般测序就是sanger,高通量有454，等）就OK了。点击NEXT,这里你可以根据自己需要自由选择。,无需选择，直接点击NEXT。,勾选相应的你使用的引物类型，之后点击NEXT。,一般功能基因都是CDS，核糖体基因rRNA, 或者ITS，视自己情况选择。,填写编码基因的名字。注：本人做的是功能基因所以是编码蛋白的所以选择的是CDS 后出现的界面,如果基因前后端都不完整就选择这两项,填写好后点击NEXT后出现这个界面选择第一个项目用来查看你提交的序列有无问题。,之后出现这个界面，具体操作参考本PPT 第15页之后内容。,若每次只提交一个序列可以选择这个选项,此处为批量提交,此处导入序列,此处可以忽略,此处必须进行修订，双击点击进行修订,出现错误基本是此处缺失序列的具体分类信息，点击lineage,添加完分类信息后点击此处,若无任何问题按上述地址发邮件,谢 谢祝各位提交顺利,
