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1、LOGO生物医学数据库检索生物医学数据库检索生物医学数据库检索生物医学数据库检索Retrieval of Medical Information DatabaseRetrieval of Medical Information Database 主讲人：主讲人： 胡胡 笳笳 昆明医科大学昆明医科大学 医学信息检索教研室医学信息检索教研室前前 言言医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室 医学信息检索系统是发展、利用较早、医学信息检索系统是发展、利用较早、较快的一个领域，各种医学数据库的不断较快的一个领域，各种医学数据库的不断出现和广泛应用，为促进人类
2、医学科学研出现和广泛应用，为促进人类医学科学研究水平的发展，发挥了重要的作用。近年究水平的发展，发挥了重要的作用。近年来，随着人类科学技术的不断发展，新技来，随着人类科学技术的不断发展，新技术、新方法不断出现，医学数据库开发和术、新方法不断出现，医学数据库开发和利用也出现了一些新特点。利用也出现了一些新特点。中文数据库中文数据库医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室共共共共八八八八十十十十九九九九种种种种数数数数据据据据库库库库医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室医学数据库的类型医学数据库的类型- W
3、hat1数据库的信息来源数据库的信息来源- Who2 常用数据库的特点常用数据库的特点-Why3怎样使用怎样使用-How4医学外文数据库的类型医学外文数据库的类型医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室u文摘型数据库 Medline EMBASE.com（荷兰（荷兰医学文摘医学文摘） BIOSIS Preview（美国（美国生物学文摘生物学文摘） CA (美国美国化学文摘化学文摘) Dialog 联机检索系统联机检索系统医学外文数据库的类型医学外文数据库的类型医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室u全文型
4、数据库 Elsevier ScienceDirect全文期刊数据库全文期刊数据库 ProQuest全文期刊数据库全文期刊数据库 Springer全文期刊数据库全文期刊数据库 OVID全文期刊库全文期刊库 EBSCOhost全文期刊数据库全文期刊数据库医学外文数据库的类型医学外文数据库的类型医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室u引文检索数据库美国科学引文索引美国科学引文索引- SCISCI医学外文数据库的类型医学外文数据库的类型医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室u循证医学数据库 WILEY Coch
5、rane数据库数据库 OVID数据库数据库 - Best Evidence PubMed - Clinical Queries SumSearch循证医学资源网站循证医学资源网站Who - 信息来源信息来源医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室1. Medline 是美国国立医学图书馆（the National Library of Medicine, NLM）研制开发的国际上最具权威性的综合性生物医学文献书目数据库。收录范围：全世界70多个国家和地区1966年以来的4600余种生物医学期刊，目前文摘条目1300余万篇，年报道量40万条，英文刊物占
6、90%、3/4有英文摘要，每周更新。内容涉及：医学、药学、牙医学、护理学、预防医学、卫生管理、兽医学等专业。PubMedPubMed是其提供是其提供InternetInternet免费检索的免费检索的WEBWEB数据库。数据库。Who -信息来源信息来源 医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室2. EMBASEEMBASE(theExderptaMedicalDatabase,荷兰医学文摘),是荷兰Elsevier科学出版公司建立的生物医学与药学书目数据库。收录了自1974年以来的70多个国家和地区的3800种期刊，尤其涵盖了大量欧洲和亚洲医学刊物
7、。Who -信息来源信息来源 医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室3. Biosis PreviewBIOSISPreview是美国生物学文摘（BiologicalAbstract）的在线数据库。是美国生物科学信息服务社(BIOSIS)生产的世界上最大的有关生命科学的文摘和索引数据库。收录世界上100多个国家和地区的5500多种期刊的文献和1650多个会议的会议录和报告，每年大约增加28万条记录。Who -信息来源信息来源 医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室4.CA (美国美国化学文摘化学文摘)化
