MS疑难杂症(参考仅供)

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1、MS计算XRD后怎样用origin把几个XRD图合并在一起作者:jelly62(站内联系TA) 发布: 2012-03-22我想用MS计算几个模型的XRD图,计算后怎么样把这些数据导出来用origin作图呢?而且我想把这几个模型的图都合并在一个图中,用什么方法实现啊。 很多虫友给了我帮助,但是我的问题还是没有解决,下载了一个8.0的origin做出来的图和MS的图还是不一样,有部分不能显示出来。下面第三幅图是MS计算出来的,第一、二两幅图是origin做出来的,都是后半部分没有显示出来。origin6.1origin8.0MS举报删除此信息贺仪(站内联系TA)在ms里面直接复制,然后再orig

2、in里直接黏贴就行xhzha(站内联系TA)origin有合并图片的功能jelly62(站内联系TA)2楼: Originally posted by 贺仪 at 2012-03-22 20:41:01:在ms里面直接复制,然后再origin里直接黏贴就行可是粘贴后在origin中做出来的图和MS中的图不一样哦weiyongkai(站内联系TA)很简单,上面有合并图形的图标!贺仪(站内联系TA)4楼: Originally posted by jelly62 at 2012-03-22 20:45:44:可是粘贴后在origin中做出来的图和MS中的图不一样哦怎么不一样?jelly62(站内联

3、系TA)6楼: Originally posted by 贺仪 at 2012-03-22 20:46:43:怎么不一样?你看看这两幅图jelly62(站内联系TA)6楼: Originally posted by 贺仪 at 2012-03-22 20:46:43:怎么不一样?后半部分没有了lifeycc(站内联系TA)在origin 里面画好两个图,然后用edit-merge这个功能可以合并图chikn(站内联系TA)我也很想知道怎么搞,坐等答案,祝福楼主lleo(站内联系TA)plot 里面有选项的 选什么瀑布的那个就行了贺仪(站内联系TA)7楼: Originally posted b

4、y jelly62 at 2012-03-22 20:52:22:你看看这两幅图7d/c6/1087580_1332420713_403.jpg84/a7/1087580_1332420720_874.jpg你是不是没有全选上呀?jelly62(站内联系TA)12楼: Originally posted by 贺仪 at 2012-03-22 21:56:26:你是不是没有全选上呀?我确认全选上了,还是这样。不知道为什么。贺仪(站内联系TA)13楼: Originally posted by jelly62 at 2012-03-23 09:51:46:我确认全选上了,还是这样。不知道为什么。

5、这个可以不选直接复制,你试试看jelly62(站内联系TA)14楼: Originally posted by 贺仪 at 2012-03-23 14:28:45:这个可以不选直接复制,你试试看是了,还是一样哦贺仪(站内联系TA)15楼: Originally posted by jelly62 at 2012-03-23 15:22:29:是了,还是一样哦那你用origin是不是启用了speed mode?关闭试试吧唯美的心(站内联系TA)我也想看看【求助】MS遇到的问题作者:咖啡喝不醉(站内联系TA) 发布: 2010-12-041.discover能量最小化不收敛是什么原因?这样出来的结

6、果可靠吗?2.数据不稳定,是不是体系未趋于平衡呢?怎么解决这个问题呢?举报删除此信息qphll(站内联系TA)如果是有文献可以参照, 那么尽量先采用文献值; 如果是新的体系, 那么很多参数都是需要测试的.你的两个问题其实反映的是同一个本质: 体系还未平衡.建议:(1) 首先做minimization, 使得体系的overlap消除, 这样MD开始的那个初始构型比较合理;(2) 跑足一定的步数, 看能量是否收敛. 这里的收敛并不是要求能量就不变化了, 而是说能量在一个比较小的范围内周期震荡.看你体系大小, 但是一般来讲如果12ns以后, 体系能量还是有很大的震荡, 那么需要考虑你的参数的使用是不

7、是合理.其实我也是空对空, 以后提问记得上图.一图胜千言.咖啡喝不醉(站内联系TA)Originally posted by qphll at 2010-12-05 02:47:49:如果是有文献可以参照, 那么尽量先采用文献值; 如果是新的体系, 那么很多参数都是需要测试的.你的两个问题其实反映的是同一个本质: 体系还未平衡.建议:(1) 首先做minimization, 使得体系的overlap消除 .此为其中的一个片段,谢谢帮忙再分析一下!043114076(站内联系TA)把结果再优化一下试试咖啡喝不醉(站内联系TA)在做聚乙烯的能量最小化时,聚乙烯的结构是用build直接建成的。可是无

8、论能量最小化多少次,都显示不收敛。这是为什么呢?咖啡喝不醉(站内联系TA)Originally posted by 咖啡喝不醉 at 2010-12-08 15:30:43:此为其中的一个,我不知道是怎么回事,是否已经收敛。谢谢帮忙再分析一下!043114076(站内联系TA)虽然没有达到收敛标准,但可以认为结果有效。不知道你是用来产生MD的初始构象还是仅仅想最小化,如果是前者已经完全达到标准了咖啡喝不醉(站内联系TA)问题已解决,谢谢各位的帮忙!如何将纳米粒子与聚合物组装起来作者:农岚沐(站内联系TA) 发布: 2012-11-29我想做添加纳米粒子的聚合物材料,目前设想的单胞很简单,就是在

