目的蛋白表达与纯化protocol.doc

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1、目的蛋白表达与纯化protocol小量表达测试:1、 挑一单克隆到3ml LB(含抗生素)中,370C,220rpm振荡培养10h12h。2、 保种:700l菌液+400l 80%灭菌甘油,充分混匀后置于-800C保存。3、 扩大培养:以1:100接菌,即取50l菌液到5ml LB(含抗生素)中,370C,220rpm振荡培养2h3h至OD值达到0.6。4、 对照取样:取1ml菌液,12000rpm离心1min,弃尽上清,-200C保存。对照5、 另取1ml菌液于一新的试管中,加1/1000 IPTG(终浓度为1mM),370C,220rpm振荡培养3h后收菌:12000rpm离心1min,弃

2、尽上清,-200C保存。370C样品6、 其余约3ml菌液于160C,220rpm继续振荡培养1h后,加0.5/1000 IPTG(终浓度为0.5mM),160C,220rpm振荡培养1224h(通常18h)后收菌:12000rpm离心1min,弃尽上清,-200C保存。160C样品7、 Bugbuster分别处理上述三个样品,取20l总蛋白,其余离心后分离上清和沉淀,进行SDS-PAGE电泳鉴定,上样顺序为:对照 370C样品 160C样品 总蛋白 上清 沉淀 总蛋白 上清 沉淀 总蛋白 上清 沉淀若目的蛋白在上清中有表达,则可以进行大量表达与纯化,具体操作如下。大量表达:1、 挑一单克隆到

3、7.5ml LB(含抗生素)中,370C,220rpm振荡培养10h12h。注意:此步用50ml离心管摇菌!2、 扩大培养:以1:100接菌,即取将上述7.5ml菌液全部接到750ml TB(含抗生素)中,370C,220rpm振荡培养4h5h至OD值达到1.0。3、 对照取样:取1ml菌液,12000rpm离心1min,弃尽上清,-200C保存。(对照)4、 其余约菌液于160C,220rpm继续振荡培养1h后,加0.5/1000 IPTG(终浓度为0.5mM),160C,220rpm振荡培养1224h(通常18h)后收菌:6000rpm、40C离心10min,弃尽上清,取一点沉淀做表达鉴定

4、(160C样品),其余-200C保存。5、 Bugbuster分别处理上述两个样品,进行SDS-PAGE电泳鉴定。(同小量表达中的7)菌体破碎(高压破菌法):1、 若目的蛋白在上清中有表达,则可取剩余菌体N g (根据目的蛋白的表达量而定),用4-6N ml的lysis buffer将菌体重悬,加入0.1mM的PMSF,置于50/100ml小烧杯中,并将烧杯置于冰上。2、 用超声破碎仪进行破碎,功率一般为100W200W,超声时间为3s,间隙时间为5s,工作次数一般为994次。3、 将破碎后的菌液移入50ml BECKMAN高速离心管中,18000rpm、40C离心30-40min,将上清移入

5、一个新的50ml离心管中。Ni柱亲和层析:Lysis buffer: 50mM Tris, 300mM NaCl, pH 8.0(可加入5-10%的甘油和1mMdTT,20mM咪唑)Wash buffer: 50mM Tris, 300mM NaCl, 20mM 咪唑, pH 8.0Elution buffer: 50mM Tris, 300mM NaCl, 500mM 咪唑, pH 8.01、 取适量的beads灌入玻璃柱中,用大量的ddH2O冲洗beads,一般为10CV5(CV代表柱体积,下同)。2、 用lysis buffer进行平衡:10CV5。3、 将平衡好的beads移入菌体破碎