8、学文摘，ChemicalAbstracts，简称CA，是世界最大的化学文摘库。也是目前世界上应用最广泛，最为重要的化学、化工及相关学科的检索工具。创刊于1907年，由美国化学协会化学文摘社（CASofACS，ChemicalAbstractsServiceofAmericanChemicalSociety）编辑出版。Who - 信息来源信息来源 医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室6. 全文型数据库全文型数据库数据库名称数据库名称 出版商及期刊数量出版商及期刊数量ElsevierElsevier全文数据库是荷兰著名商业出版公司爱思唯尔科学(Els
9、evier Science)的核心产品，共收录了2 500余种期刊，涵盖24个学科，其中1 400多种被科学引文索引(SCI)收录。ProQuest是美国ProQuest Information and Learning旗下的网络医学期刊数据库。该库收录了1997年以来重要的生物医学期刊1200多种。Springer施普林格出版社于 1842 年在德国柏林创立，是全球第一大科技图书出版公司和第二大科技期刊出版公司，每年出版 5 ,500 余种科技图书和 约1 ,700 余种科技期刊，其中超过1,500种经同行评阅的期刊。OVID美国Ovid Technologies公司开发的医学数据库系统，收
10、录了超过1200种科学、科技及医学期刊。收录了从1993年至今的文献，其中超过350种属于核心期刊，被SCI收录的期刊超过300种EBSCOhostEBSCOhost是美国EBSCO Publishing公司提供的数据库。学科综合性较强，收录了包括自然科学、社会科学、人文艺术、生物医学等多学科领域的3 000多种期刊。Why - 数据库的特点数据库的特点 医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室书目型数据库（文摘型数据库）书目型数据库（文摘型数据库）Medline EMBASE.com（荷兰（荷兰医学文摘医学文摘） BIOSIS Preview（美国
11、（美国生物学文摘生物学文摘） CA (美国美国化学文摘化学文摘)Why - 数据库的特点数据库的特点 医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室书目型数据库（文摘型数据库）书目型数据库（文摘型数据库）建立时间较早，认知度高建立时间较早，认知度高 收录期刊数比较多，专业性强收录期刊数比较多，专业性强 检索系统成熟、规范检索系统成熟、规范 标引质量高、检索途径全面标引质量高、检索途径全面 无全文提供无全文提供Why - 数据库的特点数据库的特点 医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室书目型数据库（文摘型数据库）
12、书目型数据库（文摘型数据库）如：Medline收录4600多种生物医学专业期刊；提供包括作者、题名、关键词、主题词、代码等30多个经详细标引的可检字段MESH主题词规范标引PubMed部分功能部分功能医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室超过三十多个可检字段经规范经规范化的化的MESH词表检词表检索索EMBASE的特点的特点 医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室EMBASE收录3800多种医学、药学专业期刊；涵盖了大量的欧洲和亚洲医学期刊；专有药物检索（DrugSearch）:支持药物名称检索，并提供
13、药物联接，其中包括17个核心的药物联接和47个药物管理联接。EMTREE词表检索Why - 数据库的特点数据库的特点 医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室全文型数据库全文型数据库国外全文数据库大多由期刊出版商或出版集团生产国外全文数据库大多由期刊出版商或出版集团生产 收录期刊一般为本出版社自主产权的杂志，收录范围少收录期刊一般为本出版社自主产权的杂志，收录范围少 检索系统简单、易于操作，但功能不够齐全检索系统简单、易于操作，但功能不够齐全 大多为电脑机器标引，标引质量一般大多为电脑机器标引，标引质量一般 检索结果为全文检索结果为全文Why - 数
