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1、目 录1 猪肉质性状的主效基因11.1 猪氟烷基因11.2 猪酸肉基因11.3 单磷酸腺苷蛋白激酶3亚基基因22 猪肉质性状的主要候选基因22.1 脂肪酸结合蛋白基因32.2 激素敏感脂肪酶基因32.3 酯蛋白脂肪酶基因32.4 MyoD 基因家族32.5 钙蛋白酶抑制蛋白基因42.6 黑素皮质素受体42.7 肥胖基因42.8 肌生成抑制蛋白基因52.9 ACSL基因52.10 过氧化物酶体增殖物活化受体基因52.11编码腺苷磷酸脱氨酶基因52.12 固醇调节元件结合蛋白1基因53 基因遗传标记的研究与应用策略63.1 候选基因分析( candidate genes approach)63.2
2、 标记辅助选择( marker assisted selection ，MAS)63.3 标记辅助渗入( marker assisted introgression ，MAI)74 结语与展望7参考文献8矮化砧嫁接的苹果树树冠体积小于乔化砧嫁接的苹果树树冠体积，矮化砧苹果树单株产量低于乔化砧苹果树，所以，栽植矮化苹果树必须根据不同的矮化砧木和不同类型的短枝型品种适当加大栽培密度猪肉质性状基因遗传标记的研究进展随着人民生活水平的提高，消费者对于食品品质认识的提高促使肉品加工业和零售业更加重视肉品的质量。分子生物学技术的发展也让研究者认识到基于DNA标识的选育是最有效的选育手段。如果相应性状不能用
3、一定的标记进行识别就得将动物养育到正常屠宰月龄屠宰后才能检测分析相应性状，费时费力且成本高。如果发现某一DNA标记（如多态性）和目标性状有联系就可以对年幼的动物进行基因型研究而不必等到屠宰时，并且可以敲除对性状有害的基因改良品种性状。分子标记选育技术要能够持续地用于动物育种必须在我们发现使用现有的标记已经不能满足要求的情况下能够发现新的标记。经过长时间建立的数据库是发现新的标记和检测候选基因的宝贵资源。因此与肉质相关基因的研究显得尤为重要。近年来，采用分子生物学技术对影响猪肉质性状的主效基因、候选基因及QTL定位已取得迅猛发展，下面就有关猪肉质性状基因及QTL定位的研究进展作扼要概括。1 猪肉
4、质性状的主效基因1.1 猪氟烷基因氟烷基因（halothanegene，HAL）也称为应激基因、钙释放槽基因或斯里兰卡肉桂碱受体基因。名词“氟烷基因”的应用来自使用氟烷麻醉气体测试猪的一种特征性反应，有些肌肉极其丰满的猪发生这种反应，反应的表现为肌肉强直，体温升高。氟烷反应猪的基因是隐性纯合个体（Halnn），在应激情况下易产生应激综合症（porcine stresssyndrome，PSS），形成灰白水样（pale，soft，exudative，PSE）的劣质肉。Fuji等研究发现HAL基因为PSE肉的主效基因，即位于猪染色体6q1.11.2的兰尼定受体1基因（ryanodine recep
5、tor1，RYR1）或称Ca2+释放通道基因（calcium release channel，CRC），该基因的第1843个碱基胞嘧啶C突变为胸腺嘧啶T，导致蛋白受体第615位上的精氨酸被半胱氨酸代替，从而引起受体的结构和功能发生改变1。这种改变导致应激状态下Ca2+大量非正常释放，引起电解质代谢混乱，出现肌肉持续收缩，使猪产生恶性高热。大量释出的Ca2+激活过量的糖原酵解，使肌糖原酵解过程加速，引起肌肉pH值异常降低，导致PSE肉产生。目前已经建立了PCRRFLP和PCR-SSCP方法检测氟烷基因，并有基因诊断盒上市，用于猪的育种实践2。1.2 猪酸肉基因酸肉基因又叫RN基因(Rendeme
