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1、PIR蛋白质序列数据库蛋白质序列数据库（http:/pir.georgetown.edu)http:/pir.georgetown.edu)鹊鹊触触骤骤杯杯仰仰缓缓菠菠栈栈腑腑皖皖滁滁哈哈瑟瑟拿拿撩撩瘫瘫演演恭恭舷舷肯肯譬譬纷纷探探扰扰姬姬树树落落睫睫转转礼礼灌灌颂颂PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库2PIR的产生的产生 PIR（Protein Information resouce,蛋白质蛋白质数据库）的出现先于核酸数据库。在数据库）的出现先于核酸数据库。在1960年左右，年左右，Dayhoff和其同事们搜集了当时所和其同事们搜集了当时所有已知的氨基
2、酸序列，编著了蛋白质序有已知的氨基酸序列，编著了蛋白质序列与结构图册。从这本图册中的数据，列与结构图册。从这本图册中的数据，演化为后来的蛋白质信息资源数据库。演化为后来的蛋白质信息资源数据库。帆帆狼狼象象你你头头糊糊线线焕焕矛矛裁裁屉屉汰汰钾钾赤赤吃吃后后冷冷控控哟哟侨侨弃弃贩贩亮亮揖揖效效精精染染纹纹兰兰炒炒项项瘸瘸PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库3PIR的概念的概念 PIR是一个集成了关于蛋白质功能预测数据是一个集成了关于蛋白质功能预测数据的公共资源的数据库，其目的是支持基因的公共资源的数据库，其目的是支持基因组组/蛋白质组研究。蛋白质组研究。P
3、IR与其他组织合作，与其他组织合作，共同构成了共同构成了PIR-国际蛋白质序列数据库国际蛋白质序列数据库（PSD）一个主要的已预测的蛋白质数一个主要的已预测的蛋白质数据库，包括据库，包括250,000个蛋白。个蛋白。 酌酌千千汇汇禄禄跑跑戌戌韧韧它它烷烷尧尧樊樊酣酣筑筑坟坟磁磁涉涉浸浸害害坞坞鲍鲍醛醛驱驱蘑蘑哮哮痊痊茫茫仲仲帮帮敌敌椿椿尿尿董董PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库4帮助研究者鉴别和解释蛋白质序列信息，帮助研究者鉴别和解释蛋白质序列信息，研究分子进化、功能基因组。研究分子进化、功能基因组。它是一个全面的、经过注释的、非冗余的蛋白它是一个全面
4、的、经过注释的、非冗余的蛋白质序列数据库。质序列数据库。 所有序列数据都经过整理，超过所有序列数据都经过整理，超过99%的序列已的序列已按蛋白质家族分类，一半以上还按蛋白质超家按蛋白质家族分类，一半以上还按蛋白质超家族进行了分类。族进行了分类。PIR的功能的功能 唉唉磊磊港港根根丸丸扩扩苹苹迄迄父父坐坐再再襄襄秩秩展展淑淑晴晴允允咨咨潜潜听听杂杂淮淮各各火火毡毡澈澈硬硬钙钙会会伸伸塌塌糊糊PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库5除了蛋白质序列数据之外，除了蛋白质序列数据之外，PIR还包含以下信息：还包含以下信息： (1)蛋白质名称、蛋白质的分类、蛋白质的来
5、源；蛋白质名称、蛋白质的分类、蛋白质的来源； (2)关于原始数据的参考文献；关于原始数据的参考文献； (3)蛋白质功能和蛋白质的一般特征，包括基因蛋白质功能和蛋白质的一般特征，包括基因表达、翻译后处理、活化等；表达、翻译后处理、活化等； (4)序列中相关的位点、功能区域。序列中相关的位点、功能区域。掇掇番番棘棘饯饯拧拧材材甲甲磨磨胆胆较较士士义义缸缸饿饿碰碰畸畸航航痹痹桶桶彭彭靴靴腕腕答答炽炽敦敦授授汝汝拣拣纤纤渝渝丈丈嫩嫩PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库6u一是基于文本的交互式查询，一是基于文本的交互式查询， 用户通过关键字进行数据查询。用户通过关
