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1、英文医学数据库检索英文医学数据库检索11概述n外文文摘数据库检索外文文摘数据库检索 Medline与Pubmed, EMBASE, SciFinder Scholar, BioSIS Previews, Engineering Village, Dialogn外文全文数据库检索外文全文数据库检索OVID Full Text, EBSCOhost, Elsevier SDOS, SpringLink, ProQuest Medical Library, Kluwer Online Journals OCLC FirstSearch2中南大学图书馆（）3校园网外文数据库（）4一、一、Medline
2、概述概述1.书目数据库书目数据库: NLM, 最重要最重要2.来来源源：5200+期期刊刊（80+国国家家, (LSTRC), ） 90%英文，涉及医学各领域英文，涉及医学各领域3.获取获取: 印刷、联机、光盘、网络印刷、联机、光盘、网络Medline与与PubMed5印刷型检索工具印刷型检索工具nIndex Medicus医学索引(IM) (Cumulated Index Medicus, CIM)nIndex to Dental LiteraturenInternational Nursing Index6联机检索联机检索n1964年开发MEDLARS，MEDLINE成为使用频率最高的数据
3、库9光盘检索光盘检索n1980s至今nSilverPlatter Medline on CD(银盘)10光盘11二、二、PubMed概述（概述（P.67）n检索系统检索系统: NCBIn免费免费：pubmed.govn检索检索: 最强、查全率高12主页PubMed comprises more than 20 million citations for biomedical literature from MEDLINE, life science journals, and online books. Citations may include links to full-text cont
4、ent from PubMed Central and publisher web sites13获取全文214PubMedCentral(http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/)15查找的文章提供两种格式16可在主页选择其他数据库检索171.Pubmed的文献来源nMedlinenIn-process citationsnPublisher-Supplied Citations18记录标识（记录标识（1）PubMed - in process PubMed - as supplied by publisher PubMed indexed for Medline 19
5、2.PubMed记录的字段n可供检索和显示的字段共60多个(表4-1-1)20MEDLINE格式21 TI -Lymphedemaaftertreatmentofbreastcancer.MHMH - AxillaMHMH - BreastNeoplasms/*surgery MH MH - LymphNodeExcision/*adverseeffectsMHMH - Lymphedema/*epidemiologySO - AmJSurg2004Jan;187(1):69-72. MESH字段(MEDLINE格式)22n医学主题词表(医学主题注释词顺表）n（Medical Subject
6、Headings)(MESH表）23MESHMESH特性（优势）：规范特性（优势）：规范10例AIDS病人死亡因素分析1例艾滋病患者的诊断爱滋病患者常见之口腔表征治疗获得性免疫缺陷综合征病人的健康教育主题词：获得性免疫缺陷综合征24MESHMESH特性：特性：支持副主题词限定n形式：形式：MeSH词 / Qualifiersn作用：作用：限定；扩大词量 举例：举例：白血病的发病机制研究 白血病白血病/病因学病因学 副主题词副主题词:83个个25MESHMESH特性：特性：扩展检索功能扩展检索功能nMESH树状结构体系：主题词概念等级分类体系, 它将MeSH表中的所有主题词, 按照其词义范畴和学
7、科属性,分门别类地归入15个大类,每个大类又逐级划分(主要类目见附录).每个主题词都在这种体系中至少有一个位置, 用来描述这种位置的号码称为树状结构号。26MESHMESH特性：特性：两种形式两种形式 自然语言顺序：心理学试验 倒装形式：心理学，临床 心理学，比较 心理学，教育 心理学，实验心理学，医学27三、检索途径与方法三、检索途径与方法n基本检索n高级检索:Advanced Searchn其他：Pubmed Tools,Pubmed Resources28主页29Q:遇到一个课题时,该选择何种检索方式?30基本检索：基本检索： 检索方法（规则）检索方法（规则）n不区分大小写不区分大小写n
8、逻辑组配检索逻辑组配检索 （1） NOT ，AND, OR （2）不输入默认为不输入默认为AND vitaminccommoncoldvitamincANDcommoncold31 PMID PMID- 14706589 TI -Lymphedemaaftertreatmentofbreastcancer.AUAU - OzaslanCLA LA - engPTPT - JournalArticleMHMH - AxillaMHMH - BreastNeoplasms/*surgery MH MH - LymphNodeExcision/*adverseeffectsMHMH - Lymphe
