《生物化学讲义》由会员分享,可在线阅读,更多相关《生物化学讲义(14页珍藏版)》请在金锄头文库上搜索。
1、第一章 绪论 一、生物化学的概念生物化学是从分子水平研究生物体中各种化学变化规律的科学。因此生物化学又称为生命的化学(简称:生化),是研究生命分子基础的学科。生物化学是一门医学基础理论课。二、生物化学的主要内容 1研究生物体的物质组织、结构、特性及功能。 蛋白质、核酸 2研究物质代谢、能量代谢、代谢调节。研究糖、脂、蛋白质、核酸等物质代谢、代谢调节等规律,是本课程的主要内容。3遗传信息的贮存、传递和表达,研究遗传信息的贮存、传递及表达、基因工程等,是当代生命科学发展的主流,是现代生化研究的重点。三、生物化学的发展史四、生物化学与健康的关系 生化是医学的基础,并在医、药、卫生各学科中都有广泛的应
2、用。 本课程不仅是基础医学如生理学、药理学、微生物学、免疫学及组织学等的必要基础课,而且也是医学检验、护理等各医学专业的必修课程。五、学好生物化学的几点建议 1加强复习有关的基础学科课程,前、后期课程有机结合,融会贯通、熟练应用。 2仔细阅读、理解本课程的“绪论”,了解本课程重要性,激发起学习生物化学的兴趣和求知欲望。 3每次学习时,首先必须了解教学大纲的具体要求,预读教材,带着问题进入学习。 4学习后及时做好复习,整理好笔记。 5学生应充分利用所提供的相关网站,从因特网上查找学习资料,提高课外学习和主动学习的能力。 6实验实训课是完成本课程的重要环节。亲自动手,认真、仔细完成每步操作过程,观
3、察各步反应的现象,详细、科学、实事求是地记录并分析实验结果,独立完成实验报告。第一章 蛋白质的化学一、蛋白质的分子组成(一)蛋白质的元素组成 蛋白质分子主要元素组成:C、H、O、N、S。 特征元素:N元素(含量比较恒定约为16%) 故所测样品中若含1克N,即可折算成6.25克蛋白质。(实例应用) (二)组成蛋白质的基本单位氨基酸(AA) (一)编码氨基酸的概念和种类:蛋白质合成时受遗传密码控制的氨基酸,共有20种 (二)氨基酸的结构通式:L-氨基酸 (甘氨酸除外)(三)氨基酸根据R基团所含的基团,可分为酸性氨基酸(羧基)、碱性氨基酸(氨基及其衍生基团)和极性的中性氨基酸(羟基、巯基和酚羟基)。
4、二、蛋白质的结构与功能(一)蛋白质的基本结构1肽键和肽(1)肽键:一个氨基酸的-羧基与另一氨基酸的-氨基脱水缩合而成的共价键称肽键,肽键是蛋白质分子中氨基酸之间相互连接的主键。整理为word格式(2)肽:氨基酸通过肽键而成的化合物称肽。(3)生物活性肽2蛋白质的一级结构 概念:蛋白质肽链中氨基酸残基的排列顺序,是蛋白质分子的基本结构。意义:是空间结构及其功能的基础。 实例分析: 胰岛素、分子病等(二)蛋白质的空间结构蛋白质在一级结构的基础上进一步折叠、盘曲而成的三维结构,又称构象。 维系空间结构的化学键:氢键、盐键、疏水键和二硫键等 空间结构可分下列层次: 1蛋白质的二级结构 -螺旋、-折叠、
5、-转角和无规卷曲。 2蛋白质的三级结构 特点是多肽链中疏水的氨基酸一般集中在分子内部。有些蛋白质仅有一条三级结构的多肽链,其表面可形成活性中心,具有活性。 3蛋白质的四级结构 亚基的概念、数目、种类三、蛋白质的理化性质和分类(一)、蛋白质的理化性质1两性电离与等电点 蛋白质是两性离子,其分子所带电荷受环境pH的影响。蛋白质的等电点:蛋白质分子呈电中性时的溶液pH值称蛋白质的等电点(pI)。1)蛋白质在pH小于其等电点的溶液中呈阳离子,2)蛋白质在pH大于其等电点的溶液中呈阴离子, 3)蛋白质在pH和其等电点相同的溶液中不带电,此时溶解度最低,易于沉淀析出。 临床应用:电泳技术电泳:带电颗粒在电
6、场中朝与其所带电荷相反的方向泳动,称电泳(electrophoresis)。电泳技术是目前分离、提纯、鉴定蛋白质最常用的方法之一。2蛋白质的亲水胶体性质 临床应用:盐析(salt precipitaion)、有机溶剂沉淀法3蛋白质的沉淀1)盐析法 2)有机溶剂沉淀法 3)生物碱试剂法 4)重金属沉淀法4蛋白质的变性 :蛋白质在理化因素作用下,使蛋白质分子的空间结构破坏,理化性质及生物学活性丧失的过程。 引起蛋白质变形的因素:(举例:物理因素、化学因素和生物因素)变性的本质:非共价键断裂,使蛋白质分子从严密有规则的空间结构变成松散紊乱的结构状态。 蛋白质变性的实际应用举例:应用变性的实例、防止变
7、性的实例5紫外吸收性质及呈色反应 在280 nm具有紫外吸收的特点 临床应用:用280nm 吸收值测定对蛋白质进行定性和定量。(二)蛋白质的分类1按分子形状分类 球状蛋白质、纤维状蛋白质2按组成分类 单纯蛋白质、结合蛋白质第二章 核酸的化学整理为word格式核酸的分类、分布与生物学功能分 类 分 布 生物学功能核糖核酸(RNA)细胞质 参与蛋白质的生物合成mRNA (信使RNA )5 % Pr合成的直接模板tRNA (转运RNA )15 % 活化与转运AArRNA(核蛋白体RNA)80 % 充当装配机,提供场所脱氧核糖核酸(DNA)核内染色质 遗传的物质基础*一、核酸的分子组成(一)组成成份1
