基因工程复习知识点

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1、质粒名称和大小、复制启动子、多克隆酶切位点MCS、选择标记基因16 C连接,37 C酶切凝胶电泳 pH8.0 带负电1. 基因工程:又称遗传工稈,是通指重组DNA技术的产业化设计和应用的流稈。 强调基因克隆、载体构建、遗传转化、性状表达与产品提取及纯化等全部过程。2. 基因操作技术:利用遗传重组技术,在体外通过人工“剪切”和“拼接”等方法,将包 含目的基因、特殊载体在内的各种必需元件的DNA分子经过改造和重组后,转入另一受 体生物细胞内。3. 基因:DNA分子中含有特定遗传信息的一段核苷酸序列。4. 核酸:由许多核苷酸单位通过3, 5-磷酸二酯键连接起来形成的不含侧链的具有方向性的 长链状化合

2、物。5. 顺反子(基因同义词):在反式构型中不能互补的各个突变型在染色体上所占的一个区域 称为一个顺反子。是一个必须保存完整才具有正常生理功能的遗传物质最小单位。6. 突变子(muton):突变单位,基因内部有许多突变位点,突变后产生变异的最小单位。(最 小的突变单位为1 个碱基对 bp)7. 重组子(recon):重组单位,基因内部有多个重组单位,不能由重组分开的最小单位。一个基因不是一个突变单位,也不是一个重组单位。8. 断裂基因(split gene):指基因内部被一个或更多不翻译的编码顺序即内含子所隔裂。基因都可划分为转录区(转录起始点至转录终止子的区域)和调控区(位于转录起始点 5

3、上游,包括核心启动子、上游启动元件及增强子等序列)结构基因并非都是连续的,原核生物基因是连续的,而真核生物的基因是断裂的9. 内含子(intron):在成熟mRNA的片段中未反应出的DNA区段;10. 外显子(extron/exon) : DNA序列中被转录成为mRNA中的片段。基因中能变成核苷酸序列的是外显子,内含子不能。11. 核小体(nucleosome):在真核生物中,双螺旋的DNA分子围绕一蛋白质八聚体进行盘 绕,从而形成特殊的串珠状结构。核小体结构属于DNA的高级结构。核小体是染色体的基本结构单位。12. 重叠基因(overlapping gene):两个或两个以上的基因共有一段D

4、NA序列的现象。13. 转座子(Transposon):又名转位子、跳跃基因(jumping gene)是一类DNA序列,它们 能够在基因组中通过转录和逆转录,或在内切酶(Nuclease)的作用下,在其他基因座上 出现。转座子的发现,证明了基因组并不是一个静态的集合,而是一个不断在改变自身构成的动 态有机体。14. 同源重组: 是指发生在 DNA 同源序列之间的重组。15. 位点特异性重组:指发生在特异序列之间的重组,仅见于噬菌体的基因组整合到细菌染 色体中的过程。16. 转座重组:是指不依赖于序列间的同源性而使一种DNA顺序插入另一种DNA顺序中的 重组,因此转座是一种可在染色体的不同区段

5、或不同染色体之间广泛发生的重组。又称 为复制重组。17. 基因组:是指细胞内遗传信息的携带者DNA的总体。18. 组蛋白(histones):是指染色体中的碱性蛋白质,其特点是富含二种碱性氨基酸(赖氨 酸和精氨酸)。19. PCR (Polymerase Chain Reaction):聚合酶链式反应的简称。PCR技术是一种在体外高效 快速扩增特定基因或DNA序列的方法。20. 电泳:带电颗粒在电场作用下向着与其电荷相反的电极移动的过程。21. 载样缓冲液(loading buffer):待电泳的样品在点样前与之相混合的一种缓冲液。22. 载体(vector):能携带外源基因进入受体细胞的运载

