高等生化实验报告:蛋白质分子量的测定

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1、实验一蛋白质分子量的测定一凝胶层析法一、原理凝胶层析法也称分子筛层析法,是利用具有一定孔径大小的多孔 凝胶作固定相的层析技术。当混合物随流动相经过凝胶层析柱时,其 中各组分按其分子大小不同而被分离的技术。该法设备简单、操作方 便、重复性好、样品回收率高。凝胶是一种不带电的具有三维空间的多孔网状结构、呈珠状颗粒 的物质,每个颗粒的细微结构及筛孔的直径均匀一致,像筛子,小的 分子可以进入凝胶网孔,而大的分子则排阻于颗粒之外。当含有分子 大小不一的蛋白质混合物样品加到用此类凝胶颗粒装填而成的层析 柱上时,这些物质即随洗脱液的流动而发生移动。大分子物质沿凝胶 颗粒间隙随洗脱液移动,流程短,移动速率快,

2、先被洗出层析柱;而 小分子物质可通过凝胶网孔进入颗粒内部,然后再扩散出来,故流程 长,移动速度慢,最后被洗出层析柱,从而使样品中不同大小的分子 彼此获得分离。若分子大小介于上述完全排阻或完全渗入凝胶的物 质,则居二者之间从柱中流出。总之,各种不同相对分子质量的蛋白 质分子,最终由于它们被排阻和扩散的程度不同,在凝胶柱中所经过 的路程和时间也不同,从而彼此可以分离开来。将凝胶装在柱后,柱床体积称为“总体积”以Vt表示。实质上 Vt是由Vo, Vi与Vg三部分组成,Vo称为“孔隙体积”或“外水体 积”,即存在于柱床内凝胶颗粒外面空隙之间的水相体积,相应于一 般层析法中柱内流动相的体积;Vi为内体积

3、,即凝胶颗粒内部所含水 相的体积。Vg为凝胶本身的体积。洗脱体积(Ve)与Vo与Vi之间 的关系可用下式表示:Ve=Vo+KdVi。式中Ve为洗脱体积,自加入样品时算起,到组分最大浓度(峰) 出现时所流出的体积;Kd为样品组分在二相间的分配系数,也可以 说Kd是分子量不同的溶质在凝胶内部与外部的分配系数。它只与被 分离的物质分子的大小和凝胶颗粒孔隙的大小分布有关,而与柱的长 度粗细无关,也就是说它对每一物质为常数,与柱的物理条件无关。 Kd可通过实验求得,上式可以改写为:Kd=(Ve-Vo)/Vi。上式中Ve为实际测得的洗脱体积;Vo可用不被凝胶滞留的大分 子物质的溶液(最好是有颜色以便于观察

4、,如血红蛋白,印度黑墨水, 分子量约200万的蓝色葡聚糖-2000等)通过实际测量求得;Vi可由 gXWr求得(g为干胶重量,单位为克;Wr为凝胶的“吸水量”,以 毫升每克表示)。因此,对一层析柱胶床来说,只要通过实际实验得 知某一物质的洗脱体积就可算出它的Kd值。如果假定蛋白质分子近于球形,同时没有显著的水合作用,则不 同大小分子量的蛋白质,在洗脱时峰的位置和该物质相对分子质量有 直接的定量的关系。在一根凝胶柱中,凝胶颗粒间空隙所含水相体积 为外水体积Vo,不能进入凝胶孔径的那些大分子,当洗脱体积为Vo 时,出现洗脱峰。凝胶颗粒内部孔穴的总体积为内水体积Vi,能全部渗入凝胶的那 些小分子,当

