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1、现代分子生物技术现代分子生物技术在优质肉鸡育种中的应用在优质肉鸡育种中的应用 朱朱 庆庆（四川农业大学（四川农业大学（四川农业大学（四川农业大学 教授、博导）教授、博导）教授、博导）教授、博导） 常规育种技术常规育种技术表表现现型型外外 观观生长发育生长发育产蛋性能产蛋性能大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 数量遗传分析数量遗传分析纯繁纯繁杂交杂交新品种选育新品种选育本身成绩本身成绩同胞成绩同胞成绩后裔成绩后裔成绩大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 分子生物技术分子生物技术基基因因型型分子标记分子标记基因定位基因定位性状连锁性状连锁辅助选择辅助选择大恒公司研讨会 2004. 6. 成都
2、 分子标记辅助育种分子标记辅助育种分子遗传标记分子遗传标记DNA标记标记特特特特 点：点：点：点：数量大数量大遗传稳定，不受环境影响遗传稳定，不受环境影响呈等显性或完全显性呈等显性或完全显性标标标标 记：记：记：记：RFLP, RAPD, VNTR, AFLP, mtDNA 等等大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 n n可可可可直接选择基因型直接选择基因型直接选择基因型直接选择基因型n n呈等显性，可将杂合子与纯合子区分呈等显性，可将杂合子与纯合子区分呈等显性，可将杂合子与纯合子区分呈等显性，可将杂合子与纯合子区分n n可在两种性别任何年龄的个体检测可在两种性别任何年龄的个体检测可在两种性
3、别任何年龄的个体检测可在两种性别任何年龄的个体检测n n早期选择，加快选育进展早期选择，加快选育进展早期选择，加快选育进展早期选择，加快选育进展n n可阐明家系内遗传变异可阐明家系内遗传变异可阐明家系内遗传变异可阐明家系内遗传变异n n对限性性状和年龄限性性状最为有利对限性性状和年龄限性性状最为有利对限性性状和年龄限性性状最为有利对限性性状和年龄限性性状最为有利 标记辅助选择的意义标记辅助选择的意义大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 家禽经济性状数量性状家禽经济性状数量性状标记辅助育种原理标记辅助育种原理数量性状基因座数量性状基因座（QTL）QTL图谱分析图谱分析遗传图谱构建遗传图谱构建基
4、因定位基因定位分子标记分子标记大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 技术路线：技术路线：寻找寻找QTLQTL的染色体片断的染色体片断标定标定QTL位置位置找到与找到与QTL连锁的标记连锁的标记寻找候选基因寻找候选基因与性状相关的特定基因与性状相关的特定基因特定基因的功能位点特定基因的功能位点标记辅助选择标记辅助选择大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 Southern杂交杂交 利用载体利用载体基因文库基因文库 阳性克隆阳性克隆 选择引物选择引物 作序列分析作序列分析 微卫星微卫星DNA探针（探针（CA）n PAGEPAGE检测检测 PCRPCR扩增扩增 微微卫星检测卫星检测：大恒公司研讨会
5、 2004. 6. 成都 标记性状相关分析标记性状相关分析：分子标记分子标记分子标记分子标记 （标记基因座分析（标记基因座分析（标记基因座分析（标记基因座分析 ） 基因型基因型基因型基因型 （最小二乘分析（最小二乘分析（最小二乘分析（最小二乘分析） 性状性状性状性状 （方差分析检验）（方差分析检验）（方差分析检验）（方差分析检验） 相关分析相关分析相关分析相关分析大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 功能基因定位克隆功能基因定位克隆： 确定基因在染色体上的大致位置确定基因在染色体上的大致位置确定基因在染色体上的大致位置确定基因在染色体上的大致位置 （家系连锁分析资料）（家系连锁分析资料）（家
6、系连锁分析资料）（家系连锁分析资料） 获得目的基因获得目的基因获得目的基因获得目的基因DNADNADNADNA片段片段片段片段突变检测验证和功能分析突变检测验证和功能分析突变检测验证和功能分析突变检测验证和功能分析 （染色体步移等技术）（染色体步移等技术）（染色体步移等技术）（染色体步移等技术） 绘制染色体图谱绘制染色体图谱绘制染色体图谱绘制染色体图谱 （筛选目的基因）（筛选目的基因）（筛选目的基因）（筛选目的基因） 确定含有候选基因的染色体片段确定含有候选基因的染色体片段确定含有候选基因的染色体片段确定含有候选基因的染色体片段大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 种种种种染色体数染色体数染
