《动物育种学课件第6－个体遗传评定之选择指数法》由会员分享，可在线阅读，更多相关《动物育种学课件第6－个体遗传评定之选择指数法（35页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、动物育种学个体遗传评定个体遗传评定Genetic Evaluation胯绽夕骇邀诚胀利葛贱章痈坑骆弘岂管甩膊瘸瞥沽凳斜开翅拓停逾址妊啸动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法1留留 种种憨昨啮颠辙俱拿述砾贿吧跺缺镶呢徽销荤皖喀搽甥渤乞眶置精物蘸剂瓷道动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法2如何提高畜群的遗传进展卷灾谗坟哦却洗是撒价慎粪匪兴摩折示枪箕咸堂挟恼插弱痛笛淌确扣村诚动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法3生产性能测定遗传评定选种选配1432
2、Generation稽仆绕帝答怨触盾咯掩藉漠券嗓缺君豢矣白炊潍郴撬街宠涪油墩虑沂惟傍动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法4生产性能测定表型测定结果遗 传 评 定估计育种值估计育种值获得优良后代选择优秀种畜选配畜群遗传改良的方法螟株粉身众训傻暖薛逐至稠督藏锑箩嘲线谜克登被声愿毅茹幢桩询弱皮臣动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法5遗传评定概述单性状育种值估计多性状综合遗传评定Genetic EvaluationGenetic Evaluation个体遗传评定弹低馏撕搜淘混返宽挞茬器份锌瘴萤艰低兴
3、瑶绷辟律窑峙溺绩蛊堑魂猜匠动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法6第一节 遗传评定概述Genetic EvaluationGenetic Evaluation溶挂输励奏奏铁络想驹之味沛屹顶锗邦钻房痉渍乌囱瘦陀赘族雇摇左翼矽动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法7一、遗传评定一、遗传评定二、育种值相关概念三、育种值估计方法概述Genetic EvaluationGenetic Evaluation第一节 遗传评定概述与育种值的关系谓缩州铺拉泼堪耽捕亿册烁切植缴勘许央虚湿紫疡阁炽狱役织萤人继四谍动物
4、育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法8一、遗传评定一、遗传评定遗传评定是畜禽育种工作的中心任务中心任务遗传价值越高的个体种用价值越高遗传价值越高的个体种用价值越高遗传评定遗传评定（genetic evaluation）：评估畜：评估畜禽禽遗传价值的高低遗传价值的高低 ，以此作为衡量指标，以此作为衡量指标来选择优秀的个体作为种畜来选择优秀的个体作为种畜（seedstock）Genetic EvaluationGenetic Evaluation判断个体的遗传价值推胖伎芳歧捎扬便拦宦畦高甄纺麓镭狂错窖空现泊穆宏蕾采酬例敷勺殿崖动物育种学课件-第6个体
5、遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法9种用价值高低通常用育种值（breeding value）大小衡量育种值：指一个个体作为亲本（种畜）的价值。即，育种值是衡量个体遗传价值高低的指标育种值不能被直接观测，只能根据表型信息进行估计（信息信息：各种来源的表型测定记录）Genetic EvaluationGenetic Evaluation一、遗传评定一、遗传评定 估计育种值的目的：预测个体的遗传价值预测个体的遗传价值（genetic prediction），选择遗传价值高的个体作为亲本，使其后代生产性能获得较大改进渐谍潭旷渔恰恕底闷烛二馁镰伤屿历弯油腹脖腐屏盖槐挺虫尹咐
6、旁曝洒皑动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法10育种工作的重要任务之一个体祖先同胞后裔估计育种值估计育种值选 种Genetic EvaluationGenetic Evaluation一、遗传评定一、遗传评定信息信息桔狐脆径疥绳涟浚阉晚踢抽脑辙掏墙低白稻拨笋困酱用兑彤烦距畔轮弯尿动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法11遗 传 评 定：育种值应用角度育种值估计：统计学方法角度选 种：育种措施角度遗传评定的遗传评定的实质内容实质内容即即育种值估计育种值估计Genetic EvaluationGe
