医学生物分子的分离纯化课件

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1、第七章生物分子的分离纯化医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化生物大分子（蛋白质、核酸、糖复合物等）生物分子（Biomolecule）泛指生物体特有的各类分子，是自然存在于生物体中的分子的总称，是组成生命的基本单位。包括小分子（如脂类、激素、维生素等）医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化5）能人工合成与改造。生物分子是生物所特有的有机化合物，具有如下主要特征：1）结构复杂有序、具有特殊的层次；2）行使专一的功能；3）代谢是其存在的条件；4）生物分子体系具有自我复制的能力；医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化一、生物大分子的制备 生物大分子指的是作为生物体内主要活性成分的各

2、种分子量达到上万或更多的有机分子。常见的生物大分子包括蛋白质、核酸、脂类、糖类。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化（1）分离纯化方法千差万别，没有一种标准方法可通用于各种生物大分子的分离制备；（2）制备几乎都是在溶液中进行的，难以准确估计和判断pH值、温度度等各种参数对溶液中各种组份的综合影响 生物大分子的制备有以下主要特点：医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化（3）大多数生物大分子的含量极微，分离纯化的步骤多，流程长，有的目的产物甚至要经过几十步的操作才能达到所需纯度；（4）分离纯化过程中要保证目标产物的活性。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化生物大分子制备的一般

3、步骤：生物大分子制备的一般步骤： 确定制备的目的和要求确定制备的目的和要求文献调研和预备性实验文献调研和预备性实验建立相应的可靠的分析测定方法建立相应的可靠的分析测定方法材料的破碎和预处理材料的破碎和预处理分离纯化方案的选择和探索分离纯化方案的选择和探索产物纯度的鉴定产物纯度的鉴定产物的浓缩，干燥和保存。产物的浓缩，干燥和保存。科研、开发或发现新的物质制备的关键要求达到一维电泳一条带，二维电泳一个点，或HPLC和毛细管电泳都是一个峰最困难的过程掌握目的产物的理化性质特异性强准确度高灵敏度高使用快捷方便 医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化 制备生物大分子的分离纯化方法多种多样，主要是利

4、用它们之间理化性质的差异。根据作用原理生物分子的分离、纯化可分为以下几种类型：（1）根据分子极性大小和溶解度的不同，如溶剂提取技术、盐析法、分配层析法、分级沉淀法等；（2）根据分子形状和大小不同，如凝胶过滤层析等；（3）根据物质吸附性质不同，如选择性吸附与吸附层析法等；（4）根据分子带电性（电离性质）的差异，如离子交换层析、电泳、等电聚焦法等。（5）根据配体特异性，如亲和层析。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化破碎方法应用机械法研磨法细菌、酵母匀浆法机体软组织捣碎法动物韧性组织化学法酶解法细菌、酵母去垢剂组织、细胞有机溶剂细菌、酵母物理法反复冻融法细胞超声波法细胞悬液低渗裂解法红细胞

5、冷热交替法细菌、病毒常用破碎方法常用破碎方法 医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化影响提取效果的因素影响提取效果的因素（1）pH值 （2）盐浓度（即离子强度） （3）温度 （4）水解酶 （5）搅拌与氧化 （6）有机溶剂 医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化 生物大分子的分离纯化生物大分子的分离纯化 （ 1 ）盐析法 医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化（2）有机溶剂沉淀法 医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化(3) 透析(dialysis) 利用透析袋把大分子蛋白质与小分子化合物分开的方法。含蛋白溶液透析袋透析液磁子电磁搅拌器医学医学生物分子的分离纯化生物分子的

6、分离纯化二、核酸的分离纯化 核酸（nucleic acid）是遗传信息的携带者，是基因表达的物质基础(包括DNA与RNA)。 无论是进行核酸结构还是功能研究，首先需要对核酸进行分离和纯化。 核酸样品质量将直接关系到实验的成败。 DNA与RNA理化性质及细胞定位上的差异决定了两者的最适分离与纯化条件的不同医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化分离纯化的原则 一是保持核酸碱基序列的完整性。二是尽量清除其它分子的污染，保证核酸制品的纯度。 意义：遗传信息全部储存在一级结构之中，核酸的一级结构还决定其高级结构的形式以及和其他生物大分子结合的方式。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化对于核

7、酸的纯化应达到以下三点要求： 1）核酸样品中不存在过高浓度的金属离子和对酶有抑制作用的有机溶剂； 2）其它生物大分子如蛋白质、脂类和多糖分子的污染应降至最低程度； 3）排除其它核酸分子的污染，如提取DNA分子时应去除RNA，提取RNA分子时应去除DNA。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化保持核酸的完整性 在整个操作过程中应尽量避免各种有害因素对核酸的破坏。 1）温度不要过高(04)；(高温破坏氢键) 2）控制pH值范围(pH值4-10);(极端酸碱破坏磷酸二酯键) 3）保持一定离子强度; 4）减少物理因素对核酸的机械剪切力.医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化核核酸酸制制备备

