TTV核酸模板快速制备方法概要

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1、TTV核酸模板快速制备方法07-08-23 11:47:00 编辑:studa20作者:苏明权,冯继红,于文彬,徐光华,马越 云,张建芳,张林,刘家云【关键词】TT 病毒关键词:TT病毒;聚合酶链反应;核酸制备摘要:目的寻求建立适合大批量临床标本检测 TT病毒(TTV核酸快速制备方法,直接用于PCFT增.方法应用蛋白酶K裂解酚氯仿抽取法与直接快速裂解法,分别制备TTV核酸做PCR莫板,用于TTV的聚合酶链反应的快速 检测结果 在30例非甲非庚型肝炎血清和50例慢性乙型肝炎患者血清, 应用经典的蛋白酶K裂解酚氯仿抽取法和直接快速裂解法,分别制备TTV核酸模板,在相同条件下进行PCRT增,结果两种

2、制备方法的符合率为89%.结论 TTV是一种新发现的肝炎病毒,目前主要以实验室检测病毒核酸的存在为 诊断依据,建立了具有快速、简便、适合大批量临床标本中TTV核酸制备方法,对TTV肝炎的快速诊断,具有重要的意义.Rapid preparatio n of tran sfusi on tran smitted virus nu cleicacid templateSU Min g-Qua n1 ,FENG Ji-Hong2 ,YU Wen-Bin1 ,XU Guang-Hua2 ,MA Yue-Yun1 ,ZHANG Jian-Fang1 ,ZHANG Lin1 ,LIU Jia-Yun11 C

3、enter of Clinical Molecular Biology,Xijing Hospi-tal ,Fourth Military Medical University,Xian710033,China,2 Deparmentof Infectious Diseases ,College of Medicine ,Yanan University,Ya nan716000Keywords:tra nsfusi on tran smitted virus;polymerase cha in reactio n;DNA preparati onAbstract:AIM To establi

4、sh a method adapti ng to rapid preparati on of TTV DNA from bulk samples for PCR.METHODS TTV nu cleic acid template was prepared for PCR using two methods ,viz.hydroxybenzene chloro-form extract ion and directly rapid cracki ng.RESULTS DNA abstracted by the two methods was amplified at same PCR para

5、meter and the coi ncide nee rate was89%.CONCLUSION TTV is a new discoveredhepatitis virus and the main laboratory diagnosis method is to detect its DNA by PCR ,so it is very important to establish a method for rapid preparation of TTV DNA from bulk samples.0 引言TT病毒是近年新发现的一种肝炎病毒,当发现一种新的病原性相关病毒因 子时,建立

6、一种敏感、快速、特异的实验室检测方法并评价该病毒因子在肝病 中的价值是十分重要的,该方法的临床适用性和可行性,是评价所建立方法在 临床上应用价值的关键所在 . 目前主要以实验室检测病毒核酸的存在为诊断依 据,建立具有快速、简便、适合大批量临床标本中 TTV核酸制备方法,对TTV 肝炎的快速诊断,具有重要的意义 . 我们从临床快速检测需要为目的,寻求建立 一种快速、简便的TTV核酸制备方法,用于大批量临床标本的检测,获得满意 的结果.1 材料和方法1.1 材料非甲非庚型肝炎血清30例,来自延安大学医学院传染科;慢性乙型肝炎 患者血清 50例,来自西京医院就诊患者 ;引物及合成:根据 Nishiz

7、awa 等1 报道的引物,外引物:RD037 (正义链)5-GCAGCAGCATATGGATATGT-3RD反8 义链)5-TGACTGTGCTAAAGCCTCT,扩增片段:270bp;内引物:RD051 (正义 链)5-ATACA-CATGAATGCCAGGC-3RD0反义链)5-GTACTTCTTGCTGGTGAAAT- 3扩增片段:196bp,由上海博亚生物技术有限公司合成.1.2 方法蛋白酶K裂解酚氯仿抽取法:50卩L血清加200卩L裂解液(50mmo? L-1 Tris-HCl pH8.0, 200mmo?l L -1 NaCl , 10mmo?l L-1 EDTA, 20g? L-

8、1SDS 1g? L-1蛋白酶K), 60C水浴60min,加等体积酚:氯仿:异戊醇(25 : 24: 1)混匀,4C冰浴下30min, 2000g离心10min,取上清加等体积预 冷无水乙醇-20C过夜,1000g离心20min,沉淀溶于20卩L0.1 xTE缓冲液中, 备用直接快速制备法:20卩L血清加50卩L快速裂解液(50mmo? L-1 Tris HCl, pH8.0, 50mmo?l L1 KCl, 1.5mmol? L-1 MgCl, 10g? L -1 NP-40 , 5g? L-1 Tween-205g ? L-1 Triton X-100, 2.0g? L-1 SDS)煮沸

9、 20min, 1000g 离心10min,取上清做模板.PCR扩增:第1轮PCR扩增:总反应体积为25卩L, 包括:10 x PCR缓冲液 2.5 卩 L;4 x dNTP2.0 卩 L;外引物各 1.0 卩 L (50pmol? L -1 ) ;DNA模板5.0卩L;Taq DNA酶3U?卩L-1 ;无菌蒸馏水12.5卩L;无菌石蜡 油30卩L覆盖液面,94C变性3min,进入PCR循环,循环条件:94 C 50s, 55r 50s, 72C 70s, 32个循环,最后72C延伸5min.第2轮PCF扩增:总反应 体积为25卩L,包括:10 x PCR缓冲液2.5卩L;4 x dNTP2.0卩L;内引物各1.0卩L(50pmol? L-1 );第 1 次 PCF产物 5.0 卩 L;Taq DNA酶 1.5U?卩 L -1 ;无菌蒸 馏水12.5卩L;无菌石蜡油30卩L覆盖液面,94C变性3min,进入PCR循环,循 环条件:94 C 50s, 55C 50s, 72C 70s, 32个循环,最后72C延伸5min.产物 检测:取15卩L第2次PCRT增产物,于20g? L-1琼脂糖(含EB)凝胶中,电 泳100V30min,紫外灯下观察结果,出现196bp片段者为TTV阳性.

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