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1、精品文档 你我共享数据需求分析工作表单填表说明一、 说明l 本表旨在通过调查建库对象在建立适合特定需要的数据库建设过程中的具体需求，掌握所必需的一手用户资料，并通过分析用户特定需求，进一步明确数据工作组“以需求为中心、以内容为出发点”的工作方法，最终目标则是为建库对象提供个性化且具兼容性的数据格式和解决方案。l 此表是开展数据应用研究和实践所做的重要基础性工作，是下一步工作的前提，所以请尽可能分配专人认真填写，内容应尽可能真实、准确、专业和详尽；对于无法填写的部分，最好简要说明理由。l 填表实例是一个可供参考的对象，目的是减小填写调查表给用户带来的负担，并加强调查表的一致性和规范性。本实例仅供
2、参考，用户填写表格时不受此表的约束。l 有关各个分表填写的详细说明，请参阅各个表头的相关说明。l 任何预留空间或分表均可由用户自由扩展。二、填表实例01数据需求调查表（请尽可能回答这些问题，并在需要时自行添加其他问题及其解答）1.联系信息建库单位：上海生命科学研究院生物信息中心建库负责人：何有裕/建库联系人：电话：021-234444*/ 邮件：y*siba.ac.c2. 预期成果生物研究人员可以通过 WEB 或客户端软件查询、分析数据库中的数据。生物学开发人员可以通过 ORB 接口检索调用数据库中的数据，而无需另建一套数据。考核指标：1） 建立一个基于关系型数据库的核酸蛋白质系列数据库2）
3、形成一套数据集3） 提供一个 Web 界面供用户检索3. 数据类型及来源文本、图形（图像）、视频：国内研究机构递交注册、GenBank、EMBL 等国际公共数据库下载，每天自动更新 4. 特殊数据的处理流程无5. 参考标准该领域是否已有相关国内或国际标准？无是否参考了这些标准？在建库过程参照EMBL/DDBJ/GenBank的形式，关于核酸序列的特征描述也参照上述规范。是否准备参考这些标准？是这些标准能否满足特定需求？不能完全满足特定需求如果不能，是否已有计划或解决方案？尚未6. 时间计划(10/2002) 之前完成数据需求分析改一下时间？（12/2002）之前完成数据需求规则书 (06/20
4、03) 之前完成数据库设计（12/2003）之前完成数据库著录和管理系统7其它02数据元素需求表（注意：为简化篇幅，本表只截取一部分） 元素中文名称：填入所需元素、次元素到元素中文名称Element、Qualifier两栏中，填入需要的元素时只需考虑数据库的真正需求，而不需配合任何数据标准 元素英文名称：将所需元素填入英文名称 定义：以文字描述各元素代表的内含意义，也就是各元素的意义说明 著录规范：元素在建文件时需统一遵循的国际或自订规格、形式、或规则，包括著录时的规则、与著录时须注意的要项、采用之国际标准等元素中文名称元素英文名称定义着录规范ElementQualifierElementQu
5、alifier序列名称Name序列条目的简单描述 通常字符长度限制在12个字符以内序列号Sequence No.系统赋予给序列的代号由字母CN和10个数字组成，不用著录，系统直接产生,根据递交的先后顺序依次累加序列长度Length递交序列的长度可不著录，系统将会自动计算产生序列类别Division序列所属的类型著录时参照序列代码表分子类型Molecular序列分子类型著录时参照代码表描述Description对序列的简单描述以序列的物种开头来源物种Organism该序列来源的物种的系统命名由属名种名组成，参照代码表拓扑结构Topology选择序列的拓扑学结构著录时参见代码表链类型Molecul
6、ar Type分子结构的链类型著录时参见代码表关键词Key Words查询序列的关键词发布日期Release Date序列可以公开发布的日期采用ISO8601著录，格式为YYYY-MM-DD发布限制Public序列发布的限制条件著录时参加著录代码表参考信息参考文献标题ReferenceArticleTitle参考文献的标题序号NO.参考文献的序号Medline查取号Code该参考文献在Medline上的查询号序列位置Sequence Position指出该参考文献所涉及该序列的那一部分，即位置参见EMBL关于Location著录的标准文献状态Status该文献的出版状态著录时参见代码表刊物名称
7、Magazine Name该参考文献发表的刊物名称卷号Volume NO.该参考文献发表在刊物的哪一卷期号Issue NO.该参考文献发表在刊物的哪一期开始页Start Page该参考文献在刊物中的开始页码结束页End Page该参考文献在刊物中的结束页码出版日期Published Date该刊物的是哪一年出版的作者排名AuthorSeries NO.该作者是第几作者姓名名NameFirst Name中间名Middle Name姓Last Name单位名称Organization该作者所在的单位名称单位地址Address该作者所在的单位地址03 内容关系结构图 请以图表表示元素间有无任何结构性