6、工具,且有完整的复制(及转录) 功能的DNA大分子。23. 克隆载体(cloning vector):主要是对目的基因克隆,有复制子即可24. 表达载体(expression vector):能使目的基因在宿主细胞中表达的一类载体,既有复制 子,更要有强启动子25. 穿梭载体(shuttle vector):既可在原核细胞中复制,也可在真核细胞中扩增和表达26. 质粒(plasmid):存在于微生物染色体外的小型环状双链DNA分子,基因工程技术中应 用最广泛、功能最强大、最易操作的载体。不相容性:同一细胞内不能同时存在两种质粒27. 穿梭质粒载体(shuttle plasmid vector)

7、:由人工构建的具有两种不同复制起点和选择标 记,因而可在两种不同的寄主细胞存活和复制的质粒载体28. Ampr (氨苄青霉素抗性)29. Tetr (四环素抗性)30. MCS:载体上供外源基因插入的、具有多个RE单一酶切位点的片段,一般为人工拼接 而成31. 回文结构(palindrom):以切割序列正中作为轴心,反转对称;同一单链以中心轴对折 可形成互补双链。32. 平末端:在识别序列的对称轴上进行切割;33. 粘(黏)性末端:在识别序列的两个对称点切割,产生末端带有单链尾巴的切口;34. 同裂酶:不同的RE有相同的识别特点,但切割位点不一定相同;35. 同尾酶:不同RE识别不同序列,但切

8、割后能产生相同的粘性末端,可以连接起来36. 酶单位(U):在最适反应条件下1小时完全消化l“g标准DNA所需的酶量为1个单位37. 星活力: RE 在酶切反应条件改变后识别特异序列的特性降低的一种现象38. DNA连接酶(DNA ligase):催化双链DNA中相邻碱基的5磷酸和3羟基间磷酸二酯 键形成的酶39. DNA聚合酶:催化dNTP聚合成DNA的酶,主要用于DNA的体外合成、探针标记等40. 基因重组:DNA分子间(目的基因和载体)发生共价连接形成重组DNA分子的过程。41. 转化:是指感受态的宿主细胞捕获(重组) DNA 分子的过程42.感受态细胞(competent cells)

9、:处于能摄取外界DNA分子的生理状态的细胞1. 绝大多数原核生物的DNA都是共价封闭的环状双螺旋。2. 根据重复程度,可以将DNA重复序列分为三种类型:单一或轻度重复序列、中等重复 序列、高度重复序列。3. 组成染色体的化学成分:DNA、蛋白质,RNA。4. 蛋白质含量约为DNA的二倍,RNA含量很少,还不到DNA量的10%。5. 组成染色体的蛋白质分为组蛋白和非组蛋白。6. 染色体外DNA:线粒体DNA、叶绿体DNA、质粒DNA7. CTAB (溴化十六烷三甲基铵),可与多糖、变性蛋白质等结合,提取核酸时除去多糖、 脂类等杂质8. pUC18,拷贝数可达500-700个;携带抗氨芐青霉素基因

10、,转化细菌后含pUC18能生长; 还携带细菌lacl和lacZ基因编码,使菌落呈现蓝色;如果在lacz 中间插入外源DNA,破 坏半乳糖苷酶活性,生长的菌落就呈白色,作为选择重组子的标记。9. 聚丙烯酰胺凝胶电泳分辨率高于琼脂糖凝胶电泳10. 载体按功能分为克隆载体、表达载体、穿梭载体;按来源分为质粒载体、噬菌体载体、 柯斯质粒载体、真核细胞克隆载体;按受体细胞分为原核生物载体、真核生物载体、植 物基因工程载体、动物基因工程载体11. 具有三种不同的构型:SC型(共价闭合环形DNA)、OC型(开环DNA)、L型(线性DNA)12B -半乳糖酶可分解无色的化合物X-gal产生不溶性的蓝色分解物,

