大学生物化学名词解释(完整版)

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1、生物化学名词解释1,氨基酸(ami no acid ):是含有一个碱性氨基和一个酸性羧基的有机化合 物,氨基一般连在a -碳上。2, 必需氨基酸(esse ntial ami no acid ):指人(或其它脊椎动物)(赖氨 酸,苏氨酸等)自己不能合成,需要从食物中获得的氨基酸。3,非必需氨基酸(non esse ntial ami no acid):指人(或其它脊椎动物)自己能由简单的前体合成不需要从食物中获得的氨基酸。4,等电点(pl,isoelectric point):使分子处于兼性分子状态,在电场中不迁移(分子的静电荷为零)的pH值。5,茚三酮反应(ninhydrin reactio

2、n):在加热条件下,氨基酸或肽与茚三酮反应生成紫色(与脯氨酸反应生成黄色)化合物的反应。6,肽键(peptide bond ): 一个氨基酸的羧基与另一个的氨基的氨基缩合,除 去一分子水形成的酰氨键。7,肽(peptide):两个或两个以上氨基通过肽键共价连接形成的聚合物。8,蛋白质一级结构(primary structure ):指蛋白质中共价连接的氨基酸残 基的排列顺序。9,层析(chromatography):按照在移动相和固定相(可以是气体或液体)之间的分配比例将混合成分分开的技术。10,离子交换层析(ion-exchange column )使用带有固定的带电基团的聚合 树脂或凝胶层

3、析柱,依据流动相组分离子与交换剂上的平衡离子进行可逆交换 时的结合力大小的差别而进行分离的一种层析方法。11,透析(dialysis ):通过小分子经过半透膜扩散到水(或缓冲液)的原 理,将小分子与生物大分子分开的一种分离纯化技术。12,凝胶过滤层析(gel filtrationchromatography):也叫做分子排阻层析。一种利用带孔凝胶珠作基质,按照分子大小分离蛋白质或其它分子混合物 的层析技术。13,亲合层析(affinity chromatograph ):将具有特殊结构的亲和分子制成 固相吸附剂放置在层析柱中,当要被分离的蛋白混合液通过层析柱时,与吸附 剂具有亲和能力的蛋白质就

4、会被吸附而滞留在层析柱中。那些没有亲和力的蛋 白质由于不被吸附,直接流出,从而与被分离的蛋白质分开,然后选用适当的 洗脱液,改变结合条件将被结合的蛋白质洗脱下来,这种分离纯化蛋白质的方 法称为亲和层析。14,高压液相层析(HPLC :使用颗粒极细的介质,在高压下分离蛋白质或其 他分子混合物的层析技术。一一高压、高速、高效、高灵敏度。15,凝胶电泳(gel electrophoresis ):以凝胶为介质,在电场作用下分离 蛋白质或核酸的分离纯化技术。16, SDS聚丙烯酰氨凝胶电泳(SDS-PAGE :在去污剂十二烷基硫酸钠存在下 的聚丙烯酰氨凝胶电泳。SDS-PAG只是按照分子的大小,而不是

5、根据分子所带 的电荷大小分离的。17, 等电聚胶电泳(IEF):利用一种特殊的缓冲液(两性电解质)在聚丙烯酰 氨凝胶制造一个pH梯度,电泳时,每种蛋白质迁移到它的等电点(pI)处,即 梯度足的某一 pH时,就不再带有净的正或负电荷了。18,双向电泳(two-dimensional electrophorese):等电聚胶电泳和 SDS-PAGE勺组合,即先进行等电聚胶电泳(按照pI)分离,然后再进行SDS-PAGE(按照分子大小分离)。经染色得到的电泳图是二维分布的蛋白质图。19,Edmanl降解(Edman degradation ):从多肽链游离的N末端测定氨基酸残 基的序列的过程。N末端

