新版Pubmed检索攻略ppt课件

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1、新版新版Pubmed检索攻略检索攻略1一一.PubMed概述概述1. 很多人只知道在检索框里输入一个关键字,然后按一很多人只知道在检索框里输入一个关键字,然后按一下下Go按钮这样一种单一原始的检索方式。虽然有一半按钮这样一种单一原始的检索方式。虽然有一半左右的情况,这样的操作就足以得到令人满意的信息,左右的情况,这样的操作就足以得到令人满意的信息,但对于另一半情况,就没有那么幸运了,要么你真正所但对于另一半情况,就没有那么幸运了,要么你真正所需的信息湮没在大量纷繁芜杂的需的信息湮没在大量纷繁芜杂的无用无用信息中,要么你信息中,要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。只得到了大量有用信息的冰山一角

2、。2.君欲善其事,必先利其器君欲善其事,必先利其器, PubMed就好像一把功就好像一把功能强大的枪,你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以能强大的枪,你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹,更重要的是,你要知道如何利用准星瞄准,发射子弹,更重要的是,你要知道如何利用准星瞄准,如何把这把枪的功能发挥到及至。如何把这把枪的功能发挥到及至。2二二.PUBMED简单检索技巧简单检索技巧1. 直接检索。当你打开浏览器,在地址栏内键入直接检索。当你打开浏览器,在地址栏内键入http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/ 或是百度或是百度pubmed,就进入了,就进入了PUBME

3、D检索系统主页检索系统主页。3每个人搜索效率的高低往往存在很大差别。在这里提供以下建每个人搜索效率的高低往往存在很大差别。在这里提供以下建议仅供参考:议仅供参考:n明确你要检索的关键概念及词语,即关键字;明确你要检索的关键概念及词语,即关键字;n考虑到关键字的类似说法,即有可能出现的同义词;考虑到关键字的类似说法,即有可能出现的同义词;n通过限定通过限定DATES, STUDY GROUP等,精炼检索范围;等,精炼检索范围;n多向有经验的人求教,因为不同的专业背景以及个人的差异,多向有经验的人求教,因为不同的专业背景以及个人的差异,都有可能形成不同的方法和技巧。都有可能形成不同的方法和技巧。2

4、通过布尔(通过布尔(BOOLEAN)运算来提高你的效率)运算来提高你的效率最常用的三种布尔运算即是最常用的三种布尔运算即是AND, OR, 和和NOT。AND提供的运算方式即不管所输入的两个关键词语所出现提供的运算方式即不管所输入的两个关键词语所出现的位置在哪,只要他们都出现在索引文章的某一处,就将的位置在哪,只要他们都出现在索引文章的某一处,就将其列出。其列出。而而OR则是将出现至少一个关键词的文章列出,这种运算则是将出现至少一个关键词的文章列出,这种运算在想将相似主题的文章罗列在一起时,十分有效。在想将相似主题的文章罗列在一起时,十分有效。NOT运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分除

5、去。运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分除去。但是在使用的时候要特别注意,会有可能将一些你所需要但是在使用的时候要特别注意,会有可能将一些你所需要的文章漏掉。的文章漏掉。63PUBMED检索类型检索类型通常我们所要查询的单词类型大致可以分为通常我们所要查询的单词类型大致可以分为:主题检索在主题检索在PubMed主页的检索框中键入的是英文单词主页的检索框中键入的是英文单词或短语或短语,然后回车或点击然后回车或点击Go。著者检索当我们所要查询的是著作者时,在检索框中键著者检索当我们所要查询的是著作者时,在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写,格式为:入著者姓氏全称和名字的首字母缩写,格

6、式为:著者姓著者姓空格空格 名字首字母缩写名字首字母缩写,例如,例如smith ja。刊名检索在检索框中键入刊名全称或刊名检索在检索框中键入刊名全称或MEDLINE形式的形式的简称、简称、ISSN号,例如:号,例如:mol biol cell, 或或1059-1524。日期范围检索可以在检索框中键入日期或日期范围。日日期范围检索可以在检索框中键入日期或日期范围。日期的录入格式为期的录入格式为YYYY/MM/DD;如:;如:1999/09/08, 也可以也可以不录月份和日子不录月份和日子7检索期刊子集检索词检索期刊子集检索词 AND jsubseta, 如如:neoplasm AND jsubs

