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1、医学信息检索特色和专业医学信息检索特色和专业数据库数据库 实用医学信息检索与利用2医学信息检索特色-医学信息组织语言信息组织信息组织利用一定的规则、方法和技术对信息的外部特征和内容特征进行揭示和描述信息从无序集合转换到有序集合信息转为信息资源潜在信息资源转为显在信息资源信息的外部特征信息的外部特征信息的物理载体直接反映的信息对象题名、作者、出版或发表日期、载体的物理形态等反映信息的外在的、形式的特征。信息的内容特征信息的内容特征信息包含的内容，关键词、主题词或其他知识单元表达信息组织语言信息检索语言信息检索语言（文献语言、标引语言、索引语言、标识系统）（文献语言、标引语言、索引语言、标识系统）
2、根据信息组织根据信息组织和信息检索的和信息检索的需要而创制的需要而创制的人工语言人工语言实质：实质：受控语言表达一系列概念及其相互关系的概念标识系统或是自然语言中选择出来并加以规范化的一套词汇功能：功能：简单明了描述文献的主题概念对概念进行系统排列显示概念间的关系排除一词多义、多次一义和词义含糊现象自然语言与受控语言优势优势劣势劣势自然语言自然语言（书面语言）（书面语言）减少概念间转换产生的误差操作简单、方便、灵活，适用范围广查准率降低：选词不规范，词量过大，影响主题的集中。查全率降低：不能控制多义词，使相关主题内容的文献分散。不能反映概念间的各种对应关系与隐含关系。受控语言受控语言（分类号、
3、（分类号、主题词）主题词）提高查准率：文献描述和表达概念具有唯一性、专指性提高查全率：标引时可以集中相关文献显示概念间的各种关系，有利于及时调整检索策略。标引难度大、速度慢、词汇更新滞后、对标引和检索人员要求过高。信息组织语言的两个主要大类体系分类组织语言体系分类组织语言建立在科学分类体系基础上，用分类号表达各种概念并将其按学科性质进行系统排列的组织语言。中国图书馆分类法(中图法)、美国国会图书馆图书分类法（国会法，LCC）、国际专利分类表(InternationalPatentClassification,IPC)主题组织语言主题组织语言一种描述性语言，用语词直接表达文献的主题。这些语词按字
4、顺排列成主题词表，以此作为标引检索的工具。美国医学主题词表（MedicalSubjectHeadings,MESH）、中医药学主题词表、汉语主题词表中国图书馆分类法（中图法）u建国后编制出版的大型综合性分类法。自1999年第四版起更名为中国图书馆分类法（ChineseLibraryClassification）。u既可以组织藏书排架又可以分类检索的列举式等级式体系组配分类法u按照知识门类的逻辑次序从抽象到具体、从一般到特殊、从简单到复杂对知识进行科学划分，从而产生不同级别且存在隶属关系、体现知识等级体系的类目。u每一类目分别以不同分类号做标识，分类号由字母和数字组合而成。u主要特点：按学科、专
5、业集中文献，并从知识分类角度揭示各类文献在内容上的区别和联系，提供从学科分类检索信息的途径。u全表把知识体系分五大部类二十二大类。中图法分类体系基本部类一级大类三级类目二级类目马列主义、毛泽东思想哲学社会科学自然科学综合性图书B哲学、宗教A马克思主义、列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论C社会科学总论D政治、法律E军事F经济G文化、科学、教育、体育H语言、文字I文学J艺术K历史、地理N自然科学总论O数理科学和化学P天文学、地球科学Q生物科学R医药、卫生S农业科学T工业技术U交通运输V航空航天X环境科学、安全科学Z综合性图书C社会科学总论K历史、地理N自然科学总论O数理科学和化学P天文学、地球科学Q
6、生物科学R医药、卫生X环境科学、安全科学R1预防医学、卫生学R2中国医学R3基础医学R4临床医学R5内科学R6外科学R71妇产科学R72儿科学R73肿瘤学R74神经病学与精神病学R75皮肤病学与性病学R76耳鼻咽喉科学R77眼科学R78口腔科学R79外国民族医学R8特种医学R9药学R51传染病R52结核病R53寄生虫病R54心脏、血管（循环系）疾病R55血液及淋巴系疾病R56呼吸系及胸部疾病R57消化系及腹部疾病R58内分泌腺疾病及代谢病R59全身性疾病其他级类目R59nR591营养缺乏症（四级）（四级）nR591.1无机盐缺乏症nR591.2蛋白质及氨基酸缺乏症nR591.3不饱和脂酸缺乏症
7、nR591.4维生素缺乏症（五级）（五级）nR591.41维生素A缺乏症（六级）（六级）nR591.42维生素B缺乏症nR591.43维生素C缺乏症nR591.44维生素D缺乏症nR591.45维生素E缺乏症nR591.49维生素K缺乏症nR591.5内源性营养缺乏症nR592老年病学R593免疫性疾病nR594物理性损害R595中毒及化学性损害R596遗传性疾病R597原因未明的疾病nR598职业性疾病nR599地方病学分类法在图书分类中的应用医学文献检索与利用/主编梅谊G252.7/M288医学文献检索/主编郭继军G252.7/G769分类法在CBM数据库中的体现美国医学主题词表u（Med
8、icalSubjectHeadings，MeSH）http:/www.nlm.nih.gov/mesh/meshhome.htmlu美国国立医学图书馆（NLM）编辑出版的用于储存、检索文献的受控词汇表。u用2万多个规范术语通过各种参照系统表达数十万个医学专业术语。（Thereareare27,149descriptorsin2014MeSH.）u对生物医学文献进行主题分析和标引的权威性工具，是指导使用主题词途径进行文献检索的权威性工具。About MeSHuMeSH is the National Library of Medicines controlled vocabulary thesa