7、色体数染色体数连锁图上的遗传连锁图上的遗传连锁图上的遗传连锁图上的遗传标记总数标记总数标记总数标记总数微卫星标微卫星标微卫星标微卫星标记数记数记数记数物理图上物理图上物理图上物理图上基因数基因数基因数基因数连锁群数连锁群数连锁群数连锁群数基因组大小基因组大小基因组大小基因组大小( ( ( (cMcMcMcM) ) ) )覆盖比例覆盖比例覆盖比例覆盖比例(%)(%)(%)(%)牛牛牛牛(Cattle)(Cattle)(Cattle)(Cattle)2n 602n 602n 602n 602100210021002100150015001500150060860860860831313131290
8、029002900290095959595绵羊绵羊绵羊绵羊(Sheep)(Sheep)(Sheep)(Sheep)2n 542n 542n 542n 54104010401040104089589589589510510510510527272727340034003400340095959595山羊山羊山羊山羊(Goat)(Goat)(Goat)(Goat)2n 602n 602n 602n 60337337337337307307307307202202202202 274027402740274088888888猪猪猪猪(Pig)(Pig)(Pig)(Pig)2n 382n 382n 3
9、82n 381800180018001800140014001400140040040040040019191919220022002200220095959595马马马马(Horse)(Horse)(Horse)(Horse)2n 642n 642n 642n 6424024024024020020020020010/2010/2010/2010/20* * * *19/2519/2519/2519/25* * * *936/679936/679936/679936/679* * * * 鸡（鸡（鸡（鸡（ChickenChickenChickenChicken）2n 782n 782n 78
10、2n 78172717271727172780080080080019119119119151515151380038003800380095959595人人人人(Humans)(Humans)(Humans)(Humans)2n 462n 462n 462n 46 小鼠小鼠小鼠小鼠(Mouse)(Mouse)(Mouse)(Mouse)2n 402n 402n 402n 4026470264702647026470 10487104871048710487212121211450145014501450100100100100鼠（鼠（鼠（鼠（RatRatRatRat）2n 422n 422n
11、 422n 42 90009000900090001300130013001300212121212000200020002000100100100100狗（狗（狗（狗（DogDogDogDog）2n 782n 782n 782n 78210210210210200200200200 41414141 鹿（鹿（鹿（鹿（DeerDeerDeerDeer）2n 682n 682n 682n 682302302302306666666616416416416434343434 几种重要畜禽种和人类及家鼠基因组有关数据几种重要畜禽种和人类及家鼠基因组有关数据几种重要畜禽种和人类及家鼠基因组有关数据几种
12、重要畜禽种和人类及家鼠基因组有关数据 大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 家家禽禽染染色色体体标标记记图图谱谱大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 优质鸡肉质性状选育优质鸡肉质性状选育优质鸡肉质性状选育优质鸡肉质性状选育举例说明举例说明 根据研究报道，从家禽基因组中选取与肉质性状相关的标记根据研究报道，从家禽基因组中选取与肉质性状相关的标记根据标记序列进行引物设计根据标记序列进行引物设计采集血样进行采集血样进行PCR扩增扩增家禽个体肉质性能测定家禽个体肉质性能测定对对PCR产物进行电泳检测产物进行电泳检测标记与性状相关分析标记与性状相关分析肉质功能基因肉质功能基因QTL定位定位利用标记进