9、聚合物的中央添加一个半径为30埃的二氧化硅粒子,聚合物中央也已经相应挖空了。请问如何将他们组装起来?或者说我的这个思路就不对?望高人指点!粒子填充.jpg举报删除此信息jiaoyixiong(站内联系TA)把两个都保存成PDB格式的文件直接把其中的一个pdb里的内容复制粘贴到另一个pdb文件的后面,用VMD 打开,使用moveby 命令,可以调节二者的相对位置。当二者的位置调节好之后,再使用writepdb 命令,输出正确格式的PDB 文件。农岚沐(站内联系TA)2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-11-29 23:09:33把两个都保存成

10、PDB格式的文件直接把其中的一个pdb里的内容复制粘贴到另一个pdb文件的后面,用VMD 打开,使用moveby 命令,可以调节二者的相对位置。当二者的位置调节好之后,再使用writepdb 命令,输出正确 .得安装VMD吧?那太不方便了啊。农岚沐(站内联系TA)我发现用AC来建模的时候,CPU总是只有一个核在转。我的笔记本是双核的,WIN7 32位,连着网,最多占用50%。另外有一台WIN7 64位的,I7处理器,8核,最多占用13%,就是八分之一。但是如果我在笔记本上运行Forcite的话,就可以在Job Control 里设置双核一起跑,而且接近百分百。请问各位高人,怎么让AC模块也能百

11、分百跑起来?农岚沐(站内联系TA)我试过直接将1个纳米粒子与80条聚合物单链进行封装,但是都是运行了一段时间之后出现failure,只能得到一个密度严重偏低的大盒子,边长大了接近四倍。也找不出问题到底出在哪里。望指点迷津!jolly1987(站内联系TA)4楼: Originally posted by 农岚沐 at 2012-11-30 08:45:33我发现用AC来建模的时候,CPU总是只有一个核在转。我的笔记本是双核的,WIN7 32位,连着网,最多占用50%。另外有一台WIN7 64位的,I7处理器,8核,最多占用13%,就是八分之一。但是如果我在笔记本上运行Forcite的话 .你的

12、MS版本是多少?AC好像是基于Discover的动力学模块,你试着在Discover/setup里调整Job Control试试jolly1987(站内联系TA)直接将二氧化硅粒子复制,粘贴到右边聚合物晶格里,调整二氧化硅的位置到你挖的空里应该就可以了,然后运行一下结构优化jolly1987(站内联系TA)5楼: Originally posted by 农岚沐 at 2012-11-30 10:10:19我试过直接将1个纳米粒子与80条聚合物单链进行封装,但是都是运行了一段时间之后出现failure,只能得到一个密度严重偏低的大盒子,边长大了接近四倍。也找不出问题到底出在哪里。望指点迷津!有

13、运行前后的图吗?用的什么系宗?农岚沐(站内联系TA)8楼: Originally posted by jolly1987 at 2012-11-30 10:46:26有运行前后的图吗?用的什么系宗?.AC里面好像还没涉及到系综的选择吧?请细细指教。当前的大盒子,边长472,如果封装完成的话,应该只有90.48,粒子.jpg农岚沐(站内联系TA)7楼: Originally posted by jolly1987 at 2012-11-30 10:45:02直接将二氧化硅粒子复制,粘贴到右边聚合物晶格里,调整二氧化硅的位置到你挖的空里应该就可以了,然后运行一下结构优化我试了,可以放进去。只是还有

14、个很严肃的问题:我怎么保证我的粒子跟挖出的空心重合在一起?如果只靠鼠标拖动的话,就算真的做到了,也不能让人信服啊。coco207(站内联系TA)5楼: Originally posted by 农岚沐 at 2012-11-30 10:10:19我试过直接将1个纳米粒子与80条聚合物单链进行封装,但是都是运行了一段时间之后出现failure,只能得到一个密度严重偏低的大盒子,边长大了接近四倍。也找不出问题到底出在哪里。望指点迷津!你好,我想问一下,我建立聚合物和填料的时候, Add 添加为什么只能添加上聚合物,但是纳米填料选不出来呢coco207(站内联系TA)5楼: Originally p

15、osted by 农岚沐 at 2012-11-30 10:10:19我试过直接将1个纳米粒子与80条聚合物单链进行封装,但是都是运行了一段时间之后出现failure,只能得到一个密度严重偏低的大盒子,边长大了接近四倍。也找不出问题到底出在哪里。望指点迷津!建立聚合物和填料的时候, Add 添加为什么只能添加上聚合物,但是填料选不出来呢 求指点农岚沐(站内联系TA)12楼: Originally posted by coco207 at 2012-11-30 16:08:21建立聚合物和填料的时候, Add 添加为什么只能添加上聚合物,但是填料选不出来呢 求指点.我只知道如果是周期性结构的话,在AC是不能添加进去的。你看看它弹出的提示,也许可以判断出原因。coco207(站内联系TA)13楼: Originally posted by 农岚沐 at 2012-11-30 16:30:29我

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