6、最后得到的上清中,Mix 12h。4、 500g,40C离心2min,收集上清flow-through。5、 加入50ml wash buffer,500g,40C离心2min,收集上清wash 1。6、 加入50ml wash buffer,500g,40C离心2min,收集上清wash 2。7、 加入50ml wash buffer,500g,40C离心2min,收集上清wash 3。8、 将beads灌入玻璃柱中,继续用wash buffer洗10CV3。9、 用Elution buffer洗脱:0.5CV10,用EP管分别收集eluates。10、 SDS-PAGE电泳鉴定。Resin

7、 regeneration:1、 用0.1M EDTA洗2CV(清洗至beads为无色)。2、 ddH2O洗5CV。3、 0.1M NaOH洗2CV。4、 ddH2O洗5CV。5、 加2CV的NiCl2。6、 ddH2O洗5CV。7、 用20%乙醇洗2次beads,置于480C保存。GST柱亲和层析:Lysis buffer: 1PBS (140mM NaCl, 2.7mM KCl, 10mM Na2HPO4, 1.8mM KH2PO4, pH 7.3)Wash buffer: 1PBS Elution buffer: 50mM Tris, 10mM reduced glutathione,

8、pH 8.01、 取1ml的beads灌入玻璃柱中,用大量的ddH2O冲洗beads。2、 用lysis buffer进行平衡:10CV5。3、 将平衡好的beads移入菌体破碎最后得到的上清中,Mix 12h。4、 500g,40C离心2min,收集上清flow-through。5、 加入50ml wash buffer,500g,40C离心2min,收集上清wash 1。6、 加入50ml wash buffer,500g,40C离心2min,收集上清wash 2。7、 加入50ml wash buffer,500g,40C离心2min,收集上清wash 3。8、 将beads灌入玻璃柱中

9、,继续用wash buffer洗10CV3。9、 用Elution buffer洗脱:0.5CV10,用EP管分别收集eluates。10、 SDS-PAGE电泳鉴定。Resin regeneration:1、 用6M guanidine hydrochloride洗2个柱体积。2、 立即用1PBS洗5个柱体积。3、 用70%乙醇洗34个柱体积。4、 立即用1PBS洗5个柱体积。5、 用20%乙醇洗2次beads,置于480C保存。StrepTactin柱亲和层析:Wash buffer: 100mM Tris, 150mM NaCl, 1mM EDTA, pH 8.0Elution buff

10、er:100mM Tris, 150mM NaCl, 1mM EDTA, 2.5mM desthiobiotin, pH 8.01、 取适量的beads灌入玻璃柱中。2、 用wash buffer进行平衡:10CV5。3、 将破碎后的上清灌入装有beads的玻璃柱中,控制流速为1滴/2s,收集flow-through,再重复上样一次。4、 用wash buffer冲洗:1CV5,收集washes。5、 用Elution buffer洗脱:0.5CV6,用EP管分别收集eluates。6、 SDS-PAGE电泳鉴定。Resin regeneration:Regeneration buffer:

11、100mM Tris, 150mM NaCl, 1mM EDTA, 1mM HABA, pH 8.01、 用regeneration buffer冲洗柱子,5CV3,直到柱子变为红色且颜色均一。2、 加2CV wash buffer或regeneration buffer,置于480C保存柱子。凝胶过滤层析(Superdex 75/200):Binding buffer: 20mM HEPES, 100mM NaCl, pH 7.01、 ddH2O冲洗2CV: flow rate: 1ml/min, Alarm_pressure: 0.3MPa(下同)。2、 binding buffer平衡2CV。3、 样品离心:12000rpm, 40C离心30min。4、 冲洗loop: ddH2O洗5个体积,binding buffer洗5个体积。5、 上样(injection):用注射器上样,一定要排尽注射器里的气泡。6、 Binding buffer继续洗脱约40min后,开始注意观察紫外吸收峰的出现,一旦出峰立即开始收集。7、 样品收集完毕后,继续用binding buffer冲洗直到紫外吸收基线水平。8、 ddH2O冲洗2CV。9、 20%乙醇冲洗2CV后暂停,关闭仪器。

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