8、的的技技术术路路线线医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化核酸的浓缩、沉淀与洗涤随着提取试剂的逐步加入，去除杂质时的丢失，样品中核酸的浓度会逐步下降，当不能满足后续研究与诊断所需时应对样品进行浓缩。沉淀是浓缩核酸的最常用且高效的方法，优点： 改变核酸的溶解缓冲液； 重新调整核酸的浓度； 去除溶液中某些盐离子与杂质。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化核酸的鉴定与保存（一）核酸的鉴定1. 浓度鉴定 核酸浓度的测定可通过紫外分光光度法与荧光光度法进行。 紫外分光光度法：该法是基于核酸分子中的碱基具有共轭双键结构因而可以吸收紫外线，其最大吸收波长为260nm，这一物理特性。前提：核酸样

9、品要较纯，无显著蛋白质、酚、琼脂糖及其他核酸污染。测定浓度应大于0.25 g/ml医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化荧光光度法：核酸在荧光染料溴化乙锭（ethidium bromide，EB）嵌入碱基平面后，本身无荧光的核酸在UV激发下发出红色荧光，且荧光强度的积分与溶液中核酸的含量呈正比。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化 纯度鉴定 紫外分光光度法或荧光光度法皆可用于核酸制品的纯度鉴定。紫外分光光度法：该法主要通过A260与A280的比值来判定有无蛋白质的污染。在TE缓冲液中，纯DNA的A260/A280为1.8，纯RNA的比值为2.0。比值升高与降低均提示不纯。荧光光度

10、法：用EB等荧光染料示踪的核酸电泳结果可判定核酸制品的纯度。DNA分子较RNA大得多，电泳迁移率低。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化完整性鉴定琼脂糖凝胶电泳法：以EB为示踪剂的核酸凝胶电泳结果为依据。基因组DNA片段如发生降解，电泳图呈拖尾状。完整的或降解很少的总RNA电泳图谱中，三条带的荧光强度积分应呈特定的比值，如有改变则提示有RNA的降解。此外，若在点样孔附近有着色条带，则说明存在DNA 的污染。其它方法：必要时，还可通过一些特殊的实验来鉴定RNA的完整性。 如小规模的cDNA第一条链的合成反应，已知大小的某种mRNA的Northern杂交等医学医学生物分子的分离纯化生物分子

11、的分离纯化(1) 对DNA DNA样品溶于pH8.0的TE，4 或-20 保存；在-70可保存数年 长期保存样品中可加入1滴氯仿。(2) 对RNA RNA样品溶于0.3 mol/L NaAc (pH5.2)或双蒸灭菌水中，-70 保存; 长期保存可以沉淀形式贮于乙醇中; 在RNA溶液中，加1滴0.2 mol/L VRC(氧钒核糖核苷复合物)冻贮于-70,可保存数年。（二）核酸的保存医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化尽管基因组DNA因来源、性质以及制备的目的不同，其分离纯化的方法不尽相同，但有关分离纯化的原则、主要步骤、主要技术、主要试剂及其作用原理是一样的。基因组DNA分离纯化的一般

12、程序见图7-4。真核基因组DNA的分离纯化医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化真核基因组DNA分离纯化的一般技术路线医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化1、酚抽提法、酚抽提法(SDS法）法）本法最初于1976年由Stafford及其同事提出，通过改良，以含EDTA、SDS及无DNA酶的RNA酶裂解缓冲液破碎细胞，经蛋白酶K处理后，用pH8.0的Tris饱和酚抽提DNA，重复抽提至一定纯度后，根据不同需要进行透析或沉淀处理获得所需的DNA样品。 医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化裂解液中：EDTA：离子螯合剂，抑制DNase活性，降低细胞膜稳定性SDS：溶解细胞膜、核膜

13、，乳化脂质、蛋白，并使其变性沉淀，同时变性DNase无DNase的RNase可高效水解RNA而避免DNA的消化蛋白酶K：消化DNase和胞中的蛋白质酚：变性沉淀蛋白，抑制DNase活性pH 8.0的Tris溶液保证抽提时DNA进入水相，防止DNA变性医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化q SDSSDS法流程图法流程图 （以动物组织为例）（以动物组织为例） 动物组织动物组织细胞裂解细胞裂解上层溶液上层溶液组织匀浆组织匀浆抽提抽提干燥溶解干燥溶解离心洗涤离心洗涤酒精沉淀酒精沉淀DNA溶液溶液医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化2 2、 甲酰胺解聚法甲酰胺解聚法该法操作步骤少，但耗时