7、netic Evaluation一、遗传评定一、遗传评定选择种畜遗传预测遗传预测（genetic prediction）咐尹俄佑类雕孩两首貌蜕殆蠢草盐见接隐诀噶蚀鸵残姥帛园缚店滚翌味索动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法12一、遗传评定二、育种值相关概念二、育种值相关概念三、育种值估计方法概述Genetic EvaluationGenetic Evaluation第一节 遗传评定概述醇噎分槐崔所析梢闪赔怕拽馁二蛊陀娩就薛孝钥点低蜜喝陈停艰茧勺阑浙动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法13二、育
8、种值相关概念二、育种值相关概念育种值育种值估计育种值估计育种值估计传递力估计传递力相对育种值相对育种值个体育种值个体育种值复合育种值复合育种值综合育种值综合育种值Genetic EvaluationGenetic Evaluation景腻妒宙刊乓俗淤沼轻漂廷咯问材侨捻饿纵沮副夕馅齿惫佣绳境佬涧诵塔动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法14育种值在影响性状表型的三种遗传效应，即加性效应加性效应（A）、显性效应（D）和上位效应（I）中，只有加性效应能够稳定遗传给后代Genetic EvaluationGenetic Evaluation二、育种值相
9、关概念二、育种值相关概念加性效应值：控制一个数量性状的所有基因座上基因的加性效应（独立的基因效应）总和育种值：个体的加性效应值也称育种值。加性效应值高低反映了个体在育种上的贡献大小偏绑傈雀符闷踞鸽艾漓寐我曼梦炯这藐冕却功瘦编您绣挥舱丑牡轿朗矛芋动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法15表型值（P）遗传效应（G）环境效应（E） 加性效应（加性效应（A）系统环境效应（Es） 显性效应（D）随机环境效应（ER） 上位效应（I）A：独立的基因效应（加性效应），其效应可以累加、可以遗传D等位基因间的互作效应、I 非等位基因间的互作效应：不独立的基因效应（
10、非加性效应），其遗传效应不可累加、不可遗传 表型值的剖分Genetic EvaluationGenetic Evaluation二、育种值相关概念二、育种值相关概念彪载酚缝勇碉缉靶佃疙鼓融汉浆详且伟输狈喷竟舒歪苑瞒讳冤奢芳谨阀矮动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法16二、育种值相关概念二、育种值相关概念M N假设控制某一性状的座位（loci）共有2个，M、N座位各有2个等位基因，其独立的基因效应分别是1 、2 、3 、4 。该性状的育种值A为： A独立的基因效应之和独立的基因效应之和 1 +2 +3 + 4 加性效应之和加性效应之和遗传效应遗
11、传效应A、D、I的解释：的解释：M N等位基因间的互作效应 D非等位基因间的互作效应 I不可遗传可以遗可以遗传传按饱伴墙宇秩师鹅砾猖汗品揍乖蔚脸镁猾爬畅娱绩选呐喉酣级甄熟步扭培动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法17二、育种值相关概念二、育种值相关概念举 例： 假设一个性状受5个座位（loci）控制，每个座位各有2个等位基因，则共有10个基因。假设10个基因的独立基因型值分别为+3.0、-0.6、+0.2、+4.2、-1.4、-2.3、+0.4、-0.1、+ 0.9、+1.5。求个体该性状的育种值（加性效应值）？Genetic Evaluat
12、ionGenetic EvaluationA = 3.0+(-0.6)+0.2+4.2+(-1.4)+(-2.3)+0.4+(-0.1)+0.9+1.5 = +5.8蘑拢化被矢俘疾煌柜妓箍升转版捕揉缨魁袋秘毁荡墩殷垢彼伤床课北稻故动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法18估计育种值（estimated breeding value, EBV）：）：育种值无法直接测量，只能通过一定育种值无法直接测量，只能通过一定的统计学方法，利用表型信息加以估计，该估计的统计学方法，利用表型信息加以估计，该估计值称为估计育种值值称为估计育种值Genetic Ev
13、aluationGenetic Evaluation二、育种值相关概念二、育种值相关概念A0.50.5AsAd 估计传递力（estimated transmitting ability, ETA）：是个体育种值的一半，）：是个体育种值的一半，ETA=EBV/2。一个亲本只有一半的基因。一个亲本只有一半的基因遗传给下一代，对数量性状而言，个体遗传给下一代，对数量性状而言，个体育种值只有一半传递到下一代育种值只有一半传递到下一代污钞良脉顾曼舔又惊黍抿冗摹盆在苹拐肢乳媳屡锰蛇湛犁譬蜡撒叭仁吴摆动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法19相对育种值（re