9、dema/*epidemiologySO - AmJSurg2004Jan;187(1):69-72. 格式：检索词格式：检索词字段标识字段标识LymphedemaTI 1832篇篇Ozaslan CAU 11篇篇AxillaMH 7073篇篇字段检索字段检索(教材教材P.86)32v举例（PUBMED）: 检索式 检出数量 Breast NeoplasmsMH 141536篇 Breast NeoplasmsMAJR 114513篇 灵活地扩大或缩小检灵活地扩大或缩小检索33检索举例查找查找入学前儿童入学前儿童的的哮喘治疗哮喘治疗的的文献（综述文献文献（综述文献/ /全文）全文）child,
10、preschoolmhAND asthma/therapymh 5348篇（756篇/920篇）34检索结果child,preschoolmhAND asthma/therapymh35获取全文136获取全文237日期检索格式：格式：YYYY/MM/DD date fieldn2009/10/06 edatn2008 dpn2008:2010 dpn2009/01:2010/03 edat38词语检索词语检索n自动词语匹配功能：输入未加任何限定的检索词时，系统依次进行匹配、转换和检索：MeSH转换表 刊名转换表 著者索引39livercancerANDgenetherapy2744篇 (liv
11、er neoplasmsMeSH Terms OR (liverAll Fields AND neoplasmsAll Fields) OR liver neoplasmsAll Fields OR (liverAll Fields AND cancerAll Fields) OR liver cancerAll Fields) AND (gene therapyMeSH Terms OR (geneAll Fields AND therapyAll Fields) OR gene therapyAll Fields)40精确短语检索n使用引号“liver cancer” 6987篇liver
12、 cancer 146836篇 41截词检索：加*(截取前600个截词)检索：Immun*ImmunAll Fields OR immun21All Fields OR immun68All Fields OR immun70All Fields OR immunaAll Fields OR immunabeledAll Fields OR immunablationAll Fields OR immunabsorbantAll Fields OR immunabsorbentAll Fields OR immunabsorptionAll Fields OR immunabwehrAll F
13、ields OR immunabwehrreaktionenAll Fields 42Q：检索免疫方面的文献，用：检索免疫方面的文献，用immun*检索检索文献多，还是文献多，还是immunology检索文献多检索文献多nImmun* 341839篇nImmunology 1115106 篇43Immun*4445著者检索著者检索n姓在前用全称姓在前用全称,名在后用首字母名在后用首字母 Smith jau 14819篇 “smith J”au 2240篇（2002年起可以采用全称）46Q：如何查询著者：如何查询著者Yang发表的论文发表的论文？Yang Yin-Yangmh OR YangTW
14、用：用：YangAU 47nQ:利用基本检索时，如果要作一些限定，如何实现？（举例：检索“颅脑外伤对青少年及儿童生长激素的影响”）48利用limits49limits时间时间文献文献类型类型研究研究类别类别子集子集文本文本选项选项语种语种性别性别年龄年龄字段字段50craniocerebral trauma ANDgrowth hormone选择all child:0-18years51检索结果52高级检索高级检索Search builderSearch historyMore resoures53其他nJournals Database(查询期刊信息并检索)nMeSH Database(获取
15、主题词信息并检索) nSingle Citation Matcher (从文献外表特征查找单篇或一组论文)nBatch Citation MatchernClinical Queries(临床文献查询)nTopic-Specific Queries nLinkout(外部链接)nClinical Trials54主页55Journals Database56Single Citation Matcher57举例举例查找夏家辉教授发表在“Nat Genet，1998；20（4）：370-3”的关于神经性耳聋基因的论文及相关信息58（1）输入已知条件）输入已知条件59（2）显示结果）显示结果Nat
16、genettaAND1998dpAND20viAND 4isAND370pgANDxiajau60Batch Citation Matcher61Clinical QueriesSearchbyClinicalStudyCategoryFindSystematicReviewsMedicalGeneticsSearches62过滤检索结果63Clinical Queries:Clinical Study Categoriesn按临床问题分类检索n可以根据需要选择检索文献更多一些或更少一些64Therapysensitive/broad(clinicalTitle/Abstract AND tr
17、ialTitle/Abstract) OR clinical trialsMeSH Terms OR clinical trialPublication Type OR random*Title/Abstract OR random allocationMeSH Terms OR therapeutic useMeSH Subheading)specific/narrow(randomized controlled trialPublication Type OR (randomizedTitle/Abstract AND controlledTitle/Abstract AND trialT
