高级生物化学实验指导

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1、高级生物化学实验指导四川农业大学生化研究室 二零一二年十月目录实验一 猪血中超氧化物歧化酶(sod)的分离纯化及活力测定、 同工酶电泳.1实验二 蛋白质分子量测定-凝胶层析法8实验三 纳米磁珠法小规模提取质粒DNA及纯化鉴定18实验四 DNA的琼脂糖凝胶电泳21实验一 猪血中超氧化物歧化酶(sod)的分离纯化及活力测定、 同工酶电泳 一、原理 超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)是一种能专一地清除超氧离子自由基(O2-)的金属酶,他具有抗衰老.抗辐射、抗炎和抗癌等作用,因而在医药化妆品、食品工业等方面具有了广泛地应用前景。 SOD是一种酸性蛋白,对热、PH和蛋白酶

2、的水解较一般酶稳定。按照它所含金属离子的不同,可分为Cu-Zn-SOD、Mn-SOD、Fe-SOD等三种。Cu-Zn-SOD为二聚体,呈蓝绿色;Mn-SOD呈紫红色;Fe-SOD呈褐色。SOD催化下述反应:2H+2O2-H2O2+O2。机构内0-的过量和不足均对集体不利,SOD对过量的02-的及时清理保证了集体内02-的含量相对平衡。集体内的O2-的形成可病理性和生理性两方面。在一些正常的生理过程中形成一些02-。例如:呼吸链中电子传递结果可以产生一些O2-。在某些疾病的过程产生大量02-如不及时清理,会对细胞损伤。SOD将02-,歧化为H202,而过氧化酶、股胖肝泰过氧化酶可以催化过氧化氢分

3、解,在集体内形成一套解毒系统,对集体起防护作用。本实验采用邮寄溶剂沉淀方法以新鲜猪血为原料,从中提取SOD并惊醒纯化。酶活力测定可用以下方法;邻苯三分自氧化法、黄嘌呤氧化酶法、NBT光还原法、化学发光法、肾上腺自氧化法、亚硝酸法等。该实验sod酶活性采用邻苯三分自氧化法测定,酶活性单位定义为:每毫升反应中,每分钟抑制邻苯三分氧化速率达50%的酶含量定义为一个酶的单位。样品中的蛋白质含量用考马斯亮蓝G-250法测定。考马斯蓝G-250Coomassic brilliant blue G-250)在在游离状态下呈紫色,与蛋白质结合呈现蓝色。在一定范围内,溶液在595nm波长下的光密度与蛋白质含量成

4、正比,可用比色法测定,测定范围1-1000ug。SOD同工酶鉴定采用不连续聚丙烯酰酰胺凝胶电泳技术分离鉴定。用“负”显色法,核黄素经光照所产生的活性氧O2-(氧自由基)能使氯化硝基四氮嗟蓝(NBT)由黄色的氧化型转化为蓝色的还原型。由于SOD能够抑制O2-的作用,因此,电泳分离SOD后,凝胶上无SOD处应显示为蓝色,而有SOD处则无色透明,由此可鉴定SOD同工酶的酶谱(即同工酶的数量、分布及活性大小)。二、 实验试剂与器材试剂1. SOD的提取ABC抗凝剂:柠檬酸10g,柠檬酸钠30g,葡萄糖25g,用适量蒸馏水溶解并稀释至1000ml.0.9%NaCl0.9g,溶于100ml蒸馏水中。丙酮9

5、5%乙醇氯仿2. SOD活力测定50mmol/L pH8.3磷酸缓冲液10mmol/L EDTA钠盐溶液3mmol/L 领苯三酚溶液(用10mmol/L盐酸配制)3. 考马斯亮蓝G-250法测蛋白质考马斯亮蓝G-250试剂:称取100mg考马斯亮蓝G250,溶于50ml95%乙醇中,加入100ml85%(W/V)的磷酸,蒸馏水定容至1000ml。此试剂常温下可保存30天。标准蛋白质溶液:精确称取结晶牛血清白蛋白25mg,加蒸馏水溶解并定容至100ml。吸取上述溶液40ml,用蒸馏水稀释至100ml,即为100ug/ml的标准蛋白质溶液。4. SOD同工酶鉴定40%蔗糖w/v:称取40g蔗糖加重

6、蒸水100ml。10%过硫酸铵Ap:称过硫酸铵10g,溶于100ml重蒸水中。用时现配。电极缓冲液:称取三时配羟甲基氨基甲烷6g,甘氨酸28.8g。用蒸馏水溶解并定容至1000ml,过滤后装入棕色瓶,4保存。30%的AcrBis溶液:称Acr30g,Bis0.8g,加重蒸馏水溶解,定容至100ml,过滤后装入棕色瓶,4保存。Tris-HCL,ph6.7缓冲溶液:Tris6.0g,加入1mol/L HCL 48ml,TEMED0.4ml,用浓盐酸调PH8.9后,再用蒸馏水定容至100ml。Tris-HCI,PH6.7缓冲溶液:Tris6.0g,加1mol/L HCL 48ml,TEMED0.4m

7、l,用浓盐酸调至PH6.7后,再用蒸馏水定容至100mlNBT溶液:核黄素吗(0.01%),氯化硝基四氮嗟蓝(NBT)(25mol/L),磷酸缓冲液(0.05mol/L)、PH7.8),EDTA-Na2(1.0mol/L)。2.810(3)mol/L的EDTA-Na2(用PH7.8/,3.610(3)moL/L磷酸缓冲液配制)器材752分光光度计;分析天平;具塞试管;刻度吸管;(1ml,5ml);离心机;烧杯(50ml)电泳装置一套;微量进样器;注射器。 三、操作步骤1. SOD的提取 1取新鲜猪血20ml(预先0.15:1(v/v)的比例加入ACD抗凝剂),4000r/m,10min,去上层

