rna含量的测定—紫外吸收法

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1、RNA含量的测定紫外吸收法一、目的1、掌握利用紫外吸光法测定RNA含量的原理和方法2、了解紫外分光光度计的使用原理。二、原理核酸、核苷酸及其衍生物的分子结构中的嘌呤、嘧啶碱基具有共轭双健系统(CC一CC 一),能够强烈吸收250280nm 波长的紫外光。核酸(DNA,RNA)的最大紫外吸收值在260nm 处。遵照Lambert-Beer 定律,可以从紫外光吸收值的变化来测定核酸物质的含量。在不同pH 溶液中嘌呤、嘧啶碱基互变异构的情况不同,紫外吸收光也随之表现出明显的差异,它们的摩尔消光系数也随之不同。所以,在测定核酸物质时均应在固定的pH溶液中进行。三、材料1、干酵母粉(市售)。2、0.2氢

2、氧化钠溶液,2gNaoH溶于蒸馏水并稀释至1000ml。3、标准RNA溶液:100g/mL。4、95%酸性乙醇和无水乙醇。5、分析天平6、紫外分光光度计7、离心机和离心管8、烧杯(10mL) 锥形瓶和玻璃棒9、容量瓶(100mL)10、移液管(5mL)和移液枪11、试管和试管架。四、操作1、RNA的提取置4g干酵母粉于 200ml锥形瓶中,加入0.2%NaOH溶液40ml,沸水浴加热30分钟,经常搅拌,后流水冷却,4000r/min,离心15分钟,留上清夜加入95%酸性乙醇40mL,边加边搅拌,后静置5-10分钟,再4000r/min离心5分钟,保留沉淀,再每次用10mL95%乙醇洗涤沉淀,3

3、000r/min,离心5分钟,洗涤两次,再用无水乙醇洗涤两次,每次3000r/min离心5分钟,收集沉淀于滤纸上,沉淀即为粗RNA,晾干后测定RNA的浓度。2、样品处理称取0.20.25g粗品RNA,加入2ml0.2%的NaOH溶液,和1ml H2O溶解,调成糊状,再加入4050ml H2O溶解,调节pH至7.0,然后定容至100ml。(再取2ml定容至100ml待测)3、标准曲线绘制与样品测定配制标准RNA溶液梯度,取11支试管,洗干净后,标号为0、1、2、3、4、5、6、7、A、B、C按下表,测定其Abs值,做出工作曲线试管 0 1 2 3 4 5 6 7 A B C标准RNA液(g/ml

4、) 0 5 10 15 20 25 30 35 粗品RNA(ml) 6 6 6五、实验结果 1、列表表2酵母RNA样品溶液吸光度测定结果试管01234567ABCAbs值00.1280.2260.3180.4190.5370.6220.7100.5230.5170.518 2、标准RNA曲线的绘制由吸光度-RNA浓度标准曲线可得,RNA样品溶液浓度为:C=25g/mL,因此可求出RNA样品溶液中RNA的含量为:m=2550100=0.125(g)则RNA样品的纯度为:=0.1250.2519100%=49.62%则干酵母粉中RNA的比例为:=0.1254100%=3.13%六、实验分析1、样品

5、中RNA含量较低,可能原因如下:1) 粗制的RNA在空气下长时间放置,性质改变.2) 实验环境较差,人体唾液中含有RNA酶,飞溅到RNA上,RNA降解一部分。3) 在RNA的提取过程中,对RNA粗品的冲洗次数较少,导致其遗留杂质较多。标准RNA放置时间较长,物理性质发生改变,导致其吸光度变小。故标准曲线较理论的曲线y值偏小。故最终标准曲线上面所反映的样品RNA浓度偏大。2、测定RNA含量的几种方法及其比较(1) 定磷法:磷的测定方法很多,Fiske-Subbarow定磷法是一经典的但至今仍被经常采用的方法,它具有灵敏、简便的特点。各种含磷有机物经硫酸或过氯酸水解,使有机磷消化成为无机磷。无机磷

6、在酸性条件下,与钼酸盐(常用钼酸铵或钼酸钠)反应生成磷钼酸盐络合物。用还原剂处理,磷钼酸盐络合物被还原生成钼蓝,在660nm处有最大光吸收峰。在一定浓度范围内,颜色的深浅与磷含量成正比关系。因此可应用分光光度法进行磷的定量测定。核酸是一类含磷化合物,其分子含有一定比例的磷,一般纯的RNA及其核苷酸含磷质量分数为9.0%;DNA及其核苷酸含磷质量分数为9.2%,即每100g核酸含有9.09.2g磷,也就是核酸量是含磷量的11倍左右,故测得磷的量,即可求得核酸量。这就是定磷法的理论依据,磷的定量测定是测定核酸含量常用手段之一。 生物有机磷材料中有时含有无机磷杂质,故用定磷法来测定该有机磷物质的量时

7、,必须分别测定该样品的总磷量,即样品经过消化以后所测得的含磷量,以及该样品的无机磷含量,即样品未经消化直接测得的含磷量。将总磷量减去无机磷才是该有机磷物质的含磷量。(2)地衣酚法(苔黑酚法):RNA含量测定,除可用紫外吸收法及定磷法外,常用地衣酚法测定。其反应原理是:当RNA与浓盐酸共热时,即发生降解,形成的核糖继而转变成糠醛,后者与3,5-二羟基甲苯(地衣酚或苔黑酚,orcinol)反应,在Fe 3+或Cu 2+催化下,生成鲜绿色复合物。反应产物在670nm处有最大吸收。RNA浓度在20250gml-1范围内,光吸收与RNA浓度成正比。地衣酚法特异性差,凡戊糖均有此反应,DNA和其他杂质也能

8、与地衣酚反应产生类似颜色。因此,测定PNA时可先测得DNA含量再计算RNA含量;(3) 二苯胺法:DNA分子中的脱氧核糖基,在酸性溶液中变成-羟基-酮基戊醛,与二苯胺试剂一起加热产生蓝色反应,在595nm处有最大吸收。DNA在40400微克范围内,光密度与DNA的浓度成正比。在反应液中加入少量乙醛,可以提高反应灵敏度。除DNA外,脱氧木糖,阿拉伯糖也有同样反应。其它多数糖类,包括核糖在内,一般无此反应; (4)定糖法:核酸中的戊糖可在浓盐酸或浓硫酸作用下脱水生成醛类化合物,醛类化合物可与某些成色剂缩合成有色化合物,可用比色法或分光光度法测定其溶液中的吸收值,在一定浓度范围内,溶液的吸收值与核酸的含量成正比。

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