实验三PCR扩增制备目的基因

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1、实验三PCR扩增制备目的基因概念反转录是以 RNA 为模板,通过反转录酶,合成 DNA 的过程, 是 DNA 生物合成的一种特殊方式。区分:反转录与逆转录不等同。反转录是进行基因工程过程中,人为地提取出所需要的目的基因的信使RNA,并以之为模板 人工合成DNA的过程;逆转录是RNA类病毒自主行为,在整合 到宿主细胞内以 RNA 为模板形成 DNA 的过程。二者虽同为 RNADNA的过程,但地点不同,相对性的来说,反转录在体外, 逆转录在体内。2 反转录酶与反转录过程反转录过程由反转录酶催化,该酶也称依赖RNA的DNA聚 合酶(RDDP),即以RNA为模板催化DNA链的合成。合成的 DNA链称为

2、与RNA互补DNA (cDNA)。反转录酶存在于一些 RNA 病毒中,可能与病毒的恶性转化有关。人类免疫缺陷病毒 (HIV)也是一种RNA病毒,含有反转录酶。在小鼠及人的正常 细胞和胚胎细胞中也有反转录酶,推测可能与细胞分化和胚胎发 育有关。大多数反转录酶都具有多种酶活性,主要包括以下几种活性DNA聚合酶活性;以RNA为模板,催化dNTP聚合成DNA 的过程。此酶需要RNA为引物,多为色氨酸的tRNA,在引物 tRNA3一末端以53方向合成DNA。反转录酶中不具有35 外切酶活性,因此没有校正功能,所以由反转录酶催化合成的 DNA出错率比较高。 RNase H活性;由反转录酶催化合成的cDNA

3、与模板RNA 形成的杂交分子,将由RNase H从RNA5端水解掉RNA分子。 DNA指导的DNA聚合酶活性;以反转录合成的第一条 DNA 单链为模板,以 dNTP 为底物,再合成第二条 DNA 分子。除此之外,有些反转录酶还有 DNA 内切酶活性,这可能与 病毒基因整合到宿主细胞染色体 DNA 中有关。反转录酶的发现 对于遗传工程技术起了很大的推动作用,目前它已成为一种重要 的工具酶。用组织细胞提取mRNA并以它为模板,在反转录酶的 作用下,合成出互补的DNA(cDNA),由此可构建出cDNA文库 (cDNA library),从中筛选特异的目的基因,这是在基因工程技术 中最常用的获得目的基

4、因的方法。反转录的简要过程表示如下:反转录酶的作用是以dNTP为底物,以RNA为模板,RNA(主 要是色氨酸tRNA)为引物,在tRNA3OH末端上,按53方向, 合成一条与 RNA 模板互补的 DNA 单链,这条 DNA 单链叫做互 补 DNA(complementary DNA, cDNA), 它与 RNA 模板形成 RNADNA杂交体。随后又在反转录酶的作用下,水解掉RNA链, 再以 cDNA 为模板合成第二条 DNA 链。至此,完成由 RNA 指 导的 DNA 合成过程。3 生物学意义反转录的发现有重要的理论意义和实践意义。(1)对分子生物学的中心法则进行了修正和补充,修正后 的中心法

5、则表示为:是指遗传信息从DNA传递给RNA,再从RNA 传递给蛋白质,即完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从 DNA传递给DNA,即完成DNA的复制过程。这是所有有细胞结 构的生物所遵循的法则。某些病毒中的RNA自我复制(如烟草 花叶病毒等)和在某些病毒中能以RNA为模板逆转录成DNA的 过程(某些致癌病毒)。有些病毒(如阮病毒,即疯牛病病毒)以 蛋白质直接形成蛋白质。(2)在致癌病毒的研究中发现了癌基因,在人类一些癌细 胞如膀胱癌、小细胞肺癌等细胞中,也分离出与病毒癌基因相同 的碱基序列,称为细胞癌基因或原癌基因。癌基因的发现为肿瘤 发病机理的研究提供了很有前途的线索。(3)在实际工作中

6、有助于基因工程的实施。由于目的基因 的转录产物易于制备,可将mRNA反向转录形成DNA用以获得 目的基因。RNA反转为cDNA10川体系mix 2RNA 500ngAdd Oto 10H2PCR 程序37 Co10min85C5s稀释产物即可用于后续实验。实验三PCR扩增制备目的基因1目的学会PCR操作的基本技术。2原理是将待扩增的 DNA 模板加热变性,与其两侧互补的寡聚核 苷酸引物复性,然后经过耐热的 DNA 聚合酶延伸。再进入下一 轮变性一复性一延伸的循环,n次循环后DNA可被扩增(1+X) n倍。其中25nt的引物退火温度T m=2 (A+T) +4 (G+C)。3器材旋涡混合器,微量

7、移液取样器,移液器吸头, 0.2ml PCR 微 量管,双面微量离心管架, PCR 仪,台式离心机,琼脂糖凝胶电 泳系统,水漂,恒温水浴。4试剂3U/yl Taq DNA 聚合酶,PCR 缓冲液(10x, MgCI2 free), 25mM MgCl2, dNTP,引物,模板质粒 pMD18-T-NK,无菌 dd water。5实验准备dNTP 混合液(每种 25mM), TAE 电泳缓冲液, 1000 溴化 乙锭储存液(0.5mg/ml),10加样缓冲液,1.5ml离心管装入铝制饭盒(灭菌)、移液 器吸头装入相应的吸头盒(灭菌)合成的引物:Sense primer Antisense pri

8、mer目的基因 模板质粒待扩增的NK片段长度6操作步骤(1)在0.2ml PCR微量离心管中配制20口反应体系。(以 下加样量供参考,括号内是最终需要量,实验时需参照Taq酶说 明书计算)dd wate r 13.9|aL10xPCR buffer (含 MgCI2) 2|aL2.5mmol/L dNTP 2LPr ime r1 0.5|aLpr ime r2 0.5|aL模板质粒1yL3U/|al Taq 酶 0.1|aL (3u)总体积20yL( 2 )根据厂商的操作手册设置 PCR 仪的循环程序:94C3min 94C30sec 55C30sec 72C1mingot o35 times 72C10min(3) PCR结束后,取10yL产物进行琼脂糖凝胶电泳。观察 胶上是否有预计的主要产物带。( 4)清理桌面,撰写实验报告。(5)PCR产物可以直接与T载体连接,然后转化感受态细 胞。7思考(1)复性温度如何确定?(2)为什么要在最后延伸 10min?( 3)是否有非特异性扩增产物(或引物二聚体),如何才能消除?

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