11、MCS在无外源基因插 入时不影响lacZ 基因表达;插入了外源基因的MCS影响lacZ基因表达,无0 -半乳糖 酶产生。因此在含X-gal的琼脂平板上,含非重组质粒的菌菌落是蓝色的、重组菌菌落 是白色的13. II型限制性内切酶的应用价值最大。II型酶只具限制活性,无甲基化修饰活性;对DNA 的切割要求严格的序列作为靶位点,切割精确;此类酶作用时只需要Mg2+参与,无需 ATP14. DNA连接酶主要类型有T4噬菌体DNA连接酶、大肠杆菌DNA连接酶、T4噬菌体RNA 连接酶基因工程(Geneengineering)遗传工程(Genetic engineering)转基因技术(Transgen

12、etechnology)基因操作技术(Gene opertation/Gene manipulation)分子克隆(M olecularcloning)基因克隆(Genecloning)基因重组(Gene recombination)突变子(muton)重组子(recon)断裂基因(split gene)内含子(intron)夕卜显子(extron/exon)核小体(nucleosome)重叠基因(overlapping gene)转座子(Transposon)内切酶(N uclease)同源重组(homologous recombination)位点特异性重组(site-specific r

13、ecombination)PCR(Polymerase Chain Reaction)Taq-DNA 聚合酶(Thermus aquaticus) 多克隆位点 (Multiple cloning sites,简称 MCS)分离纯化核酸的原则和要求: 应保证核酸一级结构的完整性; 排除其它分子的污染。 核酸制备时的注意事项: 尽量简化操作步骤,缩短提取过程。 尽量减少化学(化学试剂等)、物理(机械剪切力、高温等)和生物(核酸酶等)因素对 核酸的影响。如果提取的是DNA,则需要抑制DNase活力,同时还要防止机械张力拉断。金属离子螯合剂(如EDTA或柠檬酸钠)、去垢剂(如SDS)、蛋白变性剂(如苯

14、酚、氯仿) 都也可使 DNase 失活核酸制备中常用酶DNase:降解 DNARNase:降解 RNA蛋白酶K:去除蛋白质溶菌酶:溶解纟细胞壁(尤其是革兰氏阳性菌)核酸的保存保存温度:-70C长期保存的良好温度-20C也可较长时间保存4C 短期保存保存介质:TE 缓冲溶液最常用,首选;水-短期保存可用质粒DNA提取溶液I组成:葡萄糖、EDTA、溶菌酶葡萄糖:增加溶液黏度,防止菌体沉淀和DNA机械损伤EDTA:抑制DNAase,有利于溶菌酶作用溶菌酶:水解细胞壁(尤其是G+菌)溶液II组成:NaOH、SDSNaOH:溶解细胞、核酸在pH12或V3时会因H键解离而变性,0.2mol/LNaOH会使

15、溶液 pH 至 12.6SDS :溶解膜蛋白破坏细胞膜、使蛋白质变性沉淀溶液III组成:KAc (pH 4.8)使溶液pH回至中性,质粒DNA复性高浓度K盐的存在,置换了 SDS上的Na盐而形成PDS,有利于大分子染色体DNA、RNA以 及蛋白质凝聚而沉淀。溶液丨要加RNAase (如果提取的是RNA,则应该加DNAase),葡萄糖让DNA重悬(可加溶 菌酶,蛋白EK,破壁)溶液II:碱变性,让细胞裂解,让蛋白质,基因组DNA变性溶液III:酸复性,醋酸钾,蛋白质,基因组DNA复性不了,只有质粒DNA复性可能问题及解决办法1、DNA样品不纯混有多糖、蛋白等重新纯化 DNA有金属离子残留增加 70乙醇洗涤的次数(2-3 次)DNA溶解前有乙醇残留一一重新沉淀DNA,让乙醇充分挥发2、DNA降解材料不新鲜或反复冻融新鲜避免反复冻融 未很好抑制内源核酸酶的活性可增加裂解液中螯合剂的含量 操作过于剧烈,DNA被机械打断一一细胞裂解后的操作应尽量轻柔 外源核酸酶污染所有试剂用无菌水配制,耗材经高温灭菌 反复冻融将DNA分装保存于缓冲液中3、DNA提取量少实验材料不佳或量少尽量选材新鲜 破壁或裂解不充分延长处理时间和

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