18、itle/Abstract) 65Topic-SpecificQueries：特定文献查询Topic-Specific Queries6667MedlinePlus(http:/medlineplus.gov)68Topic:高血压69Topic:高血压70n印刷版印刷版: MeSH表表MeSH,SupplementtoIndexMedicusMeSH-AnnotatedAlphabeticListMeSHTreeStructuresPermutedMeSH 电子版（电子版（1）-单独电子版（电子版（2）-检索系统http:/www.nlm.nih.gov/meshMeSHDatabase71
19、电子版（1）72主题词信息主题词信息73提供MESH主要系统nPubMed: MeSH DatabasenCBMDisc: MESH词表特点:(1)提供MESH信息: 含义,所能组配的副主题词信息,树状结构(2)提供MESH检索途径:选择MESH,副主题词,是否扩展或加权74MeSHDatabase75树状结构表All MeSH Categories Diseases Category Hemic and Lymphatic Diseases Hematologic Diseases Anemia Anemia, Aplastic Anemia, Hypoplastic, Congenital
20、 Anemia, Diamond-Blackfan Fanconi Anemia下位词下位词上位词上位词76nQ：如何利用MeSH Database 查询“颅脑外伤对青少年及儿童生长激素的影响”相关文献？ 77选择SearchBoxwithAND78进行检索79Clinicaltrials.gov808182五、五、 检索举例检索举例83(1)输入提问84检索结果：Summary85Summaryn提供的信息：TI，AU，SO + 链接（Related articles+Full text)n三个细节：Filter your results；Find related Data；Search d
21、etails86Related Articles：获取相关文献获取相关文献87SummaryDiabetesta AND xiang kauthor AND susceptibility genesti88如何转换显示格式？n选择文献Display settingsn直接点击文献标题89Summary90（2） Display settings:Abstract91Abstract：MESH和Linkout92Abstract:全文链接全文链接+相关文献相关文献+引引用用+其他链接其他链接93DisplaySettings:Abstract(text)94Q:如何获取更详细的信息？95Disp
22、laySettings:MEDLINE格式96(3)结果输出：sendto97(4) 获取全文获取全文98PubMed检索相关问题Q1:如何显示系统转换后的详细检索策略？99Summary格式：searchdetails100高级检索高级检索: details101Details：详细的检索策略(liverneoplasmsMeSHTermsOR(liverAllFieldsANDneoplasmsAllFields)ORliverneoplasmsAllFieldsOR(liverAllFieldsANDcancerAllFields)ORlivercancerAllFields).102n
23、Q2:如何一次检索多个数据库？103选择：alldatabases104统一检索界面105NLMGateway(http:gateway.nlm.nih.gov)106检索结果107nQ3：从我校医学图书馆检索PubMed有何差别？108医学图书馆：pubmed109检索110nQ4:利用其他系统检索MEDLINE和PubMed检索MEDLINE有差别吗？111主要差别主要差别n1.费用费用: 免费：PubMed，gateway 收费：OVID、FirstSearch、WOK、 EMBASEn2.可检数据库可检数据库n3.检索界面检索界面112EMBASE主页1134.检索功能检索功能n自动词
24、语匹配自动词语匹配(PubMed 、Gateway、EMBASE)1145. 获取全文获取全文nPubMednFirstsearchnOVIDnEMBASE115nQ：如何在PubMed中得到个性化服务？116117MyNCBI118n如何一次检索多个数据库？119选择：alldatabases120统一检索界面121NLMGateway122检索结果123医学图书馆：pubmed124检索125MEDLINE网络检索n1.费用费用: 免费：PubMed，gateway 收费：OVID、FirstSearch、WOK、 EMBASEn2.检索服务检索服务n3.可检数据库可检数据库n4.检索界面
25、检索界面1265.检索功能检索功能n自动词语匹配自动词语匹配(PubMed 、Gateway、EMBASE)1276. 获取全文获取全文nPubMednFirstsearchnOVIDnEMBASE128六、如何有效地利用PubMed查找所需文献n选择最准确的提问词n选择最合适的检索功能n调整检索策略1291. 选择最准确的提问词选择最准确的提问词n例：如何查找IFN-的相关文献？ 130n#1 IFN- 43345 篇 (转换：IFN-gammaAll Fields）n#2 IFN 45884篇（转换IFNAll Fields AND gammaAll Fields）n#3 IFN gamm
26、a 45884篇n#4 Interferon gamma 60965篇n#5 #1 OR #2 OR #4 72006篇131Interferongamma转换 interferon-gammaMeSH Terms OR interferon-gammaAll Fields OR (interferonAll Fields AND gammaAll Fields) OR interferon gammaAll Fields1322.选择最合适的检索功能 例1：查找近两年多发性骨髓瘤 （multiple myeloma )的临床试验方面的英文文献（需全文） 133Limits134检索结果135
