生物化学计算题(DOC 7页)

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1、生物化学计算题:1、 计算赖氨酸的 20%被解离时的溶液pH。解答: 80% 20% 2、计算谷氨酸的三分之二被解离时的溶液pH。解答: 1 23、向1 L 1 mol/L 的处于等电点的甘氨酸溶液加入0.3 mol HCl, 问所得溶液的pH值是多少?如果加入0.3 mol NaOH 以代替HCl 时,pH 将是多少?解答:(1) 1-0.3 0.3 0.3(2) 0.7 0.3 4、计算0.25 mol/L 的组氨酸溶液在pH 6.4时各种离子形式的浓度(mol/L)。解答: 同理得:设解上述方程得: 组氨酸主要以形式存在。5、分别计算谷氨酸、精氨酸和丙氨酸的等电点。解答:(1) 根据谷氨

2、酸的解离曲线,其pI应该是它的羧基和侧链羧基的pKa之和的算术平均 值。即:pI=(2.19 + 4.25)/2 =3.22;(2) 精氨酸pI应该是它的氨基和侧链胍基的pKa之和的算术平均值,即pI=(9.04 + 12.48)/2 =10.76;(3) 丙氨酸pI应该是它的氨基和羧基pKa值之和的算术平均值,即pI=(2.34 + 9.69)/2 =6.02;6、计算下列肽的等电点。(1)天冬氨酰甘氨酸 (2)谷胱甘肽(3)丙氨酰丙氨酰赖氨酰丙氨酸末端COOH pK=3.58,末端pK=8.01,pK=10.58解答:(1) Asp-Gly 二肽的解离情况如下: 两性离子 (2) 谷胱甘肽

3、中Glu的羧基形成肽键,解离情况如下:(3) AlaAlaLysAla四肽的解离情况如下:。7、 (a)计算一个含有78个氨基酸的螺旋的轴长。(b)计算此螺旋完全伸展时有多长?解答:(a)含有78个氨基酸的螺旋的轴长为l =780.15 nm =11.7nm(b)此螺旋完全伸展时的长度为L=780.36 nm =28.08nm8、某一蛋白质的多肽链除一些区段为螺旋外,其余区段均为构象。该蛋白质为240 000,多肽链外形的长度为cm。试计算螺旋占该多肽链的百分数(假设构象中每氨基酸残基的长度为0.35nm)。解答:设该多肽链中螺旋的氨基酸残基数为x,氨基酸残基总数为y。解得 即螺旋占该多肽链的

4、百分数为59%。9、某油脂的碘值为68,皂化值为210。计算该油脂每个分子中含有多少个双键。解答:该油脂的平均相对分子质量:根据碘值的定义:100g油脂卤化时所能吸收的碘的克数。在本题中,皂化1mol油脂需要吸收碘的克数为:。的相对分子质量=2126.9=253.8. g/mol 544/253.8=2.14(mol)。因此平均每分子油脂含有两个双键。10、从植物种子中提取1g油脂,分成两份,分别测定该油脂的皂化值和碘值。测定皂化值的样品消耗KOH 65 mg,测定碘值的样品消耗510mg。试计算该油脂的平均相对分子质量和碘值。解答:皂化值:是指皂化1g油脂所需KOH的质量(mg)。因此该油脂

5、的皂化值:65 mg /0.5g=130;油脂的平均相对分子质量:。碘值:指100g油脂卤化时所能吸收的碘的克数。该油脂的碘值=(100/0.5)0.51=102。11、称取25mg蛋白酶配成25mL溶液,取2mL溶液测得含蛋白氮0.2mg,另取0.1mL溶液测酶活力,结果每小时可以水解酪蛋白产生1500g酪氨酸,假定1个酶活力单位定义为每分钟产生1g酪氨酸的酶量,请计算:(1)酶溶液的蛋白浓度及比活力。(2)每克纯酶制剂的总蛋白含量及总活力。解答:(1)蛋白浓度=0.26.25mg/2mL=0.625mg/mL; (2)比活力=(1500/601ml/0.1mL)0.625mg/mL=400

6、U/mg; (3)总蛋白=0.625mg/mL1000mL=625mg; (4)总活力=625mg400U/mg=2.5105U。12、对于一个遵循米氏动力学的酶而言,当S=Km时,若V=35mol/min,Vmax是多少mol/min?当S=210 -5mol/L,V=40mol/min,这个酶的Km是多少?若I表示竞争性抑制剂,KI=410-5mol/L,当S=310-2mol/L和I=310-5mol/L时,V是多少?解答:(1)当S=Km时,V=1/2Vmax,则Vmax=235=70mol/min;(2)因为V=Vmax/(1+Km/s),所以Km=(Vmax/V-1)s=1.510