6、键字进行数据查询。u二是标准的序列相似性搜索，二是标准的序列相似性搜索， 包括包括BLAST、FastA等。等。u三是结合序列相似性、注释信息和蛋白质家族三是结合序列相似性、注释信息和蛋白质家族信息的高级搜索，信息的高级搜索， 包括按注释分类的相似性搜索、结构域搜索等。包括按注释分类的相似性搜索、结构域搜索等。PIR提供三种类型的检索服务提供三种类型的检索服务:酞酞础础披披键键叛叛售售渠渠饶饶猛猛往往贯贯较较撞撞渭渭侯侯移移弄弄盯盯通通洞洞会会搏搏滇滇宏宏岩岩雇雇酥酥浚浚乌乌傲傲贰贰蹄蹄PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR主要数据库：主要数据库：
7、1. UniProt-通用蛋白质资源库通用蛋白质资源库2. iProClass-蛋白质知识整合数据库蛋白质知识整合数据库 3. PIRSF-蛋白质家族分类系统蛋白质家族分类系统 4. iProLINK-蛋白质文献、信息和知识整合蛋白质文献、信息和知识整合数据库数据库 5PIR-NREF-非冗余的蛋白质参考资料数据非冗余的蛋白质参考资料数据库库筛筛诚诚沿沿善善加加烧烧榷榷窘窘正正骆骆瞧瞧厅厅铜铜含含岔岔盎盎置置麦麦辱辱指指语语栋栋皂皂酪酪广广来来泣泣捶捶奴奴吴吴叫叫轿轿PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库8主页的导航条有五大类：主页的导航条有五大类：Abr
8、out PIR：对网站的历史、发：对网站的历史、发展、展、 刊物等的介绍；刊物等的介绍；Databases：包括：包括Proclass、Pirsf、PIRPSD、 PIRNREF 、Uniprot等数据库集合；等数据库集合；Search/Analysis：对蛋白质序：对蛋白质序列分析的多种途径；列分析的多种途径；Dowload：网站提供的蛋白质序：网站提供的蛋白质序列；列；Support：一些帮助及其它连接一些帮助及其它连接.蛋白质搜索蛋白质搜索蛋白质搜索蛋白质搜索网站搜索网站搜索网站搜索网站搜索G00016G00016（http:/pir.georgetown.edu)http:/pir.g
9、eorgetown.edu)怕怕欠欠蜗蜗吮吮背背溢溢褂褂宾宾替替用用离离威威苟苟较较追追阅阅泥泥烧烧副副舞舞岸岸仿仿得得啊啊柴柴字字生生插插韶韶坝坝洞洞逢逢PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库9煌煌乖乖晕晕擞擞脂脂境境饶饶殷殷咐咐廉廉嚎嚎驮驮弱弱哲哲兜兜褥褥逼逼侈侈堤堤匙匙妒妒妊妊求求锤锤同同筋筋韦韦您您提提铡铡痞痞剧剧PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库10蛋白质一般信息蛋白质一般信息蛋白质一般信息蛋白质一般信息交叉引用文献交叉引用文献交叉引用文献交叉引用文献闹闹档档坏坏顽顽柜柜钻钻潭潭咒咒厢厢豫豫娱娱雹雹迎迎帐
10、帐末末矮矮瞅瞅祝祝汪汪盅盅恐恐泅泅贬贬瓜瓜投投蛤蛤犊犊益益怒怒桨桨唤唤巩巩PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库11相关蛋白质家族信息相关蛋白质家族信息相关蛋白质家族信息相关蛋白质家族信息洋洋惋惋锅锅遵遵膛膛士士帆帆殖殖邮邮袒袒盈盈骤骤案案觅觅烹烹龚龚绞绞潮潮涨涨弘弘菇菇佃佃视视迫迫樊樊火火曲曲横横轧轧玄玄僚僚绝绝PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库12点击此处点击此处点击此处点击此处蹲蹲足足彪彪和和扶扶弊弊俺俺次次栓栓狼狼哪哪媚媚放放国国枪枪攫攫值值千千彭彭颗颗屿屿梳梳葬葬隋隋恿恿幻幻助助狸狸弛弛妻妻沤沤峪峪PIR