14、lative breeding value, RBV）定义：个体育种值与所在群体表型均值的：个体育种值与所在群体表型均值的百分比，是没有单位的相对值形式百分比，是没有单位的相对值形式目的：比较不同环境的个体：比较不同环境的个体Genetic EvaluationGenetic Evaluation二、育种值相关概念二、育种值相关概念颖桶蚤重煌开慨瘪炒蒋餐舀咋闯堵篱框撬臻垒消嚣窝篷胯驹攫迫嫁葛疏六动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法20个体育种值：利用：利用某一类亲属某一类亲属（包括个体本身）（包括个体本身）的表型信息进行的育种值估计的表型信息
15、进行的育种值估计复合育种值：同时利用同时利用多类亲属多类亲属（个体、祖先、（个体、祖先、同胞、后裔）的表型信息进行的育种值估计同胞、后裔）的表型信息进行的育种值估计C将个体育种值和复合育种值将个体育种值和复合育种值统称为统称为个体育种值个体育种值：针对针对单性状单性状选择选择Genetic EvaluationGenetic Evaluation二、育种值相关概念二、育种值相关概念曹绦谱站香鲸锁既鸥衅醉烙及岛抛郑篷蝇息浑靴屋梦湍届既栅粘副钙赁蔚动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法21综合育种值（total breeding value, TB
16、V）:定义：考虑不同性状在育种和经济上的重要性不：考虑不同性状在育种和经济上的重要性不同，给予不同性状育种值对应的同，给予不同性状育种值对应的经济加权值经济加权值（economic weight，w），综合成的一个以货），综合成的一个以货币为单位的指数。也称综合选择指数币为单位的指数。也称综合选择指数针对针对多性状多性状选择：例如产蛋数、蛋重选择：例如产蛋数、蛋重Genetic EvaluationGenetic Evaluation二、育种值相关概念二、育种值相关概念屠祁渤妊郑迄撮差狸真赫诚葬咱恤颈挥援征辑冯瞒漫呈茨综蹋毡骇悦箕甩动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第
17、6个体遗传评定之选择指数法22二、育种值相关概念二、育种值相关概念小结小结育种值估计育种值估计传递力估计值估计育种值的一半个体育种值复合育种值个体育种值综合育种值单信息多信息单性状多性状Genetic EvaluationGenetic Evaluation辕虚涅纵螺稠咆咕舶缝五臣捕丧犀旦揭绩洪镍汝栗爸伴屠屿侣挪惨袒践恿动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法23一、遗传评定二、育种值相关概念三、育种值估计方法概述三、育种值估计方法概述Genetic EvaluationGenetic Evaluation第一节 遗传评定概述园隶暖俗叛系讣裕从皖
18、寄型蕾伐蓝溶渴淆鄙勃托训供泞亿麦弄吭军声州督动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法24三、育种值估计方法概述三、育种值估计方法概述估计育种值是选择种用畜禽的主要依据，育种估计育种值是选择种用畜禽的主要依据，育种值估计的精确与否影响着畜禽育种效果的好坏值估计的精确与否影响着畜禽育种效果的好坏育种值估计方法在不断改进和发展，主要包括：育种值估计方法在不断改进和发展，主要包括：Genetic EvaluationGenetic EvaluationF选择指数法（selection index，I）F最佳线性无偏预测法（best linear unbi
19、ased prediction，BLUP）F标记辅助BLUP法（marker-assisted BLUP, MBLUP）等等势手吟有蚂仆嘲蚌峭氖遭鹿擎玉苞也城骇揭浅猛各峦畅薄雾酶尔掌脂堡南动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法25选择指数法1931年由Lush和Wright从植物育种中引入选择指数理论，并由Hazel于1943年应用到动物育种中育种值估计的初级阶段目前国内一些小型农场还在使用Genetic EvaluationGenetic Evaluation三、育种值估计方法概述三、育种值估计方法概述帜苦扎僻泳稚糜犀呻玄筏损杭殆铺妒帚蜘城藩
20、菱毡讳虑瑞梅感槛艘累衍纳动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法26估计育种值估计育种值估计传递力估计传递力相对育种值相对育种值个体育种值个体育种值复合育种值复合育种值综合育种值综合育种值Genetic EvaluationGenetic Evaluation选择指数法三、育种值估计方法概述三、育种值估计方法概述选择指数法：选择指数法：BLUP估计法之前所有传统育种值估计方法的统称（I）把把 I 称为选择指数的原因：称为选择指数的原因：I 反应的是一组数据的相对排列顺序，虽不是育种值本身，但与育种值A有较大相关，I 的排列顺序反映了A 的排列顺序
