染色体识别和计数

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1、数字图像处理数字图像处理染色体识别和计数染色体识别和计数08021150802115班班 第六小组第六小组小组成员赵赵 欢欢何晓璇何晓璇卢禹先卢禹先王崇林王崇林胡胡 威威染色体识别和计数染色体识别和计数算法的设计算法的设计1.图像预处理直方图均衡化2.去噪处理3.图像腐蚀4.图像二值化5.粘连染色体处理6。染色体标记7.染色体数统计图像预处理图像预处理均衡化后和均衡化前图像对比直方图均衡化直方图均衡化templates, New Content design, 10 welcome to use these powerpoint years experience welcome to use

2、these powerpoint templates, New Content design, 10 years experience 由于图像中混入的噪声并不能在前面的处理过程中被全部消除,剩余的噪声也被赋予了标号值,这就造成了统计结果的错误,因此在对图像标号完毕后还要将被标号的噪声删除掉。 标号对象的面积即该标号对象所占的像素数,将标号对象的面积与图像中所有对象的平均面积进行比较,以比较结果作为条件来删除被标号的噪声对象 去噪处理去噪处理步骤步骤(1)计算每个标号对象的面积计算每个标号对象的面积,然后计算所有对象的平均面然后计算所有对象的平均面积。积。(2)对每个对象做如下判断对每个对象做

3、如下判断:该该对象的面积是否大于平均面对象的面积是否大于平均面积的积的6倍倍?若满足以上条件若满足以上条件,则则可以认为该对象为大噪声可以认为该对象为大噪声,将将该对象删除。然后对下一个该对象删除。然后对下一个对象进行判断对象进行判断,至处理完所有至处理完所有对象为止。对象为止。(3)重新计算所剩对象的平均重新计算所剩对象的平均面积面积,转到转到(2)进行处理进行处理,直到直到没有对象被删除。没有对象被删除。(4)重新计算所剩对象的平均重新计算所剩对象的平均面积。面积。(5)对每个所剩的对象做如下对每个所剩的对象做如下判断判断:该对象的面积是否小于该对象的面积是否小于平均面积的平均面积的1/1

4、0?若是若是,则可则可以认为该对象为小噪声以认为该对象为小噪声,将该将该对象删除。然后对下一个对对象删除。然后对下一个对象进行判断象进行判断,至处理完所有对至处理完所有对象为止。象为止。(6)重新计算所剩对象的平均重新计算所剩对象的平均面积面积,转到转到(5)进行处理进行处理,直到直到没有对象被删除。没有对象被删除。(7)此时图像中的噪声已被删此时图像中的噪声已被删除完毕除完毕,根据处理结果将标号根据处理结果将标号值进行相应修改。值进行相应修改。texttexttexttexttext去噪前后图像对比腐蚀属于数学形态学的处理技术，它和膨胀不是互为逆运算，灰度图像腐蚀处理可得到两种结果：（1）如

5、果所有的结构元素都为正，则输出图像将趋向比输入图像暗（2）在比结构元素还小的区域中的明亮细节经腐蚀处理以后其效果将减弱1.删除边界某些像素，使粘连性不大的染色体分开图像的腐蚀图像的腐蚀腐蚀处理后的图像对比1 二值图像是指图像上的所有点的灰度值只有两种可能,不为“0”就为“255”,也就是整个图像呈现出明显的黑白效果。2 对图像二值化一般采用阈值分割技术,所有灰度大于或等于阈值的像素被判决为属于物体,灰度值用“255”表示,否则这些像素点被排除在物体区域以外,灰度值为“0”,表示背景welcome to use these powerpoint templates, New Content de

6、sign, 10 years experience图像二值化图像二值化粘连染色体的处理一个对象的面积与平均面积的比值基本反映了该对象中的染色体数目。大多数染色体的面积与平均面积相差无几;而当一个对象的面积大于平均面积的2倍时,该对象中通常会含有粘连的染色体。 具体步具体步骤骤如下如下步骤3421Your Text对象的面积是否大对象的面积是否大于平均面积的于平均面积的2倍。倍。若满足该条件若满足该条件,则认则认为该对象中含有粘为该对象中含有粘连染色体连染色体 Your Text对每个含有粘对每个含有粘连染色体的对连染色体的对象象,运用上述计运用上述计算原理进行计算原理进行计算算,并对存储的并对

7、存储的标号结果进行标号结果进行修正。修正。 Your Text得到的最终修正得到的最终修正结果即为整个图结果即为整个图像中的染色体数像中的染色体数目目 our计算每个计算每个对象的面积对象的面积,并计算所有并计算所有对象的平均对象的平均面积面积染色体标记对染色体的自动计数,其实就是对图像中对象的统计,因此采用标号法来对图像中的对象进行标注 标记后的图如下：结果分析经过大量的实验，该方法能够对粘连、重叠以及噪声严重的染色体图像进行很准确的染色体计数，但是其中也存在一些误差，经分析误差主要来自于以下几方面：(1)若图像中的一条或几条染色体与较大的噪声粘连在一起,在进行噪声对象删除处理时,会将这些染色体作为噪声一并删除,造成了统计结果小于实际数目(2)若几条较小的染色体粘连在一起,由于这些染色体所占面积都比较小,在对粘连染色体对象进行腐蚀运算时,可能会将其中的一条或几条染色体腐蚀掉。 (3)若几条染色体粘连的比较紧密,在对粘连染色体对象进行腐蚀运算时,可能会无法分割开,造成了统计结果小于实际数目。