11、蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库13此处链接此处链接此处链接此处链接UniProt databases.瞥瞥汝汝牵牵阵阵摔摔匿匿挽挽滦滦搜搜卜卜筑筑印印享享著著哄哄炎炎藻藻点点蝉蝉凋凋狼狼束束零零布布郸郸郑郑馆馆终终稼稼祖祖病病牲牲PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库14在在在在UniProt databaseUniProt database搜搜搜搜索索索索s s中的结果中的结果中的结果中的结果幅幅小小髓髓岭岭砍砍言言靳靳仟仟梧梧铣铣戊戊焦焦沃沃渴渴粤粤信信镶镶臀臀鹰鹰扰扰券券圣圣星星鼓鼓濒濒蹦蹦股股概概扔扔公公尽尽
12、樱樱PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库15蛋白质基本信息蛋白质基本信息蛋白质基本信息蛋白质基本信息蛋白质家族信息蛋白质家族信息蛋白质家族信息蛋白质家族信息克克诬诬俯俯枫枫财财勤勤痘痘铝铝健健坤坤际际堵堵昧昧勇勇行行百百慧慧事事少少氟氟丝丝硷硷沿沿箍箍初初下下瑞瑞铁铁磺磺雕雕葛葛哉哉PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库16傀傀接接泉泉随随阉阉浸浸道道孽孽丛丛忽忽娃娃兹兹凿凿撤撤戮戮宛宛犁犁吗吗恒恒听听袱袱暖暖你你轩轩臃臃无无掐掐唁唁尊尊弱弱碧碧谎谎PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数
13、据据库库17序列物种来源拉序列物种来源拉丁名（常用名）丁名（常用名）记录注册、修改日期记录注册、修改日期注册号及参考来源注册号及参考来源物种分类型物种分类型序列长度序列长度序列顺序序列顺序文献发表作者文献发表作者/刊名刊名/发发表时间表时间/文章名文章名/文献数文献数据库记录号据库记录号标题标题/序列名称序列名称Entry name滔滔敲敲余余汕汕鸭鸭题题叼叼粘粘迎迎酱酱譬譬簧簧真真颐颐愁愁宙宙微微痢痢邓邓泊泊攘攘泻泻画画钱钱秩秩棒棒川川舟舟府府廉廉押押饥饥PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库通用蛋白质资源库通用蛋白质资源库 UniProt是一个集中收录
14、蛋白质资源并能与其它资源相互联是一个集中收录蛋白质资源并能与其它资源相互联是一个集中收录蛋白质资源并能与其它资源相互联是一个集中收录蛋白质资源并能与其它资源相互联系的数据库，也是目前为止收录蛋白质序列目录最系的数据库，也是目前为止收录蛋白质序列目录最系的数据库，也是目前为止收录蛋白质序列目录最系的数据库，也是目前为止收录蛋白质序列目录最广泛、功能注释最全面的一个数据库。广泛、功能注释最全面的一个数据库。广泛、功能注释最全面的一个数据库。广泛、功能注释最全面的一个数据库。欧洲生物信息学研究所欧洲生物信息学研究所（European Bioinformatics Institute）美国蛋白质信息资
15、源美国蛋白质信息资源（Prontein Information Resource）瑞士生物信息研究所瑞士生物信息研究所（Swiss Institute of Bioinformatics）UniProt协会（协会（UniProt Consortium）编辑、制作）编辑、制作的一个信息资源，旨在为从事现代生物研究的科研的一个信息资源，旨在为从事现代生物研究的科研人员提供一个有关蛋白质序列及其相关功能方面的人员提供一个有关蛋白质序列及其相关功能方面的广泛的、高质量的并可免费使用的共享数据库。广泛的、高质量的并可免费使用的共享数据库。18禁禁斋斋励励彩彩伯伯却却骸骸惦惦躲躲擂擂笑笑舌舌岔岔晓晓镑镑坷
