镍柱分离纯化固定金属离子亲和柱主要用于金属螯化离子位于许多蛋白中的组氨酸残基将会和许多金属离子，例如锌铜，镍，铁等形成复合物因此，该柱料能选择性螯合一些具有组氨酸残基的蛋白质但是半胱氨酸和咯氨酸残基也能和固定化金属螯和但是亲和力比组氨酸要弱所以，结合的强度是和缓冲液的PH和金属离子决定的金属螯和柱料主要是由亚氨基的乙酰乙酸成分耦联琼脂糖柱料，借助醚长生7个原子的空间全部容量：24-30um的含有zn的干胶柱料结构：6%的高铰链的琼脂糖柱料大小：45-165um平均微粒：90um直流速度：25度/0.1MPa/30倍柱床/5厘米高度/每小时可达700厘米最大压强：0.3MPaPH变化：长期3-13 短期2-14化学稳定：通用含水缓冲液0.01M盐酸，1.0M NAOH, 20%乙醇（保存7天）物理性质：可以忽略在PH或者离子变化下的体积变化耐热性能：121度下0.1M乙酸钠作用半小时金属螯和柱料保存于事先填充于20%乙醇所以要搅拌驱除20%乙醇溶液换成去离子水比例是25%去离子水和75%处理胶处理金属螯和柱料：1 平衡所有用到的材料于室温2 搅拌金属螯和柱料3 倒水进柱子，驱除气体。
用无离子水液封几厘米4 将金属螯和柱料连续倒进柱子，用玻璃棒支撑柱壁防止气泡形成5 然后立即用无离子水液封，装上柱盖，连接上泵6 打开柱子底部的开关，然后调节泵的流速通常是不超过0.3MPa的7 经过一个稳定的柱床填鸭后，维持填压速度为3个柱床使用adaptor1 经过上溯填鸭后，关闭柱床下面开关，移开上面的薄膜，小心的加上去离子水进行液封2 一定角度插入adaptor，确保没有气泡3 确保所有的连接都没有问题，柱子/泵/样品接受器4 倾斜插入活塞确保没有气泡和管道充满液体利用活泵正反向的流动确保没有气泡5 固定adaptor，打开柱子开关，开始缓冲液的流动先以填鸭的速度直到柱床稳定后固定金属离子：金属螯和柱料通过水来螯和金属的，避免发生沉淀在胶上1 确保柱子已经平衡好如果有必要可以洗2个柱床（去离子水）2 选择金属离子和0.1-0.3M中弱性酸例如铁离子PH 3左右就好，避免形成沉淀和共沉3 加入一倍柱床的金属离子溶液4 5倍柱床的去离子水洗涤5 至少2倍柱床的平衡缓冲液结合：发生于PH5.5-8.5之间.最强反映发生于最后初始缓冲液的选择决定于金属离子和样品的结合性质乙酸钠或者磷酸钠是比较好的缓冲液中不能使用EDTA或者柠檬酸盐最通用缓冲液：0.01-0.2M磷酸钠0.05M乙酸钠强烈推荐加入0.15-0.5M NaCl用于防止离子交换。
通常如果不知道一个蛋白的结合能力，最好的就是使用锌离子和中性的磷酸或者乙酸盐，同时含有0.15-0.5M NaCl去垢剂不会影响蛋白质的结合能力金属离子的取代意味着蛋白发生了结合这种现象可以通过颜色来决定洗脱蛋白：（3种方法）1 降低PH(一步或者分步)，大部分蛋白溶解于PH4-6最终3-4是可容的可选择柠檬酸盐，磷酸或者乙酸盐2 逐步提高咪唑的浓度（0-0.5M），梯度变化最好是在初始缓冲液的PH范围3 加入EDTA或者EGTA可洗脱蛋白质但是不是通用的利用离心或者重力作用纯化组氨酸位点蛋白通过上镍进行选择性结合含有组氨酸位点蛋白，然后利用含有咪唑的缓冲液洗脱蛋白以下的实验是为了最大化将组氨酸位点蛋白结合到金属螯和柱料，然后确保能够洗脱下来当结合和洗脱的条件尚未明了时，这些方法也是很好用的为了获得高纯度的蛋白，必须摸索咪唑的缓冲液在样品上柱和洗脱时的浓度通常使用10mM-500mM范围的咪唑的缓冲液进行剃度洗脱，然后通过收集和SDS-PAGE 蛋白电泳确定洗脱浓度为了纯化不可容的含有his位点的蛋白质，（包含体），可以在变性条件下进行利用8M尿素或者6M盐酸呱进行溶解蛋白样品处理：样品要经可能溶解，避免出现堵塞现象，所以可以利用0.45uM虑膜过滤杂志如果样品时溶解于20mM磷酸缓冲液中（含有0.5M Nacl,PH7.4），必须调整PH到7－8。
上柱前准备：洗柱料：1 亲柔震动胶瓶充旋胶料2 利用吸管吸出足量柱料用以纯化目的每毫升柱料可以吸纳5毫克蛋白3 500g 离心2－5分钟，沉淀柱料4 小心去除上清5 加入5倍体积去离子水，充分振荡柱料可以倒置来回5分钟，不要机械搅拌6 再次500g 离心2－5分钟，沉淀柱料7 再次小心去除上清挂镍：1 加入0.5倍柱床体积0.1M硫酸镍，充分振荡柱料可以倒置来回5分钟，不要机械搅拌2 500g 离心2－5分钟，沉淀柱料3 小心去除上清洗柱：1加入5倍体积去离子水，充分振荡柱料，来回倒置5分钟2 500g 离心2－5分钟，沉淀柱料3小心去除上清4 再洗两次柱料（一共3×5柱床去离子水）5 最后用一倍体积起始缓冲液充旋柱料（20mM Na2HPO4 /0.5MnaCl/10mM咪唑/PH7.4）利用离心来纯化：上样：1 在起始缓冲液中加入样品，然后使整体胶浓度达到50％2 亲柔搅拌，室温离心5－30分钟，结合能力取决于蛋白和样品浓度3 500g 离心2－5分钟，沉淀柱料4 取出上清部分用于SDS-PAGE 蛋白电泳洗胶：1 加入5倍体积起始缓冲液，搅拌5分钟2 500g 离心2－5分钟，沉淀柱料。
