林木分子育种发展现状与美国林业发展现状简析

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1、# / 7世界林业发展概论论文林木分子育种发展现状与美国林业发展现状简析摘要:森林是地球之肺,也是人类生活离不开的一部分,具有极高的生态与经济价值。 林木遗传改良在森林资源可持续发展中起到关键作用,而其中现代分子技术的应用也为之带来了新的机遇和挑战。近年来,林木生物技术研究取得了重要突破,显示出独特的优势和巨大的发展潜力。转基因林木的遗传稳定性在田间试验中得到验证,遗传基因组学和关联遗传学的发展也为进一步深入开展林木遗传改良研究提供了新思路。杨树全基因组测序计划的完成实现了多年生木本植物基因组的首次破译,已经开启林木分子育种的新时代。本文将对当前林木遗传改良中的分子生物学研究进展,遗传基因组学

2、和关联遗传学策略在林木育种中的应用与林木分子生物学研究中亟需解决的问题和应用前景进行简略讨论。同时,美国作为世界上的林业大国,美国的森林主要分布在 3个地区。在西部的落基山脉到太平洋沿岸,以针叶林为主,主要树种有北美黄杉、西黄松、加州山松、恩氏云杉和科罗拉多冷杉。本文将对其林业资源、林业科技、林业管理、林业产业发展等方面进行简略介绍。并针对林业教育进行略为深入的分析。关键词:林木分子育种;遗传基因组学 ;关联遗传学;林木基因转化;美国高等教育;林业教育正文:、林木分子育种发展现状简析林木生长周期长,要培育出具有满足现代林业生产需求的林木新品种,利用传统育种方法,很难在短期内实现育种目标林木由于

3、自身固有的一些生物学特性,遗传操作困难,导致林木遗传育种基础研究比较薄弱,导致林木遗传育种在基础研究方面远远滞后于模式动植物和其他重要作物,成为林木遗传改良进程的主要限制因素。分子育种是突破林木育种周期长的关键技术,通过基因组学研究, 分析和阐明林木基因的功能是进行林木分子育种设计的 前提。1分子标记发展历程:我们在林木遗传育种的课程上已经了解过的分子育种技术主要是各种分子遗传标记。一类是基于DNA-DNA杂交的DNA标记。其中最具代表性的就是RFLP标记,常常被称为第代分子标记。第二类为基于PCR勺DNA标记。主要包括 RAPD标记与SSR标记。其中SSR被称为第二代分子标记。第三类是基于P

4、CR与限制性内切酶切技术结合的DNA标记,如AFLP与CAPS标记。第四类为基于简单核苷酸多态性的DNA标记,女0 SNP标记被称为第三代分子 标记的代表。目前的 SNP标记一般通过DNA芯片技术进行分析。2、测序技术发展历程:基因组的杂合度较高、基因组较大,且多数发生过基因组的复制,遗传背景不清晰,这些瓶颈限制了林木全基因组测序研究的进程。2000年,人们完成了拟南芥全基因组测序,这是人类完成的第一个植物全基因组测序。此后,2006年完成了毛果杨全基因组测序。此后又相继完成了葡萄、番木瓜、苹果、桃树和麻风树的全基因组测序。在这些研究如火如荼地展开的同时,我们不应该忘记测序技术的迅猛发展。经历

5、了建 立在PCR之上的第一代San ger测序法和第二代合成测序法后,第三代单分子测序技术具有高通量、低成本的特点。第代测序技术早已经投入规模化商业运营,其有测序读长较长、 测序精度高的优点,但成本高、耗时长。第二代测序技术降低了成本,提高了测序速率。但 存在较高的误差。第三代测序技术在测序过程中, 省略了扩增的步骤,极大提高了测序速度,往往就是两三天即可完成样本的测序,测序读长较长,精度非常高,并且能同时进行多个样品分析,但是目前仅在部分高新生物科技公司中开展,其规模化推广尚需要时日。三代的测序技术特点如下表。于近日,学术界中有人声称已经开发出第四代测序技术,将会使得测序技术更快、更准、成本

6、更低。3、毛果杨全基因组测序研究及结果利用:已经测序的毛果杨(Pop ulus trichocarpa )的基因组为 480 Mb,属于中等大小基因组物种。杨树生长迅速易于进行常规育种和遗传转化等研究的实验操作,已通过种间杂,为现在正在交建立了遗传作图群体。综合分析了杨属基因组数据,开发了各种分子标记进行或将来要进行的其他重要树种的基因组结构、功能、进化、遗传改良研究提供了扎实的基础。获得杨树全基因后, 各个课题组以不同基因为单位,进行了单核苷酸多态性分析等研究,已经鉴定出杨树纤维素合成相关基因4和木质素合成酶基因。测序技术1测序过程产量和成本优缺点第一代传统Sanger测序法PCR扩增DNA

7、片段合成随机末端分子毛细1管电泳分离一一输出序列6 Mb/day约 500 $/Mb测序读长较长、测序精确度较高,已经规模化,但测序成本高、速率低第二代合成测序法PCR扩增DNA片段、序列组装每次加单核酸,记录结果后洗脱、重复一一输出序列750 5000 Mb/day约 0.5 20 $/Mb高速率、测序读长较长,同核苷酸聚物测序时误差较咼,测序试剂价格较咼(454);低成本、高速率,测序读长较短,序列拼接繁琐(Solexa和SOLiD);测序错误率较高 (Solexa);可确定错误识别碱基(SOLiD)第三代单分子测序法锚疋DNA片段每次加单核酸,记录结果后 洗脱、重复或者实时测 序输出序列