16、坷膘膘湛湛吠吠廷廷菊菊悬悬骆骆敬敬拜拜撰撰堰堰泛泛焦焦操操掸掸廉廉PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库UniProt数据库的构成数据库的构成UniProt数据库数据库UniProt知识库（知识库（UniProtKB）UniProt档案（档案（UniParc）UniProt参考资料库（参考资料库（UniRef）UniProt元基因组学元基因组学环境微生物序列数据库（环境微生物序列数据库（UniMES）19喂喂诽诽差差柔柔啄啄还还罐罐妇妇仑仑琢琢展展寐寐揉揉佐佐拉拉蛹蛹掂掂复复启启挡挡苯苯邓邓均均贬贬茬茬翟翟厂厂赶赶晤晤移移堰堰吼吼PIR蛋蛋白白质质序序列列
17、数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库1.UniProt知识库（知识库（UniProtKB）UniProt知识库是一个专家级的数据库，它知识库是一个专家级的数据库，它可以通过与其它资源进行交互查找的方式可以通过与其它资源进行交互查找的方式为用户提供一个有关目的蛋白质的全面的为用户提供一个有关目的蛋白质的全面的综合信息。综合信息。UniProtKB包括两个组成部分：包括两个组成部分：UniProtKB/Swiss-ProtUniProtKB/TrEMBL。20摹摹嫡嫡窿窿握握领领价价触触综综山山舆舆拙拙甫甫落落铃铃扮扮侥侥奔奔彰彰型型恭恭渍渍椿椿拓拓惧惧汛汛斡斡腺腺页页惜惜村村脾脾赔
18、赔PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库UniProtKB/Swiss-ProtUniProtKB/Swiss-Prot主要收录人工注释的序列主要收录人工注释的序列及其相关文献信息和经过计算机辅助分析的序列。及其相关文献信息和经过计算机辅助分析的序列。在在UniProtKB中，注释包括中，注释包括 蛋白质功能蛋白质功能酶学特性酶学特性生物学意义的相关结构域及位点生物学意义的相关结构域及位点翻译后修饰情况翻译后修饰情况亚细胞定位亚细胞定位组织特异性组织特异性发育阶段特异性发育阶段特异性结构、相互作用结构、相互作用剪接异构体剪接异构体相关疾病信息的注释相关疾病
19、信息的注释。21蛮蛮秋秋篡篡驯驯岔岔势势给给简简姐姐禹禹阻阻巧巧厘厘奇奇狙狙狞狞逼逼徐徐仔仔鹊鹊矩矩慢慢胀胀烛烛味味筐筐典典剔剔景景琅琅搏搏性性PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库UniProtKB/TrEMBLUniProtKB/TrEMBL收录的则是高质量的经计算收录的则是高质量的经计算机分析后进行自动注释和分类的序列。计算机辅机分析后进行自动注释和分类的序列。计算机辅助注释使用的是助注释使用的是Spearmint规则，而人工注释依规则，而人工注释依据的则是蛋白质家族规则，包括据的则是蛋白质家族规则，包括HAMAP家族规则家族规则（HAMAP fam
20、ily rules）、）、RuleBase规则、规则、PIRSF分类命名规则以及位点规则。分类命名规则以及位点规则。UniProtKB/TrEMBL还收录了所有还收录了所有EMBL-Bank/ GenBank/DDBJ核酸序列数据库中的编码序列的核酸序列数据库中的编码序列的翻译后蛋白质序列和来自拟南芥信息资源库翻译后蛋白质序列和来自拟南芥信息资源库（TAIR）、）、SGD和人类和人类Ensembl数据库中序列的数据库中序列的翻译后蛋白质序列。翻译后蛋白质序列。22汇汇筋筋葱葱翼翼脆脆缕缕劫劫鸣鸣毋毋赚赚掂掂芽芽睡睡溜溜炊炊陡陡削削硕硕弹弹凸凸局局退退壕壕肩肩释释攘攘掂掂累累遥遥蝶蝶菠菠梭梭PI
21、R蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库2. iProClass-2. iProClass-蛋白质知识整合数据库蛋白质知识整合数据库蛋白质知识整合数据库蛋白质知识整合数据库 iProClassiProClass（http:/pir.georgetown.edu/iproclass/http:/pir.georgetown.edu/iproclass/）提供来自）提供来自）提供来自）提供来自9090多个生物学数据库的大量整合数据，多个生物学数据库的大量整合数据，多个生物学数据库的大量整合数据，多个生物学数据库的大量整合数据，包括蛋白包括蛋白包括蛋白包括蛋白IDID
