蛋白质的分子量测定

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1、蛋白质的分子量测定-SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法目的要求学会SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法原理。掌握用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定蛋白质分子量的操作技术。实验原理:SDS是十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate )的简称,它是一种阴离子表面活性剂,加入到电泳 系统中能使蛋白质的氢键、疏水键打开,并结合到蛋白质分子上(在一定条件下,大多数蛋白质与 SDS 的结合比为1.4g SDS/1g蛋白质),使各种蛋白质-SDS复合物都带上相同密度的负电荷,其数量远远 超过了蛋白质分子原有的电荷量,从而掩盖了不同种类蛋白质原有的电荷差别。这样就使电泳迁移率只取 决于分子大小这一因素,

2、于是根据标准蛋白质分子量的对数和迁移率所作的标准曲线,可求得未知物的分 子量。试剂和器材一、试剂30%分离胶贮存液:30g Acr,0.8g Bis,用无离子水溶解后定容至100mL,不溶物过滤去除后置棕色瓶贮 于冰箱。10%浓缩胶贮存液:10g Acr,0.5g Bis,用无离子水溶解后定容至100mL,不溶物过滤去除后置棕色瓶贮 于冰箱。分离胶缓冲液(Tris-HCI缓冲液PH8.9):取1mol/L盐酸48mL,Tris 36.3g,用无离子水溶解后定容 至 100mL。浓缩胶缓冲液(Tris-HCl缓冲液PH6.7):取1mol/L盐酸48mL, Tris 5.98g,用无离子水溶解后

3、定容至100mL。 电泳缓冲液(Tris-甘氨酸缓冲液PH8.3):称取Tris 6.0g,甘氨酸28.8g, SDS 1.0g,用无离子水溶解 后定容至 1L 。样品溶解液:取SDS 100mg,巯基乙醇O.ImL,甘油1mL,溴酚蓝2mg, 0.2mol/L, pH7.2磷酸缓 冲液0.5mL,加重蒸水至10mL (遇液体样品浓度增加一倍配制)。用来溶解标准蛋白质及待测固体染色液:0.25g考马斯亮蓝R-250,加入454mL 50%甲醇溶液和46mL冰乙酸即可。脱色液:75mL冰乙酸,875mL水与50mL甲醇混匀。10%过硫酸铵溶液;10%SDS溶液;1%TEMED。二、材料标准蛋白:

4、溶菌酶(Mr 14 300)、胰凝乳蛋白酶原(Mr 25 000)、胃蛋白酶(Mr 35 000)、卵清蛋白 (Mr 43 000)、血清白蛋白(Mr 67 000)等。按每种蛋白0.5-1mg/mL配制。可配成单一蛋白质标 准液,也可配成混合蛋白质标准液。二、器材DYCZ-24D 型垂直板电泳槽;移液管 1 mL (7 3), 5 mL ( 4), 0.5mL ( 1), 0.1mL ( 2);烧杯100mL ( 2);细长头的吸管;微量注射器。操作方法一、安装垂直板电泳槽1. 将密封用硅胶框放在平玻璃上,然后将凹型玻璃与平玻璃重叠;2用手将两块玻璃板夹住放入电泳槽内,玻璃室凹面朝外,插入斜

5、插板; 3用蒸馏水试验封口处是否漏水。二、制备凝胶板1 分离胶制备:取分离胶贮存液5.0mL, Tris-HCl缓冲液(PH8.9)2.5mL,10%SDS 0.20mL,去离子水10.20mL, 1 %TEMED2.00mL置于小烧杯中混匀,再加入10% 0.1mL过硫酸胺,用磁力搅拌器充 分混匀2min。混合后的凝胶溶液,用细长头的吸管加至长、短玻璃板间的窄缝内,加胶高度距样品模板 梳齿下缘约1cm。用吸管在凝胶表面沿短玻璃板边缘轻轻加一层重蒸馏水(约34cm),用于隔绝空 气,使胶面平整。分离胶凝固后,可看到水与凝固的胶面有折射率不同的界限。倒掉重蒸水,用滤纸吸去 多余的水。浓缩胶制备:

6、取浓缩胶贮存液3.0mL, Tris-HCI缓冲液(PH6.7) 1.25mL, 1%TEMED2.00mL, 4.60mL去离子水,10% 过硫酸胺0.05mL,用磁力搅拌器充分混匀。混合均匀后用 细长头的吸管将凝胶溶液加到长短玻璃板的窄缝内(及分离胶上方),距短玻璃板上缘0.5cm处,轻轻加 入样品槽模板。待浓缩胶凝固后,轻轻取出样品模槽板,用手夹住两块玻璃板,上提斜插板,使其松开, 然后取下玻璃胶室去掉密封用胶框,用 1%电泳缓冲液琼脂胶密封底部,再将玻璃胶室凹面朝里置入电泳 槽。插入斜插板,将电泳缓冲液加至内槽玻璃凹口以上,外槽缓冲液加到距平玻璃上沿 3mm 处。三、样品处理各标准蛋白

7、及待测蛋白都用样品溶解液溶解,使浓度为0.5mg/mL,沸水浴加热3分钟,冷却至室温备用。 处理好的样品液如经长期存放,使用前应在沸水浴中加热1分钟,以消除亚稳态聚合。四、加样一般加样体积为10 15pL (即2 10pg蛋白质)。如样品较稀,可增加加样体积。用微量注射器小心 将样品通过缓冲液加到凝胶凹形样品槽底部,待所有凹形样品槽内都加了样品,即可开始电泳。五、电泳将直流稳压电泳仪开关打开,开始时将电流调至10mA。待样品进入分离较时,将电流调至20 30 mA。 当蓝色染料迁移至底部时,将电流调回到零,关闭电源。拔掉固定板,取出玻璃板,用刀片轻轻将一块玻 璃撬开移去,在胶板一端切除一角作为

8、标记,将胶板移至大培养皿中染色。六、染色及脱色将染色液倒入培养皿中,染色1h左右,用蒸馏水漂洗数次,再用脱色液脱色,直到蛋白区带清晰,即可 计算相对迁移率, 见图4.1。图4.1标准蛋白在SDS-凝胶上的示意图七、结果处理测量由点样孔至溴酚蓝及蛋白质带的距离(mm),计算相对迁移率(Rf)Rf =样品移动距离(mm)/溴酚蓝移动距离(mm)以标准蛋白分子量的对数作纵坐标,相对迁移率作横坐标制作标准曲线。根据样品蛋白质的相对迁移率从 标准曲线上查出其分子量。注意事项(1)用SDS-凝胶电泳法测定分子量时,每次测量样品必须同时作标准曲线,而不得利用另一次电泳的标 准曲线。(2)因SDS可吸附考马斯

9、亮蓝染料,染色前先用脱色液浸泡凝胶,洗去SDS。可使染色及脱色时间缩 短,并使蛋白带染色而背景不染色。若样品为水溶液,则需将样品溶解液的浓度提高一倍,然后与等体积样品溶液混合。思考题1用SDS-凝胶电泳法测定蛋白质分子量时为什么要用巯基乙醇?2是否所有的蛋白质都能用SDS-凝胶电泳法测定其分子量?为什么蛋白质含量测定法/蛋白质沉淀法/Western免疫印迹1 蛋白质含量测定法2 WESTERN PROTOCOL3 Western 免疫印迹(Western Blot)4 蛋白质沉淀法5 蛋白质提取的方法总汇1蛋白质含量测定法本实验的目的是学会各种蛋白质含量的测定方法。了解各种测定方法的基本原理和

10、优缺点。 蛋白质含量测定法,是生物化学研究中最常用、最基本的分析方法之一。目前常用的有四种古老的经典方 法,即定氮法,双缩尿法(Biuret法)、Folin酚试剂法(Lowry法)和紫外吸收法。另外还有一种近 十年才普遍使用起来的新的测定法,即考马斯亮蓝法(Bradford法)。其中Bradford法和Lowry法灵 敏度最高,比紫外吸收法灵敏1020倍,比Biuret法灵敏100倍以上。定氮法虽然比较复杂,但较准 确,往往以定氮法测定的蛋白质作为其他方法的标准蛋白质。值得注意的是,这后四种方法并不能在任何条件下适用于任何形式的蛋白质,因为一种蛋白质溶液用这四 种方法测定,有可能得出四种不同的

11、结果。每种测定法都不是完美无缺的,都有其优缺点。在选择方法时 应考虑:实验对测定所要求的灵敏度和精确度;蛋白质的性质;溶液中存在的干扰物质;测定所 要花费的时间。考马斯亮蓝法(Bradford法),由于其突出的优点,正得到越来越广泛的应用。 一、微量凯氏(Kjeldahl)定氮法样品与浓硫酸共热。含氮有机物即分解产生氨(消化),氨又与硫酸作用,变成硫酸氨。经强碱碱化使之 分解放出氨,借蒸汽将氨蒸至酸液中,根据此酸液被中和的程度可计算得样品之氮含量。若以甘氨酸为例 其反应式如下:CH2COOH| + 3H2SO4 2CO2 + 3SO2 +4H2O +NH3 (1)NH22NH3 + H2SO4

