Pubmed南京医科大学图书馆 了解Pubmed需要知道的nNIH、、NLM、、NCBI与与EntreznNIH(National Institute of Health)：美国国立卫生研究院nNLM(Natioanl Library of Medicine)：美国国立医学图书馆nNCBI(National Center for Biotechnology Information，美国生物技术信息中心) nEntrez nNCBI凭借其雄厚的科技技术力量以及在生命技术方面的巨大影响，创办了一个生物技术和生命科学的优秀网站，建立了一系列的生物信息事实数据库和文献数据库，并提供基于因特网的免费的信息服务 nEntrez是NCBI网站基于多种数据库的集成检索系统，也是网上最大的免费检索生物医学资源的网站 Entrez检索平台n Entrez是NCBI为广大生物研究人员提供的一个基于文本的集成检索系统通过该平台可检索到NCBI提供的28个数据库，这些数据库包含文献数据库、DNA和蛋白质序列数据库、三维蛋白质结 构数据库、种群研究库、表达库、完全人类基因组库、分类信息库 n其中，Pubmed属于文献数据库。
文献数据库主要收藏生物医学方面的期刊、图书等 Pubmed检索系统ü（一）概述 ü（二）主要数据收录 ü（三）基本检索 ü（四）高级检索 ü（五）PubMed其它检索服务 ü（六）结果处理 ü（七）获取原文及相关资源链接 （一）概述 n PubMed（www.pubmed.gov）是由美国国立医学图书馆（NLM）下属美国生物技术信息中心（NCBI）研制的基于Web的文摘数据库，是NCBI整合检索系统Entrez中数据库之一 n 通过NCBI整合检索系统PubMed可以链接到分子生物信息学数据库文件，获取核酸序列、蛋白质序 列；从核酸序列翻译到蛋白质的序列；获取基因组和染色体图谱；蛋白质三维结构等其他生物信息数据库信息 nPubmed是目前世界上使用最广泛的免费Medline检索系统，它提供Medline、PREMedline等数据库的检索 nPubMed特点特点 ü 1.免费提供题录和文摘 ü 2.提供与原文的网址链接(部分免费获取） ü 3.提供检索词自动转换匹配 ü 4.操作简便、快捷 （二）主要收录数据收录 nMEDNLINE 美国国立医学图书馆创建的医学文献数据库n收录内容：主要收录生物医学和健康科学以及生命科学相关领域的文献，包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学，基础研究和临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或者相关教育活动的内容。
2000年起增加收录对生物医学的实习者、研究员和教育家至关重要的专业内容，包括生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容 n MEDLINE文献来源 来源于全世界70多个国家和地区的近5000种生物医学期刊，这些期刊大都经美国卫生健康研究院的文献选择技术评估委员会Literature Selection Technical Review Committee (LSTRC)评估挑选, 以及美国国立医学图书馆和数据协作采集专家 （各专业协会）推荐 近年数据涉及37种语种，回溯至1950年的数据涉及60种语种数据库47%为美国本土出版的文献， 90%为英文文献，79%的文献有著者撰写的英文文摘以上数据根据2007年11月数据库提供） nMEDNLINE数据题录标有[PubMed-indexed for Medline] n In process数据 1996年8月开始，PubMed每天收录由MEDNLINE的期刊出版商提供的尚未经规范处理的数据，该库中的记录只有简单的书目信息和文摘该库中的数据每周一次转入Medline。
当进入Medline时就会被标入Medline当进入Medline时就会被标引MeSH(数据库规范控制词表详见MeSH Database内容)词、文献类型及其它数据 n记录有 [PubMed -in process]的标记 （三）基本检索 基本检索输入框检索n1.自然语言检索 （topics) ü在检索栏中输入一个或多个检索词 (系统默认空格为AND检索） 如：placenta growth oxygen ü 布尔逻辑运算式：AND OR NOT (运算符须大写） 如：common cold AND vitamin C 将检索出同时包含感冒和维生素C两个检索词的文献 n 运算符 ü字段限定符：[] （教材86页） 例如：Stem [ti] AND neuroscience ü 截词符：”*”作为通配符进行截词检索教材89页) 例如：bacter * （系统会找到前一部分是bacter的单词， 如：bacteria、bacterium等） ü 强迫短语符：用双引号来强制系统进行短语检索教材89页） 例如： “oxygen free radicals” （不再自动转换匹配和 扩展检索） n自动转换匹配检索词 （教材88页） 对常用医学名词进行自动在MeSH转换表 （教材26页）、刊名转换表、短语表、著者索引及所有记录字段中转换匹配。