14、，所得DNA浓度低，适用于制备大片段DNA1987年Kupiec等报道了甲酰胺（formamide）解聚法，该法的细胞裂解与蛋白质水解同酚抽提法相似，但不进行酚的抽提，而是以高浓度的甲酰胺裂解DNA与蛋白质的复合物（即染色质），然后通过火棉胶袋的充分透析以除去蛋白酶K和有机溶剂。 医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化 3 3、玻棒缠绕法、玻棒缠绕法用该法收集高分子量DNA的沉淀始于20世纪30年代，现今使用的缠绕法是以1987年Bowtell的方法经改进而来。本法有两个关键步骤：一是基因组DNA沉淀在细胞裂解液和乙醇的交界面；二是将DNA沉淀缠绕在带钩玻棒上。带钩玻棒将大片段DNA从无

15、水乙醇中转移至pH8.0的TE缓冲液中。该法以盐酸胍裂解细胞，制备的DNA片段约有80kb，适用于同时从不同细胞或组织标本中提取DNA医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化基因组基因组DNA其它方法其它方法物理方式物理方式：玻璃珠法、：玻璃珠法、超声波法、研磨法、超声波法、研磨法、冻融法冻融法化学方式化学方式：异硫氰酸胍法、碱裂解法：异硫氰酸胍法、碱裂解法生物方式生物方式：酶法：酶法q根据细胞裂解方式的不同有：根据细胞裂解方式的不同有：医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化基因组基因组DNA其它方法其它方法吸附材料结合法：吸附材料结合法：q根据核酸分离纯化方式的不同有：根据核酸分离

16、纯化方式的不同有：硅质材料硅质材料阴离子交换树脂阴离子交换树脂磁珠磁珠高盐低高盐低pHpH值结合核酸，低盐高值结合核酸，低盐高pHpH值洗脱值洗脱快捷高效。快捷高效。低盐高低盐高pHpH值结合核酸，高盐低值结合核酸，高盐低pHpH值洗脱值洗脱适用于纯度要求高的实验。适用于纯度要求高的实验。磁性微粒挂上不同基团可吸附不同的目磁性微粒挂上不同基团可吸附不同的目的物，从而达到分离目的。的物，从而达到分离目的。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化基因组基因组DNA其它方法其它方法浓盐法浓盐法：有机溶剂抽提法有机溶剂抽提法：密度梯度离心法：密度梯度离心法：利用利用RNP和和DNP在盐溶液中溶解度

17、不同，将二者分离在盐溶液中溶解度不同，将二者分离有机溶剂作为蛋白变性剂，同时抑制核酸酶的降解作用有机溶剂作为蛋白变性剂，同时抑制核酸酶的降解作用利用不同内容物密度不同的原理分离各种内容物利用不同内容物密度不同的原理分离各种内容物医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化基因组基因组DNADNA片段的纯化片段的纯化纯化的原则与要求纯化的原则与要求纯化的方法有透析、层析、电泳及选择性沉淀等。无论采用何种方法从何种支持介质中纯化与回收所需要的DNA片段都要注意两个原则：一是提高片段的回收率；二要清除回收的DNA样品中的污染。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化1.回收率 为提高DNA片段的

18、回收率，可通过提高DNA样品的上样量和选择适宜的方法与材料而实现。2. 纯度 常用的纯化方法包括有机溶剂抽提法与商品化的柱层析法（column chromatography）。柱层析法采用的是阴离子交换层析的原理医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化从琼脂糖凝胶中回收DNA片段从琼脂糖凝胶中纯化DNA片段的方法主要有二乙基氨基乙基（diethyl aminoethyl，DEAE）-纤维素（cellulose）膜插片电泳法电泳洗脱法（透析袋及非透析袋电泳洗脱法）冷冻挤压法低熔点琼脂糖凝胶挖块回收法等。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化从聚丙烯酰胺凝胶回收DNA片段从聚丙烯酰胺凝胶

19、中回收DNA的标准方法是压碎与浸泡法。它是将含待回收DNA条带的凝胶块切出，用吸头或接种针将其压碎，然后以洗脱缓冲液浸泡，使DNA洗脱出来。该方法能很好地回收小于1 kb的ss或ds-DNA，依分子量不同，其回收率从小于30%至大于90%不等。回收的DNA纯度极高，无酶抑制剂，也无对转染细胞或微注射细胞有毒的污染物，虽费时但操作简单，是小片段DNA回收的较好方法。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化质质粒粒D DN NA A的的提提取取与与纯纯化化医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化质粒DNA的提取与纯化的经典方法包括： 碱裂解法 煮沸裂解法 SDS裂解法等这些方法主要由质粒D