6、nt Napole or gene RN)，是影响肉质的另一主效基因。酸肉状态原来是法国一个汉普夏猪研究组鉴定的。迄今为止，这个基因仅见于纯汉普夏或汉普夏品系中。RN基因有2个等位基因，不利等位基因RN-是正常等位基因rn的完全显性3，该基因定位于15q2.42.5区间内，其显性等位基因有增加肌糖原含量，降低腌制和烹饪火腿产量的效益，并引起猪肉酸化4。Mariani等在酸肉发生机理的系列研究中发现，在PRKAG3基因外显子3中碱基GA的突变抑制了特异磷酸蛋白激酶(adenosine monopHopHate-activated kinase)的活性，从而中止糖原的积蓄，导致了酸肉的产生，利用这
7、一突变可以准确地检测RN基因。1.3 单磷酸腺苷蛋白激酶3亚基基因AMPactivated Protein Kinase 3基因:是近年来被发现的一个影响猪肉pH 值、肉色及系水力的主效基因，有多个突变位点，其中第200个密码子发生突变(Arg200Gln200)是引起RN 效应的根本原因，这个R200Q突变导致RN/RN和RN/rn+动物的肌肉糖原含量提高了70%，猪被屠宰之后24小时测定肌肉的pH值较低，肌肉系水力下降，烤制火腿的产量也降低。这个200Q等位位点与所有RN型动物有关，并在汉普夏品种中有很高的比例，但不存在于rn+基因型或其它品种猪中。T32N、G52S和I199V 突变广泛
8、存在于一些商业猪品种中，与优良肉质性状有关5。AMPK是一种能被腺苷一磷酸（AMP）激活的蛋白激酶，被激活的AMPK主要通过改变机体内脂类和糖类代谢，使其朝着抑制ATP消耗、促进ATP生成的方向进行，从而保持体内能量平衡。AMPK是由、和三个亚基构成的异源三聚体。为催化亚基，有1和2两种同工型。和为调节亚基，亚基有1和2两种同工型，亚基有1、2和3三种同工型。其中PRKAA1和PRKAA2分别编码1和2亚基；PRKABl和PRKAB2分别编码1和2亚基；PRKAG1、PRKAG2 和PRKAG3 分别编码1、2 和3 亚基6。Milan等7首次报道汉普夏猪PRKAG3基因第200个密码子发生突
9、变（Arg200Gln200），使AMPK活性降低，从而使骨骼肌中糖原含量升高70%，最终导致猪肉终pH降低是引起RN效应的根本原因。Ciobanu8、Fontanesi9-10、Lindahl11-12、Otto13、Lu-Sheng Huang等14的研究都表明：PRKA G3编码亚基中的其他三个氨基酸（T30N，G52S，I119V）的替换对肉质都有不同程度的影响，其中紧邻Arg200的Val199Ile199突变具有与RN相反的效应，它使骨骼肌中糖原含量降低，因而有利于改善肉质。PRKA G3是近年来确定的一个影响肉质pH、肉色及系水力的主效基因。李梦云等15的研究表明PRKA G3基
10、因在雅南猪和杜长大三元杂交猪中的表达率与屠宰率、眼肌面积和背膘厚关系不大而和肌内脂肪含量成正相关。另外，王金雷等16的研究表明鸡PRKAB2基因第一外显子406bp处发生的TC的突变可显著提高活重、屠体重、腿肌重和腹脂重，同时提高肉的嫩度。Hae-Young Lee等17的研究表明PRKAA2基因可能与动物脂肪沉积有关。2 猪肉质性状的主要候选基因作为猪肉质性状的主要候选基因（cadidate gene）通常是一些已知其生物学功能和核苷酸序列的基因，它们参与肉质性状发育过程。这些基因可能是结构基因、调节基因、或在生化代谢途径中影响肉质性状表达的基因。2.1 脂肪酸结合蛋白基因脂肪酸结合蛋白（f
11、atty acid-binding proteins，FABPs）家族是存在于许多细胞类型中细胞溶质内的脂肪酸结合蛋白，至少有11种结构上不同的类型，其中心脏脂肪酸结合蛋白（H-FABP）基因被定位在猪6号染色体上，主要在心脏、骨骼肌细胞和乳腺细胞表达，对肌肉脂肪含量（IMF）有显著的影响。脂肪细胞型脂肪酸结合蛋白（A-FABP）基因被定位在猪4号染色体上，主要在脂肪细胞中表达，与肌内脂肪的分化积累有关。因此H-FABP和A-FABP基因均可作为IMF的候选基因。通过QTL遗传分析发现，与IMF有关的QTL位点极有可能存在于A-FABP基因的微卫星区域内，此位点已被精确定位于4号染色体上的65