如：renal failur （肾衰竭） 转换为 "kidney failure"[MeSH Terms] OR ("kidney"[All Fields] AND "failure"[All Fields]) OR "kidney failure"[All Fields] OR ("renal"[All Fields] AND "failure"[All Fields]) OR "renal failure"[All Fields] n自动扩展检索 系统自动对主题词、副主题词进行扩展检索 输入 “hypertension therapy（高血压治疗）,系统自动检索高血压的药物治疗、饮食疗法 n2.著者检索(authors)： 著者姓名,姓在前,名首字母在后 限定加字段符 如: genbacev o[AU] smith ab [AU] n3.期刊检索(journals)： ü 刊名输全称 new england journal of medicin ü MEDLINE认可的标准缩写形式 如：clin exp immunol[so] ü 国际标准期刊号 如：1059-1524 ①②③④ Linkout外部链接Linksout外部链接功能 n显示检索结果n保存检索结果n保存检索策 显示格式输出格式 nRSS输出 使用Google Reader订阅RSS n检索策略保存ü使用My NCBI，登录后保存检索策略 高级检索nSearch Builder：协助编写检索式nIndex：索引nHistory：检索史 限定(Limits)ü检索限定：字段限制：著者、刊名、篇名、滤过（filter原文收藏处）等ü数据输入时间：默认检索可回溯到1950年，限制选择30天-10年ü文献类型限制ü语种限制ü子文档 Mesh主题词表n功能：ü确定规范检索词ü查看词义注释、树状结构表ü副主题词、扩展、主要主题词n特点：ü一般检索逻辑关系粗浅、修饰概念匹配不特定、检索词涵盖不全面ü规范检索逻辑关系紧密、修饰概念匹配特定、下位词检索全面 n例：欲查2002-2008年肾衰竭（renalfailure）饮食疗法(diet therapy)疗效观察(treatment outcome)的相关文献？ 期刊数据库n通过输入刊名、缩写名、ISSN等,浏览期刊文献。
n提供电子原文的超链键 特定文献检索 nSingle citation mathcerü输入题录信息，查找特定文献进行补缺ü刊名要准确，缩写要标准ü著者姓名大小写不敏感ü如：已知：第一著者是Challis DE，出处是Pediatric Research；2000，47（3）：309-15，要求写出其他合著者 PMC（Pubmed Center）n生命科学期刊资源中心（教材105页）n免费提供近200种期刊的10多万篇全文（不包括PubMed动态免费全文） PubChemnPubChem是免费的公共化合物结构信息网络数据库，提供小分子生物活性的有关信息，与化学密切相关PubChem由NCBI’s Entrez信息检索系统内三个相互链接的数据库组成的，包括PubChem Substance、PubChem ComPound和PubChem BioAssay PubChem 检索方式n PubChem Compound： 2600万条结构，可利用名称、同义词或关键词来检索独特的化学结构，并提供与每一种化合物有关的生物特征信息的链接n PubChem Substance： 6200万条记录，可利用名称、同义词或关键词来检索所收录的化学物质的数据，并提供有关生物特征信息和收录者网站地址。
nPubChem BioAssay：超过 2000条生物分析，利用源自生物测定描述的术语如“癌细胞系”检索生物测定记录，并提供有关活性复合物和生物测定的链接n Structure Search：利用化学结构作为问题来检索PMbChem’s CompoMnd Data—base，结构则可通过SMILES、MoLes或其他格式被描绘出来 Clinical Trials 。