20、NA的扩增、质粒DNA的释放、质粒DNA的分离纯化三个步骤组成医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化1、碱裂解法、碱裂解法在NaOH提供的高pH（12.012.6）条件下，用强阳离子去垢剂SDS破坏细胞壁，裂解细胞，与NaOH共同使宿主细胞的蛋白质与染色体DNA发生变性，释放出质粒DNA。 医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化质粒质粒DNA碱裂解法碱裂解法q碱裂解法原理碱裂解法原理染色体染色体DNADNA比质粒比质粒DNADNA分子大得多，且染色体分子大得多，且染色体DNADNA为为线状分线状分子，而质粒子，而质粒DNADNA为共价闭合环状分子；为共价闭合环状分子；当用碱处理当用

21、碱处理DNADNA溶液时，线状染色体溶液时，线状染色体DNADNA容易发生变性，共容易发生变性，共价闭环的质粒价闭环的质粒DNADNA在回到中性在回到中性pHpH时即恢复其天然构象；时即恢复其天然构象；变性染色体变性染色体DNADNA片段与变性蛋白质和细胞碎片结合形成沉片段与变性蛋白质和细胞碎片结合形成沉淀，而复性的超螺旋质粒淀，而复性的超螺旋质粒DNADNA分子则以溶解状态存在液相分子则以溶解状态存在液相中，从而可通过离心将两者分开。中，从而可通过离心将两者分开。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化尽管碱溶液能破坏DNA中的碱基配对，但CCC质粒DNA因缠绕紧密而不易解链，只要不在碱

22、性条件下变性太久，当pH调至中性时，CCC质粒DNA就可重新恢复天然的超螺旋。该法操作简单、重复性好且成本低，制备的质粒纯度能满足DNA测序与PCR等实验要求，是使用最广泛的方法医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化质粒质粒DNA碱裂解法碱裂解法q碱裂解法流程图碱裂解法流程图对数期菌体对数期菌体溶液溶液III中和中和溶液溶液I充分重悬充分重悬溶液溶液II裂解裂解上清液上清液抽提抽提离心洗涤离心洗涤酒精沉淀酒精沉淀干燥溶解干燥溶解沉淀沉淀质粒质粒DNA溶液溶液医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化2 2、SDSSDS裂解法裂解法SDS裂解法是将细菌悬浮于等渗的蔗糖溶液中，用溶菌酶和E

23、DTA处理以破坏细胞壁，去壁细菌再用SDS裂解，从而温和地释放质粒DNA到等渗液中，然后用酚/氯仿抽提，乙醇沉淀、洗涤质粒DNA 由于条件温和，该法特别适用于大质粒DNA（15kb）的提取。但有一部分质粒DNA会与细胞碎片缠绕在一起而丢失，故产率不高。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化3、煮沸裂解法、煮沸裂解法该法条件剧烈，只能用于小质粒DNA的制备煮沸裂解法是将细菌悬浮于含Triton X-100和溶菌酶的缓冲液中，Triton X-100和溶菌酶破坏细胞壁后，沸水浴裂解细胞的同时可破坏DNA链的碱基配对，并使宿主细胞的蛋白质与染色体DNA变性，但CCC质粒DNA因结构紧密不会解链

24、。当温度下降后，CCC质粒DNA可重新恢复其超螺旋结构。通过离心去除变性的蛋白质和染色体DNA，然后回收上清中的质粒DNA。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化质粒质粒DNADNA的纯化的纯化1、CsCl-EB法 利用CsCl形成的连续密度梯度，在过量EB存在的条件下，各种不同密度的物质经离心平衡后得以分开。2、聚乙二醇沉淀法 （一种分级沉淀法）3、柱层析法 （树脂）医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化RNA极易被RNase水解，除胞内的RNase外，它还广泛存在于人的皮肤、唾液、汗液及周围的环境中；RNase分子结构中二硫键的存在使其生物学活性非常稳定，加热煮沸及一般的变性剂

25、均不能使其完全灭活，而且去除变性剂（denaturant）后，RNase的活性又可恢复。因此，在RNA的制备过程中，排除RNase的污染及强有力地抑制其活性是RNA制备成功与否的关键真核细胞RNA的分离纯化医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化 为获得完整的RNA分子，必须在总RNA提取分离的最初阶段，尽可能地灭活胞内RNase的活性。选择性地使用RNase的变性剂（如酚、氯仿及强烈的胍类变性剂）。蛋白酶K和能与蛋白质结合的阴离子去污剂如SDS、十二烷基肌氨酸钠或脱氧胆酸钠，并联合使用RNase的特异抑制剂（如RNasin与DEPC等）能极大地防止内源性RNase对RNA的降解。此外，在