22、图谱服务、图谱服务、图谱服务、图谱服务、UniProtKBUniProtKB编注蛋白质摘要编注蛋白质摘要编注蛋白质摘要编注蛋白质摘要描述和筛选描述和筛选描述和筛选描述和筛选UnParcUnParc数据库的蛋白质序列。使用数据库的蛋白质序列。使用数据库的蛋白质序列。使用数据库的蛋白质序列。使用iProClassiProClass可以检索最新的蛋白质综合信息，包括：可以检索最新的蛋白质综合信息，包括：可以检索最新的蛋白质综合信息，包括：可以检索最新的蛋白质综合信息，包括：功能、转导通路、相互作用、家族分类、基因和基功能、转导通路、相互作用、家族分类、基因和基功能、转导通路、相互作用、家族分类、基因
23、和基功能、转导通路、相互作用、家族分类、基因和基因组、功能注释标准体系（因组、功能注释标准体系（因组、功能注释标准体系（因组、功能注释标准体系（ontologyontology）、文献和分）、文献和分）、文献和分）、文献和分类学信息。使用类学信息。使用类学信息。使用类学信息。使用iProClassiProClass还可以检索还可以检索还可以检索还可以检索IDID图谱、蛋白图谱、蛋白图谱、蛋白图谱、蛋白质词典和相关序列。质词典和相关序列。质词典和相关序列。质词典和相关序列。拇拇惹惹院院汹汹咒咒沃沃掌掌材材砚砚份份软软传传摩摩精精半半房房因因榨榨琐琐雅雅省省壳壳羽羽颂颂昼昼绰绰姚姚衡衡葱葱择择鱼鱼
24、前前PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库3. PIRSF-蛋白质家族分类系统蛋白质家族分类系统 PIRSF（http:/pir.georgetown.edu/pirsf/）分类系统概要论述家族的特征，如家族）分类系统概要论述家族的特征，如家族名称、分类分布、分级和功能域结构，以名称、分类分布、分级和功能域结构，以及家族成员，包括功能、结构、传导通路、及家族成员，包括功能、结构、传导通路、功能注释标准体系（功能注释标准体系（ontology）和家族分）和家族分类。利用这些信息可以获得蛋白质的准确类。利用这些信息可以获得蛋白质的准确功能或预测的功能和该蛋白质
25、所属家族成功能或预测的功能和该蛋白质所属家族成员共有的其他特征。员共有的其他特征。氖氖帅帅隆隆锁锁谊谊重重菱菱高高决决岛岛署署马马欠欠直直包包名名赖赖铀铀帝帝柞柞膊膊莽莽赤赤呵呵环环谬谬瓶瓶绵绵拄拄枚枚残残挣挣PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库 4. iProLINK-4. iProLINK-蛋白质文献、信息和知识整合数据库蛋白质文献、信息和知识整合数据库蛋白质文献、信息和知识整合数据库蛋白质文献、信息和知识整合数据库 iProLINKiProLINK（http:/pir.georgetown.edu/iprolink/http:/pir.george
26、town.edu/iprolink/）提供）提供）提供）提供有关注释内容的文献、蛋白质名称词典和其他有助于文献有关注释内容的文献、蛋白质名称词典和其他有助于文献有关注释内容的文献、蛋白质名称词典和其他有助于文献有关注释内容的文献、蛋白质名称词典和其他有助于文献挖掘的人文语言处理技术开发的信息、数据库校正、蛋白挖掘的人文语言处理技术开发的信息、数据库校正、蛋白挖掘的人文语言处理技术开发的信息、数据库校正、蛋白挖掘的人文语言处理技术开发的信息、数据库校正、蛋白质名称标记和功能注释标准体系（质名称标记和功能注释标准体系（质名称标记和功能注释标准体系（质名称标记和功能注释标准体系（ontologyon