9、urus. It consists of sets of terms naming descriptors in a hierarchical structure that permits searching at various levels of specificity.uThe first official list of subject headings published by the National Library of Medicine appeared in 1954 . In 1960, a new and thoroughly revised Medical Subjec
10、t Headings was published.uThere are 27,149 descriptors in 2014 MeSH. There are also over 218,000 entry terms( or text words) that assist in finding the most appropriate MeSH Heading.uThe MeSH thesaurus is used by NLM for indexing articles from 5,400 of the worlds leading biomedical journals for the
11、MEDLINE/PubMED database. uIt is also used for the NLM-produced database that includes cataloging of books, documents, and audiovisuals acquired by the Library. Each bibliographic reference is associated with a set of MeSH terms that describe the content of the item. Similarly, search queries use MeS
12、H vocabulary to find items on a desired topic.MESH结构1主题词变更表（MeSHVocabularyChanges）：分别列出每年新增和删去的主题词。2主题词字顺表（MeSH）：将所有主题词、副主题词、与之有关系的非规范用词全部按字顺排列。每一主题词下列出该主题词建立的年代、树状结构号、历史注释和各种参照系统。3树状结构表（TreeStructures）：将所有主题词按学科门类系统分为16个大类。每个大类又细分为不同级别的小类，最多至12级类目。MESH标引词类型u叙词（Descriptors）：也称主题词（MainHeadings）。描述文献实
13、质概念的名词术语。同样用于PubMed的检索。每年更新。u出版特征词：即出版物类型（PublicationTypes）。如综述、临床试验、编辑部社论等。可检索形式：PTu地理名词（Geographics）：描述文献中出现的地区区域的名词术语。u修饰词（Qualifiers）：也称副主题词（Subheadings）。与主题词组配使用，表示所描述主题概念的某一特殊方面。可检索形式：SHu辅助概念词（SupplementaryConceptRecords）：用于标引化学物质、药物、或其他概念如罕见病的名词术语。可用于PubMed的检索。MESH主题词间的关系：层级关系u表明各术语间的逻辑关系。即展现
14、整部词表的结构，又可提高检索效率。u体现在树形结构表中。uHierarchical:termsthatarebroaderornarrower.Itnotonlyprovidesanoverviewofthestructureofathesaurusbutalsocanbeusedtoenhancesearching.uMeSHisorganizedhierarchicallyinto16trees.Eachcategoryisfurtherdividedintosubcategories.Withineachsubcategory,descriptorsarearrayedhierarchi
15、callyfrommostgeneraltomostspecificinuptotwelvehierarchicallevels.树形结构树形结构A解剖学B有机体C疾病N保健Z地理名词D化学物质和药品D1无机化学制品D2有机化学制品D26其他药剂D4多环碳氢化合物D3杂环化合物C1细菌性和细菌性和真菌性疾病真菌性疾病 C2病毒性疾病病毒性疾病 C3寄生虫病寄生虫病 C4肿瘤肿瘤 C5肌肉骨骼肌肉骨骼疾病疾病 C6消化系统消化系统疾病疾病 C23症状和普通症状和普通病理学病理学 树形结构示意图树形结构示意图1树状结构示意图树状结构示意图2头部耳面部耳(感觉器官)外耳中耳迷路颊颏眼额口腔鼻唇眼睑(
16、感觉器官)睫毛睑板腺眼睑眉毛睫毛MESH树形结构类目表1.AnatomyA2.OrganismsB3.DiseasesDiseasesC4.ChemicalsandDrugsD5.Analytical,DiagnosticandTherapeuticTechniquesandEquipmentE6.PsychiatryandPsychologyF7.PhenomenaandProcessesG8.DisciplinesandOccupationsH9.Anthropology,Education,SociologyandSocialPhenomenaI10.Technology,Industr
17、y,AgricultureJ11.HumanitiesK12.InformationScienceL13.NamedGroupsM14.HealthCareN15.PublicationCharacteristicsV16.GeographicalsZDiseasesC分类NeoplasmsC04分类NeoplasmsC04NeoplasmsbySiteC04.588AbdominalNeoplasmsC04.588.033+AnalGlandNeoplasmsC04.588.083BoneNeoplasmsC04.588.149+BreastNeoplasmsC04.588.180Breas