8、(如：元素的子母性，展览名称、展览尺寸、展览描述包含在展览信息下)、元素间的关联(如：展览尺寸抓尺寸中全高之值)、对外数据库的连结(如：作者、题跋人需连结人名权威档，出土地点连结地名权威文件及GIS系统)等EMBL Feature Table DefinitionSequence国际注册信息Patent来源于Author发布日期拓扑结构分子类型类别长度序列号名称链类型PublisherAuthorArticleDescriptionKey WordReferenceQualifierLocationKeyFeature KeySourceOrganismLocus核酸序列04 元素代码表 元素
9、中文名称：填入02数据元素需求表中有代码的元素 代码：列出为该元素制订之代码，此代码可在建库时作词汇控制之用，以下拉式表单呈现元素中文名称代码ElementQualifier序列类别EST / PHG / FUN / GSS / HTG / HUM / INV / ORG / MAM / VRT / PLN / PRO / ROD / STS / SYN / UNC / VRL 分子类型DNA / cDNA to mRNA / RNA / cDNA to genomic RNA / tRNA / rRNA / snRNA / ssRNA / other拓扑结构linar/ circular链类
10、型Single Strand (单链) / Double strand(多链) / Mixture strand（其它）发布限制yes/no参考信息文献状态Unpublished / In-Press / Published序列特征名称参见http:/www.ebi.ac.uk/embl/Documentation/FT_definitions/feature_table.html位置参见http:/www.ebi.ac.uk/embl/Documentation/FT_definitions/feature_table.html属性参见http:/www.ebi.ac.uk/embl/Doc
11、umentation/FT_definitions/feature_table.html参考/作者国家参见:http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/collab/country.html专利信息授予国家参见:http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/collab/country.html05 著录范例（注意：为简化篇幅，本表只截取一部分） 元素中文名称：填入02 数据元素需求表中的所有元素 实例：请填上元素的实例记录。元素中文名称实例ElementQualifier序列名称nuc 1序列长度17来源物种（Organism）Homo sapiens分子类型cDNA to
12、 mRNA 序列类别EST发布日期2001-01-08发布限制Yes拓扑结构 Linear链类型Single Strand描述CBLANF04_CB Homo sapiens cDNA clone CBLANF04, The insert is cloned randomly with the EcoRI digestion, mRNA sequence.序列值NCAAAAAAAA AAAAAAA关键词RNA参考信息/参考文献标题 Submit data to biosino database序号1文献状态Pressed参考信息/作者排名1名Q中间名姓Zhang单位名称Shanghai ins
13、titute of hematology, Rui-Jin Hospital单位地址197 Rui-Jin II Road参考信息/作者排名2名M中间名单位名称Shanghai institute of hematology, Rui-Jin Hospital单位地址197 Rui-Jin II Road国家China参考信息/参考文献标题Assignment of human derived CDC序号2Medline查取号9416904006功能需求表 元素中文名称：填入02 数据元素需求表中的所有元素 必填元素：请勾选在建立一笔数据记录时，必须填写的重要基本元素。可在系统中建立控制机制，以避免不完整记录提交和保存 多值元素：该元素是否需重复著录。如：如一种植物/动物可能有很多别名，所以在建库时需重复物种别名一栏以做著录，所以请勾选此类需重复的元素 元素顺序：请以阿拉伯数字标示出元素在建文件画面的显示顺序，需第一个显示的元素标为1，以此类推 简要查询该栏勾选的元素是用来作关键词之简单查询，也就是在简要查询下任何的检索语会搜寻此项目中勾选的所有元
