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1、. . 页脚 Cytoscape 软件画图说明 . . 页脚 1、画图前,先准备两个输入文件。 2、打开 cytoscape 软件,导入数据。 导入 edge.txt 文件 点击 File -Import -Network . . 页脚 点击 ok 得到原始图形 节点 1,文件中第一列 节点 2,文件中第 2 列 连接类型, 文件中第 3 列 . . 页脚 点击 layout -Apply Preferred Out 改变图形排列方式 此处可以用鼠标在画布中拖动图形到合适的位置。 改变画布背景。点击左侧 Contro Panel -Style-network -Backgroud paint
2、. . 页脚 设置节点之间连线的宽度和颜色 Contro Panel -Style-Edge 宽度 颜色 . . 页脚 导入 node.txt 个文件 点击 File -Import -Table . . 页脚 设置节点图形属性 Contro Panel -Style-Node . . 页脚 1、node 大小 通过设置 Height 和 Width 来控制大小 2、Node 性状 通过设置 Shape 来控制 3、Node 填充色 通过设置 Fill Color 来控制 4、Node 标签的设置 点击 Properties - Label Position . . 页脚 点击 Label Position 来设置标签位置。这里是一个示操作,要细致调整标签位置还是要设置 Column 和 Mapping Type 两个参数。 设置完成之后图形 调节节点之间的距离 点击 layout -Scale 鼠标拖动 . . 页脚 最后,画图导出成 pdf 文件 点击 File -Export-Network View as Graphics