18、tNeoplasms,MaleC04.588.180.260MammaryNeoplasmsC04.588.180.520MammaryNeoplasms,ExperimentalC04.588.180.525PhyllodesTumorC04.588.180.762DigestiveSystemNeoplasmsC04.588.274+“糖尿病”树形结构内分泌系统疾病糖尿病糖尿病并发症糖尿病并发症糖尿病血管病变(+2)糖尿病足糖尿病视网膜病变糖尿病昏迷(+1)高血糖高渗性非酮性昏迷糖尿病酮症酸中毒糖尿病肾病糖尿病神经病变(+1)糖尿病足巨大胎儿“糖尿病并发症”树形结构MESH主题词间的关系：
19、同义词u用不同的术语表达同一个概念。体现在“entryterms”中。同义词、近义词或密切相关词均被收录在“entryterms”中，帮助用户发现相关的检索术语。uSynonymous:termsthataresynonyms,allowingtheindexerorsearchertoexpressaconceptindifferentwords.uManysynonyms,near-synonyms,andcloselyrelatedconceptsareincludedasentrytermstohelpusersfindthemostrelevantMeSHdescriptorfort
20、heconcepttheyareseeking.Thereareover218,000entryterms.Entrytermsarealsotextwordsingeneral.uforexample:VitaminCisanentrytermtoAscorbicAcid“.“genetherapy”isanentrytermto“genetictherapy”.uThismeanswhenyouusegenetherapytofindrelatedliteraturesbymesh,theMedicalsubjectheadingis“genetictherapy”,notgenether
21、apy.MeSH Descriptor Data: ascorbic acidentry term: vitamin c(2013)Entry term: cancer MeSH Descriptor Data: neoplasmsMESH主题词间的关系：相关关系u既不是同义词也不存在层级关系，但词语间的确存在某种关系。提醒用户利用不同的检索词检索以提高检索效率。uRelated:termsthatarenotsynonymousorhierarchicalbutaresomehowotherwiserelated.Theseusuallyremindthesearcherofdifferen
22、tbutrelatedtermsthatmayenhanceasearch.u“Seealso”inmeshdescriptordata.MeSH Descriptor Data:genetic therapy entry term:gene therapy (2013)MESH规范形式：参照系统用代参照：Asee（见）BA：非规范化用词B：规范用词（主题词）即：用B检索文献。如：cancerseeneoplasms癌症见肿瘤膀胱癌见膀胱肿瘤羟基吡哆辛酸见吡哆酸MESH规范形式：主题词倒置uAcuteabdomenabdomen,acuteu急性肾功能衰竭肾功能衰竭,急性u局限性癫痫癫痫,局限
23、性见癫痫,部分型u重组DNA疫苗疫苗，DNAMESH规范形式：主题词、副主题词组配u副主题词副主题词(Subheadings)又称限定词，与主题词进行组配，对某一主题又称限定词，与主题词进行组配，对某一主题词的概念进行限定或复分，使主题词具有更高的专指性。词的概念进行限定或复分，使主题词具有更高的专指性。uMESH目前有83个副主题词。副主题词的使用有严格的限制。 如：诊断（如：诊断（Diagnosis，DI）、药物治疗（）、药物治疗（Drug Therapy，DT）u中医的副主题词有：按摩疗法,气功疗法,穴位疗法,针灸疗法,中西医结合疗法,中医病机,中医药疗法,中药疗法,中医疗法。u在检索中
24、，主题词与副主题词的组配（主题词在检索中，主题词与副主题词的组配（主题词/副主题词）须有逻辑关系。副主题词）须有逻辑关系。 如：如：阿司匹林治阿司匹林治疗感冒感冒 阿司匹林阿司匹林/治治疗应用；感冒用；感冒/药物物疗法。法。SubheadingsuThe diagnosis of hypertension search engines: diagnosis and hypertension MeSH: Hypertension/diagnosisuSubheadings: are qualifiers to headings that can be attached to narrow the
25、 focus of a term. There are 83 subheadings in MeSH in 2013. uEach tree category can be restricted the attachment of certain subheadings. eg. drug therapy cannot be attached to an anatomic site, such as the femur. Blood cannot be attached to plant categories, such as plant weeds, trees and so on. Sub
26、headings Hierarchies(1) classification drug effects History injuries instrumentation methods pathogenicity psychology radiation effects veterinarySubheadings Hierarchies(2)Topical Subheadings with Scope Notes,Abbreviations, and Allowable Categories(for example)http:/www.nlm.nih.gov/mesh/topsubscope.
