植物基因组DNA提取

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1、植物基因组DNA提取一、实验目的1、掌握植物基因组总DNA的抽提方法和基本原理。2、学习根据不同的植物和实验要求设计和改良植物总DNA抽提方法。二、实验原理通常采用机械研磨的方法破碎植物的组织和细胞,由于植物细胞匀浆含有多种酶类(尤 其是氧化酶类)对DNA的抽提产生不利的影响,在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂 (如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性。在液氮中研磨,材料易于破碎,并减少研磨过程中各 种酶类的作用。十六烷基三甲基溴化铵(hexadyltrimethyl ammomum bromide,简称为CTAB)、十二烷基 硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,简称SDS)等

2、离子型表面活性剂,能溶解细胞膜和核膜蛋白, 使核蛋白解聚,从而使DNA得以游离出来。加入苯酚和氯仿等有机溶剂,能使蛋白质变性, 并使抽提液分相,因核酸(DNA、RNA)水溶性很强,经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片 和大部分蛋白质。上清液中加入无水乙醇使DNA沉淀,沉淀DNA溶于TE溶液中,即得植 物总DNA溶液。三、实验仪器及试剂实验仪器:高速离心机;烘箱;冰箱;水浴锅;高压灭菌锅;Nanodrop。实验试剂:玻璃珠,十二烷基磺酸钠(SDS);三羟甲基氨基甲烷(Tris);乙二胺四乙酸 (EDTA);氯化钠;苯酚;氯仿;无水乙醇等。四、实验步骤1.SDS提取缓冲液在65 C水浴中预热。2将叶

3、片置于1.5ml离心管中,液氮速冻,组织研磨器打样。3. 加入700 l的SDS提取缓冲液,涡旋摇匀。4. 置于65C的水浴中,每隔10 min轻轻摇动,30 min后取出。5.加入200卩1 KAc溶液,摇匀,放入-20C冰箱30 min。6.10000 rpm离心5 min, 上清移至新离心管中,12000 rpm离心5 min。7.上清移至新离心管中,加入700卩1异丙醇,-20C冰箱30 min。8.10000 rpm离心5 min,弃上清,加入500卩1 70%乙醇漂洗。9. 弃液体,晾干。10. DNA纯度与浓度测定(使用nanodrop)。(1)DNA 纯度:DNA 的 0D26

4、0/0D280 般为 1.8 左右。0D260/0D280 - 1.8:说明较纯;OD260/OD280 1.8:说明可能有RNA污染;OD260/OD280 1.8:说明可能有蛋白质污染。五、注意事项1. 叶片磨得越细越好。2. 注意移液器的正确使用。3. 由于植物细胞中含有大量的DNA酶,因此,除在抽提液中加入EDTA抑制酶的活性 外,第一步的操作应迅速,以免组织解冻,导致细胞裂解,释放出DNA酶,使DNA降解。六、结果与分析1. 植物DNA提取所用试剂的作用?2. 植物DNA提取的关键步骤有哪些?3. 植物DNA提取后的用途有哪些?4从化学结构、化学性质、存在场所以及功能等方面比较DNA和RNA的异同。

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