8、碱基 A G C U T2戊糖3磷酸 比较两类核酸的化学组成 组成成分 DNA RNA 磷酸 磷 酸 磷 酸 戊糖 2-脱氧核糖 核 糖 碱基 A G C T A G C U (二)组成核酸的基本单位核苷酸1核苷 2核苷酸二、核酸的分子结构 (一)核酸分子的一级结构(二)核酸分子的空间结构1DNA的二级结构双螺旋结构,其主要特点是: 1)两条链方向相反、相互平行、主链是磷酸戊糖链,处于螺旋外侧。 2)碱基在螺旋内侧并配对存在,A与T配对的G与C配对,A与T之间二个氢键相连(A-T),G与C之间三个氢键相链(G-C)。 3)螺旋直径2nm,二个碱基对平面距0.34mm,10bp为一螺距,距离为3
9、.4nm。 4)稳定因素主要是碱基之间的氢键和碱基对平面之间的堆积力。 DNA的二级结构的生物学意义: 1)提出了遗传信息的贮存方式、DNA的复制机理 2)是DNA复制、转录和翻译的分子基础2RNA的空间结构tRNA二级结构特点:呈三叶草形,有三环四臂。 第三章 酶一、酶的概述(一)酶的概念 1酶的定义:酶是由活细胞产生的生物催化剂,本质为蛋白质,具有高度专一性和高效的催化作用。整理为word格式 2酶促反应、底物和作用物(二) 酶促反应的特点1高度的催化效率在常温常压及中性pH条件下,酶比一般催化剂的催化效率高107 -1013 倍。2高度催化专一性酶对所作用的底物有严格的选择性,从酶对底物
10、分子结构要求不同,可分三种专一性: 1)对专一性:一种E只能催化一种S (脲酶) 2)相对专一性:一种E只能催化一类S (一种化学键/水解酶类) 3)立体异构专一性:一种E只能催化一种S的某一种特定构型( LDH - 乳酸脱氢酶 ) 3高度的不稳定性(易受变性因素影响而失活)二、 酶的结构与功能(一)酶的分子组成1单纯蛋白酶 如蛋白酶、淀粉酶、脂酶等水解酶。2结合蛋白酶:酶蛋白 + 辅助因子 (结合成全酶才有活性) 1)酶蛋白: 决定催化反应的特异性 (选择E催化的S) 2)辅助因子:决定催化反应的类型(递电子、氢或一些基团) 主要有金属离子和有机小分子(辅基/辅酶)参与组成(二)酶的活性中心
11、与必需基团1活性中心:存在于酶分子表面的局部空间区域(构象),由必需基团所组成功能:结合底物并催化底物进行反应2必需基团:与酶活性中心有关的功能基团(酶发挥催化作用所需要基团),一般指分布在酶分子表面的极性基团,包括-COOH、-NH2、-OH、-SH、咪唑基等。功能:在活性中心内(活性中心的组份)有结合基团和催化基团 在活性中心外维持构象稳定(三)酶原与酶原激活1概念:在细胞内合成或初分泌时,只是酶的无活性前体酶原2酶原激活:在一定条件下,使酶原转化成活性的酶,称酶原的激活。酶原激活的过程通常是在酶原分子中切除部分肽段,从而有利于酶活性中心的形成或暴露。 3意义:在特定条件下被激活,可调节代
12、谢、保护自体 ( 避免细胞自身消化,保持血流畅通 ) 许多蛋白水解酶如消化腺分泌的蛋白酶、参于血液凝固的酶和溶解纤维蛋白凝块的酶均以酶原形式存在,发挥作用前需先经过加工。 实例:胰蛋白酶原激活(四)同工酶1概念:催化功能相同,但酶蛋白的组成与结构等均不同的一组酶 特点:a. 存在于同一种属或同一个体的不同组成或同一组织同一细胞中。 b. 一级结构不同,理化性质包括带电性质不同,免疫学性质不同,但空间结构中 的活性中心相同或相似。 c. 往往是四级结构的酶类。 d. 已发现一百多种酶具有同工酶性质。发现最早研究最多的是乳酸脱氢酶,它有五种同工酶。临床测定同工酶酶谱的变化,多用于疾病的诊断和鉴别诊
13、断。整理为word格式2组成、分型、分布、命名和医学应用 以乳酸脱氢酶为例:LDH是由2种亚基组成的四聚体,共有5种分型。LDH同工酶在诊断中的意义:心肌炎:LDH1,肺梗塞:LDH3,肝炎:LDH5三、酶催化反应的动力学影响酶促反应的因素有酶浓度、底物浓度、pH、温度、激活剂等。必需采用测定反应初速度的条件。(一)底物浓度的影响 矩形双曲线(二)酶浓度的影响 在底物浓度足够高时,酶促反应速度与酶浓度呈正比。(三)pH的影响酶活性最高时的pH值称酶的最适pH。 大多数酶最适pH值在7左右,亦有偏酸和偏碱的例外。(四)温度的影响最适温度:最大酶促反应速度时的温度。(五)激活剂对反应速度的影响1凡能提高酶活性的物质称激活剂(activator)。2通常分必需激活剂和非必需激活剂两类,前者多为金属离子。(六)抑制剂对酶促反应速度的影响 凡使酶活性降低或丧失的作用称抑制作用,使酶活性起抑制作用的物质称抑制剂。根据抑制剂与酶结合的方式不同,抑制作用可分为不可逆抑制和可逆抑制两大类。