14、据库的特点数据库的特点 医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室PubMed与CBMPubMed中国生物医学文献数据库CBMVS检索索举例例医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室某医院消化科医生欲申报立项课题“幽门螺杆菌（HP）感染胃癌易感基因多态性检测的研究”。课题研究内容是IL-1,IL-10,TNF-多态性检测,用于HP感染胃癌高危人群的筛查。检索词:胃癌（gastriccancer）；幽门螺杆菌（Helicobacterpylori）；白细胞介素1（IL-1）；白细胞介素10（IL-10）；肿瘤坏
15、死因子（TNF-）；基因多态性（Polymorphisms）。中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室中国生物医学文献数据库（CBM）是我国最早的生物医学文献数据库之一。收录了1978年以来中国生物医学期刊1800多种，年增长量40余万篇。学科范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等医学各个领域。其医学主题词（MeSH）检索是几个中文数据库中独有的，标引依据美国国立医学图书馆的MeSH和中国中医研究院出版的中医药学主题词表。中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CB
16、M）医学信息检索与利用医学信息检索与利用CBM主题词表查词中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）医学信息检索与利用医学信息检索与利用CBM主题词表参见系统CBM主主题检索索医学信息检索与利用医学信息检索与利用CBM检索主要检索主要主题词主题词扩展树形结构检索扩展树形结构检索扩展副主题词扩展副主题词CBM主主题检索索医学信息检索与利用医学信息检索与利用CBM中英文主题词入口词参见树状结构号表明其类别CBM主主题检索索医学信息检索与利用医学信息检索与利用CBM主题词在学科分类中的位置主题词在学科分类中的位置族首词族首词树状结构表明该主题词树状结构表明该主题词分属四个不同的上位学分
17、属四个不同的上位学科科CBM检索索Company Logo主题词检索5篇缺省检索17篇CBM检索索医学信息检索与利用医学信息检索与利用CBM缺省字段：在中国生物医学文献数据库（CBM）中，是中文标题、摘要、作者、关键词、主题词和刊名内容的组合。CBM检索索医学信息检索与利用医学信息检索与利用CBM医学信息检索与利用医学信息检索与利用CBM检索词在题名字段出现检索词在题名字段出现检索词在检索词在文摘文摘字段出现字段出现检索词在检索词在刊名刊名字段出现字段出现PubMedv由美国国立医学图书馆（由美国国立医学图书馆（national library of medicine, NLM)下属的国家生物
18、技术信息中心下属的国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，NCBI)开发，用于检索生物医学开发，用于检索生物医学文献的文献的WEB数据库。数据库。v1997年年6月起提供月起提供INTERNET免费服务免费服务医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室医学信息检索与利用医学信息检索与利用PubMedPubMed医学信息检索与利用医学信息检索与利用PubMedJul-24PubMed 数据库数据库不同的标注不同的标注 不同的来源不同的来源 通过通过PubMed可检索的信息可检索的信
19、息: Medline收录范围：全世界收录范围：全世界7070多个国家和地区多个国家和地区19661966年以来的年以来的46004600余种生物医学期刊，目前文摘条目余种生物医学期刊，目前文摘条目13001300余余万篇，万篇，年报年报道量道量4040万条，英文刊物占万条，英文刊物占90%90%、3/43/4有英文摘要，每周有英文摘要，每周更新。更新。内容涉及：医学、药学、牙医学、护理学、预防医学、内容涉及：医学、药学、牙医学、护理学、预防医学、卫生管理、兽医学等专业。卫生管理、兽医学等专业。记录标注：记录标注： PubMed - indexed for MEDLINE PubMed 数据库数
20、据库: Premedline 收集未经标引的最新文献收集未经标引的最新文献, , 经经MeSHMeSH词表标词表标引后，每周向引后，每周向medlinemedline移加一次移加一次, , 同时从同时从Premedline Premedline 中删除中删除 。 记录标注：记录标注： PubMed - in process Jul-24PubMed 数据库数据库:Publisher Supplied Citation 出版商直接向出版商直接向 PubMed PubMed 递送的电子文献。其中递送的电子文献。其中有一部分在有一部分在MedlineMedline中未收录。中未收录。 若出版商提供全
