“烟草cDNA文库构建及重要基因表达谱”项目评标情况

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1、附件9“烟草cDNA文库构建及重要基因表达谱研究”项目评标情况一、招标要求1项目意义建立烟草cDNA文库,获得大量的EST和全长cDNA序列是开展烟草功能基因研究的重要前提,是实施烟草基因组计划重大专项的基础性工作,将为烟草分子育种奠定基础。今年针对“烟草cDNA文库构建及重要基因表达谱研究”项目进行招标攻关,一是先期开展相关技术研究,为全面启动烟草基因组计划重大专项积累必要的技术、人才基础,二是通过项目招标,引导行业内外科研院所加大烟草遗传育种基础研究力度,推动烟草育种工程的顺利实施。目前美国、欧盟等先后开展了不同烟草品种的EST测序,并已获得了一定数量的烟草EST数据,但我国在烟草重要功能

2、基因表达调控、代谢网络等分子水平的基础还相当薄弱。因此,充分利用我国的种质资源,建立不同种质在逆境诱导、不同发育时期以及不同组织器官的cDNA文库,分离克隆与烟草生长、发育、抗逆、抗病、品质等有关基因的全长序列、调控因子以及特异启动子,研究其表达模式,进行基因表达产物分析、转基因功能验证及生理遗传学分析,对于确定基因功能,进而分析这些基因在烟草遗传改良中的利用价值和途径具有重要意义。2研究内容(1)烟草cDNA文库的构建及测序。构建普通烟草不同组织、不同时期的全长cDNA文库;构建逆境诱导的特异组织的全长cDNA文库;构建特定烟草品种(品系)特定组织的全长cDNA文库;挑选克隆并进行测序。(2

3、)基因挖掘与生物信息学分析。对测序数据进行拼接,对非重复全长cDNA序列进行功能注释和功能分类及代谢网络分析;建立烟草不同时期的基因表达谱以及全长cDNA序列的检索和比对数据库。(3)重要功能基因研究。利用生物信息学分析得到的相关基因的表达谱信息,鉴定重要的功能基因并开展关键基因的详细表达谱研究和功能分析。3经济技术指标(1)完成覆盖烟草重要发育时期根、茎、叶、花等不同组织器官和特殊烟草种质特异组织的全长cDNA文库30个左右。通过全长文库构建、全长克隆完全测序和数据拼接等,分离鉴定烟草的全长cDNA序列2万条左右。(2)建立烟草基因表达、检索及分析的基础数据库。(3)分离与烟草香气、烟碱和有

4、害物质代谢作用网络以及氮磷钾营养高效、抗病、抗旱、耐盐碱等性状相关的基因及调控因子300个以上,其中鉴定关键基因5个以上,同时进一步分析表达谱并验证其功能,获得5个以上重要基因功能验证的烟草材料。本项目的创新点在于,一是建立一批覆盖烟草重要发育时期、不同组织器官和特殊烟草种质的全长cDNA文库,建成国际上规模最大、种类最多的烟草cDNA文库,并测序获得基因全长序列;二是分析基因表达特征谱,探索在特定材料、特定时期、特定组织活跃表达且起重要作用的基因,以确定重点研究分析并具有应用前景的烟草功能基因,将使我国在烟草功能基因组研究领域在国际上占有一席之地。本项目的关键技术在于,一是通过全长cDNA文

5、库的构建及均一化,获得高质量的全长cDNA;二是通过烟草表达基因数据库的开发,建成比较完善的烟草基因相关信息的检索平台;三是分离与烟草品质、营养性状相关的基因,并进行功能验证。二、应标情况论本招棋标项柏目及罪内容历在行边业内砍外产掩生了怪巨大偶反响因,行掉业内定外科党研院策所对管标书君响应神非常配踊跃赶,通绒过烟窃草险全长造cD乐NA镇文库揉的构伴建、刚基因厚表达料数据努库的泼建立滑和重呢要性沃状功拦能基蕉因的娃鉴定闭,有妈助于将从分肃子水考平解蝇析烟宅草生插长发勤育、员品质袍形成叨、抗瓣逆、为抗病滨及物稳质代院谢的甘机制棵,为羡烟草框品种诉遗传扇改良收鉴定游坚实窝的理丙论基睡础。江因此栋共有

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