26、变性液中加入-疏基乙醇、二硫苏糖醇（DTT）等还原剂可以还原RNase中的二硫键，有利于RNase的变性、水解与灭活。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化由Chomczynski和Sacchi 于1987年提出。它以含4mmol/L的(异)硫氰酸胍与0.1mmol/L的-巯基乙醇的变性溶液裂解细胞，然后在pH4.0的酸性条件下，用酚/氯仿抽提裂解溶液，最后通过异丙醇沉淀与75%的乙醇洗涤来制备RNA。 。本法具有简便、快速、经济、高效及提取的RNA质量高等优点，能在3小时内迅速处理多个标本 酸性异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法 分离总RNA医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化mRNA

27、mRNA的分离纯化的分离纯化与序列明确的rRNA、tRNA、snRNA、scRNA不同，真核生物的mRNA在细胞中含量少，种类多且分子量大小不一。除血红蛋白及组蛋白的mRNA外，绝大多数mRNA在其3末端带有长短不同的poly（A）尾巴。依据mRNA的结构特征，利用碱基配对原则，通过oligo（dT）-纤维素或poly（U）-琼脂糖凝胶的亲和层析，可以很容易地从总RNA制品中分离纯化mRNA。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化1、oligo（dT）-纤维素柱层析法2、oligo（dT）-纤维素柱离心法3、oligo（dT）-纤维素液相结合离心法4、磁性球珠分离法 该法联合利用了oli

28、go（dT）与poly（A）的互补配对、生物素（biotin）与链亲和素（streptavidin）的结合特异性以及磁性分离原理，可对poly（A）+RNA进行高效、灵敏及快捷的分离。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化5m7G AAAAAAAAAAAA3 3TTTTTTTTTTTT-Biotin5+总RNA中的poly(A) +RNA分子退火形成杂交体 5m7G AAAAAAAAAAAA3 3TTTTTTTTTTTT-Biotin5链亲和素标记的磁珠+Streptavidin- 磁5m7G AAAAAAAAAAAA3 3TTTTTTTTTTTT-Biotin5Streptavidin

29、- 磁生物素与链亲和素的特异性结合 磁性分离5m7G AAAAAAAAAAAA3 磁铁3TTTTTTTTTTTT-Biotin5Streptavidin- 磁洗涤与洗脱水相(含纯化的mRNA)固相生物素标记的oligo(dT)磁铁5m7G AAAAAAAAAAAA3 3TTTTTTTTTTTT-Biotin5Streptavidin- 磁图 3-2 磁珠分离法纯化poly(A) +RNA的原理医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化5、其它方法Poly(U)-凝胶层析法: 利用 Poly(U)与 Poly(A)的互补配对原理Poly(U)-滤纸法: 将总RNA加到共价交联有Poly(U)的

30、滤纸上,经洗涤后加热洗脱医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化核酸分离、纯化核酸分离、纯化q蛋白质的去除：蛋白质的去除：酚酚/ /氯仿抽提氯仿抽提使用变性剂变性（使用变性剂变性（SDSSDS、异硫氰酸胍等）异硫氰酸胍等）高盐洗涤高盐洗涤蛋白酶处理蛋白酶处理医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化q多糖的去除：多糖的去除：高盐法：用乙醇沉淀时，在待沉淀溶液中加入高盐法：用乙醇沉淀时，在待沉淀溶液中加入1/21/2体体积的积的5M NaCl5M NaCl，高盐可溶解多糖。高盐可溶解多糖。用多糖水解酶将多糖降解。用多糖水解酶将多糖降解。在提取缓冲液中加一定量的氯苯在提取缓冲液中加一定量的氯

31、苯(1/2(1/2体积体积) )，氯苯可，氯苯可以与多糖的羟基作用，从而去除多糖以与多糖的羟基作用，从而去除多糖 。用用PEGPEG80008000代替乙醇沉淀代替乙醇沉淀DNADNA：在：在500L DNA500L DNA液中加入液中加入200l 20% PEG200l 20% PEG8000 8000 ( (含含1.2 M NaCl) 1.2 M NaCl) ，冰浴冰浴20min20min。核酸分离、纯化核酸分离、纯化医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化q多酚的去除：多酚的去除：在抽提液中加入防止酚类氧化的试剂：在抽提液中加入防止酚类氧化的试剂：-巯基乙醇、巯基乙醇、抗坏血酸、半胱

