扬州大学农学院生物化学期末复习试题资料.doc

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1、必需氨基酸(essential amino acids)指人(或其它脊椎动物)自己不能合成,需要从饮食中获得的氨基酸,例如赖氨酸、苏氨酸等氨基酸。非必需氨基酸(nonessential amino acids)指人(或其它脊椎动物)自己能由简单的前体合成的,不需要由饮食供给的氨基酸,例如甘氨酸、丙氨酸等氨基酸。 等电点(pI,isoelectric point)使分子处于兼性分子状态,在电场中不迁移(分子的净电荷为零)的pH值。肽键(peptide bond)一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的氨基缩合,除去一分子水形成的酰胺键。肽(peptides)两个或两个以上氨基酸通过肽键共价连接形成的聚合

2、物。 蛋白质一级结构(primary structure)指蛋白质中共价连接的氨基酸残基的排列顺序。同源蛋白质(homologous proteins)来自不同种类生物、而序列和功能类似的蛋白质。例如血红蛋白。组成蛋白质常见的20种氨基酸中,除半胱氨酸和胱氨酸外,含硫的氨基酸还有?除苏氨酸和酪氨酸外,含羟基的氨基酸还有? 什么氨基酸是一种亚氨基酸;什么氨基酸不含不对称碳原子。PRPP,5-磷酸核糖-1-焦磷酸脂肪酸-氧化的步骤有哪些?大肠杆菌DNA聚合酶I是多功能酶,它具有的酶活性有哪些?DNA的损伤修复有哪些?蛋白质二级结构(protein secondary structure)在蛋白质分

3、子中的局部区域内氨基酸残基的有规则的排列,常见的二级结构有-螺旋和-折叠 及无规则卷曲。二级结构是通过骨架上的羰基和酰胺基团之间形成的氢键维持的。蛋白质三级结构(protein tertiary structure)蛋白质分子处于它的天然折叠状态的三维构象。三级结构是在二级结构的基础上进一步盘绕、折叠形成的。三级结构主要是靠氨基酸侧链之间的疏水相互作用、氢键范德华力和盐键(静电作用力)维持的。蛋白质四级结构(quaternary structure)多亚基蛋白质的三维结构。实际上是具有三级结构的多肽链(亚基)以适当方式聚合所呈现出的三维结构。-螺旋(-helix)蛋白质中常见的一种二级结构,肽

4、链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状,一般都是右手螺旋结构,螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基酸残基(第n个)的羰基氧与多肽链C端方向的第4个残基(第n4个)的酰胺氮形成氢键。在典型的右手-螺旋结构中,螺距为0.54nm,每一圈含有3.6个氨基酸残基,每个残基沿着螺旋的长轴上升0.15nm。-折叠(-sheet)是蛋白质中的常见的二级结构,是由伸展的多肽链组成的。折叠片的构象是通过一个肽键的羰基氧和位于同一个肽链或相邻肽链的另一个酰胺氢之间形成的氢键维持的。氢键几乎都垂直伸展的肽链,这些肽链可以是平行排列(走向都是由N到C方向);或者是反平行排列(肽链反向排列)。-转角(-turn)也是多肽链中常见

5、的二级结构,连接蛋白质分子中的二级结构(-螺旋和-折叠),使肽链走向改变的一种非重复多肽区,一般含有216个氨基酸残基。含有5个氨基酸残基以上的转角又常称之环(loops)。常见的转角含有4个氨基酸残基,有两种类型。转角I的特点是:第1个氨基酸残基羰基氧与第4个残基的酰胺氮之间形成氢键;转角II的第3个残基往往是甘氨酸。这两种转角中的第2个残基大都是脯氨酸。超二级结构(super-secondary structure)也称之基元(motif)。在蛋白质中,特别是球蛋白中,经常可以看到由若干相邻的二级结构单元组合在一起,彼此相互作用,形成的有规则、在空间上能辨认的二级结构组合体。结构域(dom

6、ain)在蛋白质三级结构内的独立折叠单元。结构域通常都是几个超二级结构单元的组合。蛋白质变性(denaturation)生物大分子的天然构象遭到破坏导致其生物活性丧失的现象。蛋白质在受到光照、热、有机溶剂以及一些变性剂的作用时,次级键受到破坏,导致天然构象的破坏,使蛋白质的生物活性丧失。复性(renaturation)在一定的条件下,变性的生物大分子恢复成具有生物活性的天然构象的现象。别构效应(allosteric effect)又称之变构效应。是寡聚蛋白与配基结合改变蛋白质的构象,导致蛋白质生物活性改变的现全酶(holoenzyme)具有催化活性的酶,包括所有的必需的亚基、辅基和其它的辅助因

7、子。酶活力单位(U,active unit)酶活力的度量单位。1961年国际酶学会议规定:1个酶活力单位是指在特定条件(25,其它为最适条件)下,在1分钟内能转化1微摩尔底物的酶量,或是转化底物中1微摩尔的有关基团的酶量。比活(specific activity)每分钟每毫克酶蛋白在25下转化的底物的微摩尔数(m)。比活是酶纯度的测量。米氏方程(Michaelis-Menten equation)表示一个酶促反应的起始速度(v)与底物浓度(S)关系的速度方程,vVmaxS/(Km+S)。米氏常数(Michaelis constant,)(Km)对于一个给定反应,导致酶促反应速度的起始速度(v0

