二维电泳详细过程

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1、北京六一仪器厂DYCZ-26C双向电泳系统检测报告技术部吴承疆QQ:50894034实验原理:双向电泳是一种分析从细胞、组织或其他生物样本中提取的蛋白 质混合物的有力手段,已得到广泛应用。这项技术利用蛋白质的两种 特性,分两步将不同的蛋白质分离。第一向步骤为等电聚焦(IEF),即根据蛋白质的等电点(pl) 差异将蛋白质分离。第二向步骤为十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶 电泳(SDS-PAGE),即利用蛋白质的分子量(Mr,相对分子量)差异 将蛋白质分离。双向凝胶电泳结果中的每个斑点都对应着样本中的一 种蛋白。因此,可将上千种不同的蛋白质分离开来,并得到每种蛋白 质的等电点、表观分子量等信息。实验

2、方法:一.实验材料:1主要仪器和试剂(sigma,Ampholine购自GE)主要试剂超纯水(M让iQ)、尿素(Urea)、硫脲(Thiourea)、二硫苏糖醇(Dithiothreitol, DTT)、CHAPS (3-3-(胆酰氨丙基)二甲氨基丙磺酸内盐)、 Ampholine (PH 3-10 或 4-7 5-8)碘乙酰胺(Iodoacetamide, IAA)、EDTA-Na2(乙二胺四乙酸(Ethylenediaminetetraaceticacid)、十二烷基磺酸钠(Sodium Dodecylsulphate, SDS)、溴酚蓝(Bromophenol Blue)、低熔点琼脂糖、

3、过硫酸 铵(Ammonium Persulfate APS)、TEMED (四甲基乙二胺)、丙烯酰胺、甲叉双丙 烯酰胺;Tris碱、甘氨酸、硝酸银、无水碳酸钠、无水乙酸钠、硫代硫酸钠、 甲醛、无水乙醇、冰醋酸、氢氧化钠、磷酸、甘油(丙三醇glycerin )、牛血 清白蛋白(Bovine Serum Albumin, BSA)、蛋白质marker、蛋白定量试剂盒主要仪器DYCZ-26C、DYY-16D、DYY-6D、高速冷冻离心机、紫外分光光度计、0.1毫 克级电子分析天平、超声波细胞破碎仪、Millipore纯水仪(法国)、Eppendorf 普通离心机、beckman高速冷冻离心机、瞬时离

4、心机、恒温磁力搅拌器、UMAX 扫描仪(台湾);恒温摇床、pH计、恒温振荡器等。本次试验材料:动物组织二.实验试剂的配制尿素8MCHAPS4%DTT65mM2%Ampholine(40%)溴酚蓝0.001% 10“样品裂解液4.805g0.4g0.098g (现加)每小管5毫克0.5 ml (现加)每小管25微升(1%溴酚蓝)MilliQ水定容至10ml,分装成20小管,每小管500uL, -20C冰箱保存样品覆盖液(含8 mol/L尿素,1% Ampholine)取4.8g新鲜尿素(超纯),0.3 ml Ampholine,用去离子水定容至10mL,分装,每管含有100L,置于-20C冰箱内

5、保存。胶条平衡缓冲液母液尿素6M36gSDS2%2gTris-HCl0.375M pH8.825ml( 1.5M pH8.8 Tris-HCl)甘油20%20mlMilliQ水 定容至100ml分装成10管,每管10ml,-20C冰箱保存。 胶条平衡缓冲液I胶条平衡缓冲液母液10mlDTT0.2g充分混匀,用时现配。胶条平衡缓冲液II胶条平衡缓冲液母液10ml碘乙酰胺0.25g充分混匀,用时现配。低熔点琼脂糖封胶液低熔点琼脂糖0.5%0.5gTris25mM0.303g甘氨酸192mM1.44gSDS0.1%1ml(10% SDS)溴酚蓝0.001%1001( 1%溴酚蓝)MilliQ水 定容

