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1、 Beilstein 使用培训（一）使用培训（一） -化学合成反应的检索化学合成反应的检索药明康德新药开发有限公司药明康德新药开发有限公司药明康德版权所有药明康德版权所有1Part I: 基本检索方法介绍基本检索方法介绍2打开打开Beilstein页面后选择数据库页面后选择数据库选择数据库选择数据库3CrossFire Commander 7.0 使用界面使用界面4选择化学结构的绘图工具选择化学结构的绘图工具选择绘图工具选择绘图工具使用较为方面，一般是默认设置使用较为方面，一般是默认设置5编辑状态编辑状态选择结构或基团选择结构或基团橡皮橡皮旋转旋转放大放大缩小缩小画线画线CrossFire S
2、tructure Editor 功能键的介绍功能键的介绍Clossfire 点击后进入检索页面点击后进入检索页面6原子的定义原子的定义7官能团的定义官能团的定义8最后的字母改为最后的字母改为,代表该结构和氢都可以。代表该结构和氢都可以。以下几个也是常用的：以下几个也是常用的：任意原子；：除：任意原子；：除C,H的原子：金属原子：卤素原子的原子：金属原子：卤素原子AH, QH, MH, XH则代表这类分子或氢原子则代表这类分子或氢原子原子或官能团通式的缩写原子或官能团通式的缩写9选择设定任意取代选择设定任意取代取消任意取代取消任意取代选择多个原子定义任意取代基选择多个原子定义任意取代基10各种键
3、的定义各种键的定义11单键，快捷方式单键，快捷方式 s + 回车回车双键，快捷方式双键，快捷方式 o + 回车回车三键，快捷方式三键，快捷方式 t + 回车回车任意键，快捷方式任意键，快捷方式 a + 回车回车单或双键，快捷方式单或双键，快捷方式 i + 回车回车双或单键，快捷方式双或单键，快捷方式 d + 回车回车标示手性中心的实线，快捷方式标示手性中心的实线，快捷方式 u + 回车回车标示手性中心的虚线，快捷方式标示手性中心的虚线，快捷方式 w + 回车回车手性中心的不，明手性中心的不，明，快捷方式，快捷方式 e + 回车回车双键立体结构，快捷方式双键立体结构，快捷方式 b + 回车回车各
4、种键的定义和快捷方式详解各种键的定义和快捷方式详解12快捷方式快捷方式打开后某打开后某类模板后类模板后则成默认则成默认方式，要方式，要打开其他打开其他模板从模板从File工具工具栏打开栏打开内存结构模板内存结构模板使用使用CrossFire自带的模板画结构自带的模板画结构13使用使用CrossFire自带的模板介绍自带的模板介绍氨基酸氨基酸芳环芳环原子链原子链环烷环烷杂环杂环天然产物天然产物原子族原子族卟啉卟啉其他其他甾体甾体糖糖-线状线状糖糖-环状环状多萜多萜天然产物天然产物核糖核酸核糖核酸14结构定义状态结构定义状态画线将反应物和产物的共同原子连起画线将反应物和产物的共同原子连起定义反应物
5、和产物定义反应物和产物15定义定义反应中心及手性翻转情况反应中心及手性翻转情况在定义状态下，单击反在定义状态下，单击反应连线的一端，跳出如应连线的一端，跳出如右对话框，可设定反应右对话框，可设定反应中心中心( (反应中心反应中心oror非反应非反应中心中心) )及手性翻转情况及手性翻转情况（构象翻转（构象翻转oror保持）保持）16结构大小及字体的调整结构大小及字体的调整17从从ChemDraw中复制化学结构中复制化学结构使用方法：使用方法：从从ChemDraw中中复制结构后，在复制结构后，在检索主页面使用检索主页面使用Ctrl+v 或右键单或右键单击后左键点击后左键点Paste。Note：1
6、. 此法进入编辑器后无效；但可以在主页面复制后再进入编辑器此法进入编辑器后无效；但可以在主页面复制后再进入编辑器 2. 结构中不能含有结构中不能含有ChemDrawChemDraw自带的模板，不能有任何缩写（无法识别）。自带的模板，不能有任何缩写（无法识别）。18检索主页面定义检索属性检索主页面定义检索属性检索单一结构可用检索单一结构可用杂原子任意取代杂原子任意取代原子任意取代原子任意取代作为结构检索作为结构检索作为反应物检索作为反应物检索作为产物检索作为产物检索1919检索主页面检索主页面选择检索反选择检索反应，点击应，点击Start Search后开始检索后开始检索20Part II: 检
7、索技巧介绍检索技巧介绍21通过产物的结构对反应进行限定通过产物的结构对反应进行限定结构与官能团分开画，并且都结构与官能团分开画，并且都free site可以表示官能团的任意位置可以表示官能团的任意位置取代取代代表分子结构中含代表分子结构中含有吡啶环及硝基，有吡啶环及硝基，自然就包含了邻、自然就包含了邻、对、间位的硝基吡对、间位的硝基吡啶。但有时范围可啶。但有时范围可能过大，包含许多能过大，包含许多非期望的结构信息，非期望的结构信息，可以通过其他方法可以通过其他方法加以限定加以限定22通过产物的结构对反应进行限定通过产物的结构对反应进行限定在产物中带有敏感官能团的情况下选择性的反应检索示例在产物
