MedLinePUBMED数据库检索.ppt

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1、MEDLINEMEDLINE数据库检索数据库检索MEDLINE是由美国国立医学图书馆(NLM)下属的美国生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)研制的数据库,是美国国立图书馆MEDLARS系统规模最大、权威性最高的著名医学文献数据库。检索途径:可通过光盘检索或INTERNET检索。PUBMED: ( http:/WWW.PUBMED.COM 或http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed )InforTrieve Online: (http:/ Central: (http:/或 http:/

2、 Finder:(http:/)(需免费注册)Psychiatry24x7:(http:/ Nucleotide(核酸),Protein Sequences(蛋白质序列), Protein Structures(蛋白结构), Complete Genomes(全基因组), Taxonomy等。数据来源MEDLINE/OLDMEDLINE:MEDLINE收录1966年以来70多个国家4600多种生物医学期刊,涉及医学、牙科学、护理学、兽医学、药学、健康保健及前临床科学等学科。OLDMEDLINE还包括1951-1965年的数据。MEDLINE每星期都有新的条目内容加入。标记为PubMed-ind

3、exed for MEDLINEIn Process Citations :收录未经标引的生物医学期刊中的原始资料。这些数据经对照MeSH(Medical Subject Headings)词表将原始文献标引主题词、标明文献类型及其它索引信息等加工成MEDLINE的正式格式后转入MEDLINE,并从PREMEDLINE中删除。PREMEDLINE记录都有PubMed-in process标记 。Publisher-Supplied Citations (Articles Not in MEDLINE or PREMEDLINE):出版商直接向PubMed提供的电子文献,未被MEDLINE收录的

4、文献,标识为“PubMed-as supplied by publisher”。PubMed文献数据量大、新。PubMed设有对其它如分子生物数据库资源的超链,包括Web界面的杂志全文的链接,方便读者使用;可以检索最新文献,几乎没有时差,这是其它同类数据库很难和其相媲美的。PubMed可自动更正作者、期刊名等出现的错误。 PubMed设有自动转换功能,对于要检索的单词或短语,PubMed逐一对照下列索引:MeSH转换表(MeSH Translation Table)、期刊刊名转换表(Journal Translation Table)、短语表(Phrase list)、作者索引(Author

5、Index),自动转换成其中相应的词或短语。如果在索引中找不到该短语,PubMed将把短语分开,以单词为单位,重复以上过程,检索词之间是逻辑“与”关系。个性化服务。数据库选择数据库选择检索式输入框检索式输入框个性化注册个性化注册基本检索 高级(限定)检索主题词检索 辅助检索预检索/索引检索(Preview/Index)1.关键词检索:在检索框中输入单个或多个关键词,中间可空格、逗号或逻辑组关键词检索:在检索框中输入单个或多个关键词,中间可空格、逗号或逻辑组配符将关键词隔开。空格、逗号时默认的是逻辑组配符配符将关键词隔开。空格、逗号时默认的是逻辑组配符AND。2.期刊检索:在输入框中输入刊名进行

6、检索,刊名可以是期刊检索:在输入框中输入刊名进行检索,刊名可以是MEDLINE认可的标准认可的标准缩写或全称、缩写或全称、NLM ID, ISO缩写或缩写或ISSN号。也可以先点击左边号。也可以先点击左边Journals Database进行期刊检索。在进行期刊检索。在Journals Database界面下列出了提供全文的期刊列界面下列出了提供全文的期刊列表,部分期刊提供免费全文,有些期刊浏览全文时需要注册或订购。表,部分期刊提供免费全文,有些期刊浏览全文时需要注册或订购。3.作者检索:输入作者(姓在前,名在后)进行检索,通常姓用全称,名用缩写。作者检索:输入作者(姓在前,名在后)进行检索,

7、通常姓用全称,名用缩写。4.字段限定检索:字段限定检索: 一般格式为一般格式为“检索词检索词字段名或缩写字段名或缩写”,如,如cirrhosisti表示在题表示在题名中检索名中检索cirrhosis。5.逻辑组配:逻辑组配:PubMed支持布尔逻辑组配,逻辑组配符大小写均可,但最好使用大支持布尔逻辑组配,逻辑组配符大小写均可,但最好使用大写字母,逻辑组配式的运行次序是从左至右按逻辑运算符运算级别进行运算,写字母,逻辑组配式的运行次序是从左至右按逻辑运算符运算级别进行运算,可使用括号改变其运算次序。可使用括号改变其运算次序。6.截词检索:截词检索:PubMed可采用星号(可采用星号(*)进行截词

8、检索,如检索)进行截词检索,如检索neoplas*,则表示,则表示检索所有词以检索所有词以neoplas开始的词,如开始的词,如neoplasia、neoplasm、neoplasticism等单词。等单词。 Search Field Descriptions and TagsAffiliation ADAll Fields ALLAuthor AUFirst Author Name 1AUFull Author Name FAUIssue IPJournal Title TALanguage LAMeSH Major Topic MAJRMeSH Subheadings SHMeSH Ter

9、ms MHPublication Date DPPublication Type PTSubset SBSubstance Name NMText Words TWTitle TITitle/Abstract TIABTransliterated Title TTVolume VI限定检索限定检索限定条件主题词点点击PubMed主主页“Mesh Database”链接,或在接,或在“search”后的数据后的数据库选择下拉框中下拉框中选择“Mesh”可可进入主入主题词检索索。在在检索框内索框内输入入检索索词,如:heart surgery ,点点击“Search”或或“Go”。有匹配主题词时或

10、款目词,列出相关的主题词及其解释。若没有匹配的主题词或款目词,Suggestions中列出与输入词“heart surgery”词形相近的词。副主题词点点击相相应主主题词,Cardiac Surgical Procedures,可选择副主副主题词组配配,并列出检索词的树状结构表。副主题词列表下有两个选项,其作用为:Restrict Search to Major Topic headings only:此选项选中,表示检索主要主题词。Do Not Explode this term:表示不对该词进行下位词扩展检索,只检索该词本身。扩展检索表示不仅检索要检索的主题词,还同时对该主题词的下位词进行

11、扩展检索。检索式生成选中副主中副主题词后后点点击“Add to search builder” ,得到检索表达式框界面。如果要对多个主题词进行检索,可重复以上步骤,主题词之间的逻辑关系可通过点击“Send to”按钮后面的下拉式选择框来指定。可检索框中对检索式作进一步修改。修改时注意括号及逻辑算符的匹配。点点击“Search PubMed”即可得到即可得到检索索结果。果。点击点击PubMed主页中的主页中的“Mesh Database”,或在,或在“search”后的数据后的数据库选择下拉框中选择库选择下拉框中选择“Mesh”可进入主题词检索。可进入主题词检索。在检索框内输入检索词,如:在检索框内输入检索词,如:heart surgery ,点击,点击”Go”。主题词及其解释主题词及其解释点击相应主题词,可选择副主题词组配点击相应主题词,可选择副主题词组配点击主题词或选择“Display Settings”下的“Full”格式选项,选择副主题词。先点击“Add to search builder”再点击“Search PubMed”按钮。

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