3取出上清部分用于SDS-PAGE 蛋白电泳4再洗两次柱料（一共3×5柱床起始缓冲液）记得取出上清，部分用于SDS-PAGE 蛋白电泳洗柱：1 加入2倍体积洗脱缓冲液（20mM Na2HPO4 /0.5MnaCl/10mM咪唑/PH7.4）搅拌5分钟2再次500g 离心2－5分钟，沉淀柱料3再洗四次柱料（一共5×2柱床洗脱缓冲液）记得取出上清，部分用于SDS-PAGE 蛋白电泳，280nM吸光值，ELISA,WESTERN利用流速和重力纯化：1 在柱子底部加上滤器2 加水排气3 加柱帽，去除残余水推荐是最多2 Ml柱料就可以了样品结合：1 倒胶进入柱子2 小心上样，用波棒室温搅拌5－30分钟3 打开柱帽，收集流出峰用于分析洗胶：1 加入5倍体积起始缓冲液，收集流出液用于SDS-PAGE 蛋白电泳2再洗两次柱料（一共3×5柱床起始缓冲液）记得取出上清，部分用于SDS-PAGE 蛋白电泳洗柱：1 加上柱帽，加入2倍体积洗脱缓冲液（20mM Na2HPO4 /0.5MnaCl/10mM咪唑/PH7.4）搅拌5分钟打开柱帽，收集流出峰2再洗四次柱料（一共5×2柱床洗脱缓冲液）记得取出上清，部分用于SDS-PAGE 蛋白电泳，280nM吸光值，ELISA,WESTERN注意：0.5M咪唑的280nM吸光值＝0.5常见问题：1 样品太粘稠答：核酸存在影响，可以继续超声，加入RNA酶至10ug/ml DNA酶至5ug/ml。
然后冰浴10－15分钟或者也可以用注射器来回充旋这样可以防止堵塞柱料2 平衡时样品洗脱了下来答: 检查PH和缓冲液成分，如果缓冲液成分不正确，EDTA加入，强还原剂加入，都会导致这个现象出现加大胶的量，如果胶料承载能力过头，也绘出出现这现象准备新鲜的柱料，如果柱料断裂，也挂不上蛋白3 在洗脱液中不含有组氨酸蛋白答：如果SDS-PAGE 蛋白电泳已经发现蛋白存在于超声液中超声可能不完全可以用显微镜观察超声情况AD260/280比值通常是超声前将10mg/ml溶菌酶加入25mM Tris-HCL，PH6-8），避免发泡以降解融合蛋白蛋白可能是是包含体，可以使用4－6M盐酸呱或者4－8 M尿素溶解尿素溶解的可以进行SDS-PAGE 蛋白电泳，盐酸呱溶解的不可以进行SDS-PAGE 蛋白电泳，必须换缓冲液洗脱液浓度太稀，可以加大咪唑浓度或者降低PH 来决定最佳洗脱条件如果在平衡前的洗柱发现了目的蛋白，证明起始缓冲液中的咪唑浓度太高，可适当降低4 考马氏亮蓝或者银染发现多条带答：加入蛋白激酶抑制剂可能是蛋白降解用凝血酶切割前必须去除丝氨酸蛋白酶抑制剂采用梯度咪唑来洗脱蛋白在平衡洗脱液中加入10mM咪唑可以洗脱大量杂质而不会洗脱融合蛋白。
低于500mM咪唑可以洗掉绝大部分杂质在洗脱步奏往起始缓冲液加入去垢剂（2％TRITON x-100或者2％Tween20）50% 葡萄糖，20mM B-巯基乙醇记得杂质通常没有特意结合能力，可以改变缓冲液来洗脱如果杂志和目的蛋白有相同结合能力，那就不能用于纯化因此可以使用别的纯化系统，例如含有GST尾巴就用谷胱甘肽琼脂糖4B柱料再生，清洁和保存柱料再生：1 使用0.05M EDTA,0.5M NaCl来洗脱镍离子然后用3柱床的0.5M NaCl来洗干净EDTA2如果是铁离子可以用0.05M EDTA泡过夜3 这一步可以洗脱上面未能洗脱的残余结合蛋白清洗柱料：1 0.5倍柱床2M NaCl，反向洗脱10－15分钟2 1M NaOH洗1小时去除残余蛋白3 每一步都要用3倍柱床起始缓冲液清洗4 4倍柱床70%乙醇洗脱强亲水蛋白和脂类蛋白也可以使用2倍柱床去垢剂0.1-0.5%非离子去垢剂溶于0.1M乙酸浸泡1－2小时最后用5个柱床的70％乙醇去除去垢剂清洁：1 尽可能去除微生物2 0.5-1M NaOH反向流动半小时3 再用3－5倍柱床消毒的起始缓冲液平衡4 这个清洁步奏不一定能够提高纯化能力保存：长期保存于20％乙醇或者0.01M NaOH 于4度。