6、氨基酸残基被 苯异硫氰酸酯 修饰,然后从多肽链上切 下修饰的残基,再经层析鉴定,余下的多肽链(少了一个残基)被回收再进行 下一轮降解循环。20,同源蛋白质(homologous protein ):来自不同种类生物的序列和功能类 似的蛋白质(具有明显氨基酸序列同源的蛋白质),例如不同脊椎动物的血红 蛋白。第二章1,构形(configuration):有机分子中各个原子特有的固定的空间排列。这种排列不经过共价键的断裂和重新形成是不会改变的。构形的改变往往使分子的 光学活性发生变化。2,构象(con formatio n):指一个分子中,不改变共价键结构,仅单键周围的原 子放置所产生的空间排布。一

7、种构象改变为另一种构象时,不要求共价键的断 裂和重新形成。构象改变不会改变分子的光学活性。3, 肽单位(peptide unit ):又称为肽基(peptide group ),是肽键主链上的 重复结构。是由参于肽链形成的氮原子,碳原子和它们的 4个取代成分:羰基 氧原子,酰氨氢原子和两个相邻a -碳原子组成的一个平面单位。4, 蛋白质二级结构(protein )在蛋白质分子中的局布区域内氨基酸残基的有 规则的排列。常见的有二级结构有a -螺旋和B -折叠。二级结构是通过骨架上 的羰基和酰胺基团之间形成的氢键维持的。5, 蛋白质三级结构(protein tertiary structure):

8、蛋白质分子处于它的天然折叠状态的三维构象。三级结构是在二级结构的基础上进一步盘绕,折叠形 成的。三级结构主要是靠氨基酸侧链之间的疏水相互作用,氢键,范德华力和 盐键维持的。6,蛋白质四级结构(protein quaternary structure ):多亚基蛋白质的三维 结构。实际上是具有三级结构多肽(亚基)以适当方式聚合所呈现的三维结 构。7,a -螺旋(a -helix ):蛋白质中常见的二级结构,肽链主链绕假想的中心轴 盘绕成螺旋状,一般都是右手螺旋结构,螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基 酸残基(第n个)的羰基与多肽链C端方向的第4个残基(第4+n个)的酰胺 氮形成氢键。在古典的右手a

9、 -螺旋结构中,螺距为0.54nm,每一圈含有3.6 个氨基酸残基,每个残基沿着螺旋的长轴上升0.15 nm.8, B -折叠(B -sheet ):蛋白质中常见的二级结构,是由伸展的多肽链组成 的。折叠片的构象是通过一个肽键的羰基氧和位于同一个肽链的另一个酰氨氢 之间形成的氢键维持的。氢键几乎都垂直伸展的肽链,这些肽链可以是平行排列(由N到C方向)或者是反平行排列(肽链反向排列)。9, B -转角(B -turn ):也是多肽链中常见的二级结构,是连接蛋白质分子中 的二级结构(a -螺旋和B -折叠),使肽链走向改变的一种非重复多肽区,一 般含有216个氨基酸残基。含有5个以上的氨基酸残基的

10、转角又常称为环(loop )。常见的转角含有4个氨基酸残基有两种类型:转角I的特点是:第 一个氨基酸残基羰基氧与第四个残基的酰氨氮之间形成氢键;转角U的第三个 残基往往是甘氨酸。这两种转角中的第二个残侉大都是脯氨酸。10, 超二级结构(super-secondary structure):也称为基元(基序)(motif).在蛋白质中,特别是球蛋白中,经常可以看到由若干相邻的二级结构 单元组合在一起,彼此相互作用,形成有规则的,在空间上能辨认的二级结构 组合体。11, 结构域(domain):在蛋白质的三级结构内的独立折叠单元。结构域通常都 是几个超二级结构单元的组合。12, 纤维蛋白(fibr

11、ous protein ): 一类主要的不溶于水的蛋白质,通常都含 有呈现相同二级结构的多肽链许多纤维蛋白结合紧密,并为单个细胞或整个生物体提供机械强度,起着保护或结构上的作用。13,球蛋白(globular protein):紧凑的,近似球形的,含有折叠紧密的多肽链的一类蛋白质,许多都溶于水。典形的球蛋白含有能特异的识别其它化合物的 凹陷或裂隙部位。14, 角蛋白(keratin ):由处于a -螺旋或B -折叠构象的平行的多肽链组成不溶 于水的起着保护或结构作用蛋白质。15, 胶原(蛋白)(collagen ):是动物结缔组织最丰富的一种蛋白质,它是由 原胶原蛋白分子组成。原胶原蛋白是一种