21、文，若出版商提供全文，PubMedPubMed则建立与全文的链接，则建立与全文的链接，可免费或交一定费用直接联机获取原文可免费或交一定费用直接联机获取原文 。 记录标注记录标注:PubMed - as supplied by publisher Jul-24PubMed 数据库数据库二、检索规则（一）（一）Automatic Term Mapping词汇自动转换词汇自动转换 1、 MeSH Translation tableVitamin c 转换为转换为 “ascorbic acid”Mesh Terms OR vitamin cText Word 想要查验检索词的转换情况，并调整和保存检索
22、策略，可点击想要查验检索词的转换情况，并调整和保存检索策略，可点击“details”按钮按钮PubMed 数据库数据库 2、Journals Translation table New England journal of medicine 转换为转换为“N Engl J Med”Journal 包括期刊的三种不同表达方式包括期刊的三种不同表达方式 刊名全称、刊名全称、MEDLINE刊名缩写格式、刊名缩写格式、ISSN例例 Journal of leukocyte biology J leukoc biol 0741-5400Jul-24PubMed 数据库数据库 3、Phrase List
23、Cold compresses 在前两个表中均未找到，在短语列表中可找到这个在前两个表中均未找到，在短语列表中可找到这个词组。词组。Jul-24PubMed 数据库数据库 4、Author Index 当一个短语在前三个表中都找不到匹配词，当一个短语在前三个表中都找不到匹配词，PubMed就会就会到作者索引中查找。到作者索引中查找。 例：例：smith jc 姓前（全称）、名后（首字母缩写）姓前（全称）、名后（首字母缩写）Jul-24PubMed 数据库数据库 如果在上述如果在上述4 4个表或索引中仍找不到相匹配的词个表或索引中仍找不到相匹配的词时，时，PubMedPubMed就将短语劈开，用
24、就将短语劈开，用AND AND 将短语中的将短语中的单个词连接起来在全部字段中查找，直到找到单个词连接起来在全部字段中查找，直到找到相应的词为止。相应的词为止。例例：pressure point 转转换换为为 (“pressure”MeSH Terms OR pressureText Word) AND pointAll Fields)Jul-24PubMed 数据库数据库二、检索规则（一）（一）Automatic Term Mapping词汇自动转换词汇自动转换 1、 MeSH Translation tableVitamin c 转换为转换为 “ascorbic acid”Mesh Ter
25、ms OR vitamin cText Word 想要查验检索词的转换情况，并进行调整和保存检索策略，可想要查验检索词的转换情况，并进行调整和保存检索策略，可点击点击“details”按钮按钮Jul-24PubMed 数据库数据库MeSH Translation Table主题词注释表主题词注释表Journals Translation Table期刊注释表期刊注释表Common Phrase List常用词组表常用词组表Author Index作者索引表作者索引表No MappingNo Mapping检索词拆分检索词拆分AND（二）短语检索（二）短语检索如果在短语上加双引号，系统将只在如果
26、在短语上加双引号，系统将只在 Phrase List中查中查找，不再进行转换。找，不再进行转换。例如：例如： “single cell” “oxygen free radicals”Jul-24PubMed 数据库数据库Jul-24PubMed 数据库数据库短语检索短语检索自自动动转转换换后后的的结结果果三、检索途径与方法三、检索途径与方法v基本检索基本检索 - Basic Searchv高级检索高级检索 - Advanced Search (preview/index)v限定检索限定检索 - Limits Searchv期刊检索期刊检索 Journal Databasesv主题词检索主题词检
27、索 - MeSH Databasesv引文匹配引文匹配 - Citation Matcherv临床查询临床查询 Clinical QuerieJul-24PubMed 数据库数据库Company Logo医学信息检索与利用医学信息检索与利用PubMed检索选项医学信息检索与利用医学信息检索与利用PubMed三、基本检索普通感冒与Vc的关系检索词：1、CommonCold2、VCompany LCompany LCompany LCompany Logo四、高级检索Company LCompany Logo医学信息检索与利用医学信息检索与利用PubMed医学信息检索与利用医学信息检索与利用Pub