7、eta。可供检索的期刊子库有可供检索的期刊子库有3种:种:Abridged Index Medicus(有(有120种重要核心期刊)、种重要核心期刊)、Dental 和和 Nursing。分别使用分别使用jsubseta, jsubsetd, jsubsetn 进行限定进行限定。这个功能非常实用,如果想入组比较高质量这个功能非常实用,如果想入组比较高质量的的文献,比如文献,比如核心期刊,这个时候实用期刊检索方式将会给你核心期刊,这个时候实用期刊检索方式将会给你省省下很多下很多时间,比如,我们搜索时间,比如,我们搜索neoplasm,直接搜索,一共出来了,直接搜索,一共出来了2692727篇文献

8、。如果我们限定核心期刊,那么结果只有篇文献。如果我们限定核心期刊,那么结果只有40238篇文献,这个工作量的差异对我们来说无疑是巨大篇文献,这个工作量的差异对我们来说无疑是巨大的!大家一定要掌握。的!大家一定要掌握。9检索带文摘的记录检索的格式为:检索词检索带文摘的记录检索的格式为:检索词 AND has abstract, 如:如:liver cancer AND has abstract。 要注意的是在要注意的是在1975年前出版的文章,其年前出版的文章,其MEDLINE记录中记录中没有文摘。没有文摘。114如何处理检索结果如何处理检索结果当你点击当你点击GO或回车后,或回车后,PubMe

9、d将会自动运行检索命令,将会自动运行检索命令,在屏幕的下方显示出符合检索要求的项目。此时要注意的在屏幕的下方显示出符合检索要求的项目。此时要注意的是符合检索要求的项目是以是符合检索要求的项目是以SUMMARY(简要格式)显(简要格式)显示出来的,就是列出作者,文章题目,以及文章来源的一示出来的,就是列出作者,文章题目,以及文章来源的一些信息些信息。那么如何批量保存文献呢?打开那么如何批量保存文献呢?打开Summary下拉菜单选择其下拉菜单选择其中一种格式,然后点击中一种格式,然后点击Save键;要保存特定记录时,点击键;要保存特定记录时,点击记录左边的选择框予以标记后,再点击记录左边的选择框予

10、以标记后,再点击Save键键。使用浏览器的打印功能,即可把感兴趣的内容打印出来。使用浏览器的打印功能,即可把感兴趣的内容打印出来。系统允许每页最多显示系统允许每页最多显示500条记录。如果想打印成文本格条记录。如果想打印成文本格式,请先点击式,请先点击Text键,然后再打印。键,然后再打印。12三三. . 检索实例检索实例1明确所要检索的内容。如果我们要查询的问题是明确所要检索的内容。如果我们要查询的问题是维生维生素素C对于普通感冒的防治作用对于普通感冒的防治作用。首先我们应分析这一问。首先我们应分析这一问题中的关键词语,主要由题中的关键词语,主要由维生素维生素C,和,和普通感冒普通感冒构成。

11、构成。即即VITAMIN C和和COMMON COLD。2分析所要检索的两个相关词语的关系。根据我们的日分析所要检索的两个相关词语的关系。根据我们的日常生活经验,可以将两个关键词之间的关系定义为常生活经验,可以将两个关键词之间的关系定义为AND,于是我们可以在检索框内键入于是我们可以在检索框内键入VITAMINC AND COMMON COLD.,然后点击,然后点击GO,进行检索。下面,进行检索。下面的画面即为经过上面检索过程后所得到的相关文章。的画面即为经过上面检索过程后所得到的相关文章。143以上初步检索后所显示的结果都以默认的以上初步检索后所显示的结果都以默认的SUMMER格格式显示出来

12、,在经过阅读后,可以进一步筛选文献的内容,式显示出来,在经过阅读后,可以进一步筛选文献的内容,选中文献左侧的方框。选中文献左侧的方框。16四四. . PUBMED高级检索技巧高级检索技巧1高级检索技巧有两个入口:一是通过搜索前的高级检索技巧有两个入口:一是通过搜索前的advanced进入,就在进入,就在pubmed首页搜索框的下面。首页搜索框的下面。172第二个功能入口就是我们搜索之后的界面,在左侧的第二个功能入口就是我们搜索之后的界面,在左侧的选项。选项。18五五. . MeSHMeSH Browser Browser(医学主题词浏览器)(医学主题词浏览器)何为何为MeSH?MeSH其实是其