8、)达到最大反应速度(Vmax)一半时的底物浓度。氧化作用 指脂肪酸活化为脂酰CoA,脂酰CoA进入线粒体基质后,在脂肪酸-氧化多酶复合体的催化下,依次进行脱氢、水化、再脱氢和硫解四步连续反应,释放出一分子乙酰CoA和一分子比原来少两个碳原子的脂酰CoA。联合脱氨基作用转氨基与谷氨酸氧化脱氨或是嘌呤核苷酸循环联合脱氨,以满足机体排泄含氮废物的需求。竞争性抑制作用(competitive inhibition)通过增加底物浓度可以逆转的一种酶抑制类型。一个竞争性抑制剂通常与正常的底物或配体竞争同一个蛋白质的结合部位。这种抑制使得Km增大,而Vmax不变。非竞争性抑制作用(noncompetitiv

9、e inhibition)抑制剂不仅与游离酶结合,也可以与酶-底物复合物结合的一种酶促反应抑制作用。这种抑制使得Vmax变小,但Km不变。反竞争性抑制作用(uncompetitive inhibition)抑制剂只与酶-底物复合物结合,而不与游离酶结合的一种酶促反应抑制作用。这种抑制作用使得Vmax,Km都变小,但Vmax/Km比值不变。溶解温度DNA双螺旋变性一半时候的温度成为溶解温度别构酶(allosteric enzyme)一种其活性受到结合在活性部位以外部位的其它分子调节的酶。别构调节剂(allosteric modulator)结合在别构酶的调节部位调节该酶催化活性的生物分子,别构调

10、节剂可以是激活剂,也可以是抑制剂。同功酶(isoenzyme或isozyme)催化同一化学反应而化学组成不同的一组酶。它们彼此在氨基酸序列、底物的亲和性等方面都存在着差异。辅酶(coenzyme)某些酶在发挥催化作用时所需要的一类辅助因子,其成分中往往含有维生素。酶的分类有哪些?辅基(prosthetic group)是与酶蛋白共价结合的金属离子或一类有机化合物,用透析法不能除去。辅基在整个酶促反应过程中始终与酶的特定部位结合。尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸和尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP,nicotinamide adenine dinucleotide phosphate)含有尼克酰胺的辅酶

11、,在某些氧化还原反应中起着氢原子和电子载体的作用,常常作为脱氢酶的辅酶。黄素单核苷酸(FMN, flavin mononucleotide)核黄素磷酸,是某些氧化还原酶的辅酶。黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD, flavin adenine dinucleotide)是某些氧化还原酶的辅酶,含有核黄素。硫胺素焦磷酸(thiamine pyrophosphate)是维生素B1的辅酶形式,参与转醛基反应。磷酸吡哆醛(pyidoxal phosphate)是维生素B6(吡哆醇)的衍生物,是转氨酶、脱羧酶和消旋酶的辅酶。生物素(biotin)参与脱羧反应的一种酶的辅助因子。辅酶A(coenzyme A)一种

12、含有泛酸的辅酶,在某些酶促反应中作为酰基的载体。类胡萝卜素(carotenoids)由异戊二烯组成的脂溶性光合色素。转氨酶(transaminases) 也称之氨基转移酶(aminotransferases),在该酶的催化下一个-氨基酸的氨基转可移给另一个-酮酸。必需脂肪酸(ossential fatty acids)维持哺乳动物正常生长所需的,而动物又不能合成的脂肪酸,例如亚油酸和亚麻酸。核糖体核糖核酸(rRNA, ribosomal robonucleic acid)作为核糖体组成成分的一类RNA,rRNA是细胞内最丰富的RNA。信使核糖核酸(mRNA, messenger ribonuc

13、leic acid)一类用作蛋白质合成模板的RNA。转移核糖核酸(tRNA, transfer ribonucleic acid)一类携带激活氨基酸,将它带到蛋白质合成部位并将氨基酸整合到生长着的肽链上的RNA。tRNA含有能识别模板mRNA上互补密码的反密码。酶原激活某些酶在细胞内合成或初分泌时没有活性,这些没有活性的酶的前身称为酶原(zymogen),使酶原转变为有活性酶的作用称为酶原激活(zymogen activation)。碱基对(base pair)通过碱基之间氢键配对的核酸链中的两个核苷酸,例如A与T或U,以及G与C配对。DNA双螺旋(DNA double helix)一种核酸的

14、构象,在该构象中,两条反向平行的多核苷酸链围绕彼此缠绕形成一个右手的双螺旋结构。碱基位于双螺旋内侧,磷酸与糖基在外侧,通过磷酸二酯键相连,形成核酸的骨架。碱基平面与假想的中心轴垂直,糖环平面则与轴平行。两条链皆为右手螺旋。双螺旋的直径为2nm,碱基堆积距离为0.34nm,两核苷酸之间的夹角是36,每对螺旋由10对碱基组成,碱基按A-T, G-C配对互补,彼此以氢键相连系。维持DNA双螺旋结构稳定的力主要是碱基堆积力。双螺旋表面有两条宽窄、深浅不一的一个大沟和一个小沟。DNA变性(DNA denaturation)DNA双链解链分离成两条单链的现象。退火(annealing)即DNA由单链复性变

15、成双链结构的过程。来源相同的DNA单链经退火后完全恢复双链结构,同源DNA之间、DNA和RNA之间退火后形成杂交分子。融解温度(melting temperature, Tm)双链DNA融解彻底变成单链DNA的温度范围的中点温度。增色效应(hyperchromic effect)当双螺旋DNA融解(解链)时,260nm处紫外吸收增加的现象。减色效应(hypochromic effect)随着核酸复性,紫外吸收降低的现象。核酸内切酶(endonuclease)核糖核酸酶和脱氧核糖核酸酶中能够水解核酸分子内磷酸二酯键的酶。核酸外切酶(exonuclease)从核酸链的一端逐个水解下核苷酸的酶。重组DNA技术(recombination DNA technology)也称之基因工程(genomic engineering)。利用限制性内切酶和载体,按照预先设计的要求,将一种生物的某种目的基因和载体DNA重组后转人另一生物细胞中进行复制、转录和表达

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