12、具有右手超螺旋结构的蛋白。每个原 胶原分子都是由3条特殊的左手螺旋(螺距0.95nm,每一圈含有3.3个残基) 的多肽链右手旋转形成的。16,疏水相互作用(hydrophobic interaction):非极性分子之间的一种弱的非共价的相互作用。这些非极性的分子在水相环境中具有避开水而相互聚集的倾 向。17,伴娘蛋白(chaperone):与一种新合成的多肽链形成复合物并协助它正确 折叠成具有生物功能构向的蛋白质。伴娘蛋白可以防止不正确折叠中间体的形 成和没有组装的蛋白亚基的不正确聚集,协助多肽链跨膜转运以及大的多亚基 蛋白质的组装和解体。18,二硫键(disulfide bond ):通过

13、两个(半胱氨酸)巯基的氧化形成的共价 键。二硫键在稳定某些蛋白的三维结构上起着重要的作用。19,范德华力(van der Waals force ):中性原子之间通过瞬间静电相互作用 产生的一弱的分子之间的力。当两个原子之间的距离为它们范德华力半径之和 时,范德华力最强。强的范德华力的排斥作用可防止原子相互靠近。20,蛋白质变性(denaturation ):生物大分子的天然构象遭到破坏导致其生物 活性丧失的现象。蛋白质在受到光照,热,有机溶济以及一些变性济的作用 时,次级键受到破坏,导致天然构象的破坏,使蛋白质的生物活性丧失。21,肌红蛋白(myoglobi n):是由一条肽链和一个血红素辅

14、基组成的结合蛋 白,是肌肉内储存氧的蛋白质,它的氧饱和曲线为双曲线型。22,复性(renaturation ):在一定的条件下,变性的生物大分子恢复成具有生 物活性的天然构象的现象。23, 波尔效应(Bohr effect ) : CO2浓度的增加降低细胞内的pH,引起红细胞 内血红蛋白氧亲和力下降的现象。24, 血红蛋白(hemoglobin):是由含有血红素辅基的4个亚基组成的结合蛋白。血红蛋白负责将氧由肺运输到外周组织,它的氧饱和曲线为S型。25, 别构效应(allosteric effect ):又称为变构效应,是寡聚蛋白与配基结合 改变蛋白质的构象,导致蛋白质生物活性丧失的现象。26

15、,镰刀型细胞贫血病(sickle-cell anemia ):血红蛋白分子遗传缺陷造 成的一种疾病,病人的大部分红细胞呈镰刀状。其特点是病人的血红蛋白B 亚基N端的第六个氨基酸残缺是缬氨酸(vol ),而不是下正常的谷氨酸残基 (Ghe)。第三章1,酶(enzyme : 一种由活细胞生成的,对其特异性底物具有高校催化能力的 蛋白质或核酸。2, 脱脯基酶蛋白(apoenzyme):酶中除去催化活性可能需要的有机或无机辅助因 子或辅基后的蛋白质部分。3,全酶(holoenzyme):具有催化活性的酶,包括所有必需的亚基,辅基和其 它辅助因子。4,酶活力单位(U, active unit ):酶活力

16、单位的量度。1961年国际酶学会议 规定:1个酶活力单位是指在特定条件(25篊,其它为最适条件)下,在1min 内能转化1卩mol底物的酶量,或是转化底物中1卩mol的有关基团的酶量。5,比活(specific activity ):每分钟每毫克酶蛋白在25篊下转化的底物的 微摩尔数。比活是酶纯度的测量。6,活化能(activation energy ):将1mol反应底物中所有分子由其态转化为 过渡态所需要的能量。7,活性部位(active energy ):酶中含有底物结合部位和参与催化底物转化为 产物的氨基酸残基部分。活性部位通常位于蛋白质的结构域或亚基之间的裂隙 或是蛋白质表面的凹陷部位,通常都是由在三维空间上靠得很进的一些氨基酸 残基组成。8,酸-碱

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