32、氨酸、二硫苏糖醇等抗坏血酸、半胱氨酸、二硫苏糖醇等加入易与酚类结合的试剂：如加入易与酚类结合的试剂：如PVPPVP、PEG(PEG(聚乙二醇聚乙二醇) )，它，它们与酚类有较强的亲和力，可防止酚类与们与酚类有较强的亲和力，可防止酚类与DNADNA的结合的结合核酸分离、纯化核酸分离、纯化q盐离子的去除：盐离子的去除：7070的乙醇洗涤的乙醇洗涤医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化1.1.DNADNA中含有蛋白、多中含有蛋白、多糖、多酚类杂质糖、多酚类杂质2.2.DNADNA在溶解前，有酒在溶解前，有酒精残留，酒精抑制精残留，酒精抑制后续酶解反应后续酶解反应3.3.DNADNA中残留有金属

33、离中残留有金属离子子1.1.重新纯化重新纯化DNADNA，去除蛋去除蛋白、多糖、多酚等杂白、多糖、多酚等杂质（具体方法见前）质（具体方法见前）2.2.重新沉淀重新沉淀DNADNA，让酒精让酒精充分挥发充分挥发3.3.增加增加7070乙醇洗涤的乙醇洗涤的次数（次数（2-32-3次）次）DNA提取常见问题提取常见问题q问题一：问题一：DNADNA样品不纯，抑制后续酶解和样品不纯，抑制后续酶解和PCRPCR反应。反应。 原原因因对对策策医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化1.1.材料不新鲜或反复冻材料不新鲜或反复冻融融2.2.未很好抑制内源核酸未很好抑制内源核酸酶的活性酶的活性3.3.提取过

34、程操作过于剧提取过程操作过于剧烈，烈，DNADNA被机械打断被机械打断4.4.外源核酸酶污染外源核酸酶污染5.5.反复冻融反复冻融1.1.尽量取新鲜材料，低温保存材料避尽量取新鲜材料，低温保存材料避免反复冻融免反复冻融2.2.液氮研磨或匀浆组织后，应在解冻液氮研磨或匀浆组织后，应在解冻前加入裂解缓冲液前加入裂解缓冲液3.3.在提取内源核酸酶含量丰富的材料在提取内源核酸酶含量丰富的材料的的DNADNA时，可增加裂解液中螯合剂时，可增加裂解液中螯合剂的含量的含量4.4.细胞裂解后的后续操作应尽量轻柔细胞裂解后的后续操作应尽量轻柔5.5.所有试剂用无菌水配制，耗材经高所有试剂用无菌水配制，耗材经高温

35、灭菌温灭菌6.6.将将DNADNA分装保存于缓冲液中，避免分装保存于缓冲液中，避免反复冻融反复冻融DNA提取常见问题提取常见问题q问题二：问题二：DNADNA降解。降解。对对策策 原原因因医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化1.1.实验材料不佳或量少实验材料不佳或量少2.2.破壁或裂解不充分破壁或裂解不充分3.3.沉淀不完全沉淀不完全4.4.洗涤时洗涤时DNADNA丢失丢失1.1.尽量选用新鲜（幼嫩）的材尽量选用新鲜（幼嫩）的材料料2.2.动植物要匀浆研磨充分；动植物要匀浆研磨充分；G G菌、酵母裂解前先用生物酶菌、酵母裂解前先用生物酶或机械方式破壁或机械方式破壁3.3.高温裂解时，时

36、间适当延长高温裂解时，时间适当延长（对于动物细胞、细菌可增（对于动物细胞、细菌可增加加PKPK的用量）的用量）4.4.低温沉淀，延长沉淀时间低温沉淀，延长沉淀时间5.5.加辅助物，促进沉淀加辅助物，促进沉淀6.6.洗涤时，最好用枪头将洗涤洗涤时，最好用枪头将洗涤液吸出，勿倾倒液吸出，勿倾倒DNA提取常见问题提取常见问题q问题三：问题三：DNADNA提取量少。提取量少。对对策策 原原因因医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化三、蛋白质的分离与纯化医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化蛋白质的分离纯化是研究蛋白质化学组成、结构及生物学功能、新蛋白质的发现和疾病分子诊断的基础；分子克隆中

37、，下游的处理和分析鉴定，基因工程产品的制备，也需要蛋白质的分离和纯化。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化蛋白质分离纯化的总目标是增加制品的纯度（purity）或比活（specific activity），以增加单位蛋白质重量中靶蛋白的含量或生物学活性（比活常以活力单位数/毫克蛋白质表示），即从蛋白混合物中设法去除不要的杂蛋白和变性的靶蛋白，使靶蛋白的产量达到最高值。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化蛋白质分离纯化的一般技术路线 医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化 分离纯化的总体原则 一是保证靶蛋白结构的完整，防止降解和活性蛋白质的变性； 二是尽量满足研究与诊断对靶