7、 -5mol/L;(3)因为SKm,I,所以V=Vmax=70mol/min;13、如果人体有1014个细胞,每个体细胞的DNA含量为6.4109个碱基对。试计算人体DNA的总长度是多少?是太阳-地球之间距离(2.2109公里)的多少倍?已知双链DNA每1000个核苷酸对重110-18g,求人体的DNA的总质量。每个体细胞的DNA的总长度为:6.41090.34nm = 2.176109 nm= 2.176m人体内所有体细胞的DNA的总长度为:2.176m1014 = 2.1761011km这个长度与太阳-地球之间距离(2.2109公里)相比为:2.1761011/2.2109 = 99倍。每

8、个核苷酸对重:110-18g/1000=10-21g总DNA质量: 6.4102310-21=6.4102=640g。14、1mol甘油完全氧化成CO2和H2O时净生成多少mol ATP?假设在线粒体外生成的NADH都通过磷酸甘油穿梭进入线粒体。(要求:有分析步骤,可用简图示出所经历的主要代谢过程)甘油磷酸化消耗 -1ATP 磷酸甘油脱氢 + NADH +1.5 ATP(NADH穿梭) 磷酸甘油醛脱氢 + NADH +1.5 ATP(NADH穿梭) 1,3-二磷酸甘油酸 + 1ATP 磷酸烯醇式丙酮酸 + 1ATP 丙酮酸氧化生成乙酰CoA + NADH +2.5ATP 乙酰CoA进入三羧酸循

9、环彻底氧化 +10ATP 乙酰CoA+3 NAD+ +FAD+GDP +Pi2 CO2 +3 NADH +3H+FADH2+GTP 1mol甘油完全氧化成CO2和H2O时净生成ATP +16.5molATP 乙酰CoA进入三羧酸循环彻底氧化涉及能量产生的主要代谢过程: 、 1分子乙酰CoA通过三羧酸循环可直接生成1分子GTP、3分子NADH+H+、1分子。1分子NADH+H+ 通过氧化磷酸化生成2.5分子ATP,1分子生成1.5分子ATP。所以1分子乙酰CoA彻底氧化生成1+32.5+11.5=10分子ATP。15、1mol乳酸完全氧化成CO2和H2O时净生成多少mol ATP?假设在线粒体外

10、生成的NADH都通过磷酸甘油穿梭进入线粒体。(要求:有分析步骤,可用简图示出所经历的主要代谢过程) 乳酸脱氢酶乳酸+NAD 丙酮酸+NADH,此反应在细胞溶胶(细胞浆)中进行。在肝脏细胞匀浆体系中,细胞溶胶中生成的NADH是通过磷酸甘油穿梭系统进入线粒体内氧化。丙酮酸+NAD乙酰CoA + NADH(线粒体,丙酮酸脱氢酶系)乙酰CoA进入三羧酸循环 乙酰CoA+3 NAD+ +FAD+GDP +Pi2 CO2 +3 NADH+3H+ +FADH2+GTP 1摩尔乳酸彻底氧化成CO2和H2O生成ATP的摩尔数为:10+1.5+2.5 =14 ATP 16、试比较硬脂肪酸、油酸、亚油酸以及亚麻酸完

11、全氧化产生的ATP数。解答:硬脂肪酸为18碳饱和脂肪酸,经8次氧化产生8分子NADH+H+、8分子和9分子的乙酰CoA,脂肪酸的激活消耗2个ATP,所以硬脂肪酸完全氧化产生的ATP数: 含有一个或多个不饱和双键的脂肪酸完全氧化除了需要氧化的酶以外,还需要3顺2反烯脂酰CoA异构酶、2,4二烯酰脂CoA还原酶和2,3二烯酰脂CoA异构酶参与。从能量角度看,多1个双键,会少1次酰基CoA脱氢酶催化的脱氢反应,少生成1个,因此亚油酸完全氧化产生的ATP总数应是1203=117(个),同理,油酸应产生1201.5=118.5个ATP,亚麻酸应该产生1204.5=115.5个ATP。17、试比较1分子软

12、脂肪酸和8分子丙酮酸彻底氧化所生成ATP的数量,并简要写出与能量相关的反应过程。解答:软脂肪酸氧化时与能量相关的反应过程:能量过程:, ATP AMP 与产能相关的过程: 1分子软脂酸含16个碳原子,每一次氧化生成1分子、1分子NADH+H+,脱下1分子乙酰CoA,最后一次丁酰CoA彻底氧化生产2分子乙酰CoA,故软脂酸彻底氧化共进行7次氧化,产生7分子,7分子NADH+H+和8分子乙酰CoA,1分子NADH通过呼吸链生成2.5分子ATP,1分子通过呼吸链生成1.5分子ATP,故生成总数为:71.5+72.5+810-2=106分子ATP。丙酮酸氧化时与能量相关的反应过程: 、 故1分子丙酮酸通过三羧酸循环可直接生成1分子GTP、4分子NADH+H+、1分子。1分子NADH+H+ 通过氧化磷酸化生成2.5分子ATP,1分子生成1.5分子ATP。 所以1分子丙酮酸彻底氧化生成1+42.5+11.5=12.5分子ATP。

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