28、Med六、主题词检索举例：阿司匹林引起心肌梗死检索词：1、阿司匹林(Aspirin)2、心肌梗死(MyocardialInfarction)Company LCompany Logo选择主题词Company Logo可组配的副主题词限定在主要主题词检索不扩展下位词检索Company LCompany LCompany Logo入口词与款目词相关参见与树状结构表表表示示分分属属两两个个学学科科类类属属Company Logo临床循证医学文献属于PubMed的免费全文Company Logo七、限定检索出版日期限定文献类型限定原文语种限定研究对象限定性别限定子集限定年龄组限定Company Log
29、o案例案例Company Logo“幽门螺杆菌（HP）感染胃癌易感基因多态性检测的研究”。课题研究内容是IL-1,IL-10,TNF-多态性检测,用于HP感染胃癌高危人群的筛查。检索词:胃癌（gastriccancer）；幽门螺杆菌（Helicobacterpylori）；白细胞介素1（IL-1）；白细胞介素10（IL-10）；肿瘤坏死因子（TNF-）；基因多态性（Polymorphisms）。PubMed词语自自动转换检索索Company LogoPubMed主主题词检索索Company LCompany LCompany Logo外文数据库对比外文数据库对比医学信息检索与利用医学信息检索与
30、利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室 举例： 检索“发表在核心临床医学杂志上并能查询到全文的“有关老年人心肌梗塞的溶栓治疗”(Myocardial Infarction；Thrombolytic Therapy)的文献。对比数据库：PubMedSpringer全文期刊数据库全文期刊数据库OVID全文期刊库全文期刊库数据库对比数据库对比医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室 PubMedPubMed(Myocardial Infarction/therapyMesh) AND Thrombolytic TherapyMesh检出文献数
31、：2788年龄组：65岁以上540篇免费全文医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室Springer检索表达式医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室Springer检出文献数：1862医学专业文献数：1318点击篇名可阅读全文下载PDF格式全文医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室SCompany LogoOVIDCompany LogoOVID较完善的检索系统较完善的检索系统全文资源全文资源可可供供检检索索的的多多个个字字段段医学信息检索与利用医学信息检索与
32、利用昆明医学院信息检索教研昆明医学院信息检索教研室室OVID检索词选择不同的字段，检出结果不同医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室OVID文本词（Text Word关键词）标题词（Title）所有字段（All Fields自由词）医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室OVID医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室讨论书目型（文摘型数据库）书目型（文摘型数据库）PubMed：国际上最具权威型的综合性生物医学数据库，临床医学信息检索的首选工具。EMBASE：收
33、录多种药学专业期刊；专有药物检索；涵盖了大量的欧洲和亚洲医学期刊。可作为PubMed的扩展补充BIOSIS Preview：偏重于生物学和生命科学的资源：偏重于生物学和生命科学的资源CA (美国美国化学文摘化学文摘)： 化学、化工及制药的经典检索工具，化学、化工及制药的经典检索工具， 也是这方面文献也是这方面文献评价的重要依据评价的重要依据医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室讨论全文型数据库全文型数据库Elsevier1995年至今2500余种EBSCOhost1984年至今3000余种SpringerLINK1995年至今1800余种OVID1993年至今1200余种收录文献年限及期刊种数收录文献年限及期刊种数讨讨 论论医学信息检索与利用医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室昆明医学院信息检索教研室数据库数据库医学学科覆盖率医学学科覆盖率医学独家期刊数医学独家期刊数Medline覆盖率覆盖率SCI收录率收录率Elsevier 20.8% 221 种 44.3% 最高OVID 28.1% 136 种 74.9% 较高Springer 4.8% 51 种 29.7% 较低EBSCOhost 21.6% 101 种 23.6% 高LOGO