38、蛋白纯度的要求。纯化蛋白质总是希望纯度和产率均高，例如纯化某种酶，理想的结果是比活力和总回收率均高，但实际工作中二者不能兼得，通常在科研上希望比活力尽可能高，而牺牲一些回收率，在工业生产和分子诊断中则正相反。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化蛋白质分离纯化的条件蛋白质是一类结构复杂、有生物活性的生物大分子，离开天然的存在体系，其结构与活性变得极不稳定，因此从生物材料中提纯各种靶蛋白均需要特定的条件。应注意各种因素对靶蛋白的影响。 医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化1.缓冲液 2.盐、金属离子和螯合剂.3. 还原剂 4. 去垢剂5. 增溶剂 6. 蛋白酶抑制剂（pronase

39、 inhibitor）7. 蛋白质的环境因素 表面效应的影响温度的影响储存医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化蛋白质的分离纯化方法蛋白质的分离纯化方法蛋白质的分离纯化是依据其溶解性、分子质量大小及形状、电离性质和生物学功能的差异而进行的。分离纯化的方法可分类如下：以溶解度的差异为依据的方法：盐析、分配层析、有机溶剂沉淀、选择性沉淀和结晶等；以分子大小及形状差异为依据的方法：差速离心、区带离心、超滤、透析和凝胶过滤层析等；医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化以电离性质差异为依据的方法：电泳、离子交换层析等；以生物学功能专一性为依据的方法：亲和层析。医学医学生物分子的分离纯化生物分

40、子的分离纯化盐析法：盐析法：将硫酸铵、硫酸钠或氯化钠等加入蛋白质溶液，使蛋白质表面电荷被中和以及水化膜被破坏，导致蛋白质沉淀。 等电点沉淀法：等电点沉淀法：净电荷为零，分子之间的静电排斥力最小，因而容易聚集形成沉淀。该法适用于在等电点pH稳定的蛋白质。有机溶剂沉淀法：有机溶剂沉淀法：甲醇、乙醇、丙酮等（保持低温），破坏蛋白质的水化层，使蛋白质的溶解度降低而沉淀。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化+带正电荷的蛋白质带正电荷的蛋白质带负电荷的蛋白质带负电荷的蛋白质在等电点的蛋白质在等电点的蛋白质水化膜水化膜+带正电荷的蛋白质带正电荷的蛋白质带负电荷的蛋白质带负电荷的蛋白质不稳定的蛋白质颗

41、粒不稳定的蛋白质颗粒酸酸碱碱酸酸碱碱酸酸碱碱脱水作用脱水作用脱水作用脱水作用脱水作用脱水作用溶液中蛋白质的聚沉医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化超过滤除小分子杂质，分离、浓缩蛋白质除小分子杂质，分离、浓缩蛋白质加压蛋白质溶液半透膜支持膜的栅板超滤液医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化凝胶过滤层析凝胶过滤层析(gel filtration)(gel filtration)凝胶过滤层析亦称凝胶色谱、排阻色谱或分子筛，是利用凝胶把分子大小不同的物质分离开的一种方法。凝胶色谱的机理是分子筛效应，在洗脱过程中，大分子不能进入凝胶内部，而沿凝胶颗粒间的空隙最先流出柱外；而小分子可以进入凝

42、胶颗粒内部的多孔网状结构，路径长、流速慢，以至最后流出柱外。因此，混合样品如同“过筛”一样，因分子大小的不同得以彼此分开。 医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化离子交换层析的原理离子交换层析的原理医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化密度梯度（区带）离心：常用蔗糖密度梯度医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化电电 泳泳蛋白质在高于或低于其pI的溶液中为带电的颗粒，在电场中能向正极或负极移动。这种通过蛋白质在电场中泳动而达到分离各种蛋白质的技术, 称为电泳(elctrophoresis) 。电泳(elctrophoresis)医学医

43、学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化几种重要的蛋白质电泳几种重要的蛋白质电泳SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-polyacrylamide gel electrophoresis，SDS-PAGE）：常用于蛋白质分 子量的测定。每一个蛋白质分子都因为结合了许多的SDS而带有大量的负电荷，而蛋白质分子原有的电荷则可以忽略。由于所有的蛋白质颗粒都带有大量的负电荷，而且它们的电荷密度也大体相同，因此，Eq值接近一个常数。所以该法主要利用了蛋白质分子量大小不同而分离蛋白质。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化等电聚焦电泳（等电聚焦电泳（isoelectric focusingisoelec

44、tric focusing，IEFIEF） 通过蛋白质等电点的差异而分离蛋白质的电泳方法。pH梯度以两性电解质ampholyte（脂肪族多胺和多羧同系物）在外电场作用下自然形成。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化 双向凝胶电泳双向凝胶电泳two-dimensional two-dimensional electrophoresis electrophoresis 医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化方法原理优点缺点凝胶层析分子筛的排阻效应分辨力高、不会引起变性凝胶介质昂贵、处理量有限离子交换层析各组份与离子交换剂亲和力不同分辨力高、处理量较大需酸碱处理树脂、操作耗时电泳法等电