8、中带有敏感官能团的情况下选择性的反应检索示例23定义可能具有互变异构体的结构定义可能具有互变异构体的结构2425定义可能具有互变异构体的结构定义可能具有互变异构体的结构改变键的性质，选择改变键的性质，选择或点击相应的键修改或点击相应的键修改定义两个取代基的杂环定义两个取代基的杂环包含所有的芳环结构，包含所有的芳环结构，再文字定义再文字定义定义两个取代基的杂环定义两个取代基的杂环包含所有的芳环结包含所有的芳环结构，再文字定义构，再文字定义定义环状和非环状结构定义环状和非环状结构28定义环状和非环状结构定义环状和非环状结构29定义环状和非环状结构定义环状和非环状结构30定义检索结构定义检索结构定义
9、检索结构定义检索结构对反应检索结果进行限定对反应检索结果进行限定对反应检索结果进行限定对反应检索结果进行限定对反应检索结果进行限定对反应检索结果进行限定限定检索结果的反应物为产物倒推合成路线限定检索结果的反应物为产物倒推合成路线39通过相关反应查找反应合适的条件通过相关反应查找反应合适的条件Part III: 利用利用Beilstein 确定合成路线确定合成路线40反应检索的基本原则反应检索的基本原则41首先检索文献有没有首先检索文献有没有相同分子的合成方法相同分子的合成方法有相同分子的合成有相同分子的合成没有相同分子的合成没有相同分子的合成文献方法合理文献方法合理文献方法不合理文献方法不合理
10、（Cost, Scale up)Cost, Scale up)设计新的合成路线设计新的合成路线寻找相似结构寻找相似结构的文献合成方法的文献合成方法查阅核心结构进行组装查阅核心结构进行组装添加可以相互转换的添加可以相互转换的官能团或改变键的性质官能团或改变键的性质采用文献路线采用文献路线寻找相似结构的合成方法寻找相似结构的合成方法设计合成路线（一）设计合成路线（一）42尽量注意分子具有类似性尽量注意分子具有类似性, ,这样将其反应条件应用这样将其反应条件应用 到我们所要合成的分子中将更可靠到我们所要合成的分子中将更可靠. .l变换官能团的取代位置，扩展检索范围变换官能团的取代位置，扩展检索范围l
11、非反应的基团相同位置设为非反应的基团相同位置设为Free siteFree sitel将分子中无关重要的非反应中心为部位变为将分子中无关重要的非反应中心为部位变为Free siteFree site设计合成路线（一）设计合成路线（一）43寻找相似结构的合成方法示例寻找相似结构的合成方法示例寻找相似结构的合成方法示例寻找相似结构的合成方法示例点击反应物点击反应物,追溯文献合成路线追溯文献合成路线设计合成路线（一）设计合成路线（一）44设计合成路线（一）设计合成路线（一）通过相似结构的合成方法设计的路线通过相似结构的合成方法设计的路线45设计合成路线（二）设计合成路线（二）添加可相互转换的官能团或
12、改变键的性质添加可相互转换的官能团或改变键的性质46文献中找不到类似结构的合成方法；文献中找不到类似结构的合成方法；相关类似物的合成方法很少，找不到较为合适路线相关类似物的合成方法很少，找不到较为合适路线添加可相互转换的官能团或改变键的性质添加可相互转换的官能团或改变键的性质设计合成路线（二）设计合成路线（二）47添加可相互转换的官能团或改变键的性质添加可相互转换的官能团或改变键的性质设计合成路线（二）设计合成路线（二）48添加可相互转换的官能团或改变键的性质添加可相互转换的官能团或改变键的性质设计合成路线（二）设计合成路线（二）49添加可相互转换的官能团或改变键的性质添加可相互转换的官能团或
13、改变键的性质设计合成路线（二）设计合成路线（二）50设计合成路线（二）设计合成路线（二）51添加可相互转换的官能团示例添加可相互转换的官能团示例设计合成路线（二）设计合成路线（二）52添加可相互转换的官能团示例添加可相互转换的官能团示例设计合成路线（二）设计合成路线（二）53添加可相互转换的官能团设计合成路线添加可相互转换的官能团设计合成路线改变键的性质改变键的性质添加可相互转换的官能团添加可相互转换的官能团设计合成路线（二）设计合成路线（二）56添加可相互转换的官能团或改变键设计合成路线添加可相互转换的官能团或改变键设计合成路线设计合成路线（三）设计合成路线（三）查阅各核心结构的合成方法进行
14、组装查阅各核心结构的合成方法进行组装57Part IV: 其他功能介绍其他功能介绍58将将Chemdraw不带缩写的结构不带缩写的结构复制到复制到CrossFire 检索主页面，检索主页面，点击点击Autonom键键使用使用BeilsteinBeilstein对复杂结构进行命名对复杂结构进行命名59输入化学结构后输入化学结构后点击点击“Genernate Name” ，可得，可得到相应的化学结到相应的化学结构，其对复杂结构，其对复杂结构特别带顺反式构特别带顺反式及多个手性中心及多个手性中心的，命名特别方的，命名特别方便其还会标出便其还会标出各种环的各原子各种环的各原子的序号的序号选择命名的参考选择命名的参考使用使用BeilsteinBeilstein对复杂结构进行命名对复杂结构进行命名60如何将检索结果导出如何将检索结果导出61Beilstein 带有将检索结果导入到带有将检索结果导入到Word的功能，但内容往往太多，阅读不的功能，但内容往往太多，阅读不是很方便，因此一般建议使用是很方便，因此一般建议使用PrintKey 或或 SnagIt来直接复制检索结果来直接复制检索结果. .Question & Comments62