27、htmluabnormalities (A1-5, A7-10, A13, A14, A17, B2) AB, abnormUsed with organs for congenital defects producing changes in the morphology of the organ. It is used also for abnormalities in animals. uadministration & dosage (D1-3, D3-27) AD, adminUsed with drugs for dosage forms, routes of administra
28、tion, frequency and duration of administration, quantity of medication, and the effects of these factors. utherapy (C, F3) TH, therUsed with diseases for therapeutic interventions except drug therapy, diet therapy, radiotherapy, and surgery, for which specific subheadings exist. The concept is also
29、used for articles and books dealing with multiple therapies. Scope notes Allowable categories(tree structure number)abbreviationsuA6,A11,A12, A15,A16, A18-21 can not be obviously attached to subheading abnormalities in theory.uThere exists closely logic relationship between headings and subheadings.
30、主题词、副主题词组配示例1某种疾病的药物治疗某种疾病的药物治疗:疾病名称(主题词)/药物疗法(副主题词)药物名称(主题词)/治疗应用(副主题词)例:阿司匹林治疗心脏病阿司匹林/治疗应用心脏病/药物疗法drug therapy (DT)与疾病主题词组配,表明通过投给药品、化学品或抗生素治疗疾病。至于膳食疗法和放射疗法,则分别用“膳食疗法”和“放射疗法”。而免疫疗法及生物制品治疗则用“治疗”。therapeutic use (TU)与药品、生物制品及物理因素主题词组配,表明将其用于预防或治疗疾病,包括兽医用药。治疗应用的下位词包括：投药和剂量、副作用、禁忌证、中毒。u某种疾病的诊断乳腺癌的超声诊断
31、udiagnosis(DI)u与疾病主题词组配,表明诊断的各个方面,包括检查、鉴别诊断及预后;但不包括普查,此时应用“预防和控制”;也不包括放射学诊断、放射性核素扫描诊断和超声诊断,应分别用“放射摄影术”、“放射性核素显像”和“超声检查”。u诊断的下位词包括：病理学、放射摄影术、放射性核素显像、超声检查。乳腺癌普查：乳腺肿瘤/预防和控制主题词、副主题词组配示例2u药物引发某种疾病：疾病/化学诱导药物/副作用例：阿司匹林引起消化性溃疡阿司匹林/副作用消化性溃疡/化学诱导uadverseeffects(AE)u与药品、化学物质、生物制品、物理因素及制品主题词组配,表明以正常可接受的剂量或用法,用于
32、诊断、治疗、预防疾病及麻醉时的不良反应;也可与各种诊断、治疗、预防、麻醉、外科手术或其它技术操作主题词组配,表明因操作引起的副作用或并发症。但除外禁忌证,此时须用“禁忌证”。副作用的下位词包括：毒性、中毒。uchemicallyinduced(CI)u用以表明由于化学物质引起人或动物的疾病、综合征、先天性畸形或症状。主题词、副主题词组配示例3用加压素治疗休克引起冠状动脉疾病n冠状动脉疾病/化学诱导加压素/副作用加压素/治疗应用休克/药物疗法http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/table/pubmedhelp.T41/?report=objecton
33、ly（副主题词表）Pleases find Mesh headings and its Scope Note and allowable qualifiersuHand washing Mesh: http:/www.nlm.nih.gov/mesh/meshhome.htmlHand washingHand washing hand disinfectionSearching subheadings of Scope Notes, Abbreviations, Allowable Categories and entry term.uadverse effects Subheadings:
34、adverse effectsExercise 1uPleases find Mesh headings and its scope note and allowable qualifiers.Physical MedicineRehabilitation of Hearing ImpairedChronic Kidney FailureHuman Viral Hepatitis Juvenile-Onset DiabetesExercise 2uPlease find subheadings of scope notes, abbreviations, allowable categories and entry term.BloodDiagnosisDrug therapy EpidemiologyExercise3请分析下列检索需求的检索用词。写出中英文主题词和副主题词。n肝硬化的并发症n房颤的遗传学机制n乳腺癌的普查n维生素C预防感冒n美林（治疗发热）的副作用n阿昔洛韦治疗带状疱疹n慢性阻塞性肺疾病的营养干预