27、n原拟检索式：原拟检索式： mad cow disease epidemic study 20条n最合适的检索服务最合适的检索服务：Mesh Database“Encephalopathy, Bovine Spongiform / epidemiology” MeSH 435条例2：疯牛病的流行病学研究136 （1）MESH Database输词输词137 （2）获取主题词获取主题词138（3）组配副主题词139 (4) Send to “Search Box with AND”140 (5) (5) search Pubmedsearch Pubmed141(6) 获取结果获取结果142n例
28、3： 多奈哌齐(Donepezil) 治疗阿尔茨海默病（Alzheimer Disease）的预后和系统评价的文献143ClinicalQueries144prognosisSensitive/broad(incidenceMeSH:noexp OR mortalityMeSH Terms OR follow up studiesMeSH:noexp OR prognos*Text Word OR predict*Text Word OR course*Text Word)Specific/narrow(prognos*Title/Abstract OR (firstTitle/Abstrac
29、t AND episodeTitle/Abstract) OR cohortTitle/Abstract)145#1 (Donepezil Alzheimer Disease) AND (Prognosis/Broadfilter) 181篇#2 (Donepezil Alzheimer Disease) AND (Prognosis/narrowfilter) 45篇#3 (Donepezil Alzheimer Disease) AND Prognosis 278篇#4 #1 or #2 or #3 407篇146系统评价(DonepezilAlzheimerDisease)ANDsyst
30、ematicsb147例4:性腺淋巴瘤与Fas、Fasl的关系n选择检索词选择检索词 Sex gland lymphoma; Ovarian lymphoma Testicular lymphoma; Fas; Fasln构成检索式-高级检索的History148 History 构建检索式构建检索式1493. 调整检索策略调整检索策略n检出文献过少扩大检索n检出文献过多缩小检索150扩大检索n利用“自动转换检索词”特性n增加相关词(增加OR组配面）n减少AND组配面n扩展检索n采用截词151截词检索举例nTransplantation 335805nTransplant* 355265Ste
31、mcelltransplantation43575Stemcelltransplant*16055stemcelltransplantation(stemcelltransplantationMeSH TermsORstemcelltransplantationText Word)152nstem cell transplantAll Fields OR stem cell transplantationAll Fields OR stem cell transplantation/classificationAll Fields OR OR stem cell transplantation
32、sAll Fields) OR stem cell transplantedAll Fields) OR stem cell transplantsAll Fields)Stem cell transplant*153例：白血病患者锌、铁、铜等微量元素的例：白血病患者锌、铁、铜等微量元素的变化变化nLeukemiamh AND Zincmh AND ironmh AND copperMH 12篇nLeukemia mh AND Zinc AND iron AND copper 16篇nLeukemia mh AND (Zinc OR iron OR copper) 736篇154例例1（继续）
33、（继续）nLeukemia mh AND (Zinc OR iron OR copper OR arsenic) 771篇nLeukemia mh AND trace elements mh:noexp 25篇nLeukemia mh AND trace elementsmh 1081篇155TraceElements156缩小检索n采用主题词n采用专指词n字段限定n增加AND组配面n用NOT排除次要概念n外表特征限定n自由词检索用引号157例：查找细胞死亡相关文献例：查找细胞死亡相关文献 Cell death 116934篇“cell death” 46083篇Cell deathtw 46
34、027篇Apoptosismh 58463篇Apoptosismajr 35734篇apoptosis/geneticsmajr 2383篇apoptosis/geneticsmajr AND P53 562篇158MeSHDatabase：Celldeath159查找细胞死亡相关文献（继查找细胞死亡相关文献（继 续）续）apoptosis/geneticsmajr AND P53 ti 284篇apoptosis/geneticsmajr AND P53 ti AND englishla 272篇apoptosis/geneticsmajr AND P53 ti AND englishla NOT LUNG 258篇apoptosis/geneticsmajrp53tiAND englishla NOT Lung Field: All Fields, Limits:2 Years,Review 8篇篇160