6、至100ml加热溶解至澄清,室温保存。第一向聚丙烯酰胺凝胶储液丙烯酰胺7.09g甲叉双丙烯酰胺0.405g25 mlMilliQ水溶解后定容至第二向30%聚丙烯酰胺贮液丙烯酰胺150g4gMilliQ水溶解后定容至500ml滤纸过滤后,棕色瓶4C冰箱保存。1.5mol/L Tris碱 pH8.8Tris 碱90.75gMilliQ水400ml用1mol/L HC1调pH至8.8,加MilliQ水定容至500ml。4C冰箱保存。10% SDSSDS10gMilliQ水100ml混匀后,室温保存。10% ApAp0.1gMilliQ水1ml (用时加水溶解)溶解后,4C冰箱保存。10X 电泳缓冲液

7、(1X= 25mM Tris,192mM glycine,0.1% SDS,pH8.3)Tris 碱30g甘氨酸144gSDS10gMilliQ水1L混匀后,室温保存。第一向电极液母液(用前稀释10倍)甲叉双丙烯酰胺正极电极液母液(0.1 mol/L磷酸):取6.75mL磷酸用去离子水定容至lOOOmL。负极电极液母液(0.2 mol/L NaOH ):取16.48gNaOH,用去离子水定容至 2000mL,置于4C冰箱内可以保存2周。注意:正负极缓冲液体系有多种,要分离不同PH范围的蛋白质,需要选择 恰当的缓冲液体系。3实验操作A. 第一向 IEF-PAGE1凝胶柱的玻管准备准备干净玻管(1

8、7cm X 2mm)内径1.5mm左右的,长度取18cm,先用2M 的NaOH 泡 至少1hr,用自来水冲后;用双蒸水冲,用双蒸水泡至少1hr,中间至少换2, 3次水;后用2M的HCL泡至少1个小时,用双蒸水冲,(不能用自来水冲),然 后双蒸水泡至少1个小时,中间换3,4次水,最后泡在无水乙醇里面1hr,轰 干。用Parafilm封口膜封好底部,在15cm处作好标记,待用。2配制等电聚焦凝胶柱的制备(环境温度25C)尿素(超级纯)5.5g第一向凝胶贮备液1.33 mlAmpholine0.5 ml去离子水1.97 mlCHAPS0.2-0.4gTEMED15卩110%AP50yl定容至10毫升

9、注意:在加入TEMED和10%AP之前,先减压抽气10min,加入后立即准备装管(TEMED和10%AP的用量,不同的实验条件,需实验室自行摸索,以 装管后2-4小时聚合为宜)3灌制第一向凝胶将干净的玻璃管置于盛有凝胶液的烧杯中(插入凝胶液面下),玻璃管一端 用封口膜或白色乳胶冒头密封住,用5mL针头从密封处插入,倒吸凝胶液于指 定位置(约15厘米处)后,室温下竖直放置,待凝胶聚合后,在凝胶表面加入 50卩1样品裂解液,再沿玻璃管内壁小心注入50卩1水。放置1-2小时后吸去凝胶 上层液体,再加入50卩1新鲜的样品裂解液,其上再覆盖0.02 mol/LNaOH电极缓 冲液。4预电泳下槽加0.01

10、 mol/L磷酸电极液,上槽加0.02 mol/LNaOH电极缓冲液。下槽 接正极,上槽接负极,打开电源,将电压分别调至200V、300V、400V分别15min、 30min、30min进行预电泳,以去除未聚合的单体和杂质。5加样和电泳(根据样品性质决定电泳时间,经验最重要)预电泳后,吸弃凝胶胶面的溶液,用微量注射器取样品液30p 1(约60-150ug 蛋白),沿壁加在浓缩胶面上,注入时要慢,避免有气泡,在样品液之上小心加 入样品覆盖液25p 1,再加入上极缓冲液充满覆盖液上方的空隙,将电压先恒定 400V-500V,电泳约16小时,再恒定电压1000V电泳约2小时。6.剥胶取下凝胶管,用

