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1、分子生物学分子生物学在白血病中的运用在白血病中的运用2019-3-8交融基因实验室交融基因实验室 一、白血病相关基因改一、白血病相关基因改动动的常的常见类见类型型交融基因交融基因基因突变基因突变基因表达异常基因表达异常1.交融基因:交融基因:所所谓谓交融基因,是指将两个或多个基因交融基因,是指将两个或多个基因的的编码编码区首尾相区首尾相连连置于同一套置于同一套调调控序列控序列 包括启包括启动动子、增子、增强强子、核糖体子、核糖体结结合序列、合序列、终终止子等止子等 控制之下,构成的嵌合基因。控制之下,构成的嵌合基因。 概概 念念 Chr 9Chr 22ABLBCRBCR-ABL交融基因交融基因
2、2.基因突变:基因突变:错义突变点突变错义突变点突变插入突变插入突变缺失突变缺失突变移码突变移码突变错义突变点突变:错义突变点突变:DNA分子中一个碱基对被另一个不同的碱基对取代所引起的突变。分子中一个碱基对被另一个不同的碱基对取代所引起的突变。如:如:JAK2V617FJAK2基因基因mRNA程度程度cDNA程度:第程度:第1849位点位点G突变为突变为T蛋白程度:第蛋白程度:第617位氨基酸位点由缬氨酸位氨基酸位点由缬氨酸V突变突变为笨丙氨酸为笨丙氨酸F插入突变:插入突变:较长片段的较长片段的DNA的插入而发生突变,但不改动的插入而发生突变,但不改动阅读框阅读框如:如:NOTCH1H159
3、0-L1592insFGPNOTCH1基因基因mRNA程度程度cDNA程度:程度:c.47754776ins(TGGGCC)蛋白程度:蛋白程度:H1590-L1592insFGP缺失突变:缺失突变:较长片段的较长片段的DNA的缺失而发生突变的缺失而发生突变,但不改动,但不改动阅读框阅读框如:如:JAK2N542-E543delJAK2基因基因mRNA程度程度cDNA程度:程度:c.1624-1629del6bp蛋白程度:蛋白程度:N542-E543缺失缺失N、E氨基酸氨基酸移码突变:移码突变:DNA片段中某一位点插入或丧失一个或几个非片段中某一位点插入或丧失一个或几个非3或或3的倍数的倍数碱基
4、对时,呵斥插入或丧失位点以后的一系列编码顺序发生碱基对时,呵斥插入或丧失位点以后的一系列编码顺序发生错位的一种突变。错位的一种突变。如:如:CALRL367fs(46)突变突变CALR基因基因mRNA程度程度cDNA程度:程度:c.1179_1230del52bp蛋白程度:第蛋白程度:第367位氨基酸亮氨酸位点发生移码,在位氨基酸亮氨酸位点发生移码,在367位点起后的位点起后的46位氨基酸终止。位氨基酸终止。 癌基因或抑癌基因表达异常 如: WT1定量3、基因表达异常、基因表达异常二、白血病基因检测的临床意义二、白血病基因检测的临床意义1、 辅助诊断2、 指点治疗3、 评价预后4、 微小病变残
5、留检测三、白血病相关基因分类三、白血病相关基因分类BCR-ABLFLT3-ITDJAK2V617FC-KITPML-RARaNPM1RUNX1AML1-ETODNMT3ATET2ASXL1/ASXL2IDH1/IDH2SF3B1SRSF2U2AF1 Class 1 增增 殖殖Class 2 分分 化化Class 3 表观遗传表观遗传Class 4 剪切因子剪切因子四、白血病相关常见基因四、白血病相关常见基因AML CMLMPNALLCLLMDSAML相相关关基基因因异异常常交融基因:交融基因:1、PML-RARa:95%AML-M3分分为为三型三型L型、型、S型、型、V型型PLZF-RARaN
6、PM1-RARa2、AML1-ETO:40%AML-M2(主要主要为为M2b)3、CBF-MYH11:90%AML-M4Eo4、MLL-AF17MLL-AF6AML-M4/M5MLL-AF9AML相相关关基基因因异异常常基因突变:基因突变:FLT3-ITDNPM1A/B/D型型c-KitIDH1IDH2ASXL2NRASKRASP53DNMT3A基因定量分析:基因定量分析:WT1定量定量FLT3-ITD:AML-M3中发生频率较高中发生频率较高c-Kit: 50%AML1-ETO阳性阳性AML CBF-MYH11阳性阳性AMLASXL2:AML1-ETO阳性阳性AMLCML相相关关基基因因异异
7、常常BCR-ABL : 95%CML CML特异 marker 亚型: cDNA Protein b3a2、b2a2型 P210 e19a2型 P230 e1a2型 P190MPN相相关关基基因因异异常常PV、ET、PMF的诊断的诊断BCR-ABL排除早期慢粒排除早期慢粒PV: JAK2V617F JKA2exon12ET:JAK2V617F MPL CALRPMF: JAK2V617F MPL CALRBCR-ABLJAK2V617FMPLCALRJAK2exon12MDS相相关关基基因因异异常常WT1定量定量DNMT3ATET2ASXL1SF3B1SRSF2RUNX1SF3B1:主要见于:
8、主要见于50-70% 环形铁粒幼增多性贫血环形铁粒幼增多性贫血SRSF2 :主要见于:主要见于CMMLALL相相关关基基因因异异常常BCR-ABL:35%成人成人ALL-AML1:儿童儿童ALL预后好预后好E2A-PBX1:预后不好:预后不好MLL-AF4:婴幼儿多见婴幼儿多见NOTCH1:预后好预后好FBXW7:预后不好预后不好PTENNRASKRASB-ALLT-ALLCLL相相关关基基因因异异常常P53NOTCH1NOTCH1:见于见于B系或系或T系系CLL在在CLL中为预后不好目的中为预后不好目的五、检测方法引见:五、检测方法引见:1、RT-PCR2、PCR3、PCR-测序测序4、RQ-PCR六、结果报告单分析:六、结果报告单分析:Thank you !