8、血浆,取下层红血球粘稠液,并量其体积,然后加入2倍体积的0.9%NaCl溶液清洗,4000r/m,10min,弃上层清液,再加入2倍体积的0.9%Nacl溶液重复清洗一次,4000r/m,10min,得洗净的红血球浓稠液。2向洗净的红血球中加入等体积的蒸馏水,剧烈搅拌30min,使其充分溶血。再向溶血液中缓慢加入预冷的0.25倍体积的95%乙醇溶液和0.15倍体积的氯仿,匀浆呈暗红色,再继续搅拌15min,4000r/m,10min,去变性蛋白沉淀物,得上层液,留样2ml。将上层液用多层纱布进行粗滤,以除去上层液中的漂浮物,然后将清夜在65-70恒温水浴中进行热处理,15min后取出迅速冷却至

9、室温,4000r/m,15min除沉淀,得浅黄色粗酶液,留样2ml。3向粗酶液中加入等体积的丙酮溶液,冰箱中静置过液,4000r/m,10min弃上清液,得沉淀。将沉淀物用等体积预冷的丙酮溶液洗二次,离心收集沉淀,自然干燥即得淡绿色成品,按1mg/ml溶于蒸馏水,备用。2.SOD活力测定 1邻苯三酚自氧化率的测定 取405ml50mol/L pH8.3的磷酸缓冲液,4.2ml蒸馏水和1ml10mol/LEDTA-Na2溶液,混匀后在25水浴保温20min,取出后立即加入25预热过的邻苯三酚溶液0.3ml,迅速摇匀,倒入光径1cm的比色杯内,用10mol/L HCI作空白,325nm波长下每隔3

10、0秒测光密度值一次,整个操作在4min内完成,计算出每分钟A325的增值,此即为邻苯三酚自氧化率。要求自氧化氯控制在0.070/min左右。 2酶活力测定 操作与1一致,加入邻苯三酚前,先加入0.1ml的SOD样液,蒸馏水则减少相应的体积,同理测其光密度值,计算加酸后邻苯三酚自氧化氯。 3酶活性单位的计算 根据酶活性单位的定义,按下列公式计算酶活性: (A0-Am)/A0*100% 样液稀释倍数单位活性(U/ml)=-*反应液总体积数*- 50% 样液体积 其中,A0为邻苯三酚自氧化氯;Am为加酶后邻苯三酚自氧化氯。 总结性(U)=单位活性*酶原液总体积 4蛋白质含量测定(考马斯亮蓝G-250

11、法) 标准曲线的制作:取6支具塞试管,编号,按下表加入试剂: 管 号 试 剂 1 2 3 4 5 6 蛋白质标准液(ml) 0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0蒸馏水(ml) 1.0 0.8 0.6 0.4 0.2 0考马斯亮蓝G-250(ml) 5 5 5 5 5 5蛋白质含量(ug) 0 20 40 60 80 100 塞上盖子,摇匀。注意各管振荡程度尽量一致。在595nm波长下比色测定光密度值,比色应在1h内完成。以牛血清蛋白质含量(ug)为横坐标,光密度值为纵坐标,绘出标注曲线。 样品中蛋白质含量的测定 将待测的SOD溶解并解释到一定浓度,取1支具塞试管,准确加入0.1ml样品提

12、取液,加入0.9ml蒸馏水和5ml考马斯亮蓝G-250试剂,其余操作与标准曲线制作相同。 蛋白质含量计算 根据所测样品提取液的光密度,在标准曲线上查到相应的蛋白质含量,计算其浓度。 5结果处理 利用考马斯亮蓝G-250法测定每毫升酶原液蛋白质毫克数。 单位活力(U/ml) 总活力 比活力(U/mg)=- = - 单位蛋白质浓度(mg/ml) 总蛋白质(mg) 将测定的数据或计算结果填入下表:提纯步骤 酶液总体积 蛋白质 酶活性 总活性 比活性 回收率 纯化倍数 ml mg/ml U/ml U U/mg % 除血蛋白血清热变性后上清丙酮沉淀后的3.SOD同工酶鉴定(PAGE) 1样品制备 取一定

13、浓度(约SOD0.5mg/ml)酶液,按酶液:40%蔗糖=1:1(V: V)的比例配成样品液,备用。 2上样及电泳 组成电泳槽:将四只固定螺杆插入一只贮槽的相应空洞中,然后将贮槽框放在桌上。左手拿凹形带槽橡胶模框,右手的拇指与中指握住短玻璃板的两侧边缘插到橡胶模框的短槽内,然后以同样方式将长玻璃极插到相应的长槽内,将带有长、短玻璃板的橡胶模框平放在仰放的贮槽框架上,其下缘必须对齐贮槽框下缘。双手拿另一只贮槽框仰放在桌上的贮框相会,并使橡胶模框上的凸出线位于贮槽的有机玻璃框的中央。装上四只螺母。拧紧螺丝。最好用双手按斜角位置双双逐渐拧紧。将电泳槽垂直置起,放在桌上,带短玻璃板的贮槽称上槽,带长玻璃板的贮槽称下槽,在长玻璃板与胶模框间有一缝隙。此缝隙可用已溶化的1%琼脂沿长玻璃板下端灌入,以防止产生气泡。待琼脂完全凝固后才能灌胶。1凝胶的制备

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