13、实是Medical Subject Headings的缩略词,即医学的缩略词,即医学主题词,是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。主题词,是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。NIH的工作人员按的工作人员按MeSH词表规定,浏览生物医学期刊全词表规定,浏览生物医学期刊全文后标引出每篇文献中的文后标引出每篇文献中的MeSH主题词,其中论述文献中主题词,其中论述文献中心的主题词称主要主题词(心的主题词称主要主题词(major topic headings),论述),论述主题某一方面的内容的词称为副主题词。主题某一方面的内容的词称为副主题词。19 为什么要使用医学主题词呢?为什么要使用医学主题词

14、呢? 在期刊中,对于同一个概念往往可能有不同的描述形在期刊中,对于同一个概念往往可能有不同的描述形式,如式,如Tumor和和Neoplasm都是指肿瘤。当一个查询者希望都是指肿瘤。当一个查询者希望查阅肿瘤和查阅肿瘤和diet(饮食饮食)相关的文献时,他可能会输入相关的文献时,他可能会输入Tumor,也可能输入,也可能输入Neoplasm作为关键字,但其实这两者作为关键字,但其实这两者之间是没有区别的。一个愚蠢的检索系统可能就认识不到之间是没有区别的。一个愚蠢的检索系统可能就认识不到这点,而像这点,而像PubMed这样的这样的智能化智能化检索系统就能够准确检索系统就能够准确的意识到这点,从而不会

15、造成检索结果的遗漏。的意识到这点,从而不会造成检索结果的遗漏。20如何使用?如何使用?1、可以从、可以从PubMed首页上点击首页上点击PubMed Services下方的下方的MeSH Browser即可进入以下界面。即可进入以下界面。212.直接从搜索框内进入。把直接从搜索框内进入。把pubmed的下拉框打开,在里的下拉框打开,在里面直接找到面直接找到mesh的选项。的选项。 总而言之,主题词检索法虽然稍嫌繁琐,但其检索结总而言之,主题词检索法虽然稍嫌繁琐,但其检索结果的准确性高,遗漏率低,是最佳的检索方法,一旦熟练果的准确性高,遗漏率低,是最佳的检索方法,一旦熟练掌握,将使得我们的检索工

16、作事半功倍。掌握,将使得我们的检索工作事半功倍。22致致 谢谢n值此答辩之际,首先让我深深地感谢我的导师尊敬的李锋教授!感谢您以广博深厚的专业理论素养、严谨求真的治学作风、正直无私的高尚品德,对我言传身教。从课题设计、研究样本收集、实验和论文写作都倾注了您大量的心血,不仅培养了我的科研能力,更重要的是教育了我做一个对社会有益的人。李老师对我的严格要求和悉心教导使我终身难忘和受益。 n感谢教研室各位老师在课题进行的过程中和生活中的关心和帮助,在此向全体老师表示最诚挚的谢意。感谢刘春霞老师在选题、实验设计、病例选择、文章撰写、显微拍照甚至附加文献等等方面给予的热心指导和帮助;感谢李树刚老师给予统计

17、分析指导;感谢张文杰老师、崔晓宾师兄在文章修改方面给予的指导和帮助;感谢陈云昭老师、曹玉文老师、庞丽娟老师、邹鸿老师、齐研老师对我的实验以及生活思路的梳理与指点。感谢免疫室李洪安老师、郭长军老师、蒋金芳老师、任艳老师、梁伟华老师和刘秀霞老师在实验过程中给予的大力帮助和指导;感谢病理科王毅训老师和沈西华老师在收集样本和实验过程中给予的帮助;感谢张巍老师和孙振柱老师为本课题提供宝贵的样本与临床资料。n感谢我同学黎成芳、高海霞、魏翠蕾、董红超、申耀元、刘瑞雪、李曼、庞雪莲,张微,万国兴、李秀明在三年学习生涯的陪伴和帮助。同时非常感谢师妹王媛媛、王宁、谢玉汶,师弟厉兵城、朱建波的鼎力相助。n感谢我的父母和姐姐一直以来对我无私的关爱和支持,始终是我坚强的后盾。n最后再次感谢所有曾给予我关心、鼓励、支持与帮助的热心人!23

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