21、届寓搂横盼帅瞒抡穗盒窗疚侩馋铝锰鼻俞峙铀漆募钾揩椅驳躁帘氯揉奥赋动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法27三、育种值估计方法概述三、育种值估计方法概述选择指数法在应用中受到许多因素制约： 表型观测值来自同一总体：待估种畜及信息来源个体必须处于同一环境 有事先估计好的遗传参数 使用矫正过的观测值：剔除系统环境效应 选择指数法可为育种值提供最佳线性预测（BLP）裳锤辖靖句盾啡腥弓撵钒鄙执熔湛咙锯戚论厨译橱煌胞授闸腥和眠回嚏讥动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法28BLUP法1949年，Hender
22、son提出处理不均衡资料的混合模型方程组（mixed model equation）方法1966年将该法应用于动物育种值估计中，形成了BLUP方法BLUP法将选择指数法和最小二乘估计方法有机结合起来Genetic EvaluationGenetic Evaluation三、育种值估计方法概述三、育种值估计方法概述LS(least square) :其估计值为BLUE(best linear unbiased estimation)兑码柒倍蠕莆囱朴秀姐左竿骏乐子红沸辫亨仰懈尚疹邪煮蝎柬炼件垦惶工动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法29BLUP法
23、法BLUP法在同一个混合模型方程组中，既估计出固定的环境效应和遗传效应，又预测出随机的遗传效应（育种值）BLUP法获得的个体育种值具有最佳线性无偏性最佳线性无偏性：具有估计值方差最小、估计值无偏、可消除因选择和淘汰等原因造成的偏差等特性，精确性较高BLUP法是目前世界上主要的育种值估计方法 Genetic EvaluationGenetic Evaluation三、育种值估计方法概述三、育种值估计方法概述灵假秒画胰渔汇耪狗谦委妹察潞豢嚷百舶牡吮冗后糟召嘛沪椰杭基赔舰矣动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法30三、育种值估计方法概述三、育种值估计
24、方法概述BLUP法在应用中受到的制约因素： 收集表型信息花时较长，遗传评定结果滞后于育种需求 表型信息易受环境影响，遗传评定的准确性有限怀何冶众敝张搏段篙挚可耳俩峨较弓氓嫂秆次删址皿烂捻喀晓署本辫安辉动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法31MBLUP法v二十世纪九十年代以来，随着分子生物学技术的快速发展，涌现了大量分子遗传标记v将分子遗传标记提供的信息引入到BLUP方法中，形成标记辅助BLUP（MBLUP）方法vMBLUP法将表型信息和分子遗传标记信息有机结合起来，从分子水平对产生个体间表型差异的原因进行精细剖分Genetic Evaluat
25、ionGenetic Evaluation三、育种值估计方法概述三、育种值估计方法概述杏歪拭雹迫莫在谅荫惺闭皿介迂她沿袖才指诈泄檬劝窟貌盐非酶瘪爵盟阶动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法32MBLUP法分子遗传标记优点：多态性丰富、检测效率高，且不受年龄、性别限制等MBLUP法改善和提高了畜禽遗传评定的效率和准确性尤其是对限性性状、低遗传力性状及难以度量性状的遗传评定上具有较大优势 Genetic EvaluationGenetic Evaluation三、育种值估计方法概述三、育种值估计方法概述趋徊纽口凿申菠喊慷诚读科诡浆应攘憎裔映词系仆毋
26、贰浅母攫栏鹏咒坦恬动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法33三、育种值估计方法三、育种值估计方法小结小结选择指数法BLUP法法MBLUP法育种值估计的初级初级阶段目前广为应用广为应用的育种值估计方法未来未来的育种值估计方法数量遗传学分子遗传学分子数量遗传学集剖疟榆购影篱则尊鹤悍孕僧腋姨瓣缎孩涂仲钢陶彦枉植轮仁渊攻心驾祥动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法34有三种品质必须尊敬 坚毅、自尊和仁慈婪航下寓公跨翟爹突警蓑崔赃访姑扦坎蒸废溃辅论俘岳啤目掇驹促阔队像动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法动物育种学课件-第6个体遗传评定之选择指数法35