11、局麻针头注射器吸取一定量的蒸馏水,将针头插入胶柱-与 管壁之间,边注水边旋转玻管,直至胶柱与管壁分开,然后用洗耳球轻轻在玻管 的一端加压,使凝胶柱从玻管缓慢滑出,将凝胶柱置于编号的试管内,用蒸馏水 冲洗几次。B. 平衡取出胶条分别放入玻璃管中,用平衡缓冲液I在振荡仪上振荡15分钟,倒 掉平衡缓冲液I;再用平衡缓冲液II在振荡仪上振荡15分钟,倒掉平衡缓冲 液II,用去离子水冲洗2次(快速)。C. 第二向 SDS-PAGE1. 玻璃准备未用过的玻璃和使用过的粘有凝胶的玻璃都必须用3%的氢氧化钠溶液浸泡过夜才能使用,使用时先用水和清洁剂洗玻璃。用超纯水冲洗胶板,洗去清 洁剂,然后用无水乙醇擦洗胶板

12、。a、准备短玻璃胶板:1)带上新手套,用镜头纸少量蘸取剥离硅烷溶液擦洗玻璃板每个角落。2)5分钟后,用少量95%酒精浸湿镜头纸,在玻璃板上朝一个方向擦,然后 垂直方向擦,重复擦洗2次。b、准备长玻璃板:1)在准备长胶板前要换手套以避免交叉污染。2)用浸透12 ml硅化剂溶液的镜头纸擦洗玻璃板每个角落。3)在5分钟后,加2 ml 95%酒精在胶板上,用纸朝一个方向擦,然后垂直 方向擦,重复擦洗2次。注意:所有的清洗用具必须分开在短胶板和长胶板上使用,以免引起胶板的 交叉污染。如果已经交叉污染了,凝胶序列可能会破缝或变散。2. 凝胶配制及灌胶(1.0mm约80ml两块,1.5约130ml两块)在1

13、50ml烧杯中,配制100ml的12%的凝胶水33 ml第二向凝胶储备液40 ml1.5mol/L Tris碱 pH8.825 ml10%SDS1 ml10%AP0.5 mlTEMED0.02 ml在加入TEMED和10%AP之前,先减压抽气10min,加入后立即准备装管 (TEMED和10%AP的用量,不同的实验条件,需实验室自行摸索,4小时聚 合为宜)将玻璃板对齐,放置于制胶器中夹紧,防止胶液泄露,沿玻璃板上沿一侧缓 慢注入凝胶液,防止产生气泡,约2-3mi n灌好一块凝胶,在凝胶液表面加入约 700无水乙醇或正丁醇压胶,以防空气氧化,等待聚合。3. 胶条的放置待凝胶聚合后,将平衡好的IE

14、F胶条小心倒扣在硬塑料垫板上,由于胶条较 软、易碎,以格齿作以辅助,帮助胶条转移至第二向凝胶上(切忌胶条与凝胶接 合处不能有气泡)用配置好的低熔点琼脂糖(预先放置于微波炉中融化),密封 住胶条与空气接触表面,防止氧化。4电泳电泳条件:W恒功率,时间大约30min左右,然后4W恒定功率,大约30min, 最后调节至18W恒定功率,电泳4-6小时左右,当溴酚蓝到达胶底处即停止 电泳。5聚丙烯酰胺凝胶电泳的显色-银染一块胶的量:1. 固定:过夜+10min去离子水清洗X3冰醋酸:50ml无水乙醇200 ml定容至500 ml洗胶:把经固定的胶板置于盛有500 ml双蒸水的塑料盘中清洗三次,每次 10

15、min。2. 致敏:30min+10min去离子水清洗X3硫代硫酸钠:1.57g无水醋酸钠:34g无水乙醇:157.5 ml定容至500 ml洗胶:把经固定的胶板置于盛有500 ml双蒸水的塑料盘中清洗三次,每次 10min3. 染色:20min硝酸银:1.25g定容至500 ml银染20min后,纯水洗1minx2次(振荡混匀时,注意加遮蔽物以避光)。4. 显色:2-5min (可配置500X2瓶)碳酸钠:25g37%甲醛:0.2 ml定容至1000 ml1)先用少量显色液快速洗去“黄褐色泥沙样”的背景杂质;2).再加入多量显色液,快速振荡,密切观察染色情况,尤其注意不可 染过,及时加入终止液。5. 终止显色:10min+30min清洗7.3g 的 EDTA.2H2O定容至 50

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