13、行性状选择利用标记进行性状选择大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 n n利用分子标记研究：利用分子标记研究：利用分子标记研究：利用分子标记研究：n n地方鸡种遗传变异及遗传地方鸡种遗传变异及遗传地方鸡种遗传变异及遗传地方鸡种遗传变异及遗传多样性研究多样性研究多样性研究多样性研究n n标记与产蛋性能及蛋品质标记与产蛋性能及蛋品质标记与产蛋性能及蛋品质标记与产蛋性能及蛋品质等相关研究等相关研究等相关研究等相关研究n n标记与生长发育及料肉比标记与生长发育及料肉比标记与生长发育及料肉比标记与生长发育及料肉比等相关研究等相关研究等相关研究等相关研究 前期研究进展前期研究进展大恒公司研讨会 2004
14、. 6. 成都 n n各分子标记各分子标记各分子标记各分子标记星座位上各等位基因的星座位上各等位基因的星座位上各等位基因的星座位上各等位基因的基因频率基因频率基因频率基因频率在不在不在不在不同的群体间有比较明显的差异，出现一些特定的同的群体间有比较明显的差异，出现一些特定的同的群体间有比较明显的差异，出现一些特定的同的群体间有比较明显的差异，出现一些特定的等位基因。等位基因。等位基因。等位基因。n n不同分子标记座位所反映的不同分子标记座位所反映的不同分子标记座位所反映的不同分子标记座位所反映的群体杂合度群体杂合度群体杂合度群体杂合度具有较大具有较大具有较大具有较大的差异，具有较大选育潜力。的
15、差异，具有较大选育潜力。的差异，具有较大选育潜力。的差异，具有较大选育潜力。n n四川不同地方鸡种群有较大四川不同地方鸡种群有较大四川不同地方鸡种群有较大四川不同地方鸡种群有较大遗传差异遗传差异遗传差异遗传差异，表现出不，表现出不，表现出不，表现出不同的遗传距离。同的遗传距离。同的遗传距离。同的遗传距离。研究表明：研究表明：大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 0 0 0 00.20.20.20.20.40.40.40.40.60.60.60.60.80.80.80.81.01.01.01.01.21.21.21.2HFHFHFHFBFBFBFBFCKCKCKCKLKLKLKLKSHSHSH
16、SHSCSCSCSCHFHFHFHF0.28970.28970.28970.28971.18221.18221.18221.18220.87000.87000.87000.87000.71350.71350.71350.71350.44620.44620.44620.44620.28970.28970.28970.2897图图图图1 1 1 1 不同鸡种群聚类模式图（数字表示相对遗传距离）不同鸡种群聚类模式图（数字表示相对遗传距离）不同鸡种群聚类模式图（数字表示相对遗传距离）不同鸡种群聚类模式图（数字表示相对遗传距离）四川不同鸡种群遗传聚类分析四川不同鸡种群遗传聚类分析四川不同鸡种群遗传聚类分
17、析四川不同鸡种群遗传聚类分析大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 n n肉用性状：肉用性状：肉用性状：肉用性状：体重、日增重、相对绝对增重、屠宰性能、体重、日增重、相对绝对增重、屠宰性能、体重、日增重、相对绝对增重、屠宰性能、体重、日增重、相对绝对增重、屠宰性能、料肉比等料肉比等料肉比等料肉比等n n蛋用性状：蛋用性状：蛋用性状：蛋用性状：开产日龄、开产蛋重、开产体重、开产日龄、开产蛋重、开产体重、开产日龄、开产蛋重、开产体重、开产日龄、开产蛋重、开产体重、300300300300日龄产日龄产日龄产日龄产蛋量，月产蛋量、蛋品质性状等蛋量，月产蛋量、蛋品质性状等蛋量，月产蛋量、蛋品质性状等蛋量，月产蛋量、蛋品质性状等与性状相关的分子标记与性状相关的分子标记大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 分子标记分子标记分子标记分子标记PCRPCR产物检测（自动序列分析）产物检测（自动序列分析）产物检测（自动序列分析）产物检测（自动序列分析）大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 建立资源群体建立资源群体性状组合、配合力测定性状组合、配合力测定常规育种方法常规育种方法分子生物技术分子生物技术特色突出、性能优良特色突出、性能优良形成配套新品系、建立商业育种体系形成配套新品系、建立商业育种体系大恒公司研讨会 2004. 6. 成都 大恒公司研讨会 2004. 6. 成都