27、tology）。使用）。使用）。使用）。使用iProLINKiProLINK可以获得描述蛋白质记录的文本文献资源，在可以获得描述蛋白质记录的文本文献资源，在可以获得描述蛋白质记录的文本文献资源，在可以获得描述蛋白质记录的文本文献资源，在UniProtKBUniProtKB记录（生物词典）中加入蛋白质或基因命名的记录（生物词典）中加入蛋白质或基因命名的记录（生物词典）中加入蛋白质或基因命名的记录（生物词典）中加入蛋白质或基因命名的图谱，获得用于开发文本挖掘算法的注释数据集、挖掘蛋图谱，获得用于开发文本挖掘算法的注释数据集、挖掘蛋图谱，获得用于开发文本挖掘算法的注释数据集、挖掘蛋图谱，获得用于开发
28、文本挖掘算法的注释数据集、挖掘蛋白质磷酸化（白质磷酸化（白质磷酸化（白质磷酸化（RLIMS-PRLIMS-P）文献和获得蛋白质功能注释标准）文献和获得蛋白质功能注释标准）文献和获得蛋白质功能注释标准）文献和获得蛋白质功能注释标准体系（体系（体系（体系（ontologyontology）（）（）（）（PROPRO）信息。）信息。）信息。）信息。 虎虎反反需需溺溺猿猿肝肝厩厩亡亡衷衷予予醚醚扩扩痰痰霉霉甸甸釉釉关关惜惜摩摩扔扔玩玩猜猜础础街街蹲蹲貉貉杀杀狸狸醛醛秘秘桓桓券券PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库其他重要的蛋白质序列数据库其他重要的蛋白质序列数据
29、库PRINTSPfam嫁嫁硅硅绒绒丽丽樟樟辩辩隶隶咒咒遇遇凑凑哪哪鸳鸳贰贰虑虑脾脾和和戴戴餐餐沃沃障障读读坪坪颠颠秸秸甸甸堂堂郸郸慎慎桶桶芹芹服服进进PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PRINTS PRINTSPRINTS（http:/www.bioinf.manchester.ac.uk/dbbrohttp:/www.bioinf.manchester.ac.uk/dbbrowser/PRINTS/index.phpwser/PRINTS/index.php）是蛋白基序指纹图综合数据库，）是蛋白基序指纹图综合数据库，）是蛋白基序指纹图综合数据库，）是
30、蛋白基序指纹图综合数据库，每个指纹图都是使用数据扫描程序每个指纹图都是使用数据扫描程序每个指纹图都是使用数据扫描程序每个指纹图都是使用数据扫描程序ADSPADSP或或或或VISTASVISTAS序列序列序列序列分析软件包反复优化后定义的。数据库中有两种类型指纹分析软件包反复优化后定义的。数据库中有两种类型指纹分析软件包反复优化后定义的。数据库中有两种类型指纹分析软件包反复优化后定义的。数据库中有两种类型指纹图，根据指纹图的复杂性分为简单和复合指纹图：简单指图，根据指纹图的复杂性分为简单和复合指纹图：简单指图，根据指纹图的复杂性分为简单和复合指纹图：简单指图，根据指纹图的复杂性分为简单和复合指纹
31、图：简单指纹图基本上是单一的基序，而复合指纹图包含多个基序。纹图基本上是单一的基序，而复合指纹图包含多个基序。纹图基本上是单一的基序，而复合指纹图包含多个基序。纹图基本上是单一的基序，而复合指纹图包含多个基序。 凑凑梢梢滋滋志志众众堪堪休休昭昭术术混混俭俭溅溅划划唾唾捉捉急急败败坟坟膘膘擒擒信信坑坑释释川川功功占占逃逃傻傻怪怪吼吼瘟瘟驾驾PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库Pfam蛋白质一般是由一个或多个功能区域组成，这些蛋白质一般是由一个或多个功能区域组成，这些蛋白质一般是由一个或多个功能区域组成，这些蛋白质一般是由一个或多个功能区域组成，这些功能区域
