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1、结构化学选读结构化学选读课程基本目的课程基本目的生物大分子结构与生物分子识别的基本原理生物大分子结构与生物分子识别的基本原理研究生物大分子结构与识别的生物物理化学方法研究生物大分子结构与识别的生物物理化学方法生物大分子结构与生物分子识别研究进展生物大分子结构与生物分子识别研究进展 绝世唐门 课程主要内容1、蛋白质及核酸结构原理蛋白质及核酸结构原理2 2、蛋白质结构预测方法、蛋白质结构预测方法3 3、蛋白质折叠研究、蛋白质折叠研究4 4、用用于于蛋蛋白白质质、核核酸酸构构象象研研究究的的光光谱谱学学方方法法 （紫外、荧光、圆二色光谱等）（紫外、荧光、圆二色光谱等）5 5、 生生 物物 分分 子
2、子 识识 别别 研研 究究 的的 物物 理理 化化 学学 方方 法法 （等温滴定量热，超速离心等）（等温滴定量热，超速离心等）6 6、生物大分子结构测定生物大分子结构测定7 7、蛋白质及药物分子设计、蛋白质及药物分子设计 蛋白质结构分类：蛋白质结构分类：球蛋白球蛋白（水溶性蛋白）（水溶性蛋白）膜蛋白膜蛋白纤维蛋白纤维蛋白蛋白质功能分类催化功能催化功能运输功能运输功能营养和贮存功能营养和贮存功能收缩和运动功能收缩和运动功能结构功能结构功能防御功能防御功能调控功能调控功能其它其它蛋白质折叠问题蛋白质序列、结构、功能蛋白质序列、结构、功能 序列结构结构功能功能有关的蛋白质结构数据库蛋白质晶体结构数据
3、库 Brookhaven PDB (生物信息服务器） RCSB-PDB （http:/www.rcsb.org)蛋白质结构分类库SCOPCATHPDBSUM一级结构一级结构 二级结构二级结构 三级结构三级结构 四级结构四级结构蛋白质的一级结构2020种氨基酸残基由肽键相连成的序列种氨基酸残基由肽键相连成的序列AGPFSCHEDSGPFCSFPGA?. 20种标准氨基酸种标准氨基酸疏疏水水性性Ala Val Leu Ile Phe Pro Met带带 电电 ： Arg Lys Asp Glu (His)极极性性：Ser Thr Cys Asn Gln His Tyr Trp特殊：特殊：Gly (Pro)氨基酸的稳定性与后修饰氨基酸的稳定性与后修饰Cys, MetAsnSer, Thr, TyrGlyProHis0.360Cys0.210Ser0.130Lys0.100Thr0.100Asn0.080Arg0.055Gln0.050Glu0.050Asp0.045Ala0.025Met0.025Ile-0.005Tyr-0.040Val-0.060Gly-0.070Phe-0.120Trp-0.140Leu-0.180Pro-0.200氨基酸残基在活性部位出现的几率氨基酸残基在活性部位出现的几率