8、5000Mb/day0.5 20 $/Mb低成本、高速率、长测序读长,简化了样品准备过程和数据分析流程,测序精度非常高4、林木分子育种展望: 目前基于全基因组测序开展的研究多为以下方面: 1)开展木本植物重要性状相关基因的发现、克隆、功能分析与进化分析,例如控制开花、木材形成、树木生长习性、休眠、耐寒力、病虫害抗性、果实发育、果实性状与品质等相关基因。2)进行比较基因组学研究,分析物种间的起源与进化7。3)应用NGS获得木本植物全基因组结果制作基因芯片,为特定时间内基因表达的时空性提供信息。4)提供了大量的 SSRs和SNPs等分子标记,利于高密度遗传图谱和物理图谱构建,加速分子标记与优良性状

9、的连锁研究。5)全基因组测序结果上,进行同种木本植物不同时期、不同组织,野生型与突变体,未胁迫处理和各种胁迫处理之间的转录组学、代谢组学、蛋白质组学等的研究。开展林木分子育种,首先需要深入研究木本植物特有的重要性状形成的遗传和分子基础,并建立高效的林木未知基因克隆体系,快速克隆一批有利用价值的新基因;其次需要发展高效的分子标记育种转基因育种和分子设计育种新技术,突破复杂性状遗传改良上的技术瓶颈。,转基因那些在草本模式植物中不易开展的分子生物学领域已经或正在林木中深入和拓展 林木稳定的改良特性揭示了生物技术在林木遗传改良研究中具有巨大潜力。、美国林业发展现状简析1林业资源、林业科技、林业管理简述

10、美国的森林面积 2.98亿hmi,占土地总面积的33%。人均拥有森林面积 1.122hm。其中,用材林地(每公顷年产材能力在 1.4 m3以上的林地)1.98亿hm2,占森林总面积的66.4%; 保留林地(根据法规禁止采伐的林地,如自然保护区等2)1 400万hm,占4.7%;其他林地(每公顷年产材能力在 1.4m3以下的林地)8 600万hmi,占28.9%。美国的森林主要分布在3个地区。在西部的落基山脉到太平洋沿岸,以针叶林为主,主要树种有北美黄杉、西黄松、加州 山松、恩氏云杉和科罗拉多冷杉。上世纪五十年代,美国开始营造种子园。 六十年代后进入快速发展阶段,完成第一代种 子园,第一代改良种

11、子园。美国北卡罗来那大学到八十年代,已拥有第二代火炬松种子园。至今,已经发展到第四代第五代种子园,产量不断提高。美国林业具有相当大的经济投入, 实行计划管理,不计成本投入。由于技术与经济因素, 从事种苗生产的多为大型企业。机械化水平非常高,整地、灌溉、采种、切根、起苗等均为机械化操作。其森工生产水平也合理科学。森林经营手段也跟得上, 不会产生国内经常发生 的“拔大毛”式的砍伐。同时,美国卫星与遥感技术世界顶尖,也大大造福了他们的林业发展。美国从中央到地方有一套完整的林业管理体系,组织健全,体制稳定。统管全国林业事务的行政单位是联邦政府农业部林务局,是农业部中最大的局, 这一点就和中国林业部门非

12、林业科学研究、政策法规制定、人常不一样。林务局的主要任务是负责全国的国有林管理、员培训及使用、木材生产、指导州和私有林经营、行政管理等业务。国有林系统实行联邦林务局、大林区、林管区和营林区四级管理。全国划分成8个大林区,大林区下设林管区,全国共有155个林管区,林管区下设若干个营林区,营林区是林业系统最基层的单位。2、林业教育简析9在美国,高等林业院系大多设立在综合大学内。经过100多年的发展,美国高等林业教 育取得了巨大的进步,无论是在办学层次、教育规模,还是在专业教育质量方面都达到了很高的水平。1990年以后,通过美国林学会评审的高等林业院系有3个,分别是俄亥俄州立大 学自然资源学院(19

13、93年)、阿拉斯加大学森林科学系 (1996年)和阿拉巴马州 A&M大学林 业和生态中心(1998年)。目前美国有54所高等学校被授权开设高等林业教育。美国林业 院系中规模最大、学科最全的是纽约州立大学环境科学与林业科学学院。由于林业学科许多课程相同,常常只要增加1年就可以达到双学位的要求,为培养宽 口径、多学科复合型人才创造了条件。 本科生通常不需要写毕业论文 ,不需要参与论文答辩,但通常会要求参与实习。攻读科学硕士(MS)和博士( PHD) 般要求做论文,进行论文答辩。学校对本科生教育的教学内容没有统一的教学大纲,没有统编教材。每个教师通常会自己制作相应的教学讲义用于授课或分发给学生学习,

14、此外每门课程通常会指定大量的课外阅读材料以充实课程信息。美国高校行政权力主要集中在校长 ,学术权力则更多地集中在院系,具有鲜明的“校长 治校、教授治学“的特点。学校的一切管理工作都是围绕学科、教学及科研进行的。美国林业教育也有其问题,比如20世纪80年代至90年代的10余年间,由于过于强调吸引优秀学生从事林业工作,使得美国林业院校的学生人数大幅度下降。林业在就业机会、经济收入和成功机会等方面显得逊于其他行业,吸收高素质的学生愈来愈困难, 且在校生的质量也在下降。所以现在的美国林业教育, 很强调正确宣传的问题, 现代林业已经不是传统林业那样工作环境差、技术含量低、从业人员素质低的境况, 越发地向技术集约型、人才集约型方向发展,工作环境与条件均有大幅改善。美国林业教育一直都把吸引优秀学生求学作 为重中之重,这也是美国林业世界领先的重要原因之一。林参考文献:林木遗传改良中的分子生物学研究进展1 胥猛,潘惠新,张博,王树东,黄敏仁业科学Vol14

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