12、cM处，而在HFABP两个等位基因的微卫星位点内却没有发现IMF显著增加18。2.2 激素敏感脂肪酶基因激素敏感脂肪酶(hormone sensitive lipase，HSL)能将甘油三酯水解成甘油和脂肪酸以满足动物体的需要，是甘油三酯合成和分解的限速酶。哺乳动物体内的脂肪常以甘油三酯的形式储存于脂肪细胞内，Gu等利用鼠 HSLcDNA探针进行原位杂交，把猪的HSL基因定位于染色体的6p12-21区域内，猪HSL基因编码的氨基酸序列与人和鼠同源性为85% ，猪HSL 基因的全长序列有11kb，含有9个外显子，基因全长已被克隆和测序（Chowdhary等）。王琦等研究了HSL基因的多态性后认为
13、，HSL基因可以初步被看成是影响猪脂肪沉积性状的重要候选基因之一，并发现了SSCP多态位点19。2.3 酯蛋白脂肪酶基因酯蛋白脂肪酶(lipoprotein lipase，LPL)基因是催化与蛋白质相连的甘油三脂水解作用的酶，它可将血液中乳糜粒和极低密度酯蛋白所携带的甘油三脂分解成甘油和脂肪酸，向脂肪组织提供合成甘油三脂所需的原材料，以供各组织储存和利用。廉红霞等20对杜长白大约克猪的研究表明猪生长育肥期背最长肌LPL基因表达与肌内脂肪含量呈显著正相关。王刚等21对莱芜猪和鲁莱猪的研究表明猪肌肉组织LPL是肌内脂肪沉积的重要参与者，其编码基因的表达具有明显的体重发育特征，并对肌内脂肪的沉积具有
14、一定程度影响。因此，LPL是动物组织沉积脂肪关键酶，肌体中的脂肪组织和骨骼肌中含有丰富的酯蛋白脂肪酶。猪的LPL基因已被定位在14号染色体的q1.2-1.4上。Previato等研究表明，LPL基因的5端上游区域-368- -35之间为基因的正调控区，-724- -565为负调控区，它们影响基因的表达，从而影响脂肪沉积。鉴于LPL在动物脂肪代谢中的关键作用，猪的LPL基因可以看成是影响猪脂肪沉积的重要候选基因之一。2.4 MyoD 基因家族哺乳动物体肌纤维在胚胎形成过程中受到MyoD基因家族的调控。MyoD基因家族包括四种结构上相关的基因：MyoDI，肌细胞生成素（myogenin，MYOG）
15、，myf5和myf6。这些基因编码螺旋环螺旋（bHLH）蛋白，通过调解肌肉分化阶段特异蛋白的表达来参与肌细胞决定和分化，其中myf5和MyoDI在成肌细胞增殖过程中表达，MYOD在未分化末期表达。Myf 26是一个与MYOD有关的基因，MYOD在胎儿发育中起作用，myf 26在胎儿出生后最活跃，参与成年动物肌肉量形成的调节（Te Pas等）。myf5基因定位于5 号染色体上，而Myo D I 定位于2号染色体（Soumillion等）。MYOG基因控制启动成肌细胞融合和形成肌纤维，在肌肉分化过程中起关键作用。Soumillion等利用四种MyoDcDNA混合扫描猪基因组文库，确定了猪MyoD基因及其变异，MyoD基因有三个MspI多态位点。用猪/鼠杂交克隆板PCR的方法将MYOG位于9 号染色体上。2.5 钙蛋白酶抑制蛋白基因钙蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin，CAST)基因是一种特定的、内源性的、需钙激活的蛋白酶抑制剂，需钙蛋白酶的蛋白水解系统在细胞内普遍存在，并参与大量生长和代谢过程，Rettenberger等将CAST基因定位于2号染色体上，Ernst等进一步将其定位于2q2.12.4，并发现有三个PCRRFLP多态位点，在猪中，与发现该基因产物参与肌肉生产过程中蛋白质更新机制。而对于其他肉用家畜，已发现这个基因显著影响肉的嫩度22。2.6