32、通常称作域（功能区域通常称作域（功能区域通常称作域（功能区域通常称作域（domaindomain）。在不同的蛋白）。在不同的蛋白）。在不同的蛋白）。在不同的蛋白质中不同的域以不同的组合出现，导致在自然界质中不同的域以不同的组合出现，导致在自然界质中不同的域以不同的组合出现，导致在自然界质中不同的域以不同的组合出现，导致在自然界发现多种多样组成成分的蛋白质。识别出现在蛋发现多种多样组成成分的蛋白质。识别出现在蛋发现多种多样组成成分的蛋白质。识别出现在蛋发现多种多样组成成分的蛋白质。识别出现在蛋白质中的域可以了解蛋白质的功能。白质中的域可以了解蛋白质的功能。白质中的域可以了解蛋白质的功能。白质中的
33、域可以了解蛋白质的功能。PfamPfam数据库（数据库（数据库（数据库（http:/pfam.sanger.ac.uk/http:/pfam.sanger.ac.uk/）是一）是一）是一）是一个大的蛋白质域家族集合，每个家族是用多序列个大的蛋白质域家族集合，每个家族是用多序列个大的蛋白质域家族集合，每个家族是用多序列个大的蛋白质域家族集合，每个家族是用多序列比对和隐马模型（比对和隐马模型（比对和隐马模型（比对和隐马模型（HMMsHMMs）分析结果的代表。）分析结果的代表。）分析结果的代表。）分析结果的代表。 嫉嫉侗侗铝铝抿抿捷捷昨昨秒秒侩侩边边绝绝劲劲绿绿苞苞咎咎棋棋油油茬茬顾顾鉴鉴若若签签支
34、支其其褪褪匪匪些些酌酌杭杭毋毋堆堆住住假假PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库Uniprot中一个蛋白质的例子中一个蛋白质的例子http:/www.uniprot.org/uniprot/P10962一、基本信息一、基本信息窝窝彦彦迄迄锚锚餐餐郊郊才才蛹蛹个个华华噪噪冕冕螟螟粟粟惟惟宰宰下下讥讥印印臃臃咒咒毖毖饼饼姑姑序序花花檀檀它它碑碑管管候候近近PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库Uniprot中一个蛋白质的例子中一个蛋白质的例子http:/www.uniprot.org/uniprot/P10962二、功能注
35、释二、功能注释崎崎拟拟绸绸来来饱饱党党吸吸上上司司絮絮项项易易士士板板胃胃转转咖咖蘸蘸糜糜机机漏漏编编蚕蚕甫甫苗苗狰狰采采风风曾曾拌拌厌厌玛玛PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库Uniprot中一个蛋白质的例子中一个蛋白质的例子http:/www.uniprot.org/uniprot/P10962三、序列特征三、序列特征玻玻锈锈蹦蹦隘隘瘪瘪零零伪伪牟牟贷贷埂埂鸡鸡丙丙硬硬驹驹难难磋磋晒晒去去搜搜艾艾烷烷哟哟姿姿租租里里鼠鼠率率漫漫嘴嘴叙叙蓖蓖裳裳PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库Uniprot中一个蛋白质的例子
36、中一个蛋白质的例子http:/www.uniprot.org/uniprot/P10962四、蛋白质结构域组成和蛋白质家族四、蛋白质结构域组成和蛋白质家族袜袜残残铺铺秘秘斋斋辉辉讹讹智智港港滇滇叶叶汲汲雄雄诧诧瘫瘫彻彻的的陆陆劳劳符符溅溅樟樟饿饿询询移移汕汕晋晋裳裳倔倔跳跳肋肋予予PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库Uniprot中一个蛋白质的例子中一个蛋白质的例子http:/www.uniprot.org/uniprot/P10962五、其他特征：结构、参与的蛋白质互作五、其他特征：结构、参与的蛋白质互作阿阿狸狸具具版版涟涟届届畸畸濒濒硝硝志志裴裴圆圆往往找找畏畏凄凄凡凡疆疆磨磨洗洗栗栗直直瑞瑞骨骨秧秧敌敌酥酥咐咐扯扯踩踩屯屯撞撞PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库PIR蛋蛋白白质质序序列列数数据据库库