45、点、分子量、电荷的差异分辨力很高、可连续制备仪器试剂昂贵盐析法破坏水化膜和中和表面电荷操作简便、成本低、重复性好、对蛋白有保护作用分辨率差、纯化倍数低、沉淀中混杂盐分选择性沉淀等电点、热变性、酸碱变性等沉淀作用选择性较强、方法简便、种类较多应用范围较窄有机溶剂沉淀脱水作用和降低介电常数操作简便、分辨较强对蛋白质或酶有变性作用亲和层析蛋白质与配体之间特殊的亲和力分辨力很高局限性大高速与超速离心沉降系数或密度差异操作方便、容量大设备昂贵制备HPLC凝胶过滤、离子交换、反向色谱等分辩力很高、步骤少，仪器昂贵常用的蛋白质分离纯化方法 医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化蛋白质在组织或细胞中是以

46、复杂的混合物形式存在，每种类型的细胞都含有成千上万种不同的蛋白质，蛋白质的分离纯化往往要采取多种方法联合使用，并通过预实验进行条件优化，逐步地制备高纯度或高比活的靶蛋白，实现蛋白质分离纯化的目标 医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化蛋白质样品的纯度鉴定蛋白质样品的纯度鉴定蛋白质的纯度（purity）一般指是否含有其它杂蛋白，而不包括盐、缓冲液离子、SDS等小分子在内，一定条件下的相对均一性。目前常用的鉴定纯度的方法有：有聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）、SDS-PAGE、毛细管电泳（CE）、等电聚焦电泳（IFE）及高效液相色谱（HPLC）。此外，还有超速离心法、蛋白质的化学组成和结构分析

47、法。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化蛋白质的定量和分子量测定蛋白质的定量和分子量测定蛋白质的定量，通常是指测定溶液中的蛋白质浓度。测定蛋白质总量的方法很多，最早的经典方法是凯氏定氮法，此法虽有普遍性，但操作繁琐，目前极少使用。应用较为广泛的方法是双缩脲法、福林-酚法和紫外吸收法。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化测定蛋白质混合物中某一特定靶蛋白的含量通常要用具有高度特异性的生物学方法。活性的测定和总蛋白量的测定配合起来可以用来表示分离纯化过程中某一特定靶蛋白的纯化程度。纯化程度常用这一特定成分的含量（一般用活力单位）与总蛋白量（质量单位）之比来表示。医学医学生物分子的分离

48、纯化生物分子的分离纯化确定了蛋白质的均一性后，蛋白质的定性以及一级结构的研究，都需要测定蛋白质的分子质量以及亚基和寡聚体的分子质量。测定蛋白质分子质量的方法很多，这此方法都是根据蛋白质的理化性质来测定分子量的，由此测得的分子量称为物理分子质量。与物理分子量相对应的是化学分子量，化学分子量是从化学分析所得的结果，计算而得到的最小分子质量。医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化四、生物小分子的提取纯化医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化1、溶剂提取法2、水蒸气蒸馏法 3、升华法 4、超临界流体萃取法 5、超声提取法 6、固相萃取法 常用提取方法医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离

49、纯化分离精制的原理主要是根据：1）物质溶解度差别；2）物质在两相溶剂中的分配比不同；3)物质的吸附性差别；4）物质分子大小差异等进行分离医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化常用纯化方法1、逆流分配法（CCD） 2、液滴逆流色谱法（DCCC）3、高速逆流色谱法（HSCCC）4、气液分配色谱（GC或GLC）5、液-液分配色谱 6、凝胶过滤法 7、超滤法 8、硅胶吸附色谱9、氧化铝吸附色谱 10、大孔吸附树脂吸附色谱 等 医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化Metabolite Regulation of Glycolysis and GluconeogenesisGlucoseG6

50、PF6PF16P2GlucokinasePEPPyruvateLactate + H+ADPATPPyruvate kinaseOxaloacetateGTPGDPATP CO2ADPPyruvate carboxylaseCO2PEPcarboxy kinaseAcetyl-CoA+F16P2+ATP, Alanine_ATPADPF6P- 1- kinaseCitrate, ATP, H+_AMP, F26P2+Fructose-1,6-bisphosphataseAMP, F26P2_ADPATPPiGlucose-6-phosphataseGlucokinase binding protein (F6P-ligated)_(FBPase)医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化T-StateR-State医学医学生物分子的分离纯化生物分子的分离纯化