5、洗脱体积为Vo+Vi时,出现洗脱峰。Ve与分子量的关 系:对同一类型的化合物,洗脱特性与组分的分子量有关,流过凝胶 柱时,按分子量大小顺序流出,分子量大的走在前面。Ve与分子量 的关系可用下式表示:Ve=K1-K2logM,式中M为相对分子质量,K1 和K2为常数,Ve也可用Ve-Voo二、仪器和试剂1. 标准蛋白质:蓝色葡聚糖-2000 (200KD)、牛血清蛋白(67KD)、胃蛋 白酶(36KD)、CytC(13.7KD)等,均为分析纯。2. 仪器:层析柱核酸蛋白检测器(或紫外分光光度计)、自动部分收集 器、刻度管。3. 试剂:蓝色葡聚糖 2000、SephardexG-75、洗脱液: 0

6、.2mol/LTris-HCL-KCL,PH7.5。三、实验步骤测定蛋白质的分子量根据需要可选用SephadexG-75、G-100或 G-150型凝胶,凝胶颗粒一般在40120微米,柱管选用直径1.0-1.3cm,高 90-100cm。1.标准曲线的制定:层析柱用1.2 100cm,凝胶用SephadexG-75或 G-100o(1)蛋白质标准样品混合液:分别称取4mg蓝色葡聚糖-2000(200KD)、牛血清蛋白(67KD)、胃蛋白酶(36KD)、CytC(13.7KD)共同 溶于 2ml PH7.5 0.025mol/L Tris-Hcl 缓冲液中。(2 )上柱和洗脱:将标准样品混合液上

7、柱,然后用PH7.50.025mol/L Tris-Hcl缓冲液洗脱,流速15d/min,2ml/管,用部分收集 器收集,紫外检测仪280nm出检测,或收集后用紫外分光光度仪于 280nm出测定每管OD值,以管号(或洗脱体积)为横坐标,0D值 为纵坐标绘出洗脱曲线。根据洗脱峰位置量出每种蛋白质的洗脱体积(Ve)。然后以蛋白 质分子量的对数(lgM)为横坐标,Ve为纵坐标,作出标准曲线。为 了结果可靠,应以同样条件重复1-2次,取Ve平均值作图。2.未知数品分子量的测定:完全按照标准曲线的条件操作,根据紫外线检测的洗脱峰位置,得出体积。重复1-2次,取其平均值,由 标准曲线可查得样品的分子量。四

8、、实验结果牛血清蛋白蓝色葡聚糖-2000Ve (ml)OD值Ve (ml)OD值00.04100.03920.04120.00640.1640.0056060.00180.0180100.025100.015120.223120.341140.115140.15160.039160.07180.12180.048200200.04胃蛋白酶CytcVe (ml)OD值Ve (ml)OD值00.0270020.02920.00740.02440.02160.02660.01980.02680.018100.031100.076120.039120.185140.131140.252160.3041

9、60.215180.315180.118200.676200.077220.105220.057240.042240.047260.02260.034280.07280.025300.05300.013320320.01340.008作出洗脱曲线:牛血清白蛋白图表标题蓝色葡聚糖-2000胃蛋白酶图表标题Cytc绘出标准曲线如下:五、讨论1. 从洗脱曲线上可以看出,出现了四个较明显的峰值(实验结果较为 理想):OD:0.233(Ve=12ml),0.341 (Ve=12ml),0.676 (Ve=20ml),0.252(Ve=14ml),分别对照试验中所加样的四种蛋白质。由于分子量大的 先洗脱出来,小分子量的蛋白后洗脱出来,因此洗脱顺序是蓝色葡聚糖-2000(200KD),牛血清白蛋白(67KD),胃蛋白酶(36KD),Cytc(13.7KD)。可能由于洗脱体积间差距较小,且每管体积为整数,导 致牛血清蛋白和胃蛋白酶之间洗脱体积差距未能体现出来2. 有标准曲线可以看出胃蛋白酶峰值出现的体积与其它三种样品差 距较大,不太符合正常规律,猜测可能是由于实验过程中的操作不规 范造成的。另外实验过程中,可能由于加样时凝胶柱上层部分遭到轻 微破坏,导致部分数据不太准确。

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