12、 (NH4)2SO4 (2)(NH4)2SO4 + 2NaOH 2H2O +Na2SO4 + 2NH3 (3)反应(1)、 (2)在凯氏瓶内完成,反应(3)在凯氏蒸馏装置中进行。为了加速消化,可以加入CuS04作催化剂,K2SO4以提高溶液的沸点。收集氨可用硼酸溶液,滴定则用 强酸。实验和计算方法这里从略。计算所得结果为样品总氮量,如欲求得 样品中蛋白含量,应将总氮量减去非蛋白氮即得。如欲进一步求得样品中蛋白质的含量,即用样品中蛋白氮乘以 625 即得。 五种蛋白质测定方法比较如下:方法 灵敏度 时间 原理 干扰物质 说明 凯氏定氮法(Kjedahl法)灵敏度低,适用于0.2 I.Omg氮,误

13、差为2%费时810小时将蛋白氮转化为氨,用酸吸收后滴定非蛋白氮(可用三氯乙酸沉淀蛋白质而分离)用于标准蛋白质含量的准确测定;干扰少;费时太长 双缩脲法(Biuret法)灵敏度低120mg 中速2030分钟多肽键+碱性Cu2 + 紫色络合物硫酸铵;Tris 缓冲液;某些氨基酸 用于快速测定,但不太灵敏;不同蛋白质显色相似 紫外吸收法 较为灵敏50100mg快速510分钟 蛋白质中的酪氨酸和色氨酸残基在280nm处的光吸收 各种嘌吟和嘧啶;各种核苷酸用于层析柱流出液的检测;核酸的吸收可以校正Folin 酚试剂法(Lowry法)灵敏度高 5mg 慢速40 60分钟双缩脲反应;磷钼酸一磷钨酸试剂被Ty

14、r和Phe还原硫酸铵;Tris 缓冲液;甘氨酸;各种硫醇 耗费时间长;操作要严格计时;颜色深浅随不同蛋白质变化考马斯亮蓝法(Bradford法)灵敏度最高1 5mg 快速515分钟 考马斯亮蓝染料与蛋白质结合时,其lmax由465nm变为595nm强碱性缓冲液;TritonX-100;SDS 最好的方法;干扰物质少;颜色稳定;颜色深浅随不同蛋白质变化二、双缩脲法(Biuret法)(一)实验原理双缩脲(NH3CONHCONH3 )是两 个分子脲经180C左右加热,放出一个分子氨后得到的产物。在强碱 性溶液中,双缩脲与CuSO4形成紫色络合物,称为双缩脲反应。凡具有两个酰胺基或两个直接连接的肽 键

15、,或能过一个中间碳原子相连的肽键,这类化合物都有双缩脲反应。H2OO=C C=OHN NHR-CH CH-RO=C Cu C=OHN NHR-CH CH-RH2O紫色络合物紫色络合物颜色的深浅与蛋白质浓度成正比,而与蛋白质分子量及氨基酸成分无关,故可用来测定蛋白质 含量。测定范围为110mg蛋白质。干扰这一测定的物质主要有:硫酸铵、Tris缓冲液和某些氨基酸等。 此法的优点是较快速 ,不同的蛋白质产生颜色的深浅相近,以及干扰物质少。主要的缺点是灵敏度差。因 此双缩脲法常用于需要快速,但并不需要十分精确的蛋白质测定。(二)试剂与器材1. 试剂:(1)标准蛋白质溶液:用标准的结晶牛血清清蛋白(BSA)或标准酪蛋白,配制成10mg/ml的标准蛋白溶液,可用BSA浓度1mg/ml的A280为0.66来校正其纯度。如有需要,标准蛋白质还可预先用微 量凯氏定氮法测定蛋白氮含量,计算出其纯度,再根据其纯度,称量配制成标准蛋白质溶液。牛血清清蛋白用H20或0.9%NaCI配制,酪蛋白用0. 05N NaOH配制。(2)双缩脲试剂:称以1.50克硫酸铜(CuSO45H2O)和6.0克酒石酸钾钠(KNaC4H4O64H2O),用500毫升水溶解,

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