分子生物学课件:第20章 常用分子生物学技术的原理及应用

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1、目录目录常用分子生物学技术的常用分子生物学技术的原理及应用原理及应用The Principle and Application of Common Used Techniques in Molecular Biology第二十章第二十章目录目录第五节第五节生物大分子相互作用研究技术生物大分子相互作用研究技术 The Method of Protein-protein and Protein-DNA Interaction Study目录目录一、蛋白质相互作用研究技术一、蛋白质相互作用研究技术酵母双杂交酵母双杂交各种亲和分析(标签蛋白沉淀、免疫共沉淀等)各种亲和分析(标签蛋白沉淀、免疫共沉淀等)

2、n常用蛋白质相互作用的研究技术常用蛋白质相互作用的研究技术目录目录标签融合蛋白结合实验是一个基于亲和色谱标签融合蛋白结合实验是一个基于亲和色谱原理的、分析蛋白质体外直接相互作用的方法。原理的、分析蛋白质体外直接相互作用的方法。(一)标签蛋白沉淀(一)标签蛋白沉淀标签融合蛋白结合实验主要用于证明两种蛋标签融合蛋白结合实验主要用于证明两种蛋白分子是否存在直接物理结合、分析两种分子结白分子是否存在直接物理结合、分析两种分子结合的具体结构部位及筛选细胞内与融合蛋白相结合的具体结构部位及筛选细胞内与融合蛋白相结合的未知分子。合的未知分子。 目录目录标签融合标签融合蛋白沉淀蛋白沉淀实验流程实验流程示意图示

3、意图目录目录(二)酵母双杂交技术的基本原理(二)酵母双杂交技术的基本原理和用途和用途目录目录n酵母双杂交系统的应用酵母双杂交系统的应用证明两种已知基因序列的蛋白质可以相互作用证明两种已知基因序列的蛋白质可以相互作用的生物信息学推测。的生物信息学推测。 分析已知存在相互作用的两种蛋白质分子的的分析已知存在相互作用的两种蛋白质分子的的相互作用功能结构域或关键的氨基酸残基。相互作用功能结构域或关键的氨基酸残基。将拟研究的蛋白质的编码基因与将拟研究的蛋白质的编码基因与BD基因融合成基因融合成为为“诱饵诱饵”表达质粒,可以筛选表达质粒,可以筛选AD基因融合的基因融合的“猎物猎物”基因表达文库,筛选未知的

4、相互作用基因表达文库,筛选未知的相互作用蛋白质。蛋白质。目录目录电电 泳泳 迁迁 移移 率率 变变 动动 测测 定定 ( (electrophoretic mobility shift assay,EMSA)或或称称凝凝胶胶迁迁移移变变动动实实验验( (gel shift assay)最最初初用用于于研研究究DNA结结合合蛋蛋白白与与相相应应DNA序序列列间间的的相相互互作作用用,可可用用于于定定性性和和定定量量分分析析,已已经经成成为为转转录录因因子子研研究究的的经经典典方方法法。目目前前这这一一技技术术也也被被用用于于研研究究RNA结结合合蛋蛋白白和和特特定定RNA序列间的相互作用。序列间

5、的相互作用。二、二、DNA-蛋白质相互作用分子分析技术蛋白质相互作用分子分析技术(一)电泳迁移率变动测定(一)电泳迁移率变动测定目录目录放放射射自自显显影影未结合探针未结合探针结合有蛋白的探针结合有蛋白的探针标记探针标记探针1X1X1X1X核蛋白提取物核蛋白提取物1X10X10X未标记探针未标记探针10Xn凝胶迁移实验结果示意图凝胶迁移实验结果示意图目录目录染染色色质质免免疫疫沉沉淀淀技技术术(chromatin immunoprecipitation assay, ChIP)是是目目前前可可以以研研究究体体内内DNA与与蛋蛋白白质质相相互互作作用用的的主要方法。主要方法。(二)染色质免疫沉淀法(二)染色质免疫沉淀法目录目录n染色质免疫沉淀实验流程及结果示意图